单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 11861 - 11880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11861 | 2025-10-07 |
Invasive growth of brain metastases is linked to CHI3L1 release from pSTAT3-positive astrocytes
2024-06-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae013
PMID:38271182
|
研究论文 | 本研究揭示了pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过释放CHI3L1促进脑转移瘤侵袭性生长的机制 | 首次发现pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过分泌CHI3L1驱动脑转移瘤的侵袭性生长，并证实STAT3和CHI3L1可作为治疗靶点 | NA | 探究脑转移瘤侵袭模式与pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞的关系及其作为STAT3抑制预测生物标志物的潜力 | 人类脑转移瘤样本、患者来源异种移植模型、小鼠模型、脑切片-肿瘤共培养体系 | 肿瘤学 | 脑转移瘤 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、脑切片-肿瘤共培养实验 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11862 | 2025-10-07 |
Epigenomics-guided precision oncology: Chromatin variants in prostate tumor evolution
2025-Jan-23, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35327
PMID:39853587
|
综述 | 探讨表观基因组异质性在前列腺癌中的作用，重点关注染色质变异如何促进肿瘤进化和治疗抵抗 | 提出染色质变异作为表观基因组异质性的基本单位，强调其在细胞可塑性和治疗抵抗中的关键作用 | NA | 支持精准肿瘤学新时代，利用表观基因组学见解改善前列腺癌患者预后 | 前列腺癌 | 表观基因组学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、液体活检表观基因组分析 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11863 | 2025-10-07 |
The role of MRO as an M2 macrophage-associated gene in non-small cell lung cancer: insights into immune infiltration, prognostic significance, and therapeutic implications
2025-Jan-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01817-8
PMID:39838218
|
研究论文 | 本研究探讨M2巨噬细胞相关基因MRO在非小细胞肺癌中的免疫浸润、预后意义和治疗潜力 | 首次系统揭示MRO基因作为M2巨噬细胞标志物在非小细胞肺癌中的预后价值和免疫治疗预测意义 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证MRO的具体功能机制 | 探索MRO基因在非小细胞肺癌免疫微环境中的作用和临床意义 | 非小细胞肺癌患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, ESTIMATE算法, TIDE分析, Submap分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的非小细胞肺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11864 | 2025-10-07 |
Characterizing the diabetes-induced pathological changes of the mouse lung by single-cell RNA sequencing
2025-Jan-18, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123408
PMID:39832739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术表征糖尿病对小鼠肺部造成的病理变化 | 首次在晚期糖尿病小鼠肺中发现免疫细胞显著增加且主要为未成熟PMN-MDSCs，并揭示了肺泡细胞在糖尿病早期呈现间质表型及免疫功能下降的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病对肺部病理变化的影响机制 | 糖尿病小鼠模型肺组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11865 | 2025-10-07 |
Novel Integration of Spatial and Single-Cell Omics Data Sets Enables Deeper Insights into IPF Pathogenesis
2025-Jan-13, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13010003
PMID:39846634
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据，识别特发性肺纤维化中与疾病相关的细胞类型和潜在治疗靶点 | 创新性地整合空间多组学与单细胞RNA测序数据，并验证了空间蛋白质组学与单细胞RNA测序整合方法的有效性 | NA | 深入理解特发性肺纤维化发病机制，识别与组织病理区域相关的细胞类型 | 人类特发性肺纤维化肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割质谱, 空间蛋白质组学 | Query方法, Overlap方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 11866 | 2025-10-07 |
Galaxy as a gateway to bioinformatics: Multi-Interface Galaxy Hands-on Training Suite (MIGHTS) for scRNA-seq
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae107
PMID:39775842
|
研究论文 | 开发了一个多界面Galaxy实践培训套件(MIGHTS)，用于单细胞RNA测序分析 | 提供并行分析方法，支持图形界面和代码两种操作方式，促进不同编程水平科学家的同步培训 | NA | 解决生物信息学学习曲线陡峭的问题，为生物学家和临床医生提供单细胞分析培训工具 | 生物学家、临床医生和初学生物信息学的研究人员 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Galaxy平台 | Galaxy Training Network，支持Python-based (Scanpy)和R-based (Seurat & Monocle)分析 |
| 11867 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
|
研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集，探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点，提出间充质表型不仅是结构支持特征，更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析，缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11868 | 2025-10-07 |
TRIM44, a Novel Prognostic Marker, Supports the Survival of Proteasome-Resistant Multiple Myeloma Cells
2024-08-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171431
PMID:39273003
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM44在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗抵抗机制 | 首次系统阐明TRIM44通过连接泛素-蛋白酶体系统和自噬途径，支持蛋白酶体抑制剂耐药性骨髓瘤细胞生存的新机制 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要进一步的前瞻性研究验证TRIM44的临床价值 | 探讨TRIM44在多发性骨髓瘤预后和治疗抵抗中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 858例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11869 | 2025-10-07 |
3D-Bioprinted Co-Cultures of Glioblastoma Multiforme and Mesenchymal Stromal Cells Indicate a Role for Perivascular Niche Cells in Shaping Glioma Chemokine Microenvironment
2024-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171404
PMID:39272976
|
研究论文 | 本研究利用3D生物打印技术构建胶质母细胞瘤与间充质基质细胞共培养模型，探索血管周围微环境细胞在塑造胶质瘤趋化因子微环境中的作用 | 首次结合公共测序数据分析和3D生物打印技术，揭示血管周围微环境细胞对胶质母细胞瘤趋化因子谱多样性的关键调控作用 | 研究仅使用两种胶质母细胞瘤细胞系，未涵盖GBM的完整异质性；体外模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究胶质母细胞瘤微环境中不同细胞类型对趋化因子分泌的贡献 | 胶质母细胞瘤细胞系(U-251和DK-MG)和间充质基质细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 3D生物打印，单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 3D共培养模型 | RNA测序数据，分泌组数据 | 两种胶质母细胞瘤细胞系和间充质基质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11870 | 2025-10-07 |
Genome Restructuring around Innate Immune Genes in Monocytes in Alcohol-associated Hepatitis
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.07.607014
PMID:39211112
|
研究论文 | 本研究通过Hi-C技术分析酒精相关性肝炎患者单核细胞的基因组三维结构变化 | 首次在酒精相关性肝炎患者单核细胞中发现基因组三维结构的显著改变，特别是在天然免疫基因簇区域 | 样本量较小（仅4例患者和4例对照），需要更大规模研究验证 | 探究酒精相关性肝炎中单核细胞基因组三维结构变化及其对炎症基因表达的调控 | 酒精相关性肝炎患者和健康对照者的单核细胞 | 基因组学 | 酒精相关性肝炎 | Hi-C, scRNA-seq | NA | 基因组三维构象数据, 单细胞转录组数据 | 4例AH患者和4例健康对照 | NA | 高通量染色质构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11871 | 2025-10-07 |
Negative binomial mixture model for identification of noise in antibody-antigen specificity predictions from single-cell data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae170
PMID:39659592
|
研究论文 | 提出一种使用负二项混合模型对LIBRA-seq单细胞数据进行去噪的方法 | 首次将负二项混合模型应用于LIBRA-seq数据的噪声识别，通过聚类抗原计数为信号和噪声组分 | 方法在不同样本间存在数据规模和噪声结构的变异 | 提高单细胞B细胞受体测序数据中抗体-抗原特异性预测的准确性 | LIBRA-seq单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞B细胞受体测序，LIBRA-seq | 负二项混合模型 | 单细胞测序数据 | 9名供者代表的独立LIBRA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | LIBRA-seq（通过测序连接B细胞受体与抗原特异性） |
| 11872 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates cellular plasticity in esophageal small cell carcinoma following chemotherapy treatment
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1477705
PMID:39850495
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析食管小细胞癌患者化疗前后的细胞可塑性变化 | 首次在单细胞水平揭示食管小细胞癌化疗后的细胞可塑性动态变化及肿瘤微环境组成改变 | 仅基于单个患者的样本分析，样本量有限 | 探究食管小细胞癌化疗后细胞可塑性的分子机制 | 食管小细胞癌患者化疗前后的肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 食管小细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者化疗前后配对的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11873 | 2025-10-07 |
Correlation between circulating innate lymphoid cell precursors and thymic function
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103732
PMID:35118353
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胸腺在先天淋巴细胞池稳态维持中的作用 | 首次发现循环中存在表达细胞内CD3但不表达表面CD3的ILC前体细胞，并证明其分化能力受组织环境和年龄影响 | 未明确胸腺来源ILC前体在整体ILC池中的具体贡献比例 | 探究胸腺对周围组织先天淋巴细胞池稳态的维持作用 | 先天淋巴细胞前体、胸腺功能、不同组织环境 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和无胸腺裸鼠血液及组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11874 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and cytokine signatures in acute myeloid leukemia: A novel prognostic model
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102194
PMID:39689517
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病的细胞异质性，并基于细胞因子相关基因构建预后风险评分模型 | 首次基于7个关键细胞因子相关基因(CCL23, IL2RA, IL3RA, IL6R, INHBA, TNFSF15, TNFSF18)构建AML预后风险模型，揭示了风险组间免疫细胞浸润和细胞因子信号传导的显著差异 | 使用公开数据集，缺乏前瞻性临床验证 | 开发急性髓系白血病的精准预后评估工具 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据 | 多个独立AML患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11875 | 2025-10-07 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
|
研究论文 | 提出基于Kolmogorov-Arnold网络的KanCell深度学习模型，通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据来增强细胞异质性分析 | 利用KAN网络有效捕捉非线性关系并优化计算效率，在多种评估指标上优于现有方法 | NA | 开发整合单细胞和空间转录组数据的计算模型以解析细胞异质性 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、背外侧前额叶皮层和小鼠胚胎大脑 | 计算生物学 | 多种癌症（黑色素瘤、乳腺癌） | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | KAN（Kolmogorov-Arnold网络） | 基因表达数据 | 模拟和真实数据集（来自STARmap、Slide-seq、Visium和Spatial Transcriptomics平台） | 10x Genomics, 其他（STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics） | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Visium, 其他（STARmap、Slide-seq、Spatial Transcriptomics） | 10x Visium空间转录组平台及其他空间转录组技术 |
| 11876 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell transcriptome revealed the metabolic heterogeneity in human glioma
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e41241
PMID:39844970
|
研究论文 | 本研究通过整合分析批量、单细胞和空间转录组数据，揭示了人类胶质瘤的代谢异质性并建立了基于四种关键代谢途径的预后分型系统 | 首次基于四种关键代谢途径（谷氨酰胺分解、糖酵解、磷酸戊糖途径和脂肪酸氧化）构建胶质瘤代谢分型系统，并结合单细胞和空间转录组分析揭示代谢异质性与肿瘤微环境的关联 | 研究基于转录组数据，未直接验证代谢功能；样本量相对有限；需要进一步实验验证CX3CL1/CX3CR1信号轴的功能 | 开发基于代谢途径的胶质瘤分类系统，揭示代谢异质性及其临床意义 | 人类胶质瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 批量转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组 | ConsensusClusterPlus，CellChat，stLearn | 转录组数据，单细胞数据，空间数据 | 多个胶质瘤数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组，批量RNA-seq | NA | NA |
| 11877 | 2025-10-07 |
Clinical and immunological outcomes after randomized trial of baked milk oral immunotherapy for milk allergy
2025-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184301
PMID:39782691
|
研究论文 | 本研究评估烘焙牛奶口服免疫疗法对牛奶过敏儿童的安全性和有效性 | 首次通过随机试验证明烘焙牛奶口服免疫疗法可在减少不良反应的同时诱导脱敏，并识别了成功的免疫学相关标志物 | 样本量相对较小，仅包含30名参与者 | 确定烘焙牛奶口服免疫疗法是否能减少不良反应同时诱导脱敏，并识别成功的免疫学相关因素 | 3-18岁牛奶过敏儿童 | 临床免疫学 | 食物过敏 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | 预测模型 | 临床数据，免疫学数据 | 30名牛奶过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11878 | 2025-10-07 |
Altered Atlas of Exercise-Responsive MicroRNAs Revealing miR-29a-3p Attacks Armored and Cold Tumors and Boosts Anti-B7-H3 Therapy
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0590
PMID:39845707
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-29a-3p作为运动响应性miRNA通过抑制B7-H3表达攻击装甲型和冷肿瘤并增强抗B7-H3治疗的机制 | 首次发现miR-29a-3p是关键的运动响应性miRNA，能同时靶向巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞下调B7-H3表达，并开发了具有良好生物相容性的lipo@miR-29a-3p纳米递送系统 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索运动响应性miRNA在肿瘤抑制中的作用机制及其治疗潜力 | 乳腺癌及多种泛癌类型，包括巨噬细胞、成纤维细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，飞行时间质谱流式细胞术，体外实验，体内模型 | 动物模型 | 基因表达数据，预后数据，单细胞测序数据 | 多个独立公共队列和内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11879 | 2025-10-07 |
NBAtlas: A harmonized single-cell transcriptomic reference atlas of human neuroblastoma tumors
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114804
PMID:39368085
|
研究论文 | 本研究整合了七个单细胞或单核转录组数据集，构建了一个包含362,991个细胞的人类神经母细胞瘤协调参考图谱 | 创建了首个涵盖61名患者的大规模神经母细胞瘤单细胞转录组协调参考图谱，揭示了肿瘤区室转录组特征与临床结局的关联 | 整合的研究数据量仍有限，可能无法完全代表神经母细胞瘤的全部异质性 | 构建人类神经母细胞瘤的单细胞转录组参考图谱并解析其肿瘤异质性 | 神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61名患者的362,991个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 11880 | 2025-10-07 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
|
研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过抑制PD-1+Nrp1lo Treg细胞调控IL6中性粒细胞募集，从而控制炎症驱动性结直肠肿瘤发生 | 首次发现PD-L1通过调控PD-1+Nrp1lo Treg细胞亚群和IL6中性粒细胞来抑制结直肠肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究PD-L1在结直肠癌中调控T细胞功能的具体机制 | 小鼠结直肠肿瘤模型中的T细胞亚群和中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |