单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 11801 - 11820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11801 | 2024-08-05 |
Tracing the derivation of embryonic stem cells from the inner cell mass by single-cell RNA-Seq analysis
2010-May-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2010.03.015
PMID:20452321
|
研究论文 | 这篇文章探讨了内细胞团细胞转变为多能胚胎干细胞的机制 | 使用单细胞RNA测序分析揭示了胚胎干细胞自我更新和多能性的转变机制 | NA | 研究内细胞团细胞向多能胚胎干细胞转变的分子机制 | 内细胞团细胞及其向多能胚胎干细胞的转变过程 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 11802 | 2024-08-05 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveal heterogeneity and diagnostic markers in papillary thyroid carcinoma lymph-node metastasis
2024-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-023-02262-6
PMID:38146045
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研究论文 | 本研究分析了乳头状甲状腺癌的淋巴结转移，寻找诊断标记物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，探索了乳头状甲状腺癌淋巴结转移的异质性 | 研究中样本量有限，仅包括66名患者的样本 | 旨在发现乳头状甲状腺癌淋巴结转移的诊断标记物及治疗靶点 | 研究对象为乳头状甲状腺癌患者的淋巴结转移细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和常规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 66名乳头状甲状腺癌患者的样本 |
| 11803 | 2024-08-04 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-May-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
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综述 | 本文系统总结了巨噬细胞在心血管疾病中的多样性表型和功能可塑性及其调控机制 | 首次引入了单细胞测序技术的新视角，揭示了巨噬细胞的异质性及其在心血管疾病中的潜在治疗靶点 | 研究主要集中在巨噬细胞的功能和表型塑性，未涉及所有类型心血管疾病的综合分析 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的调控机制与治疗靶点 | 心血管疾病中的巨噬细胞及其相关机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 11804 | 2024-08-04 |
Multi-model analysis of gallbladder cancer reveals the role of OxLDL-absorbing neutrophils in promoting liver invasion
2024-May-31, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00521-7
PMID:38822440
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研究论文 | 本研究分析了胆囊癌及其免疫抑制的肿瘤微环境，突出显示了中性粒细胞在促进肝脏入侵中的作用 | 本研究识别了一种能够通过OLR1吸收oxLDL的促肿瘤中性粒细胞亚群，揭示了其独特的代谢特性和促进肿瘤侵袭的潜力 | 研究的限制在于未深入探讨不同阶段胆囊癌的细胞间相互作用及其机制 | 研究胆囊癌肿瘤微环境中特定中性粒细胞的作用及其对肝脏入侵的影响 | 主要研究对象为胆囊癌（GBC）中的中性粒细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学 (ST), 蛋白组学, 多重免疫组化 (mIHC) | NA | NA | 多种肿瘤阶段的胆囊癌样本 |
| 11805 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素，并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 11806 | 2024-08-05 |
Proteomic analysis of pleomorphic dermal sarcoma reveals a fibroblastic cell of origin and distinct immune evasion mechanisms
2024-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62927-x
PMID:38822058
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现多形性皮肤肉瘤的细胞来源和独特的免疫逃逸机制 | 首次识别出多形性皮肤肉瘤的潜在细胞来源及其免疫逃逸机制 | 样本数量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨多形性皮肤肉瘤的细胞起源及其免疫逃逸途径 | 分析健康皮肤、恶性黑色素瘤、鳞状细胞癌和多形性皮肤肉瘤的样本 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 质谱 | NA | 蛋白质数据、单细胞测序数据 | 分析了20个正常皮肤样本、27个恶性黑色素瘤样本、20个鳞状细胞癌样本和24个多形性皮肤肉瘤样本 |
| 11807 | 2024-08-04 |
Direct comparison of mass cytometry and single-cell RNA sequencing of human peripheral blood mononuclear cells
2024-May-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03399-6
PMID:38816402
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研究论文 | 本文直接比较了人类外周血单核细胞的质谱细胞术和单细胞RNA测序 | 通过整合质谱细胞术和单细胞RNA测序的数据，提供了细胞类型特征的高分辨率分析 | 缺乏合适的金标准数据集用于评估新单细胞分析工具的有效性 | 探讨转录组学和蛋白质组学之间的关系 | 人类外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，质谱细胞术，流式细胞术 | NA | RNA，蛋白质 | 人类外周血单核细胞的分样本 |
| 11808 | 2024-08-05 |
Neoantigen-specific stimulation of tumor-infiltrating lymphocytes enables effective TCR isolation and expansion while preserving stem-like memory phenotypes
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008645
PMID:38816232
|
研究论文 | 本研究探讨了针对新抗原特异性刺激肿瘤浸润淋巴细胞的效果。 | 开发了一种名为'NeoExpand'的体外刺激方法，能够选择性扩展新抗原反应性的TIL，改善其表型和功能。 | 研究样本仅限于具有p53或RAS突变的25名患者，可能影响结果的普遍适用性。 | 探讨如何优化新抗原反应性肿瘤浸润淋巴细胞的扩展和分离。 | 25名来自肺癌患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 体外刺激 | NA | 样本 | 25个TIL样本 |
| 11809 | 2024-08-05 |
Identification of epigenetic silencing of the SFRP2 gene in colorectal cancer as a clinical biomarker and molecular significance
2024-May-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05329-x
PMID:38802858
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研究论文 | 本研究调查了SFRP2基因的甲基化水平在结直肠癌中的临床生物标志物和分子意义 | 证明了SFRP2基因的启动子甲基化可以预测结直肠癌的病理特征和预后，尤其在血液样本中具有潜在的临床应用价值 | 研究未能涵盖其他类型的癌症和更大范围的人群，可能影响结果的普遍性 | 研究SFRP2基因甲基化在结直肠癌中的重要性，探索其作为生物标志物的潜力 | 包括110名健康参与者和85名结直肠癌患者的生物样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 450K DNA阵列和DNA焦磷酸测序 | NA | 血液、脂肪和结肠组织样本 | 共195个样本（110名健康参与者和85名结直肠癌患者） |
| 11810 | 2024-08-04 |
Multi-modal domain adaptation for revealing spatial functional landscape from spatially resolved transcriptomics
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae257
PMID:38819253
|
研究论文 | 提出了一种用于空间转录组学的多模态领域适应方法stMDA，以揭示空间功能格局 | stMDA整合了基因表达和其他模态的信息，提供了高效的空间聚类和变异分析 | 该研究可能在特定条件下仍面临数据稀疏性的挑战 | 该研究旨在提高空间转录组数据的分析能力 | 主要研究对象为空间转录组学数据及其多模态信息 | 数字病理学 | 癌症组织 | 多模态无监督领域适应 | 多种神经网络架构 | 基因表达数据和其他模态数据 | 涉及多种平台和物种的多样本数据 |
| 11811 | 2024-08-04 |
3D reconstruction of a gastrulating human embryo
2024-May-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.041
PMID:38657603
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研究论文 | 本研究建立了一个人类胚胎的三维模型，以理解早期人类发育，特别是在胚胎发生的重塑阶段。 | 通过高分辨率空间转录组分析，从自然胚胎获得了宝贵的参考数据集，填补了该领域的空白。 | 该研究主要依赖于来自单一样本的空间转录组数据，可能限制了结果的普适性。 | 探讨人类胚胎发育中重要阶段的细胞谱系和组织模式。 | 该研究对象是来自完整卡内基阶段8的人类胚胎的62个横截面。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 62个横截面 |
| 11812 | 2024-08-05 |
PIPET: predicting relevant subpopulations in single-cell data using phenotypic information from bulk data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae260
PMID:38819254
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于大规模数据的表型信息预测单个细胞数据中相关亚群的算法PIPET | 提出了一种新颖的算法，可以使用大规模数据中的多变量表型信息预测单细胞数据中的相关亚群 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在探索如何将小样本的单细胞数据与大样本丰富的临床特征进行整合 | 研究单个细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其与肿瘤相关的表型信息 | 数字病理学 | 肺腺癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多分类模型 | 基因表达数据 | 模拟数据集与肺腺癌和乳腺癌单细胞数据中的细胞亚群 |
| 11813 | 2024-08-05 |
Reduction of specific enterocytes from loss of intestinal LGR4 improves lipid metabolism in mice
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48622-5
PMID:38782937
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研究论文 | 该研究探讨肠道LGR4缺乏对脂质代谢的影响 | 首次发现LGR4缺失导致特定肠细胞的减少，从而改善脂质和葡萄糖代谢 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏人类临床数据支持 | 探究肠道LGR4对营养吸收和能量平衡的影响 | Lgr4小鼠及其肠道吸收细胞 | 数字病理学 | 肥胖症和肝脏脂肪变性 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了Lgr4小鼠和野生型小鼠进行对比 |
| 11814 | 2024-08-05 |
Carboxypeptidase M modulates BMSCs osteogenesis-adipogenesis via the MAPK/ERK pathway: An integrated single-cell and bulk transcriptomic study
