单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11881 - 11900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11881 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of murine reproductive tissues during preterm labor
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111846
PMID:36599348
|
研究论文 | 本文生成了小鼠生殖组织在早产劳动期间的单细胞图谱。 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了早产劳动对特定免疫和非免疫细胞亚群转录组特征的影响 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于人类早产的情况 | 揭示早产劳动中生殖组织的细胞景观和细胞通讯 | 小鼠子宫、蜕膜和宫颈的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠生殖组织的多个细胞类型 |
| 11882 | 2024-08-04 |
Statistical Inference for High-Dimensional Generalized Linear Models with Binary Outcomes
2023, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1990769
PMID:37366472
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研究论文 | 本文提出了一种高维二元广义线性模型统计推断的统一框架 | 引入了新的下界技术，提供了自适应的最优置信区间分析，并展示了对回归向量稀疏性的适应性 | 关于已知与未知设计分布的情况的讨论较为有限 | 研究高维二元广义线性模型的统计推断方法 | 研究高维二元广义线性模型，及其置信区间和假设检验的构建 | 统计 | NA | 仿真研究，单细胞RNA序列分析 | 广义线性模型 | RNA-seq数据 | 单细胞RNA-seq数据集中的样本 |
| 11883 | 2024-08-04 |
Multimodal single-cell and whole-genome sequencing of small, frozen clinical specimens
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01268-9
PMID:36624340
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研究论文 | 本文展示了从小型冷冻临床标本中进行多模态单细胞和全基因组测序的可能性 | 首次将多模态单核RNA/T细胞受体测序、空间转录组学和全基因组测序应用于小型冷冻组织 | 仍然面临一些实际和预分析挑战，可能影响方法的广泛临床应用 | 探索小型冷冻临床标本中进行单细胞基因组学的可行性和应用 | 研究对象包括皮肤黑色素瘤患者以及与之匹配的全基因组数据 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | snRNA/TCR测序, 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 从KEYNOTE-001试验中收集的多个黑色素瘤样本和与其匹配的全基因组数据 |
| 11884 | 2024-08-05 |
Cell types and molecular architecture of the Octopus bimaculoides visual system
2022-12-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.10.015
PMID:36318923
|
研究论文 | 该论文呈现了章鱼视觉系统的单细胞分子图谱 | 首次系统性描绘了章鱼视网膜的细胞类型及其分子特征 | 研究可能在未覆盖的细胞类型和功能连接性方面存在局限 | 探索章鱼视觉系统的细胞类型和分子架构 | 章鱼的视觉神经元及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA原位杂交 | NA | 细胞 | NA |
| 11885 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing: promises and challenges for human genetics
2022-Dec, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2022-2156
PMID:38836091
|
综述 | 这篇文章描述了单细胞测序在人的遗传学中的现状及其应用 | 该技术承诺在宏观规模上功能性地注释人类基因组中的每个区域及其所有可能的变异 | 文章未具体提及单细胞测序的局限性 | 研究单细胞测序在人的遗传学中的作用和应用 | 讨论该技术如何应用于表征和监测疾病，开发人类细胞图谱，以及注释基因组 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 11886 | 2024-08-05 |
The Vasculature in Pulmonary Fibrosis
2022-Dec, Current tissue microenvironment reports
DOI:10.1007/s43152-022-00040-9
PMID:36712832
|
review | 本文回顾了特发性肺纤维化（IPF）中血管的变化及其对纤维化病理生理的影响 | 此文通过单细胞RNA测序的进展，更好地表征了肺内皮细胞类型，并识别了IPF患者的血管变化 | 需要更多的研究来进一步定义这些血管变化的功能角色 | 研究血管在特发性肺纤维化中的作用及其变化 | 特发性肺纤维化患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 涉及特发性肺纤维化患者的肺组织 |
| 11887 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics demonstrates the role of CD4 T cells in effector CD8 T cell differentiation during chronic viral infection
2022-11-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111736
PMID:36450262
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨了CD4 T细胞在慢性病毒感染中对效应CD8 T细胞分化的作用 | 揭示了在CD4细胞耗竭情况下，免疫调节CD4 T细胞相较于产生IL-21的Tfh细胞的数量占优，从而影响CD8 T细胞的应答 | 未详细探讨其他细胞类型在T细胞相互作用中可能的作用 | 研究CD4 T细胞异质性及其在慢性病毒感染中的功能 | CD4和CD8 T细胞及其在慢性病毒感染中的相互作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11888 | 2024-08-05 |
TrkA+ Neurons Induce Pathologic Regeneration After Soft Tissue Trauma
2022-11-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szac073
PMID:36222619
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研究论文 | 本研究探讨了TrkA+神经元在软组织创伤后诱导病理再生的作用 | 首次发现NGF响应的TrkA表达神经在软组织创伤后的侵袭与异位骨形成相关 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性尚待验证 | 研究TraK信号调控对创伤后异位骨形成的影响 | 使用小鼠模型研究异位骨形成及相关神经元活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 影像，组织学 | 小鼠模型，具体样本量未定 |
| 11889 | 2024-08-05 |
GATA4 Regulates Developing Endocardium Through Interaction With ETS1
2022-11-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.318102
PMID:36263775
|
研究论文 | 本文研究GATA4转录因子在心脏发育中的作用及其与ETS1的相互作用 | 探索了GATA4如何在心肌细胞和心内膜细胞中选择性占据染色质的机制，并揭示了ETS1在GATA4调控内皮发育中的协同作用 | 研究主要集中在小鼠模型中，结果的转化性可能受限于物种差异 | 阐明GATA4如何通过与ETS1等非先导转录因子的相互作用来调控心内膜的发育 | 小鼠胚胎心脏中的心肌细胞和心内膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光素酶报告实验 | 细胞系 | 基因组数据和转录组数据 | 使用了小鼠胚胎心脏细胞和稳定转染的NIH3T3细胞系 |
| 11890 | 2024-08-05 |
A human STAT3 gain-of-function variant confers T cell dysregulation without predominant Treg dysfunction in mice
2022-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162695
PMID:36136607
|
研究论文 | 本研究探讨了一种人类STAT3增效变体在小鼠中引起T细胞失调的机制 | 首次使用载入小鼠模型研究STAT3 GOF综合症的病理机制，并发现Tregs并非疾病的主要驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用和治疗策略尚未确定 | 明确STAT3 GOF综合症的病理机制及其对T细胞调节的影响 | 开发了携带人类STAT3变体的小鼠模型并进行相关的单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | 自体免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | knock-in小鼠模型 | 细胞数据 | 使用STAT3 GOF患者的T细胞进行单细胞RNA测序，具体样本数量未说明 |
| 11891 | 2024-08-05 |
PTEN directs developmental and metabolic signaling for innate-like T cell fate and tissue homeostasis
2022-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01011-w
PMID:36302969
|
研究论文 | 本文研究了PTEN在先天样T细胞生成和组织稳态中的作用 | 揭示了PTEN调控先天样T细胞发育与代谢信号传导的新机制 | 该研究未明确探讨PTEN在其他类型T细胞的作用 | 阐明PTEN在T细胞发育及组织稳态中的功能 | 研究了PTEN缺失对界面样IL-17产生T细胞的影响 | NA | 人类癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | PTEN缺失小鼠和PTEN杂合缺失小鼠的样本 |
| 11892 | 2024-08-05 |
Cell-type identity of the avian utricle
2022-09-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111432
PMID:36170825
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序鉴定了鸡内耳前庭器官中的不同感官毛细胞亚型特征基因 | 首次识别了鸡前庭器官的多种感官毛细胞亚型及其对应的标记基因 | 研究主要集中于鸡的前庭器官，结果可能不适用于其他物种 | 研究鸟类前庭器官中感官毛细胞的类型及其再生能力 | 鸡的前庭器官中感官毛细胞和支持细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11893 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome mapping identifies a local, innate B cell population driving chronic rejection after lung transplantation
2022-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156648
PMID:36134664
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研究论文 | 本研究分析了肺移植后慢性排斥反应中细胞种群变化及其基因表达模式 | 首次识别了驱动肺移植后慢性排斥反应的局部固有B细胞群体及其在BOS中的作用 | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 理解B细胞在慢性排斥反应中的作用及其异质性 | 肺移植小鼠模型及人类BOS病例 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了2个不同的人类BOS队列和小鼠模型 |
| 11894 | 2024-08-05 |
Genome-wide DNA hypermethylation opposes healing in patients with chronic wounds by impairing epithelial-mesenchymal transition
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157279
PMID:35819852
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研究论文 | 本研究探讨了慢性创伤患者中全基因组DNA高甲基化如何通过影响上皮间充质转化阻碍创伤愈合 | 该研究首次通过全基因组甲基组分析揭示了慢性创伤边缘组织中高甲基化与上皮间充质转化之间的关系 | 研究主要集中于小鼠实验，可能存在物种间差异 | 研究创伤微环境中的表观遗传机制及其在慢性创伤愈合中的作用 | 慢性创伤患者的创伤边缘组织和小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq，亚硫酸盐测序 | NA | 基因组数据 | 慢性创伤患者创伤边缘组织4,689个差异甲基化区域 |
