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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11801 | 2025-10-07 |
KLRD1 (CD94): A Prognostic Biomarker and Therapeutic Candidate in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104762
PMID:39781341
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了KLRD1在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 首次系统评估KLRD1在多种癌症中的表达模式及其与预后的关系,并发现其在头颈鳞状细胞癌中作为独立预后因子的价值 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索KLRD1在癌症中的表达特征、预后价值和免疫治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和多种癌症类型的基因组数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析, 免疫浸润分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 来自TCGA、GTEx和GEO数据库的多癌症类型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11802 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis unveils cell subtypes of acral melanoma cells at the early and late differentiation stages
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.102045
PMID:39781353
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示肢端黑色素瘤在早期和晚期分化阶段的细胞亚型 | 首次识别出C3 ID2+黑色素瘤细胞作为早期亚群和C4 PCLAF+细胞作为晚期亚群在肢端黑色素瘤演化中的作用 | 仅包含6例患者样本,样本量有限,且黑色素瘤相关研究仍需进一步完善 | 研究肢端黑色素瘤的异质性及其进展机制 | 肢端黑色素瘤患者的黑色素瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 6例黑色素瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11803 | 2025-10-07 |
Elucidating the Role of Estrogen Effects in Leukemia: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100610
PMID:39781360
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法探索雌激素及其受体与白血病之间的因果关系 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法相结合研究雌激素与白血病的分子关系 | 方法学间存在不一致性,需要更大样本量和更高测序深度来阐明相互作用的复杂性 | 阐明雌激素效应在白血病中的作用机制 | 雌激素及其受体、白血病及相关蛋白 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 遗传风险评分分析 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞转录组数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11804 | 2025-10-07 |
TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3-mediated Mechano-metabolic Axis Promotes Skin Fibrosis
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.104484
PMID:39781462
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研究论文 | 本研究揭示了TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3机械代谢轴在皮肤纤维化疾病中的作用机制 | 首次发现TAGLN通过RhoA/ROCK2通路调控SLC2A3表达,建立机械环境与细胞代谢之间的联系 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探究TAGLN在皮肤纤维化发病机制中的作用 | 皮肤成纤维细胞和博来霉素诱导的小鼠皮肤纤维化模型 | 细胞生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序,RNA-seq,Transwell,伤口愈合实验,胶原凝胶收缩实验,免疫荧光 | NA | 基因表达数据,细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |
11805 | 2025-10-07 |
An Analysis Regarding the Association Between DAZ Interacting Zinc Finger Protein 1 (DZIP1) and Colorectal Cancer (CRC)
2025-Feb, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01065-1
PMID:38334905
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床样本分析,揭示了DZIP1在结直肠癌间质表型调控中的关键作用 | 首次发现DZIP1在成纤维细胞和癌细胞中表达,并证实其通过调控成纤维细胞活化和上皮间质转化促进结直肠癌进展 | 分子机制研究仍需深入,临床转化潜力有待进一步验证 | 探索DZIP1在结直肠癌发生发展中的作用机制 | 结直肠癌患者临床样本、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 假时序分析, 动物模型实验 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 临床样本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11806 | 2025-10-07 |
Intestinal Subtype as a Biomarker of Response to Neoadjuvant Immunochemotherapy in Locally Advanced Gastric Adenocarcinoma: Insights from a Prospective Phase II Trial
2025-Jan-06, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2436
PMID:39495175
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研究论文 | 本研究通过前瞻性II期临床试验发现肠道亚型可作为局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗疗效的生物标志物 | 首次发现Lauren分型中的肠道亚型与NAIC疗效相关,并构建了基于DNA损伤修复活性癌细胞和CLEC9A+树突状细胞的机器学习预测模型 | 单臂II期研究设计,样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探索局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗的疗效预测生物标志物 | 局部晚期胃腺癌患者 | 数字病理学 | 胃腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NaiveBayes | 转录组数据 | 104个样本(来自两个独立队列的75名患者)和105个初治胃腺癌单细胞RNA测序数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
11807 | 2025-10-07 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究人类皮肤衰老中表皮和真皮细胞衰老的特征 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并首次在单细胞水平系统揭示光老化和时序性衰老中不同皮肤细胞类型的衰老特征 | 研究主要关注特定细胞类型(黑色素细胞和成纤维细胞),可能未完全覆盖所有皮肤细胞类型的衰老特征 | 探究人类皮肤衰老过程中表皮和真皮细胞衰老的分子机制和空间分布特征 | 人类皮肤组织中的黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
11808 | 2025-10-07 |
Senescence landscape in the liver following sepsis and senolytics as potential therapeutics
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14354
PMID:39444093
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研究论文 | 本研究揭示了脓毒症诱导的肝脏细胞衰老景观及其对预后的影响 | 首次描述了脓毒症肝脏中的衰老景观,并证明衰老清除剂可显著降低脓毒症死亡率 | 研究仅使用小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究脓毒症诱导的肝脏细胞衰老机制及潜在治疗策略 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型肝脏组织 | 生物医学研究 | 脓毒症 | 单细胞测序,RNAscope,共聚焦显微镜,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据,流式数据 | 脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11809 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 本研究通过整合大量和单细胞转录组数据,揭示自噬在血液组织衰老过程中的关键作用及机制 | 首次通过整合大规模正常组织和AML样本的转录组数据,在单细胞分辨率水平确定经典单核细胞是衰老过程中自噬水平升高的关键细胞类型,并发现缺氧是重要调控因素 | 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证;样本来源和数量可能存在偏差 | 识别自噬与衰老相关性最强的组织,探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄血液样本、急性髓系白血病样本 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、不同年龄血液单细胞数据、2000多个AML样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
11810 | 2025-10-07 |
Non-glycanated ΔDCN isoform in muscle invasive bladder cancer mediates cancer stemness and gemcitabine resistance
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00998-8
PMID:39466536
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研究论文 | 本研究鉴定出膀胱癌干细胞中非糖基化ΔDCN亚型,揭示其通过诱导干细胞表型和赋予吉西他滨化疗耐药性促进肿瘤进展 | 首次在膀胱癌干细胞中发现非糖基化ΔDCN亚型,揭示其与糖基化DCN在细胞定位和功能上的对立作用 | 研究机制尚未完全阐明,临床样本量有限 | 阐明DCN对膀胱癌干细胞调控作用及在肌层浸润性膀胱癌中的机制 | 膀胱癌干细胞、膀胱癌细胞系、临床组织样本 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、慢病毒转染、CCK8检测、球体形成实验 | NA | 基因表达数据、临床病理特征、生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11811 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组学构建小鼠大脑时空图谱,开发空间衰老时钟模型揭示衰老和 rejuvenation 过程中的细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型(空间衰老时钟),系统揭示衰老过程中细胞对邻近细胞的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类大脑的适用性需要进一步验证 | 探究大脑衰老过程中细胞间相互作用的分子机制及其对组织功能衰退的影响 | 小鼠大脑细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞空间转录组测序 | 深度学习, 机器学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞,来自20个不同年龄阶段的小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
11812 | 2025-10-07 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322864121
PMID:38976727
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研究论文 | 本研究揭示了涡虫在伤口诱导下通过NFY转录因子调控神经元分化的机制 | 首次发现伤口诱导的NFY转录因子结合在脑再生早期启动神经分化通路 | 研究仅聚焦于涡虫模型,机制在其他再生动物中的普适性尚未验证 | 探究伤口诱导的转录调控事件如何启动神经元分化和脑再生 | 具有高再生能力的涡虫 | 发育生物学 | NA | 染色质可及性分析,单细胞转录组测序,功能研究 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11813 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境,并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11814 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
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研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案,用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案,具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记,可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |
11815 | 2025-10-07 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-05-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
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研究论文 | 本研究揭示了LYVE-1+巨噬细胞通过调节透明质酸细胞外基质促进乳腺肿瘤生长的机制 | 首次证明LYVE-1+巨噬细胞通过降解透明质酸和调节免疫微环境促进肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质和肿瘤微环境中的功能 | 小鼠乳腺组织和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
11816 | 2025-10-07 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-05-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究揭示了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌进展中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现MUC1-C通过整合STAT1炎症通路与∆Np63、SOX2基因表达,驱动头颈部鳞癌干细胞状态 | 主要基于细胞系研究,需要更多体内实验验证 | 探索MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系和肿瘤样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11817 | 2025-10-07 |
Role of ferroptosis in neuroimmunity and neurodegeneration in multiple sclerosis revealed by multi-omics data
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18396
PMID:38801304
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研究论文 | 通过多组学数据揭示铁死亡在多发性硬化症神经免疫和神经退行性变中的作用 | 开发了铁死亡水平的计算指标,首次通过整合单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学数据系统研究铁死亡在多发性硬化症中的作用机制 | 铁死亡在多发性硬化症中的确切作用机制仍需进一步验证 | 探究铁死亡在多发性硬化症发病机制中的作用 | 多发性硬化症患者样本 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | snRNA-seq, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, AUCell方法 | 诊断模型 | 多组学数据 | 七个不同白质病变区域的样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
11818 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示海胆胚胎细胞命运特化的进化重配置 | 首次利用比较单细胞RNA-seq发育时间序列揭示胚胎模式形成中的多样化进化变化 | 需要后续实验验证候选调控相互作用的假设 | 研究发育进化中调控互作的改变如何影响表型多样性 | 海胆Heliocidaris erythrogramma和其近缘物种的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海胆物种的发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11819 | 2025-10-07 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据,揭示了糖尿病心肌病中染色质可及性和转录组景观的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据构建糖尿病心肌病的综合图谱,识别了关键的转录因子和细胞亚群特异性变化 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明糖尿病心肌病的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 单细胞多组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | Seurat, Signac, chromVAR, Cicero | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞RNA和ATAC联合测序文库 |
11820 | 2025-10-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
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研究论文 | 本研究探讨了婴儿期不同浓度DEHP暴露通过组蛋白乙酰化异常导致睾丸稳态失衡的分子机制 | 首次揭示了婴儿期DEHP暴露通过线粒体功能障碍和组蛋白乙酰化异常导致未分化精原细胞命运差异的机制,并发现其对睾丸稳态的长期影响持续至成年期 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;DEHP暴露剂量和时程可能无法完全模拟真实环境暴露情况 | 阐明婴儿期DEHP暴露对睾丸发育和生殖系统功能的毒性机制 | 新生小鼠睾丸组织中的未分化精原细胞、支持细胞和间质细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第5天小鼠,分别接受40μg/kg和80μg/kg DEHP暴露10天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |