单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 11841 - 11860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11841 | 2024-08-05 |
Dynamic immune status analysis of peripheral blood mononuclear cells in patients with Klebsiella pneumoniae bloodstream infection sepsis using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380211
PMID:38898888
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了克雷伯氏肺炎菌血流感染引起的脓毒症患者外周血单核细胞的动态免疫状态 | 首次研究了在克雷伯氏肺炎菌血流感染急性阶段和恢复阶段外周血单核细胞的免疫状态变化 | 样本量仅为13个，可能影响结果的广泛适用性 | 揭示克雷伯氏肺炎菌血流感染引起的脓毒症患者外周血单核细胞的免疫功能机制 | 包括3名健康对照和10名因克雷伯氏肺炎菌血流感染而入院的患者 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 13个样本（3名健康对照，7名急性阶段患者，3名恢复阶段患者） |
| 11842 | 2024-08-04 |
Identification of Niche-Specific Gene Signatures between Malignant Tumor Microenvironments by Integrating Single Cell and Spatial Transcriptomics Data
2023-10-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14112033
PMID:38002976
|
研究论文 | 该文章提出了一种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法，以识别恶性肿瘤微环境中的特定基因特征 | 通过整合scRNA-seq和空间转录组数据，识别特定于细胞生态位的基因特征，展示了这一整合方法的潜力 | 未提及具体的局限性 | 旨在综合评估组织样本中的基因活性并识别细胞生态位特异性基因特征 | 研究对象包括五种癌症类型的配对或匹配的scRNA-seq和Visium平台数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、胃肠道间质肿瘤、肝细胞癌、子宫内膜癌、卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及五种癌症类型的配对或匹配样本数据 |
| 11843 | 2024-08-04 |
Targeting intratumor heterogeneity suppresses colorectal cancer chemoresistance and metastasis
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256416
PMID:37338390
|
研究论文 | 本文研究了肠道肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌化疗抗性和转移的影响 | 创新点在于揭示了结直肠癌干细胞样细胞的不对称分裂在早期肿瘤异质性建立中的关键作用 | 本研究仅集中于结直肠癌，可能无法广泛适用于其他类型癌症 | 研究肠内肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌治疗的影响 | 研究对象为结直肠癌干细胞样细胞及其衍生的细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 七个细胞亚型的异种移植模型 |
| 11844 | 2024-08-04 |
Quantification of spatial pharmacogene expression heterogeneity in breast tumors
2023-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1686
PMID:35906899
|
研究论文 | 本研究分析了乳腺肿瘤中286个药物基因的空间表达异质性。 | 该研究利用新开发的Visium空间转录组平台，首次定量分析了乳腺肿瘤中药物基因的空间异质性。 | 本研究主要关注了六个乳腺癌样本，样本量相对较小，可能影响结果的普适性。 | 研究肿瘤组织中药物基因的空间表达异质性及其对癌症治疗的影响。 | 六个乳腺癌组织样本中的286个药物基因。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 六个乳腺癌组织样本 |
| 11845 | 2024-08-05 |
A transcriptomics-guided drug target discovery strategy identifies receptor ligands for lung regeneration
2022-03-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj9949
PMID:35319981
|
研究论文 | 本研究提出了一种转录组指导的药物靶标发现策略，识别了用于肺部再生的受体配体 | 开发了一种新方法来识别针对慢性阻塞性肺病(COPD)的再生药物靶标，强调了EP和IP前列腺素受体配体的疗效 | 研究可能未充分考虑其他可能影响慢性病修复机制的因素 | 探索治疗慢性疾病中的组织修复缺陷的新药物靶点 | 烟草相关的慢性阻塞性肺病患者及其小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 结合慢性阻塞性肺病的临床样本和吸烟小鼠模型 |
| 11846 | 2024-08-05 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
|
研究论文 | 本研究揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型的不同免疫特性 | 首次明确了FIRS I型和II型的免疫机制差异，揭示了它们在免疫反应中的不同角色 | 由于FIRS的低发病率和产后诊断困难，分子机制仍未完全理解 | 探讨胎儿炎症反应综合征(I型和II型)的免疫机制 | 来自早产儿的脐血样本，诊断为FIRS I型或II型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 人类脐血样本来自早产儿 |
| 11847 | 2024-08-05 |
The CDK9 inhibitor enitociclib overcomes resistance to BTK inhibition and CAR-T therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jun-18, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00589-7
PMID:38886769
|
研究论文 | 该文章探讨了CDK9抑制剂enitociclib对抗MCL中的BTK抑制和CAR-T疗法的耐药性 | 研究表明CDK9是双重耐药样本中上调基因的关键成分，提出针对CDK9的治疗可能有效对抗耐药性 | 尚未提及临床试验的数据和对其他类型淋巴瘤的适用性 | 研究新疗法以克服对BTK抑制和CAR-T治疗的耐药性 | 主要研究了mantle cell lymphoma (MCL) 的耐药性以及enitociclib的疗效 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 涉及MCL和弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系 |
| 11848 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing unveils extensive intratumoral heterogeneity of cancer/testis antigen expression in melanoma and lung cancer
2024-Jun-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008759
PMID:38886115
|
研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤和肺癌中癌/睾丸抗原表达的广泛肿瘤内异质性 | 首次使用单细胞mRNA测序详细描述了肿瘤内癌/睾丸抗原表达的异质性，特别是在黑色素瘤和肺癌中 | 虽然研究揭示了广泛的异质性，但肺癌中只在五个肿瘤中发现一个肿瘤的均匀表达，因此发现可能不足 | 研究癌/睾丸抗原在黑色素瘤和肺癌中的表达异质性及其对免疫治疗的影响 | 临床获得的黑色素瘤和肺癌样本中的癌细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤; 肺癌 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 临床衍生样本中的多肿瘤细胞 |
| 11849 | 2024-08-05 |
PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development
2024-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49342-6
PMID:38858353
|
研究论文 | 该文章全面阐述了新生子宫在单细胞分辨率下的动态发展，及PR-SET7在子宫内干扰素应答和细胞死亡中的作用 | 揭示了PR-SET7通过催化H4K20me1对新生子宫基质发展进行表观遗传调控的机制 | 研究未明确探讨PR-SET7在其他阶段或不同生理条件下的作用 | 阐明PR-SET7在新生子宫基质发育中的表观遗传调控作用 | 新生子宫基质及其细胞群体 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 11850 | 2024-08-04 |
Defining mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived suppressor cells using single-cell transcriptomics
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.04.026
PMID:38627968
|
研究论文 | 本研究分析了间充质干细胞诱导的髓系来源抑制细胞的转录组特征 | 识别了MSC诱导的MDSCs的独特转录组特征，并确定了CSF-1R作为检测和富集MDSCs的关键细胞表面标记 | 研究中未指出关于RELM-γ对T细胞增殖及其他功能的具体影响 | 揭示间充质干细胞诱导的髓系来源抑制细胞的机制和特征 | 间充质干细胞诱导的CD11bLy6C细胞及其亚群 | 数字病理学 | 自体免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 分析了多种MDSCs和CD11bLy6C细胞亚群 |
| 11851 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009
PMID:38795702
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11852 | 2024-08-05 |
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537364
PMID:37131803
|
研究论文 | 本文介绍了一种计算框架D-SPIN，用于从单细胞RNA测序数据中构建基因调控网络模型 | D-SPIN模型能够通过量化的方式揭示细胞在基因敲低干扰下的调控逻辑和细胞路径组织 | NA | 旨在重建基因调控网络，理解细胞如何在有不同干扰条件下调节基因表达 | 大规模的Perturb-seq和药物反应数据集 | 计算生物学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 概率模型 | 基因表达数据 | 来自数千种不同干扰条件的单细胞数据集 |
| 11853 | 2024-08-05 |
Neutrophil extracellular traps induced by IL-1β promote endothelial dysfunction and aggravate limb ischemia
2024-Jun, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-024-01661-3
PMID:38605142
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肢体缺血相关的血管炎症和重塑中的功能意义 | 研究揭示了IL-1β诱导的NETs在肢体缺血中加剧内皮功能障碍的机制 | 未提供肢体缺血中NETs作用的全面机制和治疗效果的长期观察 | 研究NETs在肢体缺血相关血管炎症中的作用 | 本研究对象为人类肢体缺血中的中性粒细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光法 | NA | NA | NA |
| 11854 | 2024-08-05 |
RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis
2024-Jun, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01301-w
PMID:38734851
|
研究论文 | 本研究探讨了RIPK1在维持外周T细胞存活和防止TNFR1诱导的凋亡中的重要作用 | 揭示了RIPK1在不同外周T细胞亚群中的功能差异，且RIPK1的支架功能对T细胞的存活至关重要 | 未能明确不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求差异 | 研究RIPK1在外周T细胞的生存和免疫反应中的作用 | 以RIPK1条件性缺失小鼠和其他基因敲除小鼠作为研究对象 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 小鼠基因敲除技术 | NA | 转录组数据，细胞分选数据 | 涉及的样本包括不同亚群的CD4和CD8 T细胞 |
| 11855 | 2024-08-05 |
T cells in testicular germ cell tumors: new evidence of fundamental contributions by rare subsets
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02669-9
PMID:38649788
|
研究论文 | 本文分析了罕见T细胞亚型在睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）中的基本贡献 | 首次发现人类睾丸中稀有Treg和Tfh细胞与TGCT的病理生物学相关 | 样本来源和患者间的显著异质性可能影响结果的普遍性 | 研究TGCT中免疫细胞组成的变化及其在肿瘤微环境中的角色 | 分析来自独立患者队列的人类睾丸标本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化和流式细胞术 | NA | 组织样本 | 来自多个独立患者队列的人类睾丸标本 |
| 11856 | 2024-08-05 |
Spatially distinct epithelial and mesenchymal cell subsets along progressive lineage restriction in the branching embryonic mammary gland
2024-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00115-3
PMID:38760574
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序绘制了小鼠乳腺上皮和间充质的图谱，并重建了多能干细胞的分化轨迹 | 确定了承诺的和多能乳腺干细胞的早期分子标记，并定义了它们在发育组织中的空间分布 | 缺乏对早期命运特征的具体标记，限制了对乳腺干细胞衍生的谱系承诺前体的描述 | 阐释多能干细胞的谱系特征及其在乳腺发育中的空间定位 | 小鼠乳腺上皮和间充质中的多能干细胞及其后代 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E13.5到分娩阶段的小鼠样本 |
| 11857 | 2024-08-05 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Jun, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.04.041
PMID:38685385
|
研究论文 | 本研究评估了Xkr8敲除对增强化疗效果和调节肿瘤免疫微环境的影响 | 提出了Xkr8与化疗联合的全新策略，以增强抗肿瘤免疫反应并克服化学免疫耐药性 | 在临床相关的正位模型中进行的研究可能限制了结果的广泛适用性 | 探索Xkr8敲除对肿瘤免疫微环境的影响及其在化疗中的潜在应用 | 研究对象为肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 在正位胰腺肿瘤模型中使用了具有临床相关性的样本 |
| 11858 | 2024-08-04 |
KLRB1 defines an activated phenotype of CD4+ T cells and shows significant upregulation in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112072
PMID:38636371
|
研究论文 | 本研究探讨KLRB1在CD4+ T细胞中的作用及其在原发性干燥综合症中的重要性 | 发现KLRB1在CD4+ T细胞激活表型中的独特性并与临床疾病指标相关 | 样本量有限，仅包含37名健康对照和44名患者的数据 | 研究KLRB1在原发性干燥综合症中的作用 | 44名原发性干燥综合症患者和37名健康对照的外周血样本 | 数字病理学 | 原发性干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 流式细胞术 | 血液样本 | 共81个样本，包括44名患者和37名健康对照 |
| 11859 | 2024-08-04 |
Deciphering Abnormal Platelet Subpopulations in COVID-19, Sepsis and Systemic Lupus Erythematosus through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115941
PMID:38892129
|
研究论文 | 本研究旨在理解激活血小板的转录异质性及其对败血症、新冠肺炎和系统性红斑狼疮等疾病的影响 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习方法，揭示了血小板亚群在疾病严重性中的差异，并标识出重要的血小板异质性生物标志物 | 本研究的局限性在于对激活血小板转录组异质性的了解仍然有限，未来需进一步验证发现的生物标志物 | 本研究旨在剖析激活血小板的复杂转录谱，以帮助开发针对异常和致病血小板亚型的靶向疗法 | 本研究分析了来自413例患者的47,977个血小板的单细胞转录谱 | 数字病理 | 新冠肺炎, 败血症, 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组, 深度神经网络 (DNN), 极端梯度提升 (XGB), UMAP | NA | 转录组 | 413个样本 |
| 11860 | 2024-08-04 |
Identification of Marker Genes in Infectious Diseases from ScRNA-seq Data Using Interpretable Machine Learning
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115920
PMID:38892107
|
研究论文 | 本文提出了一种早期诊断系统，用于区分免疫失调综合征的严重程度 | 通过可解释的机器学习方法识别感染相关的关键基因，能够区分不同感染程度 | 本文未提及样本量及数据来源的具体限制 | 构建用于识别感染严重程度的早期诊断系统 | 重点研究不同免疫细胞和基因在感染中的表达变化 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |