单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 11881 - 11900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11881 | 2024-08-05 |
Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer
2024-Jun-17, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02039-2
PMID:38880903
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研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了一种新的癌基因集群，TRAP1低表达/CAMSAP3低表达在早期子宫内膜癌中表现出更具攻击性的行为和较差的预后。 | 首次发现TRAP1和CAMSAP3在特定细胞集群中显著下调，并构建了结合TRAP1、CAMSAP3和TP53的新的预测模型。 | 本研究的样本量相对较小，仅包含24名早期子宫内膜癌患者，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究早期子宫内膜癌的临床异质性，识别高质量预后标志物及其在肿瘤攻击性行为中的潜在作用。 | 研究对象为早期子宫内膜癌患者及其癌和旁癌组织的样本。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 蛋白质组学和单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 生物样本 | 24名早期子宫内膜癌患者 |
| 11882 | 2024-08-04 |
Cystatin F attenuates neuroinflammation and demyelination following murine coronavirus infection of the central nervous system
2024-Jun-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03153-0
PMID:38879499
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研究论文 | Cystatin F在小鼠冠状病毒感染后的神经炎症和脱髓鞘化过程中的作用 | 首次详细探讨了Cystatin F在病毒感染后神经疾病严重性中的影响 | 主要使用小鼠模型，结果可能无法直接推广到人类 | 研究Cystatin F在小鼠冠状病毒引起的神经疾病中的作用 | Cystatin F缺失的小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 电子显微镜 | NA | 细胞, RNA | Cst7-/-小鼠和控制小鼠的细胞样本 |
| 11883 | 2024-08-04 |
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.577927
PMID:38352492
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研究论文 | 本研究旨在表征参与形成粒腺瘤的趋化因子。 | 使用空间转录组学技术动态研究趋化因子表达在粒腺瘤形成过程中的变化。 | 研究中对其他免疫细胞的角色探索不足。 | 探索趋化因子在免疫细胞形成粒腺瘤中的作用。 | 小鼠感染模型和其免疫反应中的单核细胞来源巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 小鼠感染模型 |
| 11884 | 2024-08-05 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
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研究论文 | 本文研究KLF4在平滑肌细胞来源的祖细胞中的作用，探讨其对心脏炎症和纤维化的影响 | 首次发现源自成熟血管平滑肌细胞的AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的作用，并揭示了KLF4在调控这些细胞向致纤维化表型转变过程中的关键角色 | 目前尚不清楚KLF4如何具体调节AdvSca1-SM表型的分子机制 | 探讨KLF4在心脏炎症和纤维化相关过程中对平滑肌细胞来源祖细胞的作用 | 研究对象为来自主动脉、颈动脉和股动脉的AdvSca1-SM细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 11885 | 2024-08-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
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研究论文 | 介绍了一种名为scSNViz的R基础工具集，用于可视化和分析细胞特异性表达的单核苷酸变异。 | 提供了3D可视化功能，兼容多个流行的scRNA-seq处理工具，并能够进行统计指标的估计和图形表示。 | NA | 旨在理解单细胞水平的遗传变异，以获取细胞异质性和基因表达调控的见解。 | 着重分析细胞特异性表达的单核苷酸变异（sceSNVs）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11886 | 2024-08-04 |
Single-cell lineage capture across genomic modalities with CellTag-multi reveals fate-specific gene regulatory changes
2024-Jun, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01931-4
PMID:37749269
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研究论文 | 本研究提出了一种新的方法CellTag-multi，用于在不同的单细胞基因组测序中进行细胞谱系追踪 | 提出了CellTag-multi方法，可以直接捕获作为多腺苷酸化转录本表达的遗传随机条形码，适用于多种单细胞测定 | NA | 研究细胞谱系追踪与转录组分析相结合的方法 | 小鼠造血过程中的前体细胞谱系及其重编程过程中的基因调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测定 | NA | 转录本 | 小鼠造血过程中的前体细胞 |
| 11887 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of tumour infiltrating T cells efficiently identifies tumour-specific T cell receptors based on the T cell activation score
2024-May-10, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03710-9
PMID:38727812
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序建立了一种有效的方法来分离肿瘤反应性T细胞受体 | 创新性地结合多个激活和效应分子的表达水平来提高肿瘤特异性TCR的分离效率 | 研究仅包含两名肺腺癌患者，样本量较小 | 旨在识别肿瘤特异性T细胞受体以改善癌症治疗 | 研究对象为肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 2名肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 11888 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing unveils a machine learning-based pan-cancer major histocompatibility complex-related signature for predicting immunotherapy efficacy
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03714-5
PMID:38714579
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研究论文 | 该文章探讨了主要组织相容性复合体（MHC）在肿瘤免疫治疗中的潜在生物标志物作用，并开发了MHCsig以预测免疫治疗的疗效 | 开发了新的MHCsig，可以有效预测多种肿瘤免疫治疗的益处 | NA | 研究MHC与免疫治疗反应之间的关系 | 免疫治疗患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 大量的全癌症数据和临床队列 |
| 11889 | 2024-08-05 |
Overexpressing S100A9 ameliorates NK cell dysfunction in estrogen receptor-positive breast cancer
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03699-1
PMID:38713229
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A9在雌激素受体阳性乳腺癌中的作用，改善了自然杀伤细胞的功能 | 首次揭示了S100A9在ER+/HER2-BC中对NK细胞功能的重要调节作用 | 研究主要集中在细胞及分子水平，临床验证和长时间效应尚不明确 | 探索雌激素受体阳性乳腺癌中NK细胞的功能状态及其调节机制 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞系及其对NK细胞的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序, 批量mRNA测序, qPCR, ELISA | NA | 基因表达数据 | 研究中使用了MCF-7, T47D, MDA-MB-468和MDA-MB-231细胞系 |
| 11890 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Pituitary Gland Changes in Diet-Induced Obesity in Male Mice
2024-Jan-16, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad196
PMID:38146776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了膳食诱导肥胖小鼠的垂体腺变化。 | 本研究首次揭示了高脂饮食如何导致垂体细胞群体和基因表达的显著变化。 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨肥胖对垂体细胞群体及基因表达的影响。 | 研究对象为喂养高脂饮食和对照饮食的雄性小鼠的垂体腺。 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提供具体样本数量 |
| 11891 | 2024-08-05 |
Genomic Insights into Molecular Regulation Mechanisms of Intramuscular Fat Deposition in Chicken
2023-12-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14122197
PMID:38137019
|
综述 | 本文综述了影响鸡肉中 intramuscular fat (IMF) 沉积的分子调控机制 | 通过多种基因组学方法，系统描述了与IMF沉积相关的遗传和表观遗传因素 | NA | 探索鸡肉中IMF沉积的分子调控机制 | 鸡肉中的内脏脂肪沉积 | 数字病理学 | NA | 全基因组关联研究, 整个转录组测序, 蛋白质组测序, 单细胞RNA测序, 高通量染色体构象捕获, DNA甲基化测序, mA甲基化测序 | NA | NA | NA |
| 11892 | 2024-08-04 |
SARS-CoV-2 infection establishes a stable and age-independent CD8+ T cell response against a dominant nucleocapsid epitope using restricted T cell receptors
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42430-z
PMID:37872153
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研究论文 | 本文分析了SARS-CoV-2感染后针对核壳蛋白的CD8 T细胞反应的特征 | 发现SARS-CoV-2感染后CD8 T细胞的增殖反应增强并持续存在 | 缺乏对CD8 T细胞在感染前后特异性和TCR组成的全面表征 | 研究SARS-CoV-2感染中CD8 T细胞对核壳蛋白特定表位的反应 | 针对SARS-CoV-2核壳蛋白的CD8 T细胞及其TCR特征 | 免疫学 | SARS-CoV-2感染 | 单细胞测序，转录组分析 | NA | 免疫细胞数据 | 包括恢复期和未感染供体的CD8 T细胞 |
| 11893 | 2024-08-05 |
Cell-by-Cell: Unlocking Lung Cancer Pathogenesis
2022-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14143424
PMID:35884485
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review | 本综述文章总结了单细胞分析在非小细胞肺癌研究中的应用，尤其是肺腺癌亚型。 | 利用单细胞测序技术，文章揭示了肿瘤起源细胞和肿瘤免疫动态的新知识，重写了谱系可塑性和肿瘤内部异质性的机制细节。 | 该综述主要集中于肺腺癌亚型，可能未涵盖其他类型的肺癌及其相应的病理机制。 | 旨在总结肺腺癌发病机制及其肿瘤微环境的互动。 | 研究对象为不同阶段的肺腺癌肿瘤组织及相关动物模型。 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括不同阶段的肺腺癌样本及相关动物模型 |
| 11894 | 2024-08-05 |
secDrug: a pipeline to discover novel drug combinations to kill drug-resistant multiple myeloma cells using a greedy set cover algorithm and single-cell multi-omics
2022-03-09, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-022-00636-2
PMID:35264575
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研究论文 | 本文介绍了一种计算管道，用于发现对抗耐药性多发性骨髓瘤细胞的新药组合 | 提出了一种结合药理基因组数据的优化算法来预测新药组合，并开发了可普遍应用的R软件包 | 实验主要在体外进行，临床应用效果尚未验证 | 研究针对耐药性多发性骨髓瘤的新药组合的发现 | 主要研究耐药性多发性骨髓瘤细胞及其药物组合 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，CyTOF单细胞蛋白组学，CRISPR基因编辑 | 贪婪集合覆盖算法 | 基因组数据，转录组数据，细胞系数据 | 使用了多个代表耐药性的人的多发性骨髓瘤细胞系 |
| 11895 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics inferred from pathology whole-slide images links tumor heterogeneity to survival in breast and lung cancer
2020-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75708-z
PMID:33139755
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研究论文 | 本文介绍了一种利用数字病理全切片图像进行空间转录组分析的方法，以连接肿瘤异质性与乳腺癌和肺癌的生存率 | 提出了一种新的方法，通过深度学习模型在病理全切片图像上空间解析mRNA和miRNA表达水平，并构建异质性指数(HTI) | 现有分析方法需要大量训练样本和复杂的流程，而我们的模型在样本数量较少的情况下仍显示了良好的性能 | 研究肿瘤异质性及其对生存的影响，以改善癌症的诊断和治疗 | 研究了乳腺癌和肺癌样本中的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | 使用了来自两个癌症队列的少量训练样本 |
| 11896 | 2024-08-05 |
Deconstructing Olfactory Stem Cell Trajectories at Single-Cell Resolution
2017-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.04.003
PMID:28506465
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研究论文 | 本研究详细描述了嗅觉干细胞在产生成熟后代时的轨迹 | 集成单细胞RNA测序和统计分析与体内谱系追踪，揭示了嗅觉上皮中的细胞命运潜力和分支点 | NA | 阐明细胞命运决策和组织稳态的机制 | 嗅觉上皮中的嗅觉干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11897 | 2024-08-04 |
Advances and applications of biomimetic biomaterials for endogenous skin regeneration
2024-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.04.011
PMID:38883311
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综述 | 文章概述了生物仿生材料在促进自体皮肤再生中的最新进展 | 提出了新型的生物仿生材料，具备精确的结构、化学成分和生物物理特性 | 当前应用的生物材料在结构和功能上过于简单，无法精确模拟复杂的组织结构 | 探讨生物仿生材料在自体皮肤再生中的应用及其进展 | 关注生物仿生材料如何促进自体皮肤的再生 | 数字病理学 | NA | 重编程、柔性电子皮肤、人工智能、单细胞测序和空间转录组 | NA | NA | NA |
| 11898 | 2024-08-04 |
The art of healing hearts: Mastering advanced RNA therapeutic techniques to shape the evolution of cardiovascular medicine in biomedical science
2024-Aug, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102627
PMID:38723793
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综述 | 本文深入分析了心血管疾病背景下RNA疗法的发展状态 | 强调了各种针对分子生物学基本法则不同阶段的RNA疗法方法 | 本文未提及具体实验数据或临床试验结果 | 探讨新的RNA治疗方法及其在心血管疾病中的应用 | 心血管疾病中的多种编码和非编码RNA候选者 | 生物医学 | 心血管疾病 | 下一代测序技术，单细胞测序技术 | NA | RNA，基因组数据 | NA |
| 11899 | 2024-08-05 |
Non-canonical Wnt pathway expression in the developing mouse and human retina
2024-Jul, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109947
PMID:38815793
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研究论文 | 本研究分析了非经典Wnt通路在小鼠和人类视网膜发育中的表达情况 | 识别了在小鼠和人类视网膜发育中具有特定表达的新型配体、受体和介导基因 | 人类视网膜的发育和突触生成作用较少建立 | 探讨非经典Wnt信号通路在人类视网膜发育中的作用 | 小鼠和人类视网膜以及人类视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 分析了小鼠和人类视网膜及视网膜类器官的多个发展时间点的数据 |
| 11900 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics in embryonic mouse diaphragm muscle reveals regional gradients and subdomains of developmental gene expression
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110018
PMID:38883818
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研究论文 | 本文提供了小鼠胚胎横膈肌空间基因表达数据，揭示了肌肉区域的基因特征及其发育过程 | 首次报告了小鼠胚胎横膈肌的空间基因表达模式 | 目前缺乏对其他胚胎时期或不同肌肉类型的系统性研究 | 研究小鼠胚胎横膈肌的发育和神经肌肉连接形成中的基因表达模式 | 小鼠胚胎横膈肌，特别是在胚胎天数E14.5和E18.5的样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 横截面小鼠胚胎样本，具体样本大小未提供 |