单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 11901 - 11920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11901 | 2024-08-05 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-Apr-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
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研究论文 | 本研究识别了导致综合性牙缺失的新型SOX4基因突变 | 首次报告了导致综合性牙缺失的SOX4错义突变 | 研究中可能未充分探索其他潜在的调控机制 | 识别Coffin-Siris综合症中导致牙缺失的致病突变并探索调控机制 | 研究对象为表现出牙缺失的Coffin-Siris综合症患者 | 数字病理学 | 综合性疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 1名中国Coffin-Siris综合症患者 |
| 11902 | 2024-08-04 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.03.556122
PMID:37732188
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研究论文 | 本文提出Polaris，一个用于图像基础空间转录组分析的分析管道 | 结合深度学习模型进行细胞分割和点检测，以及概率基因解码器以准确量化单细胞基因表达 | NA | 开发一个无缝的解决方案用于分析空间转录组数据 | 图像基础空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | NA |
| 11903 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2883310/v1
PMID:37205420
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 | SRP-001作为一种小分子药物，具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404，展现出与传统镇痛药相比的创新效果 | 研究主要集中在转录组学的分析上，未提供大规模的临床验证数据 | 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 | 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 11904 | 2024-08-05 |
Dedifferentiation maintains melanocyte stem cells in a dynamic niche
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05960-6
PMID:37076619
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研究论文 | 该文章研究了黑色素干细胞在动态微环境中的去分化现象 | 文章提出黑色素干细胞在发育和成熟过程中在不同状态间转变的机制，挑战了现有理论 | 研究未详细探讨外部因素如何影响黑色素干细胞的迁移和去分化 | 探索黑色素干细胞如何在动态微环境中维持 | 黑色素干细胞及其在毛囊中的行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | NA | NA |
| 11905 | 2024-08-05 |
Delineating the transcriptional landscape and clonal diversity of virus-specific CD4+ T cells during chronic viral infection
2022-10-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80079
PMID:36255051
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研究论文 | 本文研究了慢性病毒感染过程中病毒特异性CD4 T细胞的转录景观和克隆多样性 | 识别了在感染高峰期形成的Th1、Tfh和记忆样T细胞亚群中多个转录明显不同的状态，包括一个新的具有细胞杀伤特征的Slamf7亚群 | 尚未充分研究细胞内因子如TCR使用对CD4 T细胞命运承诺的影响 | 探究慢性病毒感染中CD4 T细胞的转录特征及其克隆多样性 | 病毒特异性CD4 T细胞，孤立于慢性淋巴细胞脉络膜脑膜炎病毒感染的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | NA | NA |
| 11906 | 2024-08-05 |
Metabolic transitions define spermatogonial stem cell maturation
2022-08-25, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac157
PMID:35856882
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研究论文 | 本研究表明人类青春前的生精细胞经历了从氧化磷酸化到厌氧代谢的显著代谢转变。 | 首次揭示了青春期前人类生精干细胞的代谢特征及其向成人代谢转变的机制。 | 人类青春前组织样本稀缺，每个年龄组样本数量有限，功能状态仅通过基因富集分析给出指示。 | 探讨生精细胞在青春前发展期间是否经历代谢改变。 | 研究对象包括人类青春前的生精细胞、鼠类和猪的生精细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 总共分析了来自3只幼鼠和2只成年鼠的生精细胞，以及不同年龄的人类生精细胞 |
| 11907 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals karyotype heterogeneity in murine and human malignancies
2016-05-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0971-7
PMID:27246460
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研究论文 | 本文探讨了小鼠和人类恶性肿瘤中的核型异质性 | 采用新开发的单细胞全基因组测序平台揭示了肿瘤细胞间的拷贝数异质性 | 文章未提及具体的样本量和是否涉及其他类型的肿瘤 | 研究染色体不稳定性在恶性肿瘤中的影响 | 以小鼠T细胞淋巴瘤和人类B细胞白血病为对象 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞全基因组测序 (scWGS) | NA | 基因组数据 | 小鼠T细胞淋巴瘤样本和人类B细胞白血病样本 |
| 11908 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
|
研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道，用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准，并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中，所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 |
| 11909 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
|
研究论文 | 本研究探讨了在动脉粥样硬化进展过程中单细胞基因表达模式的临床和病理生理相关性 | 首次通过整合高基因丰度的单细胞亚群与冠状动脉疾病基因调控网络，确认GRN39在促进晚期、症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 对单细胞转录组数据的详细理解仍然不足，且临床适用性需要进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化发病机制的细胞遗传调控网络 | 在Ldlr-/-Apob100/100小鼠模型和人类样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16588个单细胞和600名冠状动脉疾病患者的基因组数据 |
| 11910 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类，强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型，并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 |
