单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 11921 - 11940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11921 | 2024-08-04 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
|
研究论文 | 这篇文章探讨了细胞类型进化过程中的新发现和挑战 | 文章创新性在于强调了发育本体论在细胞类型同源性中的重要性，并提出了单细胞转录组学的应用 | 文章未提及具体的研究限制 | 本研究旨在深入理解动物进化中细胞类型的演变 | 研究对象为不同研究生物的细胞类型及其同源性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 11922 | 2024-08-04 |
Understanding Spondyloarthritis Pathogenesis: The Promise of Single-Cell Profiling
2024-04, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01132-7
PMID:38227172
|
review | 本文概述了单细胞分析在脊柱关节炎研究中的最新进展和趋势 | 引入基于测序的方法对RNA、蛋白质或表观遗传修饰进行单细胞分辨率的量化，推动了发现驱动的研究 | 研究仍处于早期阶段，面临高成本和疾病组织样本有限的挑战 | 阐述单细胞分析在脊柱关节炎发病机制研究中的应用 | 主要研究脊柱关节炎相关的细胞状态和治疗反应特征 | NA | 脊柱关节炎 | 单细胞TCR-seq | NA | RNA, 蛋白质, 表观遗传修饰 | NA |
| 11923 | 2024-08-04 |
Navigating the landscapes of spatial transcriptomics: How computational methods guide the way
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1839
PMID:38527900
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综述 | 本文综述了空间转录组数据挖掘的当前计算方法 | 提出了对现有分析理论和工具的更新和改革建议，以应对新的实验技术 | 数据分析和生物学见解生成的困难尚未完全解决 | 探讨空间转录组研究中的计算方法 | 空间转录组数据及其挖掘方法 | 计算生物学 | NA | NA | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 11924 | 2024-08-04 |
Spatial analysis toolkits for RNA in situ sequencing
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1842
PMID:38605484
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综述 | 本文介绍了RNA原位测序（ISS）的生物信息学工具包及其数据分析流程 | 提出了适用于ISS数据分析的先进生物信息学工具，并详细审查了每种工具的应用及其与ISS数据的兼容性 | 未提及具体的实验实例支持工具的有效性 | 帮助研究者选择合适的工具以进行ISS数据分析 | RNA原位测序（ISS）和相关数据分析工具 | 数字病理学 | NA | 原位测序（ISS） | NA | 图像数据 | NA |
| 11925 | 2024-08-04 |
The Genetic Landscape of Familial Pulmonary Fibrosis
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202204-0781OC
PMID:36622818
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研究论文 | 本文综合评估了家族性肺纤维化（FPF）的遗传风险，通过分析569个FPF家族的遗传稀有变异。 | 首次确定了已知与FPF相关的基因中遗传稀有变异的流行率，并识别出新的候选基因和通路。 | 未能识别多个家族共享的新稀有变异基因，表明大多数FPF家族的遗传风险涉及多样化的基因和通路。 | 研究FPF的遗传风险，揭示其相关的基因和通路。 | 569个FPF家族的受影响个体及其遗传稀有变异。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 全外显子组测序和候选基因测序 | NA | 基因组数据 | 569个FPF家族的样本 |
| 11926 | 2024-08-05 |
An atlas of gene regulatory networks for memory CD4 + T cells in youth and old age
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.07.531590
PMID:36945549
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研究论文 | 该文章整合了单细胞RNA测序、scATAC-seq和基因组规模建模，表征了年轻和老年小鼠的记忆CD4 T细胞的基因调控网络 | 文章中建立的基因调控网络为记忆T细胞中的预测调控机制提供了全面资源，并揭示了与年龄相关的CD4 TM的变化 | 研究中可能缺乏对其他免疫细胞类型的全面考察 | 研究旨在阐明衰老对记忆CD4 T细胞功能和调控机制的影响 | 研究对象为年轻和老年小鼠的记忆CD4 T细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, scATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的13个CD4 TM群体 |
| 11927 | 2024-08-05 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq analyses revealed the function and clinical value of thrombospondins in colon cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.021
PMID:38827236
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研究论文 | 本研究揭示了血小板反应蛋白在结肠癌中的功能和临床价值。 | 研究首次系统分析了血小板反应蛋白在结肠癌中的表达及作用，识别了其作为新的治疗靶点和预后标志物的潜力。 | 该研究依赖于多个高通量数据集，可能存在数据异质性和分析方法的局限性。 | 明确血小板反应蛋白在结肠癌中的具体作用及其临床意义。 | 利用1981个样本分析血小板反应蛋白在结肠癌中的预后相关性和细胞来源。 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq | NA | 样本 | 1981个样本 |
| 11928 | 2024-08-05 |
Plasma proteome analysis implicates novel proteins as potential therapeutic targets for chronic kidney disease: A proteome-wide association study
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31704
PMID:38828357
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研究论文 | 该研究通过全基因组关联研究结合人类血浆蛋白组学识别与慢性肾病相关的新型蛋白。 | 本研究首次系统性识别出22种与慢性肾病显著相关的血浆蛋白，其中INHBC、LMAN2和SNUPN被提出作为新的治疗靶点。 | 研究集中于特定种类的已知蛋白，可能存在未识别新的潜在靶点的局限。 | 识别与慢性肾病发病机制相关的新型蛋白和潜在的治疗靶点。 | 研究涉及与慢性肾病相关的22种血浆蛋白及其在疾病中的作用。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据 | 分析了健康人类和小鼠肾脏的单细胞RNA测序数据，具体样本量未列明 |
| 11929 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of gene signatures associated with aging in human aortic dissection
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31298
PMID:38828294
|
研究论文 | 本文通过生物信息学分析探讨了与人类主动脉夹层相关的衰老基因签名。 | 研究识别了与衰老相关的枢纽基因，并提出了ESR1下调可能加重主动脉夹层的假说。 | 研究需要进一步验证有关ESR1在主动脉夹层形成中的作用，尤其是在临床环境中。 | 分析衰老相关基因与主动脉夹层的关联，以提供新见解和治疗策略。 | 衰老相关基因及其在主动脉夹层中表达的调控网络。 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及从13名主动脉夹层患者的197,605个主动脉细胞中获得的数据 |
| 11930 | 2024-08-05 |
Molecular characterization of nodose ganglia development reveals a novel population of Phox2b+ glial progenitors in mice
2024-Jun-03, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1441-23.2024
PMID:38830761
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研究论文 | 本文研究了迷走神经结的发展，并发现了一种新的Phox2b+胶质前体细胞群体 | 揭示了迷走神经结的胶质前体细胞具有独特的转录程序，并且这些细胞能够产生自主神经元 | 对迷走神经胶质细胞的发育基因程序尚未完全理解 | 探究迷走神经结中的胶质细胞前体的发育和转录特征 | 以小鼠为研究对象，分析迷走神经结中胶质前体细胞的性质 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 小鼠，性别不限 |
| 11931 | 2024-08-04 |
Mitochondrial RNA modification-based signature to predict prognosis of lower grade glioma: a multi-omics exploration and verification study
2024-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63592-w
PMID:38824202
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研究论文 | 该研究探讨了线粒体RNA修饰在低级别胶质瘤预后中的作用 | 提出了一种基于线粒体RNA修饰的评分系统以预测低级别胶质瘤的预后，并通过多组学数据进行验证 | 线粒体RNA修饰相关基因的作用机制可能尚未完全解释 | 研究线粒体RNA修饰对低级别胶质瘤的影响及其预后预测能力 | 低级别胶质瘤及其相关的线粒体RNA修饰基因 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | RNA-seq | LASSO回归, 随机生存森林 | 基因表达数据 | 1120个正常脑组织样本和529个低级别胶质瘤样本 |
| 11932 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
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研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 |
| 11933 | 2024-08-05 |
Targeting ARNT attenuates chemoresistance through destabilizing p38α-MAPK signaling in glioblastoma
2024-May-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06735-1
PMID:38806469
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研究论文 | 本研究探讨了芳香烃受体核转运蛋白(ARNT)在胶质母细胞瘤(GBM)发病机制中的功能意义 | 发现ARNT作为GBM的致癌驱动因子，并且通过干扰p38α-MAPK信号通路来降低化疗耐药性 | 本研究未提及样本规模或临床试验数据的应用，可能限制了结果的普遍性 | 研究ARNT在胶质母细胞瘤的发病机制中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞系及其相关的分子机制 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因沉默技术 (lentiviral shRNAs) | NA | 公共数据集，RNA序列数据 | NA |
| 11934 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
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研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA |
| 11935 | 2024-08-05 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-May, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
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综述 | 这篇文章总结了肿瘤相关中性粒细胞（TAN）生物学的最新数据和模型，关注在肿瘤内在信号影响下演变的多样性 | 文章通过对不同癌症实体的转录组特征进行分类，提出了一种新的中性粒细胞亚群分类，以超越传统的N1/N2二元分类 | 文章的局限性在于未能提供关于中性粒细胞在抗癌治疗中的具体应用实例 | 研究肿瘤微环境中中性粒细胞的多样性及其对抗癌治疗的影响 | 主要研究非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 11936 | 2024-08-04 |
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-Apr-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172014
PMID:38564300
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研究论文 | 本文揭示了NFκB信号在心肌病理中的作用，特别是通过CCR2+巨噬细胞驱动的心肌损伤机制 | 首次定义了NFκB信号在心肌细胞和巨噬细胞中对心律失常性心肌病自然进展的贡献 | 本研究主要基于Dsg2mut/mut小鼠模型，可能限制了对人类病理的广泛适用性 | 揭示心律失常性心肌病中的免疫信号机制及其对心肌损伤的影响 | 采用Dsg2mut/mut小鼠模型研究心肌细胞和巨噬细胞在心律失常性心肌病中的相互作用 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Dsg2mut/mut小鼠模型进行研究，具体样本量未提及 |
| 11937 | 2024-08-04 |
MEF2C Hypofunction in GABAergic Cells Alters Sociability and Prefrontal Cortex Inhibitory Synaptic Transmission in a Sex-Dependent Manner
2024-Mar, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100289
PMID:38390348
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研究论文 | 本研究探讨了MEF2C在GABA能细胞中的低功能对社交性和前额叶皮层抑制突触传递的影响，并呈现性别差异。 | 首次揭示了MEF2C在发育GABA能细胞中的低功能导致的性别特异性社交偏好缺陷和行为改变。 | 只在小鼠模型中进行研究，可能无法完全反映人类的情况。 | 研究MEF2C在GABA能细胞中的低功能如何影响社交行为及前额叶皮层的突触传递。 | 以小鼠为研究对象，聚焦于MEF2C低功能对GABA能细胞的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 电生理、单细胞转录组学、光遗传学 | 小鼠模型 | 基因表达数据、脑电图数据 | 使用了多个小鼠样本，具体样本数量未提及 |
| 11938 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
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研究论文 | 本研究探讨了CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中的潜在致病性 | 未提供具体实验验证结果的详细信息 | 研究CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤中的致病机制 | 研究了91种循环炎症蛋白与主动脉瘤之间的因果关系 | 数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了731种免疫特征和91种循环炎症蛋白 |
| 11939 | 2024-08-04 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
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研究论文 | 本文介绍了一种新的空间转录组分析方法STew，用于联合分析空间信息和基因表达 | STew通过引入空间转录组多角度表示学习方法，克服了有效利用空间信息的挑战 | 未提及具体的实验限制或适用范围 | 旨在提高空间转录组数据分析的准确性和可扩展性 | 研究涉及不同的空间转录组数据，包括单细胞和多细胞分辨率的技术 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多角度表示学习 | 转录组数据 | 使用来自人类背外侧前额叶和小鼠主嗅 bulb 的数据进行基准测试 |
| 11940 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and transcriptional drivers of triple-negative breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113564
PMID:38100350
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研究论文 | 本研究通过结合功能和分子 profiling 以及计算分析，定义了三阴性乳腺癌（TNBC）的转录、表观遗传和代谢亚型及其亚型驱动的超级增强子和转录因子 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌的转录亚型在单细胞水平上的相对均一性，并发现 PRRX1 转录因子是驱动间质型 TNBC 的关键因素 | NA | 旨在表征三阴性乳腺癌的异质性及其转录驱动因素 | 三阴性乳腺癌的转录、表观遗传和代谢亚型及其驱动因素 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 大规模多平台多组学研究 |