单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 11841 - 11860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11841 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Transcriptome of the Human Endometrium Reveals Epithelial Characterizations Associated with Recurrent Implantation Failure
2024-01, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300110
PMID:37690851
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示了与反复植入失败（RIF）相关的子宫内膜上皮特征 | 首次表明RIF患者子宫内膜腺体中MAP2K6 EPCAM上皮细胞替代腺上皮细胞，并表明RIF患者衍生的腺体类器官对性激素反应减弱 | 研究样本量较小，仅包括3名RIF患者，可能影响结果的普适性 | 探讨反复植入失败患者中子宫内膜的细胞和分子机制 | 研究对象为3名反复植入失败患者的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 3名反复植入失败患者，分析25,315个单个细胞 |
| 11842 | 2024-08-05 |
T cell-related ubiquitination genes as prognostic indicators in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424752
PMID:38919610
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T细胞相关泛素化基因的HCC预后风险评分 | 提出了一种新的预后和免疫治疗效果预测指标，基于T细胞相关泛素化基因 | 未提及具体的限制 | 为肝细胞癌患者设计新的预后评估工具 | 肝细胞癌患者的T细胞相关泛素化基因 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | RNA数据 | 3050个T细胞标记基因，结合TCGA的临床数据 |
| 11843 | 2024-08-05 |
Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305874
PMID:38917129
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研究论文 | 该文章展示了一种基于效应大小的替代方法，用于多物种单细胞RNA测序的差异分析 | 提出了一种基于效应大小的分析管道，适用于小样本和多物种数据的融合 | 涉及的样本小，且可能存在批次效应导致的偏差 | 旨在展示效应大小配置文件作为单细胞转录组分析的有效替代 | 探讨来自于人类和牛的外周血单核细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 其他 | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个物种的小样本数据，包括人类和牛的外周血单核细胞 |
| 11844 | 2024-08-04 |
Construction and Validation of a Prognostic Model Based on Novel Senescence-Related Genes in Non-Small Cell Lung Cancer Patients with Drug Sensitivity and Tumor Microenvironment
2023-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300190
PMID:37518773
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研究论文 | 本文开发了一种基于新颖衰老相关基因的预后模型，以评估非小细胞肺癌患者的药物敏感性和肿瘤微环境 | 提出了一种新的预后系统，基于12个衰老基因的表达，评估肺腺癌患者的生存风险 | 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能会受到数据集的限制 | 研究衰老相关基因在非小细胞肺癌中对预后的影响 | 非小细胞肺癌（LUAD）患者以及相关细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | LASSO Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和GEO数据集的样本，具体数量未在摘要中说明 |
| 11845 | 2024-08-04 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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评论 | 本文总结了空间单细胞技术在探索胃肠组织转录组方面的最新进展 | 提出了利用空间转录组技术提供基因表达的基因组范围全景，以揭示胃肠组织的分子组成 | 未在摘要中明确指出具体的局限性 | 推广对胃肠生理的理解 | 胃肠道组织及其单细胞层次的功能和表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 11846 | 2024-08-04 |
HSV-2 triggers upregulation of MALAT1 in CD4+ T cells and promotes HIV latency reversal
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164317
PMID:37079384
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研究论文 | 本研究探讨了单纯疱疹病毒2型（HSV-2）如何促进CD4+ T细胞中MALAT1的上调以及HIV的潜伏期逆转 | 研究首次揭示了HSV-2通过上调MALAT1和其他机制促进HIV-1的再激活 | 本研究没有提及样本的多样性和长期观察的结果 | 探究HSV-2感染如何影响HIV-1的潜伏期和再激活机制 | 研究的对象是人类CD4+ T细胞和2D10细胞模型 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序 | 2D10细胞模型 | RNA序列数据 | 使用了人类CD4+ T细胞和若干2D10细胞样本 |
| 11847 | 2024-08-04 |
Dissociation protocols used for sarcoma tissues bias the transcriptome observed in single-cell and single-nucleus RNA sequencing
2023-May-31, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10977-1
PMID:37254069
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研究论文 | 本文研究了不同肉瘤亚型的细胞分离方法对转录组的影响 | 首次阐明了分离方法对肉瘤患者衍生肿瘤样本分子特征解读的影响 | 仅探讨了三种肉瘤亚型，可能不适用于所有肉瘤类型 | 评估不同的细胞分离方法如何影响肉瘤样本的转录组数据 | 患者来源的肉瘤样本及其相应的单细胞和单核RNA测序数据 | 数字病理 | 肉瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 125,831个细胞和细胞核 |
| 11848 | 2024-08-05 |
Clonally expanded, thyrotoxic effector CD8+ T cells driven by IL-21 contribute to checkpoint inhibitor thyroiditis
2023-05-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg0675
PMID:37196065
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研究论文 | 本研究揭示了IL-21驱动的克隆扩展的效应CD8+ T细胞在免疫检查点抑制剂相关甲状腺炎中的作用 | 首次直接比较了免疫检查点抑制剂甲状腺炎与自身免疫性桥本甲状腺炎的免疫浸润，揭示了IL-21在甲状腺毒性CD8 T细胞中的关键作用 | 研究主要依赖于小鼠模型，缺乏临床试验数据支持 | 探讨免疫检查点抑制剂相关副作用的免疫机制及潜在治疗靶点 | 包括接受免疫检查点抑制剂治疗的患者和桥本甲状腺炎患者的甲状腺样本 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 涉及多个患者的甲状腺样本 |
| 11849 | 2024-08-05 |
C5aR1-positive neutrophils promote breast cancer glycolysis through WTAP-dependent m6A methylation of ENO1
2021-07-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04028-5
PMID:34312368
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研究论文 | 本文探讨了C5aR1阳性中性粒细胞如何通过WTAP依赖性m6A甲基化促进乳腺癌的糖酵解。 | 识别出一种新类型的C5aR1阳性中性粒细胞，与乳腺癌进展和不良预后相关。 | 当前对中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用尚不明确，仍需进一步研究。 | 研究C5aR1阳性中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用及其机制。 | C5aR1阳性中性粒细胞及其在乳腺癌中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 临床乳腺癌样本及单细胞数据 |
| 11850 | 2024-08-05 |
Crosstalk among proximal tubular cells, macrophages, and fibroblasts in acute kidney injury: single-cell profiling from the perspective of ferroptosis
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01072-z
PMID:38753279
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研究论文 | 本文研究了近端小管细胞、巨噬细胞和成纤维细胞在急性肾损伤中的相互作用，尤其关注铁死亡的视角 | 文章首次揭示了急性肾损伤中细胞之间的相互作用及其与铁死亡的关系 | 尚未详细探讨急性肾损伤中铁死亡的具体机制 | 探讨急性肾损伤中细胞的相互作用及其对铁死亡的影响 | 近端小管细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 急性肾损伤小鼠和人类样本 |
| 11851 | 2024-08-05 |
Vanin-2 is expressed in peripheral blood T cells and upregulated in SLE patients
2024-Jun-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae145
PMID:38920355
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研究论文 | 该研究探讨了Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的表达及其在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的上调情况 | 发现Vanin-2在T细胞中的独特表达，并与SLE患者T细胞功能变化相关 | 研究中未探讨其他vanin家族成员在T细胞中的作用 | 阐明Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的重要性 | 外周血T淋巴细胞及其在SLE患者中的表达 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，西方印迹 | NA | NA | NA |
| 11852 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of spermatogenesis in obstructive azoospermia and Sertoli cell-only patients
2024-Jun-25, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcae009
PMID:38192002
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研究论文 | 本研究展示了阻塞性无精症和仅有塞尔托利细胞患者中生精过程的长读转录组特征 | 首次利用PacBio长读测序揭示了人类生精过程中的新转录本和新基因 | 研究样本量较小，仅限于患者的睾丸活检样本 | 揭示阻塞性无精症患者中生精的转录组特征 | 阻塞性无精症和非阻塞性无精症患者的睾丸细胞 | 数字病理学 | 生育不孕 | PacBio长读单细胞测序 | NA | 转录组数据 | OA患者3个样本，NOA患者3个样本 |
| 11853 | 2024-08-05 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞转录复杂性指标(SCTC)，用于更准确地推断单细胞的发育潜力。 | 引入了经济复杂性理论的见解，以改进对单细胞发育潜力的测量，比现有指标SCTD更精确。 | 在某些情况下，G表达并不会单调减少，这可能影响现有发育潜力估计的准确性。 | 研究单细胞分析中发育潜力的推断及伪时间重建方法。 | 关注单细胞转录组数据，这些数据能够提供细胞的发育潜力信息。 | 数字病理 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA |
| 11854 | 2024-08-05 |
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011
PMID:38599212
