单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 11941 - 11960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11941 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals a myeloid cell-related regulon predicting neoadjuvant immunotherapy response across cancers
2024-May-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05123-9
PMID:38773508
|
研究论文 | 本文分析了肿瘤免疫治疗响应相关的髓系细胞调控系统 | 识别了与免疫检查点抑制剂响应相关的PPARG调控单元，并构建了髓系细胞图谱 | 研究主要集中在特定癌症种类上，可能不适用于所有癌症类型 | 探索肿瘤患者对免疫治疗的反应机制 | 从肺腺癌患者中提取的单细胞RNA测序数据和大规模的全癌种数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 1名肺腺癌患者的预处理和后处理样本，以及多个癌症类型的大规模数据集 |
| 11942 | 2024-08-05 |
Tenascin C as a novel zinc finger protein 750 target regulating the immunogenicity via DNA damage in lung squamous cell carcinoma
2024-May-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12285-8
PMID:38711034
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研究论文 | 本研究揭示了锌指蛋白750（ZNF750）通过调节tenascin C（TNC）在肺鳞状细胞癌中的免疫原性和DNA损伤修复机制 | 首次提出ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中的作用，以及其对免疫原性和DNA损伤修复的影响 | 尚未在临床环境中验证研究结果 | 探讨ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中对DNA损伤修复和免疫原性的调节作用 | 研究对象为肺鳞状细胞癌中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 肺鳞状细胞癌样本的单细胞测序数据 |
| 11943 | 2024-08-04 |
scmFormer Integrates Large-Scale Single-Cell Proteomics and Transcriptomics Data by Multi-Task Transformer
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307835
PMID:38483032
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研究论文 | 提出了一种新的单细胞多模态/多任务变换器 scmFormer，以整合单细胞蛋白组学与其他组学数据 | scmFormer 通过系统基准测试展示了在整合大规模单细胞多模态数据和异质多批次配对多组学数据方面的优势 | NA | 研究旨在填补整合单细胞蛋白组学和其他组学数据的现有空白 | 主要研究对象为大规模单细胞多组学数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞 RNA 测序 | 变换器 | 细胞数据 | 超过 148 万个细胞 |
| 11944 | 2024-08-05 |
Specific lineage transition of tumor-associated macrophages elicits immune evasion of ascitic tumor cells in gastric cancer with peritoneal metastasis
2024-05, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01486-6
PMID:38460015
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研究论文 | 本研究系统评估了腹水中与肿瘤相关的巨噬细胞的特定谱系转变以及其对胃癌伴腹膜转移的免疫逃逸的影响 | 首次识别了来自PM-GC患者腹水中的CTShigh到C1Qhigh巨噬细胞的免疫抑制转变 | 本研究的局限性在于样本数量和来源的多样性可能影响结果的普遍性 | 旨在探讨腹水中肿瘤微环境在胃癌伴腹膜转移中的免疫抑制作用及其导致治疗失败的机制 | 研究对象为51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 生物样本 | 51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 |
| 11945 | 2024-08-05 |
Tumor-infiltrating monocytic myeloid-derived suppressor cells contribute to the development of an immunosuppressive tumor microenvironment in gastric cancer
2024-03, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-023-01456-4
PMID:38217732
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研究论文 | 本研究探讨了不同免疫抑制细胞在胃癌免疫微环境发展中的作用 | 识别了肿瘤浸润的单核细胞来源抑制性细胞在胃癌免疫抑制微环境中的关键作用，尤其是IER3+ M-MDSCs | 研究主要集中于未治疗或对免疫检查点抑制剂(Ici)有抵抗性的胃癌患者的样本 | 探讨不同免疫抑制细胞类型在胃癌免疫微环境中的作用 | 未治疗或对免疫检查点抑制剂抵抗的胃癌患者的样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和多重免疫染色 | NA | 基因表达数据 | 未处理或免疫检查点抑制剂抵抗的胃癌患者样本 |
| 11946 | 2024-08-04 |
Network Analysis of Osteoarthritis Progression Using a Steiner Minimal Tree Algorithm
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S438407
PMID:38779430
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研究论文 | 本文提供了与骨关节炎相关基因的综合分析 | 采用Steiner最小树算法分析骨关节炎进展及发现新的生物分子 | 未提及研究的局限性 | 分析与骨关节炎相关的基因及其生物通路 | 与骨关节炎相关的177个基因 | 数字病理学 | 骨关节炎 | Steiner最小树算法 | NA | 基因数据 | 从187项研究中收集了177个与骨关节炎显著相关的基因 |
| 11947 | 2024-08-04 |
Overactivated MX1 Positive Natural Killer Cells Promote the Progression of Sepsis-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S460259
PMID:38779429
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研究论文 | 本研究探讨了在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中MX1阳性自然杀伤(NK)细胞的特征及其对疾病进展的影响 | 本研究首次识别出在脓毒症诱导的ARDS中独特的MX1+NK细胞群体，并揭示其在疾病进展中的作用 | 由于样本数量有限，需要更大规模的样本进行进一步探索 | 探讨脓毒症诱导的ARDS中NK细胞的特征及其在疾病中的作用 | 本研究以115名脓毒症患者为对象，其中包括63名发展为ARDS的患者 | 数字病理 | 急性呼吸窘迫综合征 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 转录组数据，细胞群体数据 | 总共分析了115名脓毒症患者，其中63名发展为ARDS，52名未发展为ARDS |
| 11948 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics: A Powerful Tool in Disease Understanding and Drug Discovery
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.95908
PMID:38773973
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研究论文 | 本文章介绍了空间转录组学在疾病理解和药物发现中的应用 | 空间转录组学作为一种新兴技术，提供了基因表达的空间信息，有助于药物靶点发现 | 当前在空间转录组学研究中仍存在许多挑战和问题需要解决 | 探讨空间转录组学在药物发现中的潜力和应用 | 空间转录组学的分析策略及其在新的靶点发现和药物机制解析中的应用 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11949 | 2024-08-05 |
SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN HEALTH AND DISEASE
2024-Jan-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002274
PMID:37962963
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研究论文 | 单细胞转录组分析作为理解健康与疾病基本机制的强大工具。 | 提供了单细胞转录组分析的新方向，特别是在计算分析方面，以区分健康与疾病组织。 | 没有提及该研究的具体限制。 | 探讨单细胞转录组分析在健康和疾病条件下的应用。 | 分析不同细胞类型的转录组数据以理解生物学特性。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11950 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the spatiotemporal distribution of triterpenoid saponin biosynthesis and transposable element activity in Gynostemma pentaphyllum shoot apexes and leaves
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1394587
PMID:38779067
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析了Gynostemma pentaphyllum的顶芽和叶片中三萜皂苷生物合成和可转座元件活动的时空分布 | 首次在植物中单细胞水平上探讨了可转座元件的表达 | 未提及具体的实验限制 | 探讨Gynostemma pentaphyllum中三萜皂苷的生物合成及其在细胞分化中的调控作用 | 涉及Gynostemma pentaphyllum的顶芽和叶片中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个单细胞 |
| 11951 | 2024-08-05 |
Spatial-temporal proliferation of hepatocytes during pregnancy revealed by genetic lineage tracing
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.002
PMID:37794588
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研究论文 | 本研究揭示了妊娠期间肝细胞的时空增殖模式及其来源 | 发现妊娠期肝细胞增殖的独特时空模式，主要来源于zone 2的Ccnd1肝细胞 | 研究主要集中在小鼠模型，临床应用效果尚未测试 | 研究妊娠期间母体肝脏细胞来源和增殖机制 | 妊娠过程中肝细胞的增殖及其来源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，双重重组酶介导的遗传谱系追踪 | NA | NA | NA |
| 11952 | 2024-08-04 |
Cardiac splicing as a diagnostic and therapeutic target
2023-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00828-0
PMID:36653465
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综述 | 本文讨论了心脏替代剪接在心肌健康和疾病中的重要性及其作为诊断和治疗靶点的潜力 | 强调了心脏剪接调节因子作为治疗靶点的识别以及在临床试验中评估剪接调节剂的转化管道的开发 | 可能缺乏对所有类型心脏病患者的广泛适应性和细节深入的分析 | 识别心脏剪接在心肌疾病中的作用，以改善诊断和治疗 | 心脏病患者及其心肌替代剪接机制的研究 | 数字病理学 | 心肌病 | 多组学技术和长读取及单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 11953 | 2024-08-07 |
Identifying leukocyte phenotypes by scRNA-seq to predict cardiovascular risk
2023-07, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00891-1
PMID:37217590
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11954 | 2024-08-04 |
Differentiation of IL-26+ TH17 intermediates into IL-17A producers via epithelial crosstalk in psoriasis
2023-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39484-4
PMID:37391412
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研究论文 | 本研究识别出IL-26+ T17中间细胞通过上皮细胞间的相互作用分化为IL-17A产生细胞的机制 | 首次揭示IL-26在银屑病T17细胞应答中的作用，及其通过调节基底角质细胞的TGF-β1产生促进自身分化的过程 | 未详细探讨IL-26在其他免疫环境中的作用及其是否适用于其他疾病 | 研究IL-26在银屑病中作为T17细胞前体的分化作用 | IL-26+ T17中间细胞及其在银屑病皮肤中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，TCR测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11955 | 2024-08-05 |
MICROGLIA AND INFILTRATING T-CELLS ADOPT LONG-TERM, AGE-SPECIFIC, TRANSCRIPTIONAL CHANGES AFTER TRAUMATIC BRAIN INJURY IN MICE
2023-02-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002027
PMID:36730818
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研究论文 | 本研究探讨了老年小鼠在创伤性脑损伤后的微胶质细胞和浸润T细胞的长期转录变化 | 研究发现老年小鼠的微胶质细胞和T细胞在创伤后表现出独特的基因特征，提供了有关年龄相关脑损伤反应的新见解 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全推广到人类 | 研究创伤性脑损伤后，不同年龄小鼠的免疫反应及其机制 | 年轻和老年的C57BL/6小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠各组（具体样本数未提供） |
| 11956 | 2024-08-04 |
NKX2‑1 copy number alterations are associated with oncogenic, immunological and prognostic remodeling in non‑small cell lung cancer
2024-Jul, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14436
PMID:38774453
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研究论文 | 本研究探讨了NKX2-1拷贝数变化与非小细胞肺癌的肿瘤特征及其临床意义的关系 | 揭示了NKX2-1拷贝数变化对非小细胞肺癌肿瘤的击打特征和预后影响，首次将其与EGFR和PD-L1状态相结合进行分析 | 样本主要来自菲律宾的患者，可能限制了结果的普遍性 | 研究NKX2-1拷贝数变化在非小细胞肺癌中的作用及其临床意义 | 招募了45名菲律宾患者的肿瘤样本进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学和PCR | NA | 肿瘤样本数据 | 共分析了1,130个肺腺癌和鳞状细胞癌的样本，以及1,654个单细胞RNA测序数据 |
| 11957 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of human adrenal aging
2024-Jun, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101954
PMID:38718896
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研究论文 | 本研究对人类肾上腺老化机制进行了单细胞和空间转录组分析 | 该研究是第一项在单细胞分辨率下详细分析人类老化肾上腺皮质的研究 | 由于人类肾上腺生物学的显著物种差异，相关机制的研究仍然不足 | 阐明人类肾上腺皮质的功能和结构变化与老化之间的关系 | 老化的人类肾上腺皮质 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11958 | 2024-08-04 |
Atherosclerotic Plaque Epigenetic Age Acceleration Predicts a Poor Prognosis and Is Associated With Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Humans
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320692
PMID:38634280
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研究论文 | 该文章探讨了动脉粥样硬化斑块的表观遗传年龄加速（EAA）与心血管事件风险之间的关系 | 文章首次揭示了动脉粥样硬化斑块的EAA是预示未来不良预后的独立标志 | 研究局限于单一的观察性队列，缺乏更广泛人群的验证 | 探究动脉粥样硬化斑块的表观遗传年龄加速对心血管事件风险的预测能力 | 研究对象包括485例人类颈动脉动脉粥样硬化斑块和93例血液样本 | 数字病理 | 心血管疾病 | 全基因组DNA甲基化分析和单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 血液和组织样本 | 总样本数为578例，其中斑块样本485例，血液样本93例 |
| 11959 | 2024-08-04 |
Multiomics integration reveals NETosis heterogeneity and TLR2 as a prognostic biomarker in pancreatic cancer
2024-May-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00586-x
PMID:38769374
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中NETosis的异质性及TLR2作为预后生物标志物的作用 | 通过单细胞RNA测序、空间RNA测序和多组学方法，建立了多组学预后模型，并确认了TLR2在患者预后中的重要性 | 研究的样本可能存在选择偏差，且标志物的适用性需要进一步验证 | 探讨胰腺癌微环境中NETosis的异质性及其预后相关因素 | 该研究对象为胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境及其免疫细胞特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序, 多组学分析 | NA | 数据集 | 使用了已发表的数据集和内部患者队列 |
| 11960 | 2024-08-04 |
Bio-nanoparticles loaded with synovial-derived exosomes ameliorate osteoarthritis progression by modifying the oxidative microenvironment
2024-May-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02538-w
PMID:38769545
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研究论文 | 本研究旨在开发一种负载SOD3富集外泌体的水凝胶微球，以保护软骨并为骨关节炎治疗引入新的有效方法 | 首次使用S-EXOs负载的水凝胶微球对软骨进行保护，并提出了一种创新的骨关节炎治疗方案 | 本研究未对长时间使用S-EXOs的潜在副作用进行详细评估 | 研究S-EXOs在骨关节炎中的保护机制及其治疗潜力 | 聚焦于软骨细胞和外泌体（EXOs）在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, PCR, 西方印迹, 免疫荧光 | NA | 细胞, 组织 | 4247个细胞 |