单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11961 - 11980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11961 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3296446/v1
PMID:37720050
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研究论文 | 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 | 提出了一种新的浆细胞过渡状态，促使功能性浆细胞前体的生成 | 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 | 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 | 研究抗原特异性的浆细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq+BCR-seq | NA | NA | NA |
| 11962 | 2024-08-04 |
The Use of Single-Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics in Understanding the Pathogenesis and Treatment of Skin Diseases
2023-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2023.100198
PMID:37205302
|
review | 本论文回顾了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤疾病研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学来剖析皮肤疾病的关键细胞成分及其空间排列 | NA | 提升皮肤疾病治疗的精准医学水平 | 皮肤疾病，包括异常伤口愈合、炎症性皮肤疾病和癌症 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11963 | 2024-08-05 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪组织中一种特定的前脂肪细胞群体及其分化路径 | 通过单细胞RNA测序发现了一种新的人类CD31 CD45细胞群，并将其放置于已知前脂肪细胞群之前的表观遗传路径上 | 研究可能受到样本选择和细胞异质性的限制 | 揭示脂肪细胞的分化过程及其生理机制 | 研究了脂肪组织中的间质血管部分(SVF)中细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 11964 | 2024-08-05 |
Osteoblast-intrinsic defect in glucose metabolism impairs bone formation in type II diabetic male mice
2023-05-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85714
PMID:37144869
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病小鼠骨生成受损的机制，强调了骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷 | 首次识别糖尿病小鼠中骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷是糖尿病性骨质疏松的潜在原因 | 仅在小鼠模型中进行研究，限制了结果对人类的直接适用性 | 探讨2型糖尿病对骨生成的影响及其机制 | 以青少年2型糖尿病小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病性骨质疏松 | 稳定同位素追踪，Seahorse测定，单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 11965 | 2024-08-05 |
High-content CRISPR screening
2022, Nature reviews. Methods primers
DOI:10.1038/s43586-022-00098-7
PMID:37214176
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研究论文 | 该文章介绍了高内容CRISPR筛选技术及其应用于生物发现的潜力 | 文章强调了高内容方法如何提供前所未有的细节，以直接获得生物学见解 | NA | 探索CRISPR筛选的基本和高级概念及其在生物医学研究和药物开发中的应用 | 各种基因功能的非偏见探讨，包括癌症研究、免疫学和微生物学等领域 | 数字生物学 | 癌症 | CRISPR | NA | RNA测序, 空间成像 | NA |
| 11966 | 2024-08-05 |
Dense and accurate whole-chromosome haplotyping of individual genomes
2017-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01389-4
PMID:29101320
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研究论文 | 本文介绍了一种整合相位策略，用于对个体基因组进行密集且准确的全染色体单倍型分析 | 提出了一种新颖的整合相位策略，通过结合不同的测序技术实现高效的单倍型分析 | 缺乏对更广泛生物样本的验证，目前结果主要基于特定个体NA12878 | 研究旨在提高基因组分析中对单倍型信息的获取和利用 | 研究对象为人类基因组中的单倍型信息 | 数字病理学 | NA | 链特异性单细胞测序、PacBio数据、10X Genomics链接读测序 | NA | 基因组数据 | 使用了10个Strand-seq文库和10倍覆盖的PacBio数据或10X Genomics链接读数据 |
| 11967 | 2024-08-05 |
Tracing the derivation of embryonic stem cells from the inner cell mass by single-cell RNA-Seq analysis
2010-May-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2010.03.015
PMID:20452321
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研究论文 | 这篇文章探讨了内细胞团细胞转变为多能胚胎干细胞的机制 | 使用单细胞RNA测序分析揭示了胚胎干细胞自我更新和多能性的转变机制 | NA | 研究内细胞团细胞向多能胚胎干细胞转变的分子机制 | 内细胞团细胞及其向多能胚胎干细胞的转变过程 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 11968 | 2024-08-05 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveal heterogeneity and diagnostic markers in papillary thyroid carcinoma lymph-node metastasis
2024-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-023-02262-6
PMID:38146045
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研究论文 | 本研究分析了乳头状甲状腺癌的淋巴结转移，寻找诊断标记物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，探索了乳头状甲状腺癌淋巴结转移的异质性 | 研究中样本量有限，仅包括66名患者的样本 | 旨在发现乳头状甲状腺癌淋巴结转移的诊断标记物及治疗靶点 | 研究对象为乳头状甲状腺癌患者的淋巴结转移细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和常规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 66名乳头状甲状腺癌患者的样本 |
| 11969 | 2024-08-04 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-May-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
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综述 | 本文系统总结了巨噬细胞在心血管疾病中的多样性表型和功能可塑性及其调控机制 | 首次引入了单细胞测序技术的新视角，揭示了巨噬细胞的异质性及其在心血管疾病中的潜在治疗靶点 | 研究主要集中在巨噬细胞的功能和表型塑性，未涉及所有类型心血管疾病的综合分析 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的调控机制与治疗靶点 | 心血管疾病中的巨噬细胞及其相关机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 11970 | 2024-08-04 |
Multi-model analysis of gallbladder cancer reveals the role of OxLDL-absorbing neutrophils in promoting liver invasion
2024-May-31, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00521-7
PMID:38822440
|
研究论文 | 本研究分析了胆囊癌及其免疫抑制的肿瘤微环境，突出显示了中性粒细胞在促进肝脏入侵中的作用 | 本研究识别了一种能够通过OLR1吸收oxLDL的促肿瘤中性粒细胞亚群，揭示了其独特的代谢特性和促进肿瘤侵袭的潜力 | 研究的限制在于未深入探讨不同阶段胆囊癌的细胞间相互作用及其机制 | 研究胆囊癌肿瘤微环境中特定中性粒细胞的作用及其对肝脏入侵的影响 | 主要研究对象为胆囊癌（GBC）中的中性粒细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学 (ST), 蛋白组学, 多重免疫组化 (mIHC) | NA | NA | 多种肿瘤阶段的胆囊癌样本 |
| 11971 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素，并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 11972 | 2024-08-05 |
Proteomic analysis of pleomorphic dermal sarcoma reveals a fibroblastic cell of origin and distinct immune evasion mechanisms
2024-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62927-x
PMID:38822058
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现多形性皮肤肉瘤的细胞来源和独特的免疫逃逸机制 | 首次识别出多形性皮肤肉瘤的潜在细胞来源及其免疫逃逸机制 | 样本数量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨多形性皮肤肉瘤的细胞起源及其免疫逃逸途径 | 分析健康皮肤、恶性黑色素瘤、鳞状细胞癌和多形性皮肤肉瘤的样本 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 质谱 | NA | 蛋白质数据、单细胞测序数据 | 分析了20个正常皮肤样本、27个恶性黑色素瘤样本、20个鳞状细胞癌样本和24个多形性皮肤肉瘤样本 |
| 11973 | 2024-08-04 |
Direct comparison of mass cytometry and single-cell RNA sequencing of human peripheral blood mononuclear cells
2024-May-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03399-6
PMID:38816402
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研究论文 | 本文直接比较了人类外周血单核细胞的质谱细胞术和单细胞RNA测序 | 通过整合质谱细胞术和单细胞RNA测序的数据，提供了细胞类型特征的高分辨率分析 | 缺乏合适的金标准数据集用于评估新单细胞分析工具的有效性 | 探讨转录组学和蛋白质组学之间的关系 | 人类外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，质谱细胞术，流式细胞术 | NA | RNA，蛋白质 | 人类外周血单核细胞的分样本 |
| 11974 | 2024-08-05 |
Neoantigen-specific stimulation of tumor-infiltrating lymphocytes enables effective TCR isolation and expansion while preserving stem-like memory phenotypes
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008645
PMID:38816232
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研究论文 | 本研究探讨了针对新抗原特异性刺激肿瘤浸润淋巴细胞的效果。 | 开发了一种名为'NeoExpand'的体外刺激方法，能够选择性扩展新抗原反应性的TIL，改善其表型和功能。 | 研究样本仅限于具有p53或RAS突变的25名患者，可能影响结果的普遍适用性。 | 探讨如何优化新抗原反应性肿瘤浸润淋巴细胞的扩展和分离。 | 25名来自肺癌患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 体外刺激 | NA | 样本 | 25个TIL样本 |
| 11975 | 2024-08-05 |
Identification of epigenetic silencing of the SFRP2 gene in colorectal cancer as a clinical biomarker and molecular significance
2024-May-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05329-x
PMID:38802858
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研究论文 | 本研究调查了SFRP2基因的甲基化水平在结直肠癌中的临床生物标志物和分子意义 | 证明了SFRP2基因的启动子甲基化可以预测结直肠癌的病理特征和预后，尤其在血液样本中具有潜在的临床应用价值 | 研究未能涵盖其他类型的癌症和更大范围的人群，可能影响结果的普遍性 | 研究SFRP2基因甲基化在结直肠癌中的重要性，探索其作为生物标志物的潜力 | 包括110名健康参与者和85名结直肠癌患者的生物样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 450K DNA阵列和DNA焦磷酸测序 | NA | 血液、脂肪和结肠组织样本 | 共195个样本（110名健康参与者和85名结直肠癌患者） |
| 11976 | 2024-08-04 |
Multi-modal domain adaptation for revealing spatial functional landscape from spatially resolved transcriptomics
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae257
PMID:38819253
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研究论文 | 提出了一种用于空间转录组学的多模态领域适应方法stMDA，以揭示空间功能格局 | stMDA整合了基因表达和其他模态的信息，提供了高效的空间聚类和变异分析 | 该研究可能在特定条件下仍面临数据稀疏性的挑战 | 该研究旨在提高空间转录组数据的分析能力 | 主要研究对象为空间转录组学数据及其多模态信息 | 数字病理学 | 癌症组织 | 多模态无监督领域适应 | 多种神经网络架构 | 基因表达数据和其他模态数据 | 涉及多种平台和物种的多样本数据 |
| 11977 | 2024-08-04 |
3D reconstruction of a gastrulating human embryo
2024-May-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.041
PMID:38657603
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研究论文 | 本研究建立了一个人类胚胎的三维模型，以理解早期人类发育，特别是在胚胎发生的重塑阶段。 | 通过高分辨率空间转录组分析，从自然胚胎获得了宝贵的参考数据集，填补了该领域的空白。 | 该研究主要依赖于来自单一样本的空间转录组数据，可能限制了结果的普适性。 | 探讨人类胚胎发育中重要阶段的细胞谱系和组织模式。 | 该研究对象是来自完整卡内基阶段8的人类胚胎的62个横截面。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 62个横截面 |
| 11978 | 2024-08-05 |
PIPET: predicting relevant subpopulations in single-cell data using phenotypic information from bulk data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae260
PMID:38819254
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于大规模数据的表型信息预测单个细胞数据中相关亚群的算法PIPET | 提出了一种新颖的算法，可以使用大规模数据中的多变量表型信息预测单细胞数据中的相关亚群 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在探索如何将小样本的单细胞数据与大样本丰富的临床特征进行整合 | 研究单个细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其与肿瘤相关的表型信息 | 数字病理学 | 肺腺癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多分类模型 | 基因表达数据 | 模拟数据集与肺腺癌和乳腺癌单细胞数据中的细胞亚群 |
| 11979 | 2024-08-05 |
Reduction of specific enterocytes from loss of intestinal LGR4 improves lipid metabolism in mice
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48622-5
PMID:38782937
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研究论文 | 该研究探讨肠道LGR4缺乏对脂质代谢的影响 | 首次发现LGR4缺失导致特定肠细胞的减少，从而改善脂质和葡萄糖代谢 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏人类临床数据支持 | 探究肠道LGR4对营养吸收和能量平衡的影响 | Lgr4小鼠及其肠道吸收细胞 | 数字病理学 | 肥胖症和肝脏脂肪变性 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了Lgr4小鼠和野生型小鼠进行对比 |
| 11980 | 2024-08-05 |
Carboxypeptidase M modulates BMSCs osteogenesis-adipogenesis via the MAPK/ERK pathway: An integrated single-cell and bulk transcriptomic study
2024-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302508R
PMID:38713087
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研究论文 | 本研究探讨了羧肽酶M（CPM）在骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）成骨与成脂过程中的调节作用 | 本研究揭示了CPM作为BMSCs分化的关键调节因子，并提供了MAPK/ERK通路在此过程中的作用机制的新线索 | 研究主要基于现有的数据分析，可能存在单细胞RNA测序数据的局限性 | 研究骨质疏松症（OP）中BMSCs成骨与成脂的平衡失调机制 | 主要研究骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）及其在骨质疏松症中的功能 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | NA | 细胞数据 | 分析了来自八个scRNA-seq数据集的56,377个细胞 |