单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 11921 - 11940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11921 | 2024-08-05 |
Dissecting intratumoral myeloid cell plasticity by single cell RNA-seq
2019-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.2113
PMID:31033233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肿瘤微环境中髓样细胞的转录动态 | 首次揭示了早期非小细胞肺癌中CD14+ 单核细胞向M2巨噬细胞的分化路径及其转录重编程机制 | 本研究只涉及4名早期非小细胞肺癌患者，样本量有限 | 研究肿瘤微环境中髓样细胞的分化和转录重编程 | 4名早期非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 4名早期非小细胞肺癌患者的11,485个细胞 |
| 11922 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Cutaneous T-Cell Lymphoma Reveals Underlying Heterogeneity Associated with Disease Progression
2019-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-18-3309
PMID:30718356
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研究论文 | 皮肤T细胞淋巴瘤的单细胞分析揭示了与疾病进展相关的潜在异质性 | 首次使用单细胞RNA测序和机器学习方法定义了Sézary综合症中不同的转录组状态，并建立了能够预测早期与晚期CTCL疾病的基因签名 | 对疾病病理机制的理解仍不完整，这可能限制了治疗方案的开发 | 揭示Sézary综合症的异质性，并提供更好的转录组多样性理解 | Sézary综合症中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 增强树分类模型 | 基因表达数据 | NA |
| 11923 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer and Single-Cell Modeling of Genomic Alterations Through Gene Expression
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00671
PMID:31379928
|
研究论文 | 本研究通过基因表达分析癌症中的基因组改变，提出了一种新的预测模型 | 提出基因聚合作为工具，以提高基因表达预测模型的准确性 | 未提及具体的样本规模和数据来源限制 | 研究基因表达与基因组变化之间的关系以及其在癌症预测中的应用 | 癌症类型中的单体突变和拷贝数变化 | 机器学习 | 癌症 | 基因表达分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 11924 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01788-6
PMID:38839885
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研究论文 | 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 | 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变，揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 | 研究主要集中于初期的人类胚泡，可能无法完全推及其他发育阶段或物种 | 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 | 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 203个胚泡包含14,908个单细胞 |
| 11925 | 2024-08-05 |
Microwave ablation combined with PD-L1 blockade synergistically promotes Cxcl9-mediated antitumor immunity
2024-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16182
PMID:38655660
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研究论文 | 本研究探讨了微波消融与PD-L1拮抗，协同促进Cxcl9介导的抗肿瘤免疫 | 发表了微波消融结合抗PD-L1治疗对肿瘤免疫的改善作用的新发现 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探究微波消融与PD-L1拮抗结合对结直肠癌肝转移防治的潜力 | 使用经过微波消融的前临床小鼠模型进行研究 | 数字病理 | 结直肠癌 | 微波消融和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本和肿瘤细胞 | 小鼠模型，样本数量未具体说明 |
| 11926 | 2024-08-05 |
Quantification and statistical modeling of droplet-based single-nucleus RNA-sequencing data
2024-Jul-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxad010
PMID:37257175
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研究论文 | 本研究探讨了基于液滴的单核RNA测序数据的量化和统计建模 | 系统评估了基于液滴的单核RNA测序数据的概率分布，并发现其符合负二项分布 | 未能详细分析所有可能的量化映射策略 | 准确建模单核RNA测序数据，以改进下游分析 | 使用小鼠皮层和肾脏的单核RNA测序数据进行研究 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠皮层和肾脏的伪阴性对照数据 |
| 11927 | 2024-08-05 |
IRF8 configures enhancer landscape in postnatal microglia and directs microglia specific transcriptional programs
2024-Jul-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.25.546453
PMID:37645844
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF8在后天小胶质细胞发育中的作用 | IRF8通过结合增强子区域调控小胶质细胞特异性的转录程序，揭示了其在小胶质细胞发育中的关键作用 | 研究未涉及IRF8在其他类型免疫细胞中的潜在作用 | 了解IRF8在后天小胶质细胞发育及特异性转录调控中的角色 | 后天发育的小胶质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | 5xFAD模型 | NA | NA |
| 11928 | 2024-08-07 |
A one-stop shop for 3D spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01847-y
PMID:39009876
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11929 | 2024-08-05 |
Leveraging Integrated RNA Sequencing to Decipher Adrenomedullin's Protective Mechanisms in Experimental Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Jun-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060806
PMID:38927741
|
研究论文 | 本研究旨在阐明肾上腺髓质素在实验性支气管肺发育不良中的保护机制 | 本研究整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了肾上腺髓质素缺乏与炎症、自然杀伤细胞频率增加及内皮细胞和二型肺泡细胞频率下降之间的关系 | 本研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类情况 | 阐明肾上腺髓质素对支气管肺发育不良病理机制的影响 | 使用LPS诱导的小鼠实验模型研究肾上腺髓质素的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含肾上腺髓质素足量（野生型或基因敲除）和肾上腺髓质素单倍缺失（haplodeficient）小鼠的肺组织样本 |
| 11930 | 2024-08-04 |
LHFPL2 Serves as a Potential Biomarker for M2 Polarization of Macrophages in Renal Cell Carcinoma
2024-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25126707
PMID:38928412
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研究论文 | 本文探讨了LHFPL2在肾细胞癌中作为巨噬细胞M2极化的潜在生物标志物的作用 | 揭示了LHFPL2与肾细胞癌及其在巨噬细胞M2极化中的关系，并提出了潜在的靶向药物 | 尚未在体外或临床试验中验证LHFPL2作为生物标志物的有效性 | 研究LHFPL2在肾细胞癌中对巨噬细胞极化的影响及其作为癌症治疗靶点的潜力 | 研究对象为609名肾透明细胞癌患者的转录组数据及34,326个肾癌细胞的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 609名KIRC患者和34,326个肾癌细胞 |
| 11931 | 2024-08-05 |
Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18492
PMID:38890795
|
研究论文 | 本文探讨了miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用 | 首次揭示miR-874-3p通过靶向ATF3调控椎间盘退变的病理过程 | 仅在实验室环境和动物模型中验证，临床应用尚需进一步研究 | 研究miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的作用及机制 | 椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包含椎间盘退变患者和多种细胞类型的椎间盘退变大鼠样本 |
| 11932 | 2024-08-04 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2024-05-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03267-x
PMID:38773520
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法HATCHet2，用于从肿瘤的多样本群体DNA测序数据中同时推断克隆和单倍型特异的拷贝数异常。 | HATCHet2改进了早期HATCHet方法，通过引入新的统计量mhBAF来提高对焦点拷贝数异常的识别，并能识别镜像亚克隆CNAs。 | 该研究可能受限于从相对较小的样本中得出的结论，并未涵盖更广泛的样本多样性。 | 研究的目的是提高从肿瘤样本中推断拷贝数异常的准确性。 | 研究对象为来自10名前列腺癌患者的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 群体DNA测序 | HATCHet2 | 基因组数据 | 10个前列腺癌患者的肿瘤样本 |
| 11933 | 2024-08-05 |
Adipose-tissue regulatory T cells are a consortium of subtypes that evolves with age and diet
2024-Jan-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320602121
PMID:38227656
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研究论文 | 研究表明，脂肪组织中的调节性T细胞随着年龄和饮食的变化而演变 | 发现脂肪组织中存在功能上不同的调节性T细胞亚型，并且这些亚型在不同年龄和饮食下表现出不同的基因表达特征 | 未涉及具体的临床应用示例，仅在小鼠模型中进行研究 | 探索年龄和饮食对脂肪组织调节性T细胞异质性的影响 | 研究了小鼠的腹膜内脂肪组织中的调节性T细胞亚型 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和饮食的小鼠多个样本 |
| 11934 | 2024-08-04 |
Endothelial cell ferroptosis influences IDH wild-type glioblastoma growth in recurrent glioblastoma multiforme patients
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13961
PMID:38985083
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞铁死亡在复发性胶质母细胞瘤中的作用 | 本研究首次通过单细胞测序分析复发性胶质母细胞瘤中内皮细胞铁死亡的上调及其对肿瘤生长的影响 | 研究主要集中在内皮细胞与胶质母细胞瘤的相互作用，可能忽略了其它细胞类型的影响 | 理解复发性胶质母细胞瘤中肿瘤内变化驱动因素 | 分析复发性和原发性胶质母细胞瘤的内皮细胞铁死亡特征 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | 对两对原发性和复发性胶质母细胞瘤进行分析 |
| 11935 | 2024-08-05 |
M2 Macrophage Classification of Colorectal Cancer Reveals Intrinsic Connections with Metabolism Reprogramming and Clinical Characteristics
2024, Pharmacogenomics and personalized medicine
DOI:10.2147/PGPM.S458798
PMID:39011168
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研究论文 | 本文研究了结直肠癌中M2巨噬细胞的分类及其与代谢重编程和临床特征的内在联系 | 提出了一种独特的M2分类技术，并发现了代谢表型与免疫特征之间的关系 | 仍需进一步研究以确认所识别的基因特征在免疫与肿瘤代谢之间的关键作用 | 探讨结直肠癌中免疫细胞代谢演变的临床意义 | M2巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的代谢变化 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 | 混合聚类模型 | 基因表达数据 | 分析了来自TCGA和GEO数据集的多组样本 |
| 11936 | 2024-08-04 |
Integration of spatial and single-cell data across modalities with weak linkage
2023-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.12.523851
PMID:36711792
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研究论文 | 本文提出了一种新的跨模态数据集成方法MaxFuse，以解决单细胞和空间组学数据之间的弱链接问题 | MaxFuse方法通过迭代共同嵌入、数据平滑和细胞匹配来实现高质量的数据集成，即使在信息关联性较弱的情况下也能保持高鲁棒性和准确性 | 目前的方法依赖于高度相关的先验“链接”特征，当相关特征稀少或缺乏信息时，现有方法会失败 | 研究目的在于提升单细胞和空间组学数据的跨模态集成能力 | 研究对象主要是单细胞测序和空间蛋白组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 空间条形码技术 | NA | 多组学数据 | 通过对单细胞和空间真实多组学数据集的基准测试进行验证 |
| 11937 | 2024-08-05 |
Critical changes in hypothalamic gene networks in response to pancreatic cancer as found by single-cell RNA sequencing
2022-04, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2022.101441
PMID:35031523
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌对下丘脑基因网络的影响，特别是在癌症恶病质中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序分析了下丘脑在胰腺癌引起的恶病质响应中的细胞类型特异性变化 | 研究仅在小鼠模型中进行，临床转化仍需更多研究 | 揭示胰腺癌导致的恶病质对下丘脑的分子影响 | 小鼠模型的下丘脑及其对胰腺癌的响应 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型的具体样本数量未在摘要中提供 |
| 11938 | 2024-08-05 |
Geometric Sketching Compactly Summarizes the Single-Cell Transcriptomic Landscape
2019-06-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.05.003
PMID:31176620
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研究论文 | 本文介绍了一种通过几何素描来总结单细胞转录组特征的方法 | 提出了一种利用少量细胞数据增强单细胞数据分析的几何素描方法 | 研究中未提及的样本数量和其他细节的数据可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨如何加速和增强单细胞转录组数据的分析 | 针对脐带血细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 涉及脐带血细胞的一个小子集 |
| 11939 | 2024-08-05 |
Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial
2019-06-19, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20188746
PMID:31217225
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review | 本文详细介绍了单细胞RNA-seq分析的最佳实践和工作流程 | 提供了独立比较研究的基础上的最佳实践推荐，并整合到工作流程中 | 未提及具体案例的样本大小和类型 | 为单细胞RNA-seq分析领域的新手提供工作流程教程 | 聚焦于单细胞RNA-seq分析的预处理和下游分析步骤 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集、基因表达数据 | NA |
| 11940 | 2024-08-05 |
HSV-1 single-cell analysis reveals the activation of anti-viral and developmental programs in distinct sub-populations
2019-05-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.46339
PMID:31090537
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研究论文 | 本文结合活细胞成像和单细胞 RNA 测序，揭示了 HSV-1 感染中不同亚群的抗病毒和发育程序的激活。 | 揭示了在 HSV-1 感染中，感染细胞的转录异质性并识别出转录上独特的亚群体。 | 研究主要集中在初级人类细胞的感染，可能无法完全适用于其他类型细胞或感染方式。 | 研究 HSV-1 感染过程中的单细胞水平的病毒和宿主转录异质性。 | 主要研究初级人类细胞在 HSV-1 感染下的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序和活细胞成像 | NA | RNA 数据 | NA |