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研究论文 | 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮Norrin/β-连环蛋白信号通路来调控视网膜血管生成和血-retinal屏障的成熟 | 研究首次表明谷氨酸能活动在视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟中扮演重要角色 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探讨谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟 | 小鼠视网膜中的神经元和血管内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和药理学激活 | NA | 基因组数据和功能验证结果 | 使用了若干小鼠视网膜样本 |
| 11855 | 2024-08-05 |
MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing
2024-Jun-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06775-7
PMID:38866777
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研究论文 | 本研究揭示了MAL2如何通过EGFR/SREBP-1通路重编程肝内胆管癌中的脂质代谢 | 发现MAL2在肝内胆管癌中的特异富集及其通过EGFR稳定膜定位来促进脂质积累的机制 | 本研究的局限性在于未能完全阐明MAL2与EGFR之间的所有可能交互作用 | 研究MAL2在肝内胆管癌中的作用及其机制 | 研究对象为肝内胆管癌细胞及其相关的细胞系和类器官 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | scRNA-seq，转录组学和代谢组学分析 | NA | NA | 涉及的样本数量及类型未明确说明 |
| 11856 | 2024-08-05 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸乙酰转移酶14在TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿纤维化中的作用 | 揭示了KAT14通过与血清反应因子SRF的合作，促进组蛋白H4乙酰化并增加ECM生成的机制 | 尚未深入探讨KAT14在其他类型内膜异位症中的作用及其潜在临床应用 | 研究TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿相关纤维化的分子机制 | 研究对象为卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类内膜间质细胞 | 数字病理学 | 卵巢内膜囊肿 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本，细胞系 | 涉及卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类间质细胞 |
| 11857 | 2024-08-05 |
Fibroblast Diversity and Epigenetic Regulation in Cardiac Fibrosis
2024-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116004
PMID:38892192
|
综述 | 本文探讨了心脏纤维化中成纤维细胞的多样性和表观遗传调控机制 | 强调了表观遗传调控在心脏纤维化发病机制中的关键作用，尤其是针对DNA甲基转移酶和组蛋白去乙酰化酶的靶向治疗潜力 | 研究主要集中在分子和细胞机制的探索上，具体的临床验证和应用尚需进一步研究 | 旨在阐明心脏纤维化中成纤维细胞的多样性及其激活过程的调控机制 | 研究对象为心脏成纤维细胞及其在心脏纤维化中的作用 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 11858 | 2024-08-04 |
Ablation of Vitamin D Signaling in Cardiomyocytes Leads to Functional Impairment and Stimulation of Pro-Inflammatory and Pro-Fibrotic Gene Regulatory Networks in a Left Ventricular Hypertrophy Model in Mice
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115929
PMID:38892126
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研究论文 | 本研究 aimed to clarify vitamin D 信号在左心室肥厚和功能障碍发展中的角色 | 本研究首次显示在小鼠心肌细胞中去除维生素 D 受体会导致心脏功能损害及促炎和促纤维化基因网络的刺激 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能难以直接推广到人类 | 阐明维生素 D 信号在左心室肥厚和功能障碍中的作用 | 主要研究对象为小鼠，包括野生型小鼠和心肌细胞特异性 VDR 敲除小鼠 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 横向主动脉缩窄术（TAC） | NA | 心脏组织切片转录组数据 | 4 个月大的雄性小鼠，包括多种基因型 |
| 11859 | 2024-08-05 |
Based on scRNA-seq and bulk RNA-seq to establish tumor immune microenvironment-associated signature of skin melanoma and predict immunotherapy response
2024-May-25, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-024-03080-3
PMID:38795156
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研究论文 | 本研究基于scRNA-seq和bulk RNA-seq数据建立了与皮肤黑色素瘤相关的肿瘤免疫微环境标志，并预测了免疫治疗反应 | 通过对SKCM的scRNA-seq数据分析，识别出五个肿瘤免疫微环境相关基因，并构建了TIMAS用于预测免疫治疗结果 | 研究未提及样本规模及其可能影响结果的局限性 | 探索与皮肤黑色素瘤相关的肿瘤微环境的预后指标以提高免疫治疗的有效性 | 分析皮肤黑色素瘤患者的肿瘤免疫微环境及其基因表达 | 数字病理学 | 皮肤癌 | scRNA-seq 和 bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11860 | 2024-08-04 |
Differential gene expression analysis of spatial transcriptomic experiments using spatial mixed models
2024-05-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61758-0
PMID:38744956
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研究论文 | 本文探讨了使用空间混合模型进行空间转录组实验的差异基因表达分析 | 使用线性混合模型与空间相关结构来有效处理数据中的空间自相关性，降低了第一类错误率 | 没有提到具体的局限性 | 研究如何有效分析空间转录组数据中的差异基因表达 | 空间转录组数据中的细胞和组织领域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 线性混合模型 | 基因数据 | NA |