单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 11901 - 11920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11901 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder
2019-01-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-07931-2
PMID:30674886
|
研究论文 | 本文提出了一种深度计数自编码器网络用于单细胞RNA测序数据的去噪 | 引入了一种考虑计数分布、过度离散和稀疏性的深度计数自编码器网络，使用负二项噪声模型处理数据 | 本文未提及具体的局限性 | 开发一种可扩展的方法来对单细胞RNA测序数据进行去噪 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 深度计数自编码器 | RNA测序数据 | 数百万个细胞的数据集 |
| 11902 | 2024-08-05 |
Gene expression variability across cells and species shapes innate immunity
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0657-2
PMID:30356220
|
研究论文 | 该文章探讨了不同物种和细胞之间先天免疫反应的转录差异及表达变异 | 文章揭示了先天免疫反应的转录性差异及细胞间的表达可变性，尤其是在细胞因子和趋化因子编码基因方面的发现 | 论文未详细描述在不同物种间的基因表达调控机制的具体过程 | 研究不同物种和细胞中先天免疫反应的转录特征 | 研究对象为不同物种中的成纤维细胞和单核吞噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 不同物种的成纤维细胞和单核吞噬细胞样本，具体数量未说明 |
| 11903 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Uncovers a Robust Transcriptional Response to Morphine by Glia
2018-09-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.08.080
PMID:30257220
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质细胞对吗啡的转录反应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了少突胶质细胞和星形胶质细胞对吗啡的特异性转录响应 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能无法直接推广到其他物种 | 调查特定细胞类型对吗啡的转录反应 | 小鼠的核壳，特别关注少突胶质细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 药物成瘾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠的核壳样本，数量未具体说明 |
| 11904 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome landscape elucidates the cellular and developmental responses to tomato chlorosis virus infection in tomato leaf
2024-Jul, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.14906
PMID:38619176
|
研究论文 | 该研究揭示了病毒感染对番茄叶片细胞和发育的反应。 | 首次利用单细胞RNA测序分析病毒感染阶段的细胞类型特异性表达和表观遗传特征。 | 未探讨不同环境条件下病毒感染对细胞响应的影响。 | 研究植物细胞在病毒感染下的发育和响应机制。 | 健康和番茄黄化病毒感染的番茄叶片中的23226个单个细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 23226个单个细胞 |
| 11905 | 2024-08-04 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-May-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
|
研究论文 | 本文展示了靶向BCL9/BCL9L通过促进常规1型树突细胞的激活和肿瘤渗透来增强抗原呈递的效果 | 发明了一种新的抑制剂hsBCL9，表明其在抑制肿瘤生长和促进抗肿瘤CD8 T细胞反应方面的有效性 | 对BCL9/BCL9L在肿瘤中是否损害抗原呈递的机制仍未完全理解 | 研究BCL9/BCL9L在抗肿瘤免疫中的作用及其对抗原呈递的影响 | 探讨BCL9/BCL9L的靶向对常规1型树突细胞的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 药理抑制及单细胞转录组学分析 | NA | 细胞分析数据 | 使用Bcl9/Bcl9l敲除小鼠和野生型小鼠进行比较分析 |
| 11906 | 2024-08-04 |
Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48282-5
PMID:38729950
|
研究论文 | 本研究介绍了一种成本效益高的疾病建模方法，结合了混合的肿瘤类器官和单细胞RNA测序技术 | 提出了一种计算方法Vireo-bulk，有效分解混合RNA-seq数据，并揭示了供体iPSC系在巨噬细胞分化过程中的异质性 | 研究中未提及具体样本量和其他潜在的实验限制 | 旨在通过混合的bulk和单细胞RNA测序技术提高疾病建模的成本效益 | 以同源诱导多能干细胞分化的类器官为研究对象，探索疾病机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA |
| 11907 | 2024-08-05 |
Investigation of ENO2 as a promising novel marker for the progression of colorectal cancer with microsatellite instability-high
2024-May-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12332-4
PMID:38724951
|
研究论文 | 本研究探讨了ENO2作为微卫星不稳定高（MSI-H）结直肠癌进展的潜在新标志物。 | 该研究首次揭示了ENO2在MSI-H结直肠癌中的中心基因作用，并建立了基于ENO2的预后预测模型。 | 该研究仅基于单细胞RNA测序数据，临床验证可能需要更多样本与多中心数据支持。 | 探索微卫星不稳定高结直肠癌的代谢转录组相关亚型并识别预后生物标志物。 | 微卫星不稳定高结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11908 | 2024-08-04 |
A Clustering Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Automatic Weighting Penalty and Low-Rank Representation
2024 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3362472
PMID:38319777
|
研究论文 | 本文提出了一种基于自动加权惩罚和低秩表示的单细胞RNA-Seq数据聚类方法 | 引入加权距离约束并结合相似性约束，提出JAGLRR聚类方法，提高了特征贡献的评估 | 未提及具体的局限性 | 改善现有单细胞RNA-Seq数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 数据集 | 8个真实数据集和模拟数据集 |
| 11909 | 2024-08-05 |
LPCAT2 inhibits colorectal cancer progression via the PRMT1/SLC7A11 axis
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-02996-4
PMID:38605214
|
研究论文 | 本研究揭示LPCAT2通过PRMT1/SLC7A11轴抑制结直肠癌的进展 | 发现LPCAT2能够通过调节PRMT1的细胞质定位来影响SLC7A11的表达，从而诱导结直肠癌细胞的铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用的可行性尚需进一步验证 | 阐明LPCAT2在结直肠癌细胞中的作用机制及其潜在的治疗靶点 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的LPCAT2+和LPCAT2-肿瘤细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 实验室试验 | 小鼠结肠癌模型 | 生物组织样本 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的多个样本 |
| 11910 | 2024-08-05 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
|
综述 | 这篇综述提供了皮肤黑素干细胞的起源、生物特性、稳态维护和治疗潜力的全面概述 | 强调了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实践模型在黑素干细胞研究中的重要性 | NA | 提升对黑素干细胞生物特性和微环境调控机制的理解，以改善其在临床应用中的效果 | 皮肤黑素干细胞及其在皮肤疾病中的作用 | 再生医学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA |
| 11911 | 2024-08-05 |
Endocrine islet β-cell subtypes with differential function are derived from biochemically distinct embryonic endocrine islet progenitors that are regulated by maternal nutrients
2024-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946483/v1
PMID:38496675
|
研究论文 | 这篇文章探讨了内分泌岛β细胞亚型的起源及其功能差异 | 本研究首次展示了胚胎内分泌岛前体的生化特性如何导致不同功能的β细胞亚型产生 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全概括人类的情况 | 旨在揭示β细胞亚型的产生机制及其与糖尿病的关联 | 研究对象为小鼠胚胎内分泌岛前体细胞及其衍生的β细胞亚型 | 生物医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序和DNA甲基化分析 | 组合细胞谱系追踪 | 基因表达数据 | 多个小鼠胚胎的内分泌岛前体细胞 |
| 11912 | 2024-08-04 |
A potential defensive role of TIM-3 on T lymphocytes in the inflammatory involvement of diabetic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1365226
PMID:38812511
|
研究论文 | 本研究探讨了TIM-3在糖尿病肾病中T淋巴细胞的潜在防御作用 | 提出了TIM-3在糖尿病肾病进展中的保护性作用，并基于CD3+TIM-3+ T细胞的监测建议识别高风险患者 | 尚未完全了解各种T淋巴细胞亚群在糖尿病肾病中的调节机制 | 研究糖尿病肾病中T淋巴细胞的免疫检查点分子的功能及其对疾病进展的影响 | 360名糖尿病肾病成人患者和DKD小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理 | 糖尿病肾病 | 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 图像和基因数据 | 360个糖尿病肾病患者 |
| 11913 | 2024-08-05 |
Age-associated B cells are heterogeneous and dynamic drivers of autoimmunity in mice
2023-05-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221346
PMID:36828389
|
研究论文 | 年龄相关的B细胞（ABCs）在小鼠中是异质性和动态的自身免疫驱动因子 | 首次揭示了ABCs在狼疮发病机制中的直接作用及其异质性和动态特性 | 研究主要集中于小鼠模型，临床相关性尚未得到验证 | 探讨年龄相关B细胞在自身免疫病中的作用 | 小鼠中的年龄相关B细胞及其在自身免疫中的作用 | 数字病理学 | 狼疮 | scRNA-seq | MRL/lpr SLE模型 | 细胞数据 | NA |
| 11914 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of the maternal-fetal interface during ICP and normal pregnancy
2024-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians
DOI:10.1080/14767058.2024.2361278
PMID:38835155
|
研究论文 | 本研究揭示了在妊娠期肝内胆汁淤积（ICP）与正常妊娠中母-胎界面的细胞异质性和基因表达差异 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统性分析了ICP与正常妊娠中胎盘的细胞类型、基因特征和功能变化 | 样本数量较小，仅分析了两名个体，可能影响结果的通用性 | 研究ICP影响胎盘的遗传机制 | 对比ICP和正常妊娠胎盘中母-胎界面的细胞类型和基因表达 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 2名个体，一名为ICP患者，一名为正常妊娠者 |
| 11915 | 2024-08-04 |
Lapagyl mitigates UV-induced inflammation and immunosuppression via Foxp3+ Tregs and CCL pathway: A single-cell transcriptomics study
2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155679
PMID:38701542
|
研究论文 | 本研究评估了草本产品Lapagyl对紫外辐射引起的皮肤老化的疗效 | 揭示了Lapagyl通过调节Foxp3+ Tregs和CCL通路减轻皮肤炎症和免疫抑制的机制 | 模型建立在SKH-1无毛小鼠上，结果能否推广到人类尚需进一步验证 | 评估Lapagyl在对抗紫外辐射引起的皮肤老化中的有效性 | 研究对象为使用紫外辐射模型的SKH-1无毛小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本 | SKH-1无毛小鼠 |
| 11916 | 2024-08-05 |
Characterization of a Human Respiratory Mucosa Model to Study Odorant Metabolism
2024-Jun-05, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00752
PMID:38775624
|
研究论文 | 本文研究了人类呼吸粘膜模型，以探索气味物质代谢 | 首次揭示了组织工程化人类呼吸粘膜模型的XME特征，并证明其适合用于研究鼻腔气味物质代谢 | 该研究主要集中在特定的代谢酶上，其他酶的角色尚未探索 | 研究人类鼻腔呼吸粘膜在气味物质代谢中的作用 | 人类呼吸组织模型及其内部的代谢酶活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 组织工程化模型 | 生物实验数据 | NA |
| 11917 | 2024-08-04 |
Memory/Active T-Cell Activation Is Associated with Immunotherapeutic Response in Fumarate Hydratase-Deficient Renal Cell Carcinoma
2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2760
PMID:38512114
|
研究论文 | 本研究探讨了记忆/活跃T细胞激活与富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌免疫治疗反应之间的关系 | 识别了一种与ICI+TKI治疗有效性相关的记忆和效应T细胞的特征 | 需要进一步验证记忆/活跃T细胞特征与治疗效果之间的关联 | 研究富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌的最佳治疗和分子相关性 | 91名来自15个医疗中心的富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据和RNA数据 | 91名患者 |
| 11918 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01831-y
PMID:38698087
|
研究论文 | 该文章研究了亲和力成熟的浆细胞的发育动态和基因组程序。 | 文章提出了一个新的浆细胞转变状态，并揭示了浆细胞前体的增殖和编程模型 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能在其他物种中不完全适用 | 阐明抗原特异性浆细胞前体的发展动态和基因组程序 | 浆细胞前体，特别是长寿命骨髓浆细胞的生成 | NA | NA | 单细胞RNA测序和B细胞抗原受体测序 | NA | NA | 使用小鼠模型进行实验 |
| 11919 | 2024-08-05 |
NGEF is a potential prognostic biomarker and could serve as an indicator for immunotherapy and chemotherapy in lung adenocarcinoma
2024-May-19, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03046-1
PMID:38764064
|
研究论文 | 本研究评估了NGEF作为肺腺癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点的有效性 | 揭示了NGEF在肺腺癌中的作用，并指出其与肿瘤阶段、免疫浸润和化疗反应的显著关联 | 未明确指出具体的局限性 | 研究NGEF在肺腺癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者的NGEF表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 定量聚合酶链反应, 免疫组化染色, 西方印迹分析 | NA | NA | LUAD样本中基于中位数NGEF表达构建的高低表达组 |
| 11920 | 2024-08-05 |
TCL1A-expressing B cells are critical for tertiary lymphoid structure formation and the prognosis of oral squamous cell carcinoma
2024-May-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05292-7
PMID:38764038
|
研究论文 | 本研究揭示了B细胞中TCL1A表达在胚中心结构形成和口腔鳞状细胞癌(OSCC)预后中的作用 | TCL1A被识别为OSCC免疫治疗的新靶点，强调了其在B细胞增殖和抗原呈递能力中的作用 | 尚未明确B细胞在OSCC治疗中的全部角色 | 探讨TCL1A在口腔鳞状细胞癌预后和B细胞功能中的作用 | 口腔鳞状细胞癌患者的B细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、组织微阵列、复合免疫组化 | NA | 组织样本 | 包括146个临床样本和359个OSCC样本 |