| 11895 | 2024-08-05 |
Interleukin-17 governs hypoxic adaptation of injured epithelium
2022-07-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abg9302
PMID:35709248
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研究论文 | 本文研究了IL-17A如何调控受损上皮的缺氧适应 | 揭示了IL-17A通过激活HIF1α来驱动受损上皮的缺氧适应，并且说明了其在上皮愈合过程中的重要性 | 未说明样本大小和具体实验条件 | 探讨IL-17A在受损上皮的缺氧适应中的作用 | 受损的上皮细胞及其周围的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 11896 | 2024-08-05 |
A comparative transcriptomic analysis of glucagon-like peptide-1 receptor- and glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor-expressing cells in the hypothalamus
2022-07-01, Appetite
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.appet.2022.106022
PMID:35430298
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序比较了下丘脑中表达GIPR和GLP-1R的细胞类型和表达谱 | 首次提供了对下丘脑中GLP-1R和GIPR细胞的详细比较，揭示了其在能量平衡和进食行为中的作用机制 | 本文未探讨GLP-1R和GIPR共同激动下的具体机制 | 旨在深入理解下丘脑中表达胰高血糖素样肽-1和葡萄糖依赖性胰岛素促分泌肽受体的细胞种群 | 下丘脑中表达GIPR和GLP-1R的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 转录组数据 | 共分离和测序了14,091个Glp1rEYFP+和GiprEYFP+细胞 |
| 11897 | 2024-08-05 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
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研究论文 | 该文章系统性地识别了在急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者接受地西他滨治疗后诱导的全球基因组和转录组改变。 | 本研究揭示了地西他滨诱导的全球可逆性低甲基化及其对干扰素诱导的通路的影响，为理解其在体内的作用提供了新的视角。 | 临床反应与表观遗传或转录特征之间没有关联，样本大小和患者间的变异限制了捕捉较小效应所需的统计能力。 | 研究地西他滨对急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者的反应及其分子机制。 | 急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者的主要骨髓样本。 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 全基因组亚硫酸盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 在患者治疗过程中收集的主要骨髓样本 |
| 11898 | 2024-08-05 |
Genetic loss of function of Ptbp1 does not induce glia-to-neuron conversion in retina
2022-06-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110849
PMID:35705053
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研究论文 | 这篇文章探讨了Ptbp1的遗传功能缺失是否会导致视网膜胶质细胞转化为神经元 | 揭示了Ptbp1的缺失不能有效诱导视网膜Mϋller胶质细胞转化为功能性神经元 | 仅在特定的基因突变体中研究了Ptbp1的功能，可能无法推广到其他细胞类型 | 研究Ptbp1在视网膜胶质细胞转化为神经元中的角色 | 成年视网膜Mϋller胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年视网膜Mϋller胶质细胞的突变体 |
| 11899 | 2024-08-05 |
Mapping the developing human immune system across organs
2022-06-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo0510
PMID:35549310
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研究论文 | 该文章映射了人类免疫系统在多个器官中的发育过程 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、抗原受体测序和空间转录组学，重建了发育中的人类免疫系统，揭示了免疫细胞功能的晚期获得以及单核细胞和T细胞的成熟 | 限制在于对发育中的免疫系统的分布网络进行的描述仍然有限 | 研究人类胎儿免疫系统的发育及其在不同组织中的分布 | 九种胎儿组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、抗原受体测序、空间转录组学 | NA | NA | 九种胎儿组织 |
| 11900 | 2024-08-05 |
Drug-Induced Hypersensitivity Syndrome (DIHS)/Drug Reaction With Eosinophilia and Systemic Symptoms (DRESS): Clinical Features and Pathogenesis
2022-05, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2022.02.004
PMID:35176506
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研究论文 | 本研究讨论了药物诱导超敏反应综合征（DIHS）/药物反应伴嗜酸性粒细胞增多和全身症状（DRESS）的临床特征和发病机制 | 研究揭示了DIHS/DRESS与特定HLA等位基因的强关联，为预防和早期诊断提供了新思路 | 未涉及更广泛的药物反应机制和长期随访影响 | 探讨DIHS/DRESS的临床特征及其发病机制 | 讨论DIHS/DRESS与药物及HLA等位基因的关系 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |