单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11821	2024-08-05	Single cell transcriptomic analysis of the canine duodenum in chronic inflammatory enteropathy and health 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1397590 PMID:38933260	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析慢性炎性肠病犬的十二指肠细胞多样性	揭示了犬类十二指肠黏膜的细胞异质性和潜在的分子机制	该研究样本量较小，仅涉及7只狗	研究慢性炎性肠病中犬类十二指肠的细胞组成及其影响	健康犬和患有慢性炎性肠病的犬	数字病理学	肠道疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞转录组数据	7个样本（3只健康犬和4只慢性炎性肠病犬）
11822	2024-08-04	Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling 2023-Dec-20, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI172116 PMID:38127441	research paper	该研究探讨了肺间质中mTORC1的过度活跃如何导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑	本研究提出了肺间质细胞与内皮细胞之间的配体-受体间相互作用，强调了在LAM及其他mTORC1驱动疾病中改变的间质细胞与内皮细胞轴的重要性	当前研究的限制是未能探讨TSC2突变对内皮细胞的直接影响	研究LAM细胞如何与内皮细胞相互作用，以引发血管重塑	使用含有Tsc2基因缺失的mTORC1功能获得小鼠模型来研究肺间质细胞与内皮细胞的相互作用	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠模型	基因组数据	涉及1年的Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl小鼠
11823	2024-08-05	High-resolution transcriptomics informs glial pathology in human temporal lobe epilepsy 2022-10-23, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-022-01453-1 PMID:36274170	研究论文	本研究验证了一种从人类大脑皮层中同时分离神经元、星形胶质细胞和少突胶质前体细胞的方法，并研究了与颞叶癫痫相关的转录组特征	首次揭示了颞叶癫痫中特异性混合胶质亚群的存在，并表明其表达反应性星形胶质细胞和少突胶质细胞的特征	样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性	研究癫痫中的神经元和胶质细胞之间的复杂相互作用及其转录组特征	从癫痫手术样本中分离的神经元和胶质细胞群体	数字病理学	癫痫	RNA-seq，单细胞RNA-seq (scRNA-seq)	NA	转录组数据	包含四个额外的人类TLE样本和对照样本
11824	2024-08-05	Degradation-resistant implanted biomaterials establish an immunosuppressive microenvironment that induces T cell exhaustion by recruiting myeloid cells 2022-Jul, Fundamental research IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.fmre.2021.10.007 PMID:38933993	研究论文	研究表明，耐降解的钛基植入材料通过招募髓系细胞建立免疫抑制微环境，从而诱导T细胞耗竭	首次揭示了钛基植入物如何通过招募髓系细胞形成免疫抑制微环境	对植入物周围免疫环境的影响机制尚需进一步探索	探索植入生物材料对局部免疫环境的影响	耐降解的钛基植入材料及其对周围免疫环境的影响	数字病理	NA	单细胞RNA测序	NA	组织样本	NA
11825	2024-08-05	Multi-tissue scRNA-seq reveals immune cell landscape of turbot (Scophthalmus maximus) 2022-Jul, Fundamental research IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.fmre.2021.12.015 PMID:38933994	研究论文	本文开发了一个鲽鱼的动态细菌感染模型，并创建了鱼类免疫细胞景观。	首次系统性解析了鲽鱼中的免疫细胞亚群及其在细菌感染中的双重功能	主要集中于鲽鱼，结果可能不适用于其他鱼类	阐明骨鱼类免疫细胞的细致分布和功能	鲽鱼（Scophthalmus maximus）	数字病理学	NA	scRNA-seq	NA	表达谱数据	NA
11826	2024-08-05	Single-cell profiling of peanut-responsive T cells in patients with peanut allergy reveals heterogeneous effector TH2 subsets 2018-06, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2017.11.060 PMID:29408715	研究论文	该研究系统性地表征了花生特异性T细胞在花生过敏患者外周血中的表型。	首次发现花生过敏患者中存在多种效应性TH2亚群，并识别出与调节性T细胞相关的CD154表达变化。	研究主要集中在特定患者人群，结果可能不适用于其他类型的过敏或不同的种族人群。	全面表征花生特异性T细胞在花生过敏患者中的作用及其表型变化。	花生过敏患者及健康对照者的外周血样本中的花生反应性T细胞。	数字病理学	花生过敏	单细胞RNA测序	NA	样本细胞	包括花生过敏患者、健康对照者及高阈值个体的多个样本
11827	2024-08-04	Polypeptide N-Acetylgalactosaminyl transferase 14 is a novel mediator in pancreatic β-cell function and growth 2024-Sep-15, Molecular and cellular endocrinology IF:3.8Q2 DOI:10.1016/j.mce.2024.112269 PMID:38763428	研究论文	研究表明GALNT14在胰腺β细胞中高度表达，并调节其功能和生长	发现GALNT14是调节β细胞生物学的新型调节因子，为β细胞O-糖基化与糖尿病发展的关系提供了新的视角	研究主要集中在小鼠模型，尚未在其他物种中验证	探讨GALNT14在胰腺β细胞功能和生长中的作用	主要研究GALNT14在小鼠胰腺β细胞中的表达和功能	数字病理学	糖尿病	CRISPR/Cas9	NA	单细胞测序	三个啮齿动物2型糖尿病模型的初级岛屿
11828	2024-08-05	Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease 2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-024-00395-9 PMID:38914538	研究论文	本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模	提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法，并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系	模型的验证主要依赖于小鼠实验，可能不完全适用于人类	旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态	研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据	数字病理学	炎症性肠病	流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq)	常微分方程(ODE)	细胞计数数据和基因表达数据	涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据
11829	2024-08-04	Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research 2024-Jun-20, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02040-9 PMID:38902727	研究论文	本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用	本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化，提供了比传统转录组更多的信息	目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战	探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向	癌症相关的转录组数据及其空间表达	数字病理学	癌症	空间转录组测序技术	NA	基因表达数据	NA
11830	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model 2024-Jun-13, Kidney research and clinical practice IF:2.9Q1 DOI:10.23876/j.krcp.23.317 PMID:38934039	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了人类白细胞抗原（HLA）敏化过程中Th17通路的角色。	首次揭示了Th17细胞及其细胞因子在HLA敏化中的作用	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类生理	探究在人类白细胞抗原敏化中涉及的特定通路	使用HLA.A2转基因小鼠开发的异体敏化小鼠模型	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	分别从ALLO和SYN生成9190和8890个单细胞转录组
11831	2024-08-05	IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice 2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800 PMID:38695167	研究论文	本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的动脉粥样硬化逆转的影响	本研究首次揭示了IL-1β在饮食诱导动脉粥样硬化中的重要作用和机制	研究仅在阿泡蛋白E缺失小鼠模型中进行，可能影响结果的普适性	研究饮食改变对动脉粥样硬化病变性质和稳定性的影响	使用Apoe-/-小鼠模型来观察饮食对动脉粥样硬化病变的影响	心血管病学	心血管疾病	单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫染色，高分辨率共聚焦显微镜分析	NA	组织样本	Apoe-/-小鼠18只
11832	2024-08-04	Single-Cell Sequencing Reveals MYOF-Enriched Monocyte/Macrophage Subcluster as a Favorable Prognostic Factor in Sepsis 2024-05, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300673 PMID:38456367	research paper	本研究利用单细胞RNA测序揭示了脓毒症中MYOF富集的单核细胞/巨噬细胞亚簇作为有利预后因素	该研究首次展示了MYOF基因在脓毒症中的重要性，并揭示了其与生存结果的相关性	该研究的限制未被明确提及	探讨脓毒症中免疫细胞景观及其与预后的关系	单细胞RNA测序得到的脓毒症患者免疫细胞	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	研究中未明确样本数量
11833	2024-08-05	Satellite Cell-Derived Exosomes: A Novel Approach to Alleviate Skeletal Muscle Atrophy and Fibrosis 2024-04, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300558 PMID:38329214	研究论文	这项研究探讨了来自骨骼肌卫星细胞的外泌体在缓解骨骼肌萎缩和纤维化中的作用	引入了骨骼肌卫星细胞产生的外泌体作为治疗骨骼肌萎缩和纤维化的新方法	缺乏长期疗效的研究数据和在不同动物模型上的验证	研究骨骼肌卫星细胞外泌体在治疗骨骼肌萎缩和纤维化中的潜在应用	Sprague Dawley (SD) 大鼠的去神经骨骼肌	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	使用了去神经的Sprague Dawley (SD) 大鼠
11834	2024-08-04	Single-Cell Transcriptomics Reveals the Ameliorative Effect of Oridonin on Septic Liver Injury 2024-03, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300542 PMID:38408269	研究论文	该文章主要研究了Oridonin对脓毒症肝损伤的改善作用及其机制	通过单细胞转录组学揭示Oridonin在脓毒症模型中的保护机制	实验主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类	探索Oridonin对脓毒症引起的生理变化的保护作用	脓毒症诱导的小鼠肝脏模型	数字病理学	脓毒症	单细胞转录组测序	NA	细胞数据	63,486个细胞
11835	2024-08-04	Identification of Surface Markers and Functional Characterization of Myeloid Derived Suppressor Cell-Like Adherent Cells 2024-03, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300159 PMID:37986133	研究论文	本研究识别了髓源抑制细胞样附着细胞的基因特征及功能	本研究首次识别了特定的MLAC表面标记，为进一步研究这种细胞类型提供了重要工具	缺乏对MLAC特异性标记的了解在进一步特性化该细胞类型时造成限制	研究髓源抑制细胞样附着细胞在肿瘤微环境中的角色以及其特征	髓源抑制细胞样附着细胞的基因签名和功能特性	数字病理学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	使用公共单细胞RNA-seq数据分析特定细胞群体
11836	2024-08-04	Insight into Tetrabromobisphenol A-Associated Liver Transcriptional Landscape via Single Cell RNA Sequencing 2024-02, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300477 PMID:37867281	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术描述了四溴双酚A引起的小鼠肝脏转录组特征	揭示了四溴双酚A（TBBPA）对肝细胞和内皮细胞的功能障碍及其对免疫细胞招募的影响	研究仅在小鼠模型中进行，需在其他模型和人类样本中验证	探讨环境毒素四溴双酚A引发的肝脏损伤机制	小鼠肝脏中的主要细胞类型	数字病理学	肝病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型
11837	2024-08-05	Identification and Validation of Glomeruli Cellular Senescence-Related Genes in Diabetic Nephropathy by Multiomics 2024-02, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300453 PMID:37957539	研究论文	本研究旨在识别和验证与糖尿病肾病相关的肾小球细胞衰老相关基因	研究首次揭示FOS和ZFP36可能在糖尿病肾病中发挥抗衰老作用	研究中只是验证了部分核心基因的表达，仍需更大规模的验证	提供新的线索以基于抗衰老策略治疗糖尿病肾病	研究对象包括糖尿病肾小球和对照肾小球样本	数字病理学	糖尿病肾病	微阵列分析, scRNA-seq	NA	基因表达数据	41个糖尿病肾小球和20个对照肾小球样本
11838	2024-08-04	Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of B cells and tertiary lymphoid structures in muscle-invasive bladder cancer 2024-01-12, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-04860-1 PMID:38216927	研究论文	该研究揭示了肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中B细胞和三级淋巴结构的异质性	本研究提供了关于MIBC中B细胞亚型的异质性及TLSs在MIBC结果中的重要作用的新见解	本研究的局限性在于样本大小较小，仅涉及12名膀胱癌患者	探索肌肉侵袭性膀胱癌中肿瘤浸润B细胞和三级淋巴结构的功能和机制	该研究的对象为12名膀胱癌患者的B细胞和T细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	细胞	12名膀胱癌患者的11612个B细胞和55392个T细胞
11839	2024-08-05	Single-cell transcriptome sequencing reveals aberrantly activated inter-tumor cell signaling pathways in the development of clear cell renal cell carcinoma 2024-01-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-023-04818-9 PMID:38191424	研究论文	本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌发展过程中异常激活的肿瘤细胞间信号传导通路	首次揭示了透明细胞肾细胞癌中异常激活的细胞间信号通路及其特定的癌干细胞亚群体的作用	只分析了少量病例，且未深入探讨信号通路的具体机制	研究透明细胞肾细胞癌发展相关的细胞间信号传导	6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本	数字病理学	透明细胞肾细胞癌	scRNA-seq	NA	NA	6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本
11840	2024-08-05	Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneous features of myeloid-derived suppressor cells in newborns 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1367230 PMID:38919617	研究论文	本研究揭示了新生儿骨髓源抑制细胞的异质性特征和成熟轨迹	首次通过单细胞RNA测序明确了新生儿多形核骨髓源抑制细胞的分化阶段	尚未深入探讨新生儿MDSCs在免疫系统中的具体功能和机制	探讨新生儿骨髓源抑制细胞的组成及功能异质性	新生儿外周血中的多形核骨髓源抑制细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	生物样本数据	新生儿的外周血样本