单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 11881 - 11900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11881 | 2024-08-05 |
Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq
2016-Apr-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aad0501
PMID:27124452
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索转移性黑色素瘤的多细胞生态系统 | 揭示了黑色素瘤肿瘤中细胞的转录异质性及其与细胞周期和空间背景的关系 | 研究仅分析了19名患者的样本，样本量相对较小 | 探讨黑色素瘤肿瘤的基因型和表型状态 | 4645个来自19名患者的单细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4645个单细胞来自19名患者 |
| 11882 | 2024-08-05 |
Parallel single-cell sequencing links transcriptional and epigenetic heterogeneity
2016-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.3728
PMID:26752769
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞基因组范围内的甲基组和转录组平行测序方法 | 该方法揭示了异质甲基化的远程调控元件与关键多能性基因转录之间的未知关联 | NA | 探索转录变异与表观遗传变异之间的关联 | 61个小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | scM&T-seq | NA | 基因组甲基组和转录组数据 | 61个小鼠胚胎干细胞 |
| 11883 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals coordinated ectopic gene-expression patterns in medullary thymic epithelial cells
2015-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3246
PMID:26237553
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研究论文 | 本研究揭示了髓质胸腺上皮细胞中组织特异性自身抗原的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了髓质胸腺上皮细胞中TRAs的协同表达模式 | 研究未阐明单个mTEC中TRAs表达的具体调控机制 | 探讨髓质胸腺上皮细胞中自身抗原表达的调控机制 | 针对髓质胸腺上皮细胞中的组织特异性自身抗原进行研究 | 数字病理学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个mTECs样本 |
| 11884 | 2024-08-05 |
Aire controls gene expression in the thymic epithelium with ordered stochasticity
2015-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3247
PMID:26237550
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研究论文 | Aire转录因子通过诱导外源性胸腺特异性基因的表达来控制免疫耐受性 | 本研究揭示了Aire靶基因在小部分胸腺髓样上皮细胞中的特异性激活，与DNA甲基化模式无关 | 未提及具体样本数量和限制因素 | 探讨Aire对胸腺上皮基因表达的特异性调控机制 | Aire充足和缺乏的胸腺髓样上皮细胞(mTECs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA甲基化分析 | NA | NA | NA |
| 11885 | 2024-08-05 |
Droplet barcoding for single-cell transcriptomics applied to embryonic stem cells
2015-May-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.04.044
PMID:26000487
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研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学的高通量液滴条形码技术。 | 提出了一种高效的液滴微流控方法，可以从成千上万个单细胞中标记RNA，并进行后续的下一代测序分析。 | 没有明确提到该方法在特定样本上的适用性或潜在的技术障碍 | 旨在有效识别和分析单细胞水平的基因表达。 | 分析小鼠胚胎干细胞以揭示细胞群体结构和分化异质性。 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA数据 | 数千个单细胞 |
| 11886 | 2024-08-05 |
Recent advances in genomic DNA sequencing of microbial species from single cells
2014-Sep, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3785
PMID:25091868
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研究论文 | 本文讨论了通过单细胞测序对微生物物种的基因组DNA进行测序的最新进展 | 揭示了通过单细胞测序技术填补未培养物种的基因组序列空白的潜力 | 对微生物物种的研究仍然受到技术和样本可得性的限制 | 研究未培养微生物的基本生物学、分类和进化 | 未培养的微生物物种及其基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组DNA | NA |
| 11887 | 2024-08-05 |
Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2694
PMID:24141493
|
研究论文 | 该文章比较了不同的单细胞RNA扩增方法的敏感性和准确性 | 系统评估了多种单细胞RNA-seq方法的性能，并显示出在较小的测序读取数下仍能准确测量单细胞转录组 | 未提及具体的限制 | 探讨单细胞转录组分析的有效性 | 比较不同的单细胞RNA扩增方法 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了不同数量的单细胞样本 |
| 11888 | 2024-08-05 |
A tripartite transcription factor network regulates primordial germ cell specification in mice
2013-Aug, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/ncb2798
PMID:23851488
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研究论文 | 本文探讨了三种转录因子网络在小鼠原始生殖细胞(PGC)特定中的调控作用 | 揭示了BLIMP1、AP2γ和PRDM14之间相互依赖的转录网络对PGC特异性命运的影响 | 未提及具体的实验范围或潜在的不确定性 | 研究转录因子如何调控原始生殖细胞的规范化 | 研究小鼠的原始生殖细胞 | NA | NA | 转录组分析和染色质免疫沉淀测序 | NA | NA | 使用了正常和突变的PGC的单细胞转录组数据 |
| 11889 | 2024-08-05 |
Development and applications of single-cell transcriptome analysis
2011-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.1557
PMID:21451510
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评论 | 本文回顾了单细胞转录组分析的历史、进展、潜在应用和未来发展 | 结合活细胞成像和谱系追踪的方法，能够揭示个体细胞的基因表达网络 | NA | 探讨基因型与表型之间的关系 | 单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 11890 | 2024-08-04 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-Jun-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
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研究论文 | 本文研究了CD8+ T细胞中的体细胞突变与克隆扩增之间的关系 | 揭示了非恶性T细胞中的突变谱，并首次确认CD8细胞中的非同义变异频率高于同义变异 | 未明确提及对样本选择和其他T细胞类型的影响 | 了解体细胞突变对CD8 T细胞扩增的影响 | 来自90位血液和免疫疾病患者的CD8和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 90名患者的T细胞 |
| 11891 | 2024-08-05 |
Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature
2024-Jun-07, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014
PMID:38851995
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研究论文 | 该文章分析了与胶原相关的转录组、蛋白组和尿液组的变化，以检测临床显著性前列腺癌 | 通过胶原相关转录组、蛋白组和尿液组的特征建立了机器学习模型，显著优于传统的前列腺特异抗原 (PSA) 方法 | 本研究的一个局限性是其回顾性特征 | 研究胶原在前列腺癌检测中的作用 | 涉及临床显著性前列腺癌患者的转录组、蛋白组和尿液组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据，蛋白组数据，尿液组数据 | 转录组1393个，蛋白组104个，尿液组923个 |
| 11892 | 2024-08-05 |
Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.010
PMID:38697109
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研究论文 | 该研究探讨了人类多能干细胞来源的β细胞的功能成熟过程 | 揭示了蜕膜代谢重塑，尤其是对神经酰胺代谢活动的下调对β细胞成熟的重要性 | 研究中具体的细胞标志物和环境因素对成熟过程的影响未深入探讨 | 研究人类胰腺β细胞的成熟机制及其功能获得 | 人类多能干细胞来源的β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞转座酶易接触染色质测序 (scATAC-seq) | NA | NA | NA |
| 11893 | 2024-08-05 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-Jun-05, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 本文观察了海参Apostichopus japonicus中环口神经环内神经细胞的超微结构和转录特征 | 首次应用单细胞RNA测序研究海参中神经细胞的转录特征并识别了六种神经细胞类型 | 缺乏对神经细胞功能及其在生态系统中作用的进一步研究 | 研究海参神经细胞的超微结构以及其转录特征 | 海参Apostichopus japonicus的环口神经环中的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 六种神经细胞类型 |
| 11894 | 2024-08-05 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jun-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了成蚊Aedes aegypti中肠细胞图谱 | 首次建立了Aedes aegypti中肠单细胞RNA测序的分离和测序协议 | 缺乏对已知转录组的重复性验证和其他中肠细胞的功能研究 | 研究Aedes aegypti中肠细胞类型及其在arbovirus感染中的作用 | Aedes aegypti成虫的中肠细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | NA |
| 11895 | 2024-08-04 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢修改如何限制SARS-CoV-2在类人气道器官中的传播 | 通过建立人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，首次揭示了脂质通路修改对SARS-CoV-2传播的限制作用 | 本研究主要基于体外模型，尚需进一步验证在真实生物体中的效果 | 揭示脂质代谢在COVID-19病毒感染中的作用机制 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，主要关注SARS-CoV-2的感染和传播 | 数字病理学 | 新冠病毒感染 | 单细胞测序（ScRNAseq） | 气道类器官（iPSC-AOs） | 细胞与分子生物数据 | NA |
| 11896 | 2024-08-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
|
评论 | 本文回顾了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用和转录组权衡。 | 提出了单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种创新且尚未充分利用的技术，提供了独特的细胞层面转录组分析视角。 | 需要考虑传统方法与scRNA-seq之间的权衡。 | 探讨单细胞RNA测序在生殖毒理学中的应用及其对毒性物质暴露的响应。 | 主要研究斑马鱼的个体细胞基因表达谱。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11897 | 2024-08-05 |
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0045OC
PMID:37290124
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研究论文 | 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 | 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全推及人类 | 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 | 以SM22α-表达细胞为对象，分析其在肺泡化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型和早产儿样本 |
| 11898 | 2024-08-05 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
|
review | 该综述重点介绍了膀胱癌患者的新靶点、进展和治疗方法 | 结合抗体药物偶联物（ADC）与免疫疗法的成功被视为膀胱癌治疗的重大突破，并探讨了其他ADC作为治疗选项的兴趣 | 该文献没有明确提及局限性 | 旨在阐明膀胱癌的治疗靶点，以改善患者特异性的护理和治疗结果 | 膀胱癌患者及其治疗相关的新靶点和方法 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11899 | 2024-08-05 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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review | 这篇综述总结了单细胞和空间组学在理解膀胱癌生物学中的最新进展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间组学技术在肿瘤微环境、膀胱癌异质性、癌症干性和细胞可塑性方面的创新应用 | 在将研究结果转化为临床实践和实施个体化治疗策略方面仍存在挑战 | 探讨单细胞和空间组学在膀胱癌中的应用及其对新治疗策略发展的影响 | 研究膀胱癌中肿瘤微环境和细胞异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间组学技术 | NA | NA | NA |
| 11900 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
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研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |