单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11821 - 11840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11821 | 2024-08-05 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-Jun-05, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 本文观察了海参Apostichopus japonicus中环口神经环内神经细胞的超微结构和转录特征 | 首次应用单细胞RNA测序研究海参中神经细胞的转录特征并识别了六种神经细胞类型 | 缺乏对神经细胞功能及其在生态系统中作用的进一步研究 | 研究海参神经细胞的超微结构以及其转录特征 | 海参Apostichopus japonicus的环口神经环中的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 六种神经细胞类型 |
| 11822 | 2024-08-05 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jun-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了成蚊Aedes aegypti中肠细胞图谱 | 首次建立了Aedes aegypti中肠单细胞RNA测序的分离和测序协议 | 缺乏对已知转录组的重复性验证和其他中肠细胞的功能研究 | 研究Aedes aegypti中肠细胞类型及其在arbovirus感染中的作用 | Aedes aegypti成虫的中肠细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | NA |
| 11823 | 2024-08-04 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢修改如何限制SARS-CoV-2在类人气道器官中的传播 | 通过建立人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，首次揭示了脂质通路修改对SARS-CoV-2传播的限制作用 | 本研究主要基于体外模型，尚需进一步验证在真实生物体中的效果 | 揭示脂质代谢在COVID-19病毒感染中的作用机制 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，主要关注SARS-CoV-2的感染和传播 | 数字病理学 | 新冠病毒感染 | 单细胞测序（ScRNAseq） | 气道类器官（iPSC-AOs） | 细胞与分子生物数据 | NA |
| 11824 | 2024-08-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
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评论 | 本文回顾了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用和转录组权衡。 | 提出了单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种创新且尚未充分利用的技术，提供了独特的细胞层面转录组分析视角。 | 需要考虑传统方法与scRNA-seq之间的权衡。 | 探讨单细胞RNA测序在生殖毒理学中的应用及其对毒性物质暴露的响应。 | 主要研究斑马鱼的个体细胞基因表达谱。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11825 | 2024-08-05 |
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0045OC
PMID:37290124
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研究论文 | 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 | 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全推及人类 | 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 | 以SM22α-表达细胞为对象，分析其在肺泡化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型和早产儿样本 |
| 11826 | 2024-08-05 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
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review | 该综述重点介绍了膀胱癌患者的新靶点、进展和治疗方法 | 结合抗体药物偶联物（ADC）与免疫疗法的成功被视为膀胱癌治疗的重大突破，并探讨了其他ADC作为治疗选项的兴趣 | 该文献没有明确提及局限性 | 旨在阐明膀胱癌的治疗靶点，以改善患者特异性的护理和治疗结果 | 膀胱癌患者及其治疗相关的新靶点和方法 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11827 | 2024-08-05 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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review | 这篇综述总结了单细胞和空间组学在理解膀胱癌生物学中的最新进展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间组学技术在肿瘤微环境、膀胱癌异质性、癌症干性和细胞可塑性方面的创新应用 | 在将研究结果转化为临床实践和实施个体化治疗策略方面仍存在挑战 | 探讨单细胞和空间组学在膀胱癌中的应用及其对新治疗策略发展的影响 | 研究膀胱癌中肿瘤微环境和细胞异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间组学技术 | NA | NA | NA |
| 11828 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
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研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |
| 11829 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
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研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 |
| 11830 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
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研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 |
| 11831 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
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研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 |
| 11832 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11833 | 2024-08-05 |
Integrative bioinformatics approach yields a novel gene expression risk model for prognosis and progression prediction in prostate cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18405
PMID:38842134
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研究论文 | 本文构建了一个基于基因表达的新型前列腺癌预后和进展预测风险模型 | 开发了一个整合多种数据集的风险模型，并鉴定出八个独立预后因子 | 模型的验证仅通过一个独立数据集进行，可能限制了其广泛适用性 | 旨在建立一个有效的前列腺癌进展预测模型 | 前列腺癌患者，重点分析基因表达与无进展生存期之间的关系 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两例去势相关前列腺癌和两例激素相关前列腺癌样本 |
| 11834 | 2024-08-04 |
Mapping the Cellular Biogeography of Human Bone Marrow Niches Using Single-Cell Transcriptomics and Proteomic Imaging
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585083
PMID:38559168
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和蛋白质组成像绘制了人类骨髓微环境的细胞生物地理学 | 首次全面构建了人类骨髓的空间分辨多组学图谱 | 研究主要集中于较小的样本量，可能无法代表所有人群 | 探索人类骨髓中非造血细胞的空间组织及其功能 | 29,325个富集的非造血骨髓细胞及18例个体的样品 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) 和CO-检测通过索引 (CODEX) 多重成像 | NA | 图像和转录组数据 | 29,325个非造血骨髓细胞和18个个体样本 |
| 11835 | 2024-08-05 |
CD4+ T cell heterogeneity in gestational age and preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1401738
PMID:38774869
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠期和子痫前期中CD4+ T细胞的异质性。 | 文章首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体组分析揭示了妊娠年龄对决策性CD4 T细胞亚群的多样性和克隆性的重要性。 | 未提及具体的样本数量和方法的局限性。 | 研究CD4+ T细胞在妊娠期和子痫前期中的异质性及其对母胎耐受的影响。 | 决策性CD4 T细胞亚群及其在子痫前期中的表达变化。 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11836 | 2024-08-04 |
Cardiac pericytes mediate the remodeling response to myocardial infarction
2023-05-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162188
PMID:37183820
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研究论文 | 这篇文章探讨了心脏周细胞在心肌梗死后的重塑反应中的作用 | 首次揭示了心脏周细胞在急性缺血损伤后调控血管稳态和纤维化反应的关键角色 | 未详细探讨心脏周细胞的全部作用机制 | 旨在阐明心脏周细胞在缺血性重塑中的角色 | 心脏周细胞与心肌梗死后的纤维化及血管通透性变化 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个来源的心脏周细胞样本 |
| 11837 | 2024-08-04 |
Regulation of human salt-sensitivite hypertension by myeloid cell renin-angiotensin-aldosterone system
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1208270
PMID:37534363
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研究论文 | 本研究探讨了饮食盐对人类单核细胞免疫细胞中肾素-血管紧张素-醛固酮系统基因表达的影响及其在盐敏感性高血压中的作用 | 揭示了饮食盐摄入对人类单核细胞中RAAS表达的调控机制与系统性RAAS的不同 | 未探讨盐敏感高血压的长期影响和其他潜在的影响因素 | 研究盐敏感高血压中免疫细胞对饮食盐影响的机理 | 人类的单核细胞免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高盐处理的人类免疫细胞 |
| 11838 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a paracrine interaction that may drive oncogenic notch signaling in human adenoid cystic carcinoma
2022-11-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111743
PMID:36450256
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析人类腮腺腺样囊性癌中的肿瘤细胞间相互作用 | 首次揭示了腺样囊性癌中肿瘤细胞表达的异质性及其在Notch信号通路中的潜在作用 | 研究仍缺乏对人类肿瘤中MYB和Notch信号的完整体内描述 | 探索腺样囊性癌的病理生理学及其细胞信号传递机制 | 腺样囊性癌的原发肿瘤及其匹配的局部复发样本 | 数字病理学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含有腺样囊性癌的多个样本及三个已发表患者组 |
| 11839 | 2024-08-05 |
PRDM16 Is a Compact Myocardium-Enriched Transcription Factor Required to Maintain Compact Myocardial Cardiomyocyte Identity in Left Ventricle
2022-02-22, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究表明PRDM16是维持左心室紧凑型心肌细胞身份所需的转录因子。 | 建立了心肌特异性Prdm16基因敲除小鼠模型，该模型能够完全再现患者的左心室非紧凑型心肌病表型，揭示了PRDM16的作用机制。 | 目前尚不清楚PRDM16缺失如何导致左心室非紧凑型心肌病的具体分子机制。 | 探讨PRDM16在左心室非紧凑型心肌病中的作用和机制。 | 使用心肌细胞特异性Prdm16基因敲除小鼠及相关技术进行分析。 | 数字病理学 | 心脏病 | RNA测序，染色质免疫沉淀深度测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 生成并分析了心肌细胞特异性Prdm16基因敲除小鼠模型 |
| 11840 | 2024-08-05 |
Matters of the heart: Cellular sex differences
2021-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.04.010
PMID:34166708
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研究论文 | 本文探讨了心脏中男性和女性细胞的差异，特别是非肌肉细胞类型 | 探讨了细胞性别在心脏健康和疾病中的差异，强调了微环境对细胞表型的影响 | 许多研究未报告细胞的性别，且多数研究使用的细胞来自男性 | 研究心脏中细胞性别差异及其对心脏健康和疾病的影响 | 哺乳动物心脏的男性和女性细胞，包括非肌肉细胞族群 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |