单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 11901 - 11920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11901 | 2025-10-07 |
The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage†
2025-Jan-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae136
PMID:39303127
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现复发性流产患者母胎界面中dNK1/2和EVT1细胞亚群的缺失 | 首次鉴定出同时表达dNK1和dNK2生物标志物的新NK细胞亚群dNK1/2，并发现其在复发性流产组织中缺失 | NA | 研究复发性流产患者母胎界面的细胞特征异常 | 复发性流产患者和健康捐赠者的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 复发性流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发性流产患者和健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11902 | 2025-10-07 |
PerturbDB for unraveling gene functions and regulatory networks
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae777
PMID:39265120
|
研究论文 | 开发了PerturbDB平台，用于整合和分析Perturb-Seq数据集以揭示基因功能和调控网络 | 首个用户友好的Perturb-Seq数据整合平台，通过基因聚类和化学扰动整合识别潜在抑制剂 | 平台依赖现有公开数据集，未提及对新数据类型的扩展支持 | 构建基因功能研究和调控网络解析的平台工具 | 基因功能、调控网络、癌症相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | Perturb-Seq, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | Mixscape算法 | 单细胞转录组数据 | 4,518,521个单细胞转录组，涉及10,194个基因在19种细胞系中的敲低实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11903 | 2025-10-07 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
|
研究论文 | 介绍了一个名为MAPbrain的灵长类大脑多组学图谱平台 | 开发了首个整合转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据的灵长类大脑多组学图谱 | 未明确说明数据整合和分析方法的具体技术限制 | 理解基因如何影响大脑发育及神经系统疾病机制 | 灵长类大脑发育过程 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个亚区，涵盖胚胎和成年阶段，包含人类和非人灵长类的164个时间点 | NA | 多组学整合分析 | MAPbrain | 在线交互式多组学分析平台，支持用户数据上传和整合分析 |
| 11904 | 2025-10-07 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
|
研究论文 | 介绍scTWAS Atlas知识库，这是一个整合单细胞转录组全关联研究数据的综合性数据库 | 开发首个整合文献整理和数据分析的scTWAS综合知识库，提供交互式知识图谱和多组学水平调控网络 | 当前版本仅涵盖34个性状、30种细胞类型和9种细胞条件，覆盖范围有待扩展 | 构建单细胞转录组全关联研究的综合知识库，解决细胞类型异质性解释难题 | 基因-性状关联、细胞类型特异性调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究(scTWAS)、单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析 | NA | 基因表达数据、关联分析数据、多组学数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状、30种细胞类型、9种细胞条件和16,470个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11905 | 2025-10-07 |
CancerSCEM 2.0: an updated data resource of single-cell expression map across various human cancers
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae954
PMID:39460627
|
研究论文 | 介绍单细胞表达图谱数据库CancerSCEM 2.0的更新内容与功能增强 | 新增拷贝数变异评估、转录因子富集、伪时间轨迹构建、生物特征评分等功能，并首次引入单细胞水平癌症代谢图谱 | 未提及具体的技术验证或数据质量评估细节 | 构建和优化人类癌症单细胞表达图谱数据库 | 127个研究项目中的1466个单细胞RNA测序数据集，涵盖74种癌症类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1466个数据集，涵盖肿瘤、匹配正常组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11906 | 2025-10-07 |
ncPlantDB: a plant ncRNA database with potential ncPEP information and cell type-specific interaction
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1017
PMID:39470718
|
研究论文 | 介绍了一个整合植物非编码RNA和ncRNA编码肽数据的综合数据库ncPlantDB | 首个提供植物ncRNA编码肽信息和细胞类型特异性相互作用网络的综合数据库 | NA | 构建一个包含ncPEP信息和细胞类型特异性相互作用的植物ncRNA数据库 | 43种植物物种的非编码RNA和ncRNA编码肽 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, Ribo-seq分析, 文献挖掘 | NA | 基因组数据, 序列数据, 相互作用数据 | 包含353,140个ncRNAs, 3,799个ncPEPs和4,647,071个相互作用 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11907 | 2025-10-07 |
scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae913
PMID:39470724
|
研究论文 | 开发了一个全面的单细胞谱系追踪数据库scLTdb，包含109个经过人工整理和标准化分析的数据集 | 首次构建了专门针对单细胞谱系追踪技术的综合数据库，提供交互式分析模块和细胞命运相关基因特征识别功能 | NA | 构建单细胞谱系追踪数据库以促进对细胞命运决定和谱系分化的理解 | 单细胞谱系追踪数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞谱系追踪技术 | NA | 单细胞测序数据 | 109个数据集 | NA | 单细胞谱系追踪 | NA | NA |
| 11908 | 2025-10-07 |
LnCeCell 2.0: an updated resource for lncRNA-associated ceRNA networks and web tools based on single-cell and spatial transcriptomics sequencing data
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae947
PMID:39470723
|
研究论文 | 介绍更新版lncRNA相关ceRNA网络资源LnCeCell 2.0，整合单细胞和空间转录组测序数据 | 首次将单细胞和空间转录组测序数据整合到ceRNA网络分析中，提供细胞特异性和空间位点特异性的ceRNA互作网络 | NA | 构建精细调控的lncRNA-ceRNA网络资源平台 | lncRNA、ceRNA网络、单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 多种疾病（86种疾病/表型） | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 测序数据、网络数据、临床信息 | 1,002,988个细胞、367,971个空间位点、20,326名癌症患者 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 11909 | 2025-10-07 |
Diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia: an overview of the current genomic classification, diagnostic approaches, and future directions
2025-Jan, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15338
PMID:39403021
|
综述 | 概述B细胞急性淋巴细胞白血病的当前基因组分类、诊断方法和未来发展方向 | 重点介绍光学基因组图谱、甲基化分析和单细胞测序等新技术在B-ALL诊断中的应用前景 | NA | 总结B-ALL的最新诊断标准和检测方法，探讨新技术在提高诊断准确性中的作用 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL） | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 下一代测序, 全基因组转录组测序, 光学基因组图谱, 甲基化分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11910 | 2025-10-07 |
Unraveling the effects of prenatal anesthesia on neurodevelopment: A review of current evidence and future directions
2024-Dec, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2024.09.003
PMID:39276873
|
综述 | 综述产前麻醉对神经发育影响的研究证据并展望未来研究方向 | 整合脑类器官与单细胞测序技术探索产前麻醉的神经毒性机制 | 临床研究受限于伦理和技术障碍，现有发现尚无定论 | 探讨产前麻醉对胎儿大脑发育的影响 | 胎儿神经发育过程 | NA | NA | 单细胞测序 | 脑类器官 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11911 | 2025-10-07 |
Tropism for ciliated cells is the dominant driver of influenza viral burst size in the human airway
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320303121
PMID:39008691
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研究论文 | 本研究利用原代人气道培养物探究不同上皮细胞类型对流感病毒复制动力学和病毒产量的影响 | 发现纤毛细胞和分泌细胞虽然都是流感病毒主要感染的细胞类型，但只有纤毛细胞与病毒产量增加相关，而感染分泌细胞反而降低总体病毒输出 | 研究基于体外培养系统，可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究流感病毒在不同上皮细胞类型中的复制动力学和病毒产量差异 | 原代人气道培养物中的上皮细胞 | 病毒学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个供体和30个独立分化条件的气道培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11912 | 2025-10-07 |
Plasmodium infection induces phenotypic, clonal, and spatial diversity among differentiating CD4+ T cells
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114317
PMID:38848213
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了疟原虫感染期间CD4+ T细胞的分化多样性、克隆分布和空间相互作用 | 首次在近单细胞分辨率下绘制了脾脏微环境中CD4+ T细胞的空间分布和细胞间相互作用网络，并发现CCR5在克隆扩增和Th1分化中的新功能 | 研究主要聚焦于脾脏组织，未涉及其他免疫器官；TCR转基因对照模型可能无法完全模拟多克隆T细胞的真实反应 | 阐明疟原虫感染过程中CD4+ T细胞的分化表型、克隆特性和空间定位机制 | 小鼠脾脏中的CD4+ T细胞、单核细胞和基质细胞 | 空间转录组学 | 疟疾 | 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 11913 | 2025-10-07 |
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114339
PMID:38852158
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠海马神经干细胞从发育状态向成年状态转变的分子级联过程 | 首次发现神经干细胞成熟需要经历两个连续步骤：首先进入静息状态，然后进一步成熟，每个步骤都涉及独特的代谢基因表达变化 | 研究仅限于小鼠早期出生后发育阶段，人类或其他物种的适用性尚需验证 | 探索发育期神经干细胞向成年神经干细胞状态转变的过程、里程碑和机制 | 小鼠齿状回神经干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11914 | 2025-10-07 |
Microglia-astrocyte crosstalk in the amyloid plaque niche of an Alzheimer's disease mouse model, as revealed by spatial transcriptomics
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114216
PMID:38819990
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块微环境内小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用 | 首次使用CosMx和Stereo-seq两种高分辨率空间转录组学平台同时分析淀粉样斑块微环境的转录组特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明阿尔茨海默病淀粉样斑块微环境中神经胶质细胞的相互作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织样本 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | CosMx, Stereo-seq | 空间转录组学 | CosMx, Stereo-seq | 高分辨率空间转录组学平台 |
| 11915 | 2025-10-07 |
Interferon-γ induces combined pyroptotic angiopathy and APOL1 expression in human kidney disease
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114310
PMID:38838223
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素-γ通过诱导焦亡性血管病变和APOL1表达在人类肾脏疾病中的致病机制 | 首次证明IFN-γ同时诱导内皮细胞损伤和肾脏细胞焦亡，揭示了APOL1介导的塌陷性肾小球病的组合机制 | 研究主要基于体外模型，需要更多体内实验验证 | 探究干扰素信号在肾脏疾病中的直接致病作用 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和患者样本 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,免疫印迹,定量荧光分析,多组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和COVID-19、蛋白尿性肾病、塌陷性肾小球病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 11916 | 2025-10-07 |
Immunotherapeutic targeting of surfaceome heterogeneity in AML
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114260
PMID:38838225
|
研究论文 | 本研究通过分析100例急性髓系白血病样本的表面蛋白质组和单细胞转录组，识别了原始AML细胞优先表达的抗原和标志物 | 首次在100例遗传多样性AML样本中系统分析表面蛋白质组异质性，并在亚群水平评估抗原表达 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证 | 识别AML免疫治疗的潜在靶点 | 100例遗传多样性原发性人类AML样本 | 癌症免疫学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组分析, 单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 100例原发性人类AML样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组学 | NA | NA |
| 11917 | 2025-10-07 |
Single-cell-resolved interspecies comparison shows a shared inflammatory axis and a dominant neutrophil-endothelial program in severe COVID-19
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114328
PMID:38861386
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较COVID-19感染过程中仓鼠与人类的分子反应特征 | 首次在仓鼠模型中解析COVID-19疾病进展的单细胞转录组动态，并建立与人类数据的跨物种比较框架 | 缺乏患者感染初期的活检样本，依赖动物模型推演人类疾病机制 | 揭示严重COVID-19的炎症反应机制和疾病进展路径 | 叙利亚仓鼠和罗伯罗夫斯基仓鼠的肺组织，以及人类COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液、鼻拭子和尸检肺组织 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康与SARS-CoV-2感染的仓鼠肺组织，配合多个人类COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11918 | 2025-10-07 |
A phosphate transporter in VIPergic neurons of the suprachiasmatic nucleus gates locomotor activity during the light/dark transition in mice
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114220
PMID:38735047
|
研究论文 | 本研究通过电生理记录和单细胞测序发现视交叉上核VIP能神经元中的磷酸盐转运蛋白PiT2在夜间上调，调控小鼠明暗转换时的运动活动 | 首次发现PiT2磷酸盐转运蛋白在视交叉上核VIP能神经元中表达，并证明其通过调节神经元放电和蛋白质磷酸化来调控昼夜节律行为 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索视交叉上核调控昼夜行为节律的分子机制 | 小鼠视交叉上核神经元 | 神经科学 | 昼夜节律紊乱 | 膜片钳记录,单细胞测序 | NA | 电生理数据,基因表达数据 | 小鼠视交叉上核单个神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11919 | 2025-10-07 |
The molecular basis of scale development highlighted by a single-cell atlas of Bicyclus anynana butterfly pupal forewings
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114147
PMID:38662541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了双环蝶前翅鳞片细胞发育的分子基础 | 首次在蝴蝶翅膀中应用单细胞RNA测序技术，识别了多种细胞类型的分子标记，并发现senseless和HR38基因在鳞片细胞分化中的关键调控作用 | 研究仅针对双环蝶特定发育阶段（22.5-25小时雄性蛹期）的前翅大细胞，样本范围有限 | 探索蝴蝶翅膀鳞片细胞多样性的分子基础 | 双环蝶前翅鳞片细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、原位杂交、免疫荧光、CRISPR-Cas9基因编辑 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 约5,200个大细胞（>6μm） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11920 | 2025-10-07 |
Understanding glioblastoma at the single-cell level: Recent advances and future challenges
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002640
PMID:38814900
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综述 | 本文综述了单细胞技术在胶质母细胞瘤研究中的最新进展与未来挑战 | 系统总结了单细胞转录组学在揭示胶质母细胞瘤异质性和细胞可塑性方面的新见解 | 存在成本高昂、数据分析复杂、临床转化困难等挑战 | 深入理解胶质母细胞瘤在单细胞水平的特征 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |