单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 11961 - 11980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11961 | 2024-08-04 |
3D reconstruction of a gastrulating human embryo
2024-May-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.041
PMID:38657603
|
研究论文 | 本研究建立了一个人类胚胎的三维模型，以理解早期人类发育，特别是在胚胎发生的重塑阶段。 | 通过高分辨率空间转录组分析，从自然胚胎获得了宝贵的参考数据集，填补了该领域的空白。 | 该研究主要依赖于来自单一样本的空间转录组数据，可能限制了结果的普适性。 | 探讨人类胚胎发育中重要阶段的细胞谱系和组织模式。 | 该研究对象是来自完整卡内基阶段8的人类胚胎的62个横截面。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 62个横截面 |
| 11962 | 2024-08-05 |
PIPET: predicting relevant subpopulations in single-cell data using phenotypic information from bulk data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae260
PMID:38819254
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于大规模数据的表型信息预测单个细胞数据中相关亚群的算法PIPET | 提出了一种新颖的算法，可以使用大规模数据中的多变量表型信息预测单细胞数据中的相关亚群 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在探索如何将小样本的单细胞数据与大样本丰富的临床特征进行整合 | 研究单个细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其与肿瘤相关的表型信息 | 数字病理学 | 肺腺癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多分类模型 | 基因表达数据 | 模拟数据集与肺腺癌和乳腺癌单细胞数据中的细胞亚群 |
| 11963 | 2024-08-05 |
Reduction of specific enterocytes from loss of intestinal LGR4 improves lipid metabolism in mice
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48622-5
PMID:38782937
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研究论文 | 该研究探讨肠道LGR4缺乏对脂质代谢的影响 | 首次发现LGR4缺失导致特定肠细胞的减少，从而改善脂质和葡萄糖代谢 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏人类临床数据支持 | 探究肠道LGR4对营养吸收和能量平衡的影响 | Lgr4小鼠及其肠道吸收细胞 | 数字病理学 | 肥胖症和肝脏脂肪变性 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了Lgr4小鼠和野生型小鼠进行对比 |
| 11964 | 2024-08-05 |
Carboxypeptidase M modulates BMSCs osteogenesis-adipogenesis via the MAPK/ERK pathway: An integrated single-cell and bulk transcriptomic study
2024-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302508R
PMID:38713087
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研究论文 | 本研究探讨了羧肽酶M（CPM）在骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）成骨与成脂过程中的调节作用 | 本研究揭示了CPM作为BMSCs分化的关键调节因子，并提供了MAPK/ERK通路在此过程中的作用机制的新线索 | 研究主要基于现有的数据分析，可能存在单细胞RNA测序数据的局限性 | 研究骨质疏松症（OP）中BMSCs成骨与成脂的平衡失调机制 | 主要研究骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）及其在骨质疏松症中的功能 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | NA | 细胞数据 | 分析了来自八个scRNA-seq数据集的56,377个细胞 |
| 11965 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell analysis uncovers the immunopathological mechanisms associated with IgA nephropathy progression
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173651
PMID:38716725
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研究论文 | 本研究通过跨物种单细胞分析揭示了与IgA肾病进展相关的免疫病理机制 | 采用跨物种单细胞RNA测序的方法探索IgA肾病的致病程序，并发现了与病情进展相关的特定蛋白表达 | 本研究的.sample size相对较小，未来需要更大范围的研究来验证结果 | 探讨IgA肾病的致病机制及其与肾功能下降的关系 | 人类IgA肾病及小鼠和大鼠IgA肾病模型 | 数字病理学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠IgA肾病模型 | 基因表达数据 | 21个进展样本和28个非进展样本 |
| 11966 | 2024-08-04 |
Decoding the principle of cell-fate determination for its reverse control
2024-May-06, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00372-2
PMID:38710700
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研究论文 | 该文章探讨了细胞命运决定的机制及其反向控制 | 提出了一种利用单细胞RNA-seq数据进行动态分子调控网络建模的概念控制框架 | 获取用于模型开发的基本动态实验数据仍然是一个重大障碍 | 理解和操控细胞命运决定的过程 | 细胞命运决定的核心调控电路及其主调控因子 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 动态分子调控网络数据 | NA |
| 11967 | 2024-08-04 |
Developmental regulation of primitive erythropoiesis
2024-05-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000806
PMID:38415349
|
综述 | 本文概述了原始红细胞生成的最新研究进展，重点关注其胚胎起源和发展调控的物种特异性差异 | 揭示了新的转录因子及其非经典角色，扩展了对原始红细胞生成的理解，并表明了胚胎中红细胞生成的保护性特征 | 研究主要针对小鼠及稀有早期人类胚胎样本，缺乏更广泛的物种比较 | 深入理解原始红细胞生成的分子和代谢途径，以便为体外生成红细胞提供基础 | 重点研究原始红细胞的起源和发育调控，包括小鼠胚胎和稀有人类胚胎样本 | NA | NA | 单细胞转录组学和谱系追踪 | NA | 细胞样本 | 小鼠胚胎和稀有人类胚胎样本 |
| 11968 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of adipose tissue-derived mesenchymal stem cells under chondrogenic induction
2024-May, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:37915134
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪组织来源的间充质干细胞在软骨诱导下的异质性。 | 揭示了不同细胞簇之间在增殖和分化平衡中的差异，特别是在软骨刺激前后的动态变化。 | 研究主要集中在特定时间点的单细胞RNA测序，可能缺乏对更长期分化过程的全面了解。 | 研究脂肪组织来源间充质干细胞对软骨诱导的反应及其异质性。 | 脂肪组织来源的间充质干细胞（AT-MSCs）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 37,219个高质量转录本 |
| 11969 | 2024-08-04 |
The estrogen signaling pathway reprograms prostate cancer cell metabolism and supports proliferation and disease progression
2024-Apr-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170809
PMID:38625747
|
研究论文 | 这篇文章揭示了雌激素受体α在前列腺癌细胞代谢中的作用，并支持其增殖和疾病进展 | 文章首次表明雌激素受体α在前列腺癌细胞代谢重编程中发挥重要作用，并可能作为治疗靶点 | 雌激素受体α在一半肿瘤中未表达，限制了对其临床相关性的全面理解 | 研究雌激素信号通路对前列腺癌细胞代谢和增殖的影响 | 使用人类前列腺癌组织微阵列和细胞模型研究前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-Seq | NA | 组织样本和细胞模型 | 来自两个前列腺癌组织微阵列的患者样本 |
| 11970 | 2024-08-04 |
Cholangiocytes Modulate CD100 Expression in the Liver and Facilitate Pathogenic T-Helper 17 Cell Differentiation
2024-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.11.283
PMID:37995866
|
研究论文 | 这篇文章探讨了胆管细胞如何调节肝脏中CD100的表达并促进致病性T辅助17细胞的分化 | 文章首次表明胆管细胞通过与免疫细胞的交叉对话发挥作用，并强调了其在病理机制中的主动、促炎角色 | 研究主要依赖于特定小鼠模型，可能无法完全反映人类病理过程 | 理解原发性硬化性胆管炎相关的病理机制 | 主要研究胆管细胞与免疫细胞之间的相互作用及其在病理过程中的角色 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 空间转录组学、免疫成像、高维流式细胞术、RNA测序 | 细胞共培养模型 | 组织活检样本和细胞 | 涉及从变异特异性小鼠中提取的脾细胞及患者材料的多种样本 |
| 11971 | 2024-08-05 |
scX: A user-friendly tool for scRNA-seq exploration
2024-Mar-07, ArXiv
PMID:37961742
|
研究论文 | 本论文介绍了scX，一个基于Shiny框架的R包，用于简化单细胞RNA测序的数据分析和可视化 | scX提供了一个用户友好的互动图形界面，使用户能够轻松访问关键的scRNA-seq分析 | 需要熟练的专业知识来处理和解释数据 | 研究旨在简化单细胞RNA测序实验的数据分析和可视化 | 单细胞RNA测序实验的数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 数据集 | NA |
| 11972 | 2024-08-05 |
A distinct tumor microenvironment makes anaplastic thyroid cancer more lethal but immunotherapy sensitive than papillary thyroid cancer
2024-Mar-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173712
PMID:38478516
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研究论文 | 本文探讨了非分化甲状腺癌和乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境差异及其对免疫治疗的影响 | 研究首次构建了甲状腺癌的单细胞图谱，并发现CXCL13+ T细胞在非分化甲状腺癌样本中的富集 | 缺乏对不同治疗方案长时间观察的临床数据 | 探究非分化甲状腺癌与乳头状甲状腺癌之间的肿瘤微环境差异及其对免疫治疗的影响 | 主要研究对象为非分化甲状腺癌和乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及的样本包括非分化甲状腺癌和乳头状甲状腺癌样本，但具体样本数未列出 |
| 11973 | 2024-08-05 |
Targeting HIV persistence in the tissue
2024-03-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000836
PMID:38169333
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研究论文 | 该文章探讨了针对HIV在组织中的持存现象的挑战和新策略。 | 文章提出了针对HIV持存的组织特定疗法，强调微环境的重要性以及使用新工具获得的详细信息。 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果来支持所提出的策略。 | 研究HIV组织储存的复杂性及其消除策略。 | HIV感染者组织中的HIV储存及相关细胞。 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选，mRNA技术，组织类器官 | NA | 组织样本 | NA |
| 11974 | 2024-08-05 |
An integrated single-cell RNA-seq atlas of the mouse hypothalamic paraventricular nucleus links transcriptomic and functional types
2024-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13367
PMID:38281730
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研究论文 | 本研究构建了小鼠下丘脑旁核的转录组细胞类型详细图谱 | 整合了多个PVN单细胞数据集，并进行功能性表征，首次提供了不同神经内分泌亚型的详细分类 | 目前的分子分类仍不够充分，未来需要更多的数据来完善分类 | 旨在详细描述小鼠下丘脑旁核的转录组细胞类型及其功能 | 研究对象为小鼠下丘脑旁核的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 整合多个小鼠下丘脑旁核单细胞数据集，具体样本数量未明 |
| 11975 | 2024-08-05 |
Comprehensive scRNA-seq Analysis and Identification of CD8_+T Cell Related Gene Markers for Predicting Prognosis and Drug Resistance of Hepatocellular Carcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究分析了CD8+T细胞亚型对肝细胞癌预后和药物耐受性的影响 | 开发了一个基于CD8+ T细胞异质性的12基因标志，用于预测肝细胞癌的生存结果和免疫治疗反应 | 未提及具体的局限性 | 研究CD8+ T细胞亚型对肝细胞癌的影响，以预测预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者的CD8+ T细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据来自于多个数据库的患者信息 |
| 11976 | 2024-08-05 |
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
2023-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01669-w
PMID:37932455
|
研究论文 | 这篇文章探讨了一种在急性损伤后促进组织再生的特殊间充质干细胞亚型。 | 首次识别了'早期反应'间充质干细胞亚型，并展示了其如何促进免疫细胞的募集与组织再生。 | 未详细阐述该亚型在其他组织和病理情况中的作用。 | 研究急性损伤后间充质干细胞如何促进组织再生。 | 肌肉间充质干细胞(MmSCs)及其在急性损伤后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 11977 | 2024-08-05 |
CO-CLUSTERING OF SPATIALLY RESOLVED TRANSCRIPTOMIC DATA
2023-Jun, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/22-aoas1677
PMID:37811520
|
研究论文 | 本文介绍了一种新统计模型SpaRTaCo，用于对空间基因表达数据进行共聚类 | 提出了一种利用空间信息进行细胞和基因聚类的新方法 | 尚欠缺广泛的实证验证，尤其在不同类型组织样本中的适用性 | 旨在更好地理解组织中基因功能和相互作用的空间变化 | 研究细胞类型和基因在组织中空间表达模式的聚类 | 数字病理学 | NA | 10X-Visium | 聚类模型 | 转录组数据 | 应用于一个人脑组织样本 |
| 11978 | 2024-08-05 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
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综述 | 本文系统地回顾了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构以及与其他细胞器的相互作用 | 文章结合了内质网在体外成熟中引发的临床问题，并通过单细胞RNA测序识别了内质网的机制 | NA | 探讨内质网在哺乳动物卵母细胞中的时空分布及其功能 | 哺乳动物卵母细胞及其内质网 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 11979 | 2024-08-05 |
Exploring the heterogeneity of white adipose tissue in mouse and man
2023-06, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2023.102045
PMID:37094486
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研究论文 | 本文讨论了人类和小鼠白色脂肪组织的异质性，特别是成熟脂肪细胞的异质性 | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学拓展了对脂肪细胞亚群体的理解 | 该研究未说明具体实验数据或样本规模 | 探讨脂肪组织的异质性及其在代谢病生理中的潜在贡献 | 人类和小鼠的白色脂肪组织及其细胞成分 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞类型相关的数据 | NA |
| 11980 | 2024-08-05 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 这篇文章探讨了CX3CR1+ 巨噬细胞在通过相互作用CCL26促使过敏性肺炎症消退中的作用 | 文章首次揭示了CCL26-CXCR途径在过敏性肺炎症消退中的重要性 | 研究主要集中于特定的细胞机制，可能未覆盖所有相关因素 | 研究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性肺炎症消退过程中的机制 | 人类和小鼠模型中的气道巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 过敏性肺炎 | 质谱细胞分析、单细胞RNA测序、物理和免疫学分析 | 转基因小鼠 | 生物样本 | 使用了人类亚段支气管激发和小鼠过敏性肺炎模型的样本 |