单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 11901 - 11920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11901 | 2024-08-05 |
Resident vascular Sca1+ progenitors differentiate into endothelial cells in vascular remodeling via miR-145-5p/ERG signaling pathway
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110080
PMID:38883819
|
研究论文 | 这篇文章研究了血管重塑中Sca1+前体细胞如何通过miR-145-5p/ERG信号通路分化为内皮细胞。 | 文章创新点在于揭示了Sca1细胞在血管重塑中的分化过程及其受miR-145-5p/ERG通路的负调控。 | 本研究的局限性在于未完全阐明Sca1细胞的所有潜在起源及机制。 | 研究的目的是探讨Sca1+前体细胞向内皮细胞分化的机制。 | 研究对象为小鼠模型中的Sca1+前体细胞及其在血管重塑过程中的作用。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型中的Sca1+前体细胞 |
| 11902 | 2024-08-05 |
Decoding temporal heterogeneity in NSCLC through machine learning and prognostic model construction
2024-Jun-13, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-024-03435-0
PMID:38872167
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中的时间异质性及其预后模型的构建 | 首次结合cNMF和XGBoost进行NSCLC细胞功能模块分类及标记基因选择，并建立了基于基因的风险评分模型 | 研究范围可能受限于所选择的样本数量及其异质性，影响结果的普适性 | 识别与非小细胞肺癌进展相关的时间异质性生物标志物 | 93,406个来自22名非小细胞肺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析，XGBoost，cNMF，LASSO回归 | XGBoost | 转录组数据 | 93,406个细胞，来自22名患者 |
| 11903 | 2024-08-05 |
IPF-related new macrophage subpopulations and diagnostic biomarker identification - combine machine learning with single-cell analysis
2024-Jun-13, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02845-8
PMID:38872139
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研究论文 | 本研究分析了特发性肺纤维化(IPF)患者的单细胞转录组测序数据，识别了IPF相关的巨噬细胞亚群并探讨其分子特征和生物功能 | 首次识别了IPF特有的ATP5-MΦ巨噬细胞亚群及其特征基因，揭示了其与氧化磷酸化和质子跨膜转运的关联 | 对巨噬细胞的异质性和分子特征的理解仍然有限，临床相关性待进一步验证 | 探讨IPF患者巨噬细胞的分子特征及其在疾病预后中的价值 | 特发性肺纤维化患者的肺组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | 机器学习 | 基因组数据 | IPF患者肺组织中的单细胞样本 |
| 11904 | 2024-08-05 |
The Contribution of Meckel's Cartilage-Derived Type II Collagen-Positive Cells to the Jawbone Development and Repair
2024-Jun-05, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241259059
PMID:38836522
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研究论文 | 本研究探讨了麦克尔软骨来源的II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的贡献 | 首次揭示了II型胶原阳性细胞在下颌骨形成和再生中的关键作用 | 研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 阐明II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复过程中的功能 | 分析小鼠在胚胎第10.5天的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠样本 |
| 11905 | 2024-08-04 |
Oxytocin alleviates liver fibrosis via hepatic macrophages
2024-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101032
PMID:38882603
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研究论文 | 这项研究探讨了催产素通过肝巨噬细胞缓解肝纤维化的机制 | 首次揭示了催产素在肝脏中调节巨噬细胞表型的新路径 | 研究主要集中在小鼠模型，临床应用效果尚需验证 | 研究催产素在肝纤维化中的作用及其机制 | 使用小鼠模型来研究肝纤维化和巨噬细胞的表型变化 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 细胞群体数据 | 使用若干肝纤维化小鼠模型 |
| 11906 | 2024-08-04 |
Development of Novel Models of Aggressive Variants of Castration-resistant Prostate Cancer
2024-Jun, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2023.10.011
PMID:38433714
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研究论文 | 本研究开发了代表侵袭性去势抵抗性前列腺癌新模型 | 提出了新的前临床模型，包括患者来源的异种移植（PDX）、PDX衍生的类器官（PDXO）和患者来源的类器官（PDO） | 样本量有限，且主要集中于特定的前列腺癌亚型 | 开发新的预临床模型并为新药评估制定策略 | 51名转移性前列腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 全外显子测序（WES）、RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序 | PDX、PDXO、PDO | 基因组数据和药物敏感性数据 | 51名患者，建立了20个前临床模型（5个NEPC、7个DDR、1个MSI-high PDX，16个PDXO和6个PDO） |
| 11907 | 2024-08-04 |
Blocking OLFM4/galectin-3 axis in placental polymorphonuclear myeloid-derived suppressor cells triggers intestinal inflammation in newborns
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112058
PMID:38613883
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研究论文 | 该研究报告了胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的密切关系 | 首次揭示了OLFM4/凝集素-3轴在胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的重要作用 | 该研究未能探讨ELF（外源性生长因子）对结果的潜在影响 | 研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症的关联 | 主要研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞及其对子代的新生儿肠道炎症的影响 | 数字病理学 | 新生儿坏死性肠炎 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括缺乏Olfm4的小鼠母体和健康小鼠的胎盘样本 |
| 11908 | 2024-08-05 |
IFI30 as a key regulator of PDL1 immunotherapy prognosis in breast cancer
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112093
PMID:38669947
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研究论文 | 本研究探讨了IFI30在乳腺癌中的作用及其与PD-L1免疫治疗的预测关系 | 揭示了IFI30在乳腺癌组织中表达上调，并与肿瘤分期和预后显著相关，同时还发现其与免疫相关信号通路的显著关联 | 本研究的具体机制和IFI30与PD-L1轴之间的关系仍不清晰 | 研究IFI30在乳腺癌中的作用及其对PD-L1表达和T细胞浸润的影响 | 乳腺癌组织中的IFI30表达及其与PD-L1的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | RNA，蛋白质 | 通过TCGA和GTEx数据库以及自制的乳腺癌组织微阵列进行分析 |
| 11909 | 2024-08-04 |
LoRA-TV: read depth profile-based clustering of tumor cells in single-cell sequencing
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae277
PMID:38877886
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研究论文 | 本研究提出了一种基于单细胞测序数据读深度特征的肿瘤细胞聚类新方法LoRA-TV | LoRA-TV利用低秩优化和鲁棒平滑方法聚合共享的基因组特征，以提高肿瘤细胞聚类性能 | NA | 研究如何通过单细胞测序揭示肿瘤细胞群体的异质性 | 肿瘤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 模拟数据和实际数据 | NA |
| 11910 | 2024-08-07 |
scRNA-seq: oh, the joys
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02263-0
PMID:38654084
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11911 | 2024-08-04 |
TGFβ-Responsive Stromal Activation Occurs Early in Serrated Colorectal Carcinogenesis
2024-Apr-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094626
PMID:38731846
|
研究论文 | 该研究揭示了TGFβ激活的基质在锯齿状结直肠癌发生中的作用 | 文章提出了TGFβ依赖的基质激活在锯齿状肿瘤发生早期的关系 | 未提及具体的实验验证或临床相关性 | 阐明TGFβ激活的基质在锯齿状癌发生中的贡献 | 研究对象为39个结直肠癌样本和12个大规模转录组样本，分析其基质细胞的转录特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39个结直肠癌样本和2014个其他样本 |
| 11912 | 2024-08-05 |
Changes in seminal plasma microecological dynamics and the mechanistic impact of core metabolite hexadecanamide in asthenozoospermia patients
2024-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.166
PMID:38882497
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研究论文 | 本研究探讨了在精液微生态动态变化中核心代谢物十六烷酰胺对弱精子症患者的影响 | 揭示了精液中六种微生物属与核心代谢物十六烷酰胺之间的显著关联，及其提高精子活力的潜力 | 尚未清楚微生态与男性不育的直接关系 | 研究精液微生态动态与弱精子症之间的关系 | 弱精子症患者，分为正常、轻度、中度和重度四组 | 数字病理学 | 男性不育症 | 16S rDNA测序和多组学分析 | NA | 精液样本 | 四组弱精子症患者，具体样本量未提及 |
| 11913 | 2024-08-04 |
Preliminary Analysis of Aging-Related Genes in Intracerebral Hemorrhage by Integration of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Technology
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S457480
PMID:38883702
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研究论文 | 本研究旨在识别与脑内出血相关的潜在老龄化相关基因。 | 识别了24个特定于脑内出血的老龄化相关基因，提供了老龄化影响脑内出血机制的新见解。 | 样本量较小，分析结果可能限制于特定数据集。 | 探索老龄化在脑内出血发病机制中的作用。 | 四例脑内出血患者的周围血肿组织样本。 | 数字病理学 | 脑内出血 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名脑内出血患者的样本 |
| 11914 | 2024-08-05 |
Expression and clinical significance of interleukin-6 pathway in cholangiocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374967
PMID:38881895
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研究论文 | 本研究探讨了IL-6通路在胆管癌中的表达及其临床意义 | 本研究首次揭示了IL-6通路在胆管癌肿瘤微环境中的表达特征及其与预后的相关性 | 未发现基因表达与总体生存率及无病生存率直接相关，但关系的进一步机制尚需探讨 | 研究IL-6通路在胆管癌中的潜在预后价值 | 胆管癌组织微阵列中的IL-6及相关分子的表达 | 数字病理学 | 胆管癌 | 多重免疫荧光 | NA | 组织样本 | NA |
| 11915 | 2024-08-05 |
Identification of an 11-miRNA-regulated and surface-protein genes signature predicts the prognosis of lung adenocarcinoma based on multi-omics study
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CWMT4815
PMID:38883394
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研究论文 | 本研究开发了一种基于11个miRNA调控的表面蛋白基因的风险评分系统，以预测肺腺癌的预后 | 研究首次结合多组学分析，识别出与肺腺癌预后相关的特定miRNA及基因 | 研究结果可能受限于样本的选择和外部验证的准确性 | 改善肺腺癌患者的预后评估工具 | 聚焦于肺腺癌相关的miRNA和表面蛋白基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据进行验证 |
| 11916 | 2024-08-04 |
Comparative Analysis of Single-cell and Single-nucleus RNA-sequencing in a Rabbit Model of Retinal Detachment-related Proliferative Vitreoretinopathy
2023-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2023.100335
PMID:37496518
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研究论文 | 本研究比较了兔子模型中与视网膜脱离相关的增生性玻璃体视网膜病的单细胞和单核RNA测序 | 创新点在于结合使用单细胞RNA测序和单核RNA测序，以更准确地识别与增生性玻璃体视网膜病相关的转录网络 | 两种RNA测序技术的局限性均被强调，特别是在细胞类型捕获率方面 | 研究增生性玻璃体视网膜病的发病机制 | 使用兔子模型诱导的单侧增生性玻璃体视网膜病变 | 数字病理学 | 增生性玻璃体视网膜病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 兔子眼睛的增生性玻璃体视网膜病样本及对侧眼作为对照 |
| 11917 | 2024-08-04 |
Proteostasis governs differential temperature sensitivity across embryonic cell types
2023-11-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.10.013
PMID:37949057
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研究论文 | 本文研究了不同胚胎细胞类型对温度敏感性的差异 | 首次使用全动物单细胞RNA测序识别驱动表型变异的细胞类型和分子程序 | 目前未探讨其他环境压力对胚胎发育的影响 | 探究温度压力对胚胎细胞类型的影响及其敏感性的基础 | 研究斑马鱼胚胎在温度压力下的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 数百个斑马鱼胚胎 |
| 11918 | 2024-08-05 |
People critically ill with COVID-19 exhibit peripheral immune profiles predictive of mortality and reflective of SARS-CoV-2 lung viral burden
2021-12-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100476
PMID:34873589
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研究论文 | 本文研究了COVID-19重症患者的外周免疫状态与死亡率之间的关联 | 采用单细胞RNA测序对免疫状态进行高维剖析，揭示了与COVID-19死亡率相关的细胞分子特征 | 可能未能考虑所有潜在的免疫细胞状态和不同的临床变量 | 旨在阐明重症COVID-19患者的免疫细胞状态与死亡的关系 | 重症COVID-19患者的血液和呼吸样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 血液和呼吸样本 | 重症COVID-19患者的高维样本 |
| 11919 | 2024-08-05 |
A biomechanical switch regulates the transition towards homeostasis in oesophageal epithelium
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00679-w
PMID:33972733
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研究论文 | 这篇文章探讨了机械应力如何调节食管上皮向稳态过渡的机制 | 揭示了机械应力对KLF4细胞群体的影响，从而平衡细胞增殖并标志着稳态的过渡 | 目前尚未完全了解调控细胞决策的所有过程 | 研究食管上皮细胞在后出生阶段如何响应机械应力以达到稳态 | 小鼠食管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 11920 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of the immune microenvironment in pediatric acute leukemia
2024-Aug-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217018
PMID:38844062
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研究论文 | 该文章对儿童急性白血病的免疫微环境进行了单细胞转录组分析 | 揭示了不同T细胞亚群与急性髓性白血病（AML）进展和复发相关的特定功能表达程序，并识别了潜在的免疫治疗靶点 | 文章未提到样本的地理分布和数量限制 | 深入分析儿童白血病中的肿瘤微环境以改善免疫治疗的有效性 | 主要研究儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）和急性髓性白血病（AML）患者的骨髓来源T细胞 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 儿童B-ALL和AML患者的样本，具体数量未提及 |