| 11911 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
|
研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台，以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞，约600种代谢物 |
| 11912 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11913 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
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研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器，以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据，生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 |
| 11914 | 2024-08-05 |
Deciphering infected cell types, hub gene networks and cell-cell communication in infectious bronchitis virus via single-cell RNA sequencing
2024-May, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012232
PMID:38743760
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性研究感染性支气管炎病毒对细胞类型和细胞间通讯的影响 | 首次系统性鉴定了特定细胞类型中表达的组织特异性分子标志物和相应的基因网络 | 未提及样本数量的具体细节及其在研究中的影响 | 探讨感染性支气管炎病毒在小鸡中的致病机制及其对免疫反应的影响 | 研究感染性支气管炎病毒感染后的肾脏、法氏囊和气管组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11915 | 2024-08-05 |
Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002633
PMID:38787797
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研究论文 | 本文探讨了将系统发育整合到单细胞RNA测序分析中的应用，以比较物种、基因和细胞之间的联系 | 提出了将系统发育方法整合进scRNA-seq分析中，以克服物种间比较的挑战并加强基因和细胞演化假设的验证 | NA | 实现跨物种、基因和细胞的比较，揭示细胞基因表达与细胞功能演化之间的联系 | 单细胞RNA测序数据及其在不同物种和细胞中的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 系统发育树 | RNA序列 | NA |
| 11916 | 2024-08-05 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
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研究论文 | 这项研究展示了HIV感染患者肠道粘膜免疫细胞的转录组特征 | 研究发现免疫非应答者在肠道浆细胞的比例低于免疫应答者，并探讨了记忆B细胞和滤泡B细胞向浆细胞转化的障碍 | 样本数量有限，只有少数免疫非应答者被纳入研究 | 探讨HIV感染患者中的肠道粘膜免疫细胞在免疫恢复中的作用 | 研究对象包括HIV阴性对照、免疫应答者和免疫非应答者 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据及免疫细胞分析数据 | 54,475个免疫细胞来自五个HIV阴性对照、九个免疫应答者和三个免疫非应答者 |
| 11917 | 2024-08-05 |
Immunological Characteristics of Hepatic Dendritic Cells in Patients and Mouse Model with Liver Echinococcus multilocularis Infection
2024-Apr-25, Tropical medicine and infectious disease
IF:2.8Q1
DOI:10.3390/tropicalmed9050095
PMID:38787028
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研究论文 | 本文探讨了肝脏包虫感染患者和小鼠模型中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 首次系统分析了肝脏树突状细胞亚群在肝脏包虫感染中表现出的免疫表型特征 | 未深入探讨不同小鼠模型对免疫特征的影响 | 研究肝脏包虫感染微环境中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 临床包虫感染患者和小鼠模型中的肝脏树突状细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 组织样本 | 四个包虫感染患者标本和感染小鼠模型 |
| 11918 | 2024-08-05 |
Identification of GPI-anchored protein LYPD1 as an essential factor for odontoblast differentiation in tooth development
2023-05, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104638
PMID:36963497
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研究论文 | 本研究识别了GPI锚定蛋白LYPD1作为牙齿发育中牙本质细胞分化的关键因素 | LYPD1被发现是发育中牙齿中前牙本质细胞的新标记，并且在通过其GPI-AP功能调节Smad1/5/8磷酸化以促进牙本质细胞分化中扮演重要角色 | 研究仅在小鼠牙髓细胞和外源性器官培养系统中验证，可能无法完全概括人类牙齿发育机制 | 探讨脂质筏对牙齿发育的具体影响，并确认LYPD1在牙本质细胞分化中的作用 | 通过微阵列和单细胞RNA测序方法研究前牙本质细胞以及相关的信号传导机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠牙髓细胞和牙胚的外源性器官培养 |
| 11919 | 2024-08-04 |
Proteomic Profiling of Fallopian Tube-Derived Extracellular Vesicles Using a Microfluidic Tissue-on-Chip System
2023-Mar-27, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10040423
PMID:37106610
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研究论文 | 本研究建立了一种微流控平台来培养人类输卵管上皮以收集细胞外囊泡，并首次报告了295种常见的输卵管衍生小细胞外囊泡蛋白 | 首次描述了由人类输卵管衍生的小细胞外囊泡蛋白质组成及其与腺癌转录组的关联 | 目前对hFTE衍生的小细胞外囊泡的内容和功能理解有限 | 旨在揭示输卵管来源的小细胞外囊泡的基线蛋白质谱以及其在卵巢癌发生中的潜在作用 | 研究对象是人类输卵管上皮和其衍生的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱分析 | 微流控组织芯片 | 蛋白质 | 295种小细胞外囊泡蛋白 |
| 11920 | 2024-08-05 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
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研究论文 | 本研究揭示了MC1R信号传导缺失如何通过TBX3影响红色头发颜色（RHC）性状和黑色素瘤的易感性 | 首次发现TBX3在红色头发颜色性状中的作用，并揭示其与黑色素瘤易感性之间的关系 | 研究主要基于小鼠模型，结果是否完全适用于人类尚需进一步验证 | 探究MC1R信号传导缺失如何通过改变黑色素生成影响黑色素瘤的易感性 | 研究对象为来自RHC小鼠模型的黑素细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 通过RHC小鼠模型提取的黑素细胞 |