单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27901 篇文献，本页显示第 11901 - 11920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11901 | 2024-08-04 |
Identification of Marker Genes in Infectious Diseases from ScRNA-seq Data Using Interpretable Machine Learning
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115920
PMID:38892107
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研究论文 | 本文提出了一种早期诊断系统，用于区分免疫失调综合征的严重程度 | 通过可解释的机器学习方法识别感染相关的关键基因，能够区分不同感染程度 | 本文未提及样本量及数据来源的具体限制 | 构建用于识别感染严重程度的早期诊断系统 | 重点研究不同免疫细胞和基因在感染中的表达变化 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11902 | 2024-08-05 |
Sex-Based Mechanisms of Cardiac Development and Function: Applications for Induced-Pluripotent Stem Cell Derived-Cardiomyocytes
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115964
PMID:38892161
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研究论文 | 本文概述了性别在心脏发育和功能中的机制，并探讨了诱导多能干细胞衍生心肌细胞的应用 | 首次全面理解性别特异性心脏差异的机制 | 对性别差异的机制尚未完全阐明 | 研究性别在心脏生理和病理中的作用和机制 | 主要研究男性和女性的心脏发育及其功能的差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 诱导多能干细胞, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11903 | 2024-08-05 |
scZAG: Integrating ZINB-Based Autoencoder with Adaptive Data Augmentation Graph Contrastive Learning for scRNA-seq Clustering
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115976
PMID:38892162
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研究论文 | 本文提出了一种结合ZINB模型和自适应数据增强图对比学习的深度学习框架，用于单细胞RNA测序的聚类分析 | 创新地结合了ZINB模型去噪和自适应图对比学习，解决了单细胞RNA测序数据的高维稀疏性问题 | 可能未能充分涵盖所有潜在的高维拓扑结构 | 研究单细胞RNA测序数据的聚类分析方法 | 重点研究单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别和聚类 | 计算机视觉 | NA | ZINB模型，图对比学习 | APPNPGCN | 基因表达数据 | 10个常见的单细胞RNA测序数据集 |
| 11904 | 2024-08-04 |
Circadian Rhythm Disruption in Hepatocellular Carcinoma Investigated by Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-May-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115748
PMID:38891936
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研究论文 | 本研究通过整合分析大规模和单细胞RNA测序数据，探讨了肝细胞癌中的生物钟节律失调 | 首次结合大规模RNA转录组分析和单细胞测序，确定与生物钟节律失调相关的基因的表达变化 | 具体的细胞和分子机制尚不清楚 | 研究生物钟节律失调在肝细胞癌发生中的作用及其相关基因 | 肝细胞癌患者的CRD相关基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11905 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Metabolic Changes in Epithelial Glycosphingolipids and Establishes a Prognostic Risk Model for Pancreatic Cancer
2024-May-24, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics14111094
PMID:38893622
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析揭示了胰腺癌中上皮糖鞘脂代谢的变化，并建立了预后风险模型 | 首次将上皮糖鞘脂代谢与胰腺癌的预后联系起来，建立了基于六基因的预后模型 | 该研究的样本量及其外部验证的数据库可能限制了结果的广泛适用性 | 探索胰腺癌中糖鞘脂代谢的变化及其与患者预后的关系 | 胰腺腺癌组织中的上皮细胞及其代谢特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞代谢数据 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据，具体样本数量未提供 |
| 11906 | 2024-08-05 |
Unraveling Divergent Transcriptomic Profiles: A Comparative Single-Cell RNA Sequencing Study of Epithelium, Gingiva, and Periodontal Ligament Tissues
2024-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115617
PMID:38891804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序研究牙周组织的转录组特征 | 首次揭示了牙周组织的层次结构和环境因素对细胞组成的影响 | 样本量较小，仅涉及7个组织样本，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在识别牙周特异性标记以深入了解牙周病理生理 | 主要研究人类牙周韧带、牙龈和上皮组织的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 7个组织样本 |
| 11907 | 2024-08-05 |
New Insight into Intestinal Mast Cells Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2024-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115594
PMID:38891782
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综述 | 本综述总结了单细胞转录组学研究如何为肠道肥大细胞的发育及其在健康和疾病中的功能角色提供了见解 | 使用单细胞RNA测序技术揭示的肠道肥大细胞的起源、分化及其表型和功能 | 关于肥大细胞生物学的若干方面尚待澄清 | 探讨肥大细胞的起源、分化及其在不同组织中的功能 | 肠道肥大细胞亚群及其在健康与疾病中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤进展 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11908 | 2024-08-04 |
Identification of apoptosis-immune-related gene signature and construction of diagnostic model for sepsis based on single-cell sequencing and bulk transcriptome analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1389630
PMID:38894720
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研究论文 | 本文探讨了与凋亡免疫相关的基因特征及其在脓毒症诊断模型中的应用 | 本文首次识别了11个凋亡相关基因作为脓毒症的特征诊断标志，并构建了相应的预后模型 | 本研究主要依赖于基因表达数据和小鼠模型，可能限制了在临床应用中的直接转化 | 研究目的在于识别与脓毒症相关的凋亡基因并建立诊断模型 | 研究对象为脓毒症基因表达数据及相应的动物模型 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序和大规模转录组分析 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多项外部数据集和小鼠模型的分析 |
| 11909 | 2024-08-04 |
SinglePointRNA, an user-friendly application implementing single cell RNA-seq analysis software
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300567
PMID:38889133
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研究论文 | 该文章介绍了SinglePointRNA，这是一个用户友好的单细胞RNA测序分析应用程序 | SinglePointRNA提供了一个图形界面，简化了单细胞RNA-seq数据的分析过程，降低了对用户数学和编程技能的要求 | 该应用程序对复杂分析的先前知识仍然有一定要求，可能不适合所有用户 | 开发一个可访问的工具集，帮助研究者自主进行单细胞RNA-seq数据的详细分析 | 单细胞RNA-seq数据的分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据集 | NA |
| 11910 | 2024-08-05 |
Autoimmune uveitis attenuated in diabetic mice through imbalance of Th1/Th17 differentiation via suppression of AP-1 signaling pathway in Th cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347018
PMID:38887289
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响 | 首次揭示了糖尿病小鼠中Th1细胞分化的选择性抑制与AP-1信号通路下调的关系 | 仅使用小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理机制 | 研究糖尿病对器官特异性自身免疫疾病的影响 | 使用C57BL/6和Ins2Akita小鼠模型研究炎症和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | C57BL/6和Akita小鼠模型 |
| 11911 | 2024-08-05 |
Establishment of a prognostic model for hypoxia-associated genes in OPSCC and revelation of intercellular crosstalk
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371365
PMID:38887298
|
研究论文 | 该文章建立了一个与缺氧相关的预后模型，并揭示了细胞间的相互作用 | 提出了将缺氧亚型与免疫微环境和临床特征相结合的新方法 | 样本量和数据来源可能限制了模型的广泛适用性 | 探讨缺氧对口咽鳞状细胞癌（OPSCC）预后的影响 | OPSCC患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 口咽癌 | scRNA-seq, WGCNA, CIBERSORT | Cox模型, LASSO | 基因组数据 | 来源于GEO的OPSCC整体测序数据 |
| 11912 | 2024-08-05 |
Integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq to explore the differentiation mechanism of human nail stem cells mediated by onychofibroblasts
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1416780
PMID:38887517
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研究论文 | 该研究探讨了人类指甲干细胞（NSC）由指甲成纤维细胞（OF）介导的分化机制 | 首次揭示了指甲成纤维细胞在调节指甲干细胞分化中的作用，并确定了BMP4信号通路的关键角色 | 对指甲成纤维细胞细胞特性和转录组学特征的理解仍有限 | 研究人类指甲成纤维细胞的特性及其在指甲干细胞分化中的作用 | 人类指甲成纤维细胞和干细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 三种来自人类指甲单位的指甲成纤维细胞样本和对照成纤维细胞 |
| 11913 | 2024-08-05 |
Evaluation of nanoscale versus hybrid micro/nano surface topographies for endosseous implants
2024-01-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2023.10.030
PMID:37918471
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研究论文 | 我们研究了纳米级钛表面形态对粘附性间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞功能的影响 | 首次利用单细胞RNA测序识别植入表面的早期细胞群体，揭示了纳米级表面对骨形成过程的特异性影响 | 未明确提到样本的来源和数量，可能影响结果的广泛应用 | 研究纳米级表面形态对骨整合过程中细胞和组织水平的影响 | 粘附性间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养实验和体内实验数据 | NA |
| 11914 | 2024-08-05 |
ScnML models single-cell transcriptome to predict spinal cord neuronal cell status
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1413484
PMID:38894722
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研究论文 | 本研究开发了一种机器学习预测模型ScnML，用于预测脊髓神经细胞的亚群体和标记基因。 | ScnML模型通过XGBoost算法在预测中实现了高度准确性，并发现了新的重要基因，提升了脊髓神经细胞状态预测的潜力。 | 现有实验技术识别脊髓神经细胞发展过程依然存在劳动密集和成本高的问题。 | 准确识别脊髓神经细胞的细胞状态，以促进新治疗和康复策略的发展。 | 脊髓神经细胞的亚群体及标记基因。 | 机器学习 | NA | XGBoost | NA | 转录组数据 | 训练数据集的准确率为94.33%，测试数据集的准确率为94.08%至94.26%不等 |
| 11915 | 2024-08-04 |
Immune mechanisms shape the clonal landscape during early progression of prostate cancer
2023-06-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.010
PMID:37148881
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在前列腺癌早期进展中调节肿瘤克隆景观的作用 | 研究展示了肿瘤中的多克隆景观与微环境的关系，并揭示了免疫编辑在克隆生存中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探讨免疫微环境如何影响肿瘤内异质性和克隆景观 | 主要研究了前列腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和克隆动态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型 | NA | NA | 使用了基因工程小鼠模型进行研究 |
| 11916 | 2024-08-05 |
Targeting BMP2 for therapeutic strategies against hepatocellular carcinoma
2024-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101970
PMID:38797016
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研究论文 | 本研究探讨了BMP2在肝细胞癌（HCC）生长和转移中的作用 | 文章创新性地结合了单细胞RNA测序和整体RNA测序来分析BMP2在HCC中的关键作用 | NA | 研究BMP2在肝细胞癌进展中的作用，评估其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌细胞系Huh-7及其相关的HCC模型 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11917 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing to classify and characterize tumor subgroups in bulk RNA-sequencing data
2024-Jul, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04710-6
PMID:38811523
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研究论文 | 本研究提出了一种名为CLIPPR的算法，用于从大规模转录组数据中分类和特征化肿瘤亚组 | 通过结合单细胞模型、RNA推断的拷贝数变异信号和初始大规模模型，CLIPPR算法展示了其在肿瘤分类方面的优势 | 虽然CLIPPR算法在整体准确性方面表现优越，但在某些情况下仍可能面临分类准确性有限的问题 | 提升癌症亚组的分类准确性，以便实现个性化治疗 | 研究针对脑膜瘤的分类，并包括多达789个样本的肿瘤数据 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | CLIPPR元模型 | 转录组数据 | 77个样本和约10,000个单细胞，以及789个肿瘤样本和711个TCGA胶质瘤样本 |
| 11918 | 2024-08-05 |
Single-cell technologies in psoriasis
2024-Jul, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110242
PMID:38750947
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综述 | 本文综述了单细胞技术在牛皮癣研究中的应用 | 介绍了单细胞技术在了解牛皮癣发病机制中的新进展 | 未提及具体的实验结果或数据 | 探讨牛皮癣的发病机制 | 牛皮癣相关的免疫细胞及其与皮肤实质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞转录组、蛋白组和代谢组 | NA | NA | NA |
| 11919 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq reveals dark- and light-induced differentially expressed gene atlases of seedling leaves in Arachis hypogaea L
2024-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14306
PMID:38391124
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研究论文 | 本文探讨了花生种子叶在暗光条件下的不同基因表达图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统性研究花生在光照条件下的基因表达变化 | 研究可能未覆盖所有潜在的基因调控机制 | 探明花生种子叶在不同光照条件下的基因表达及其调控机制 | 主要研究对象为一周大的花生幼苗叶片的单细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 13409和11296个单细胞 |
| 11920 | 2024-08-05 |
Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway
2024-Jul, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31376
PMID:38450771
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研究论文 | 该文章探讨了在近端气道中的适应性免疫应答的相似性网络分析 | 首次通过单细胞RNA测序和相似性网络分析，揭示了iSGS患者气道中的T细胞克隆及其抗原靶标 | 样本量有限，研究仅针对特定患者群体，可能不具备普遍性 | 研究近端气道黏膜中T细胞受体的解剖分布和抗原靶标 | 自主性亚声门狭窄患者的匹配疤痕和未受影响的黏膜 | 数字病理学 | 气道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 32名自主性亚声门狭窄患者和10名健康对照 |