2024-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302508R
PMID:38713087
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研究论文 | 本研究探讨了羧肽酶M（CPM）在骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）成骨与成脂过程中的调节作用 | 本研究揭示了CPM作为BMSCs分化的关键调节因子，并提供了MAPK/ERK通路在此过程中的作用机制的新线索 | 研究主要基于现有的数据分析，可能存在单细胞RNA测序数据的局限性 | 研究骨质疏松症（OP）中BMSCs成骨与成脂的平衡失调机制 | 主要研究骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）及其在骨质疏松症中的功能 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | NA | 细胞数据 | 分析了来自八个scRNA-seq数据集的56,377个细胞 |
| 11815 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell analysis uncovers the immunopathological mechanisms associated with IgA nephropathy progression
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173651
PMID:38716725
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研究论文 | 本研究通过跨物种单细胞分析揭示了与IgA肾病进展相关的免疫病理机制 | 采用跨物种单细胞RNA测序的方法探索IgA肾病的致病程序，并发现了与病情进展相关的特定蛋白表达 | 本研究的.sample size相对较小，未来需要更大范围的研究来验证结果 | 探讨IgA肾病的致病机制及其与肾功能下降的关系 | 人类IgA肾病及小鼠和大鼠IgA肾病模型 | 数字病理学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠IgA肾病模型 | 基因表达数据 | 21个进展样本和28个非进展样本 |
| 11816 | 2024-08-04 |
Decoding the principle of cell-fate determination for its reverse control
2024-May-06, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00372-2
PMID:38710700
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研究论文 | 该文章探讨了细胞命运决定的机制及其反向控制 | 提出了一种利用单细胞RNA-seq数据进行动态分子调控网络建模的概念控制框架 | 获取用于模型开发的基本动态实验数据仍然是一个重大障碍 | 理解和操控细胞命运决定的过程 | 细胞命运决定的核心调控电路及其主调控因子 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 动态分子调控网络数据 | NA |
| 11817 | 2024-08-04 |
Developmental regulation of primitive erythropoiesis
2024-05-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000806
PMID:38415349
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综述 | 本文概述了原始红细胞生成的最新研究进展，重点关注其胚胎起源和发展调控的物种特异性差异 | 揭示了新的转录因子及其非经典角色，扩展了对原始红细胞生成的理解，并表明了胚胎中红细胞生成的保护性特征 | 研究主要针对小鼠及稀有早期人类胚胎样本，缺乏更广泛的物种比较 | 深入理解原始红细胞生成的分子和代谢途径，以便为体外生成红细胞提供基础 | 重点研究原始红细胞的起源和发育调控，包括小鼠胚胎和稀有人类胚胎样本 | NA | NA | 单细胞转录组学和谱系追踪 | NA | 细胞样本 | 小鼠胚胎和稀有人类胚胎样本 |
| 11818 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of adipose tissue-derived mesenchymal stem cells under chondrogenic induction
2024-May, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:37915134
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪组织来源的间充质干细胞在软骨诱导下的异质性。 | 揭示了不同细胞簇之间在增殖和分化平衡中的差异，特别是在软骨刺激前后的动态变化。 | 研究主要集中在特定时间点的单细胞RNA测序，可能缺乏对更长期分化过程的全面了解。 | 研究脂肪组织来源间充质干细胞对软骨诱导的反应及其异质性。 | 脂肪组织来源的间充质干细胞（AT-MSCs）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 37,219个高质量转录本 |
| 11819 | 2024-08-04 |
The estrogen signaling pathway reprograms prostate cancer cell metabolism and supports proliferation and disease progression
2024-Apr-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170809
PMID:38625747
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研究论文 | 这篇文章揭示了雌激素受体α在前列腺癌细胞代谢中的作用，并支持其增殖和疾病进展 | 文章首次表明雌激素受体α在前列腺癌细胞代谢重编程中发挥重要作用，并可能作为治疗靶点 | 雌激素受体α在一半肿瘤中未表达，限制了对其临床相关性的全面理解 | 研究雌激素信号通路对前列腺癌细胞代谢和增殖的影响 | 使用人类前列腺癌组织微阵列和细胞模型研究前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-Seq | NA | 组织样本和细胞模型 | 来自两个前列腺癌组织微阵列的患者样本 |
| 11820 | 2024-08-04 |
Cholangiocytes Modulate CD100 Expression in the Liver and Facilitate Pathogenic T-Helper 17 Cell Differentiation
2024-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.11.283
PMID:37995866
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研究论文 | 这篇文章探讨了胆管细胞如何调节肝脏中CD100的表达并促进致病性T辅助17细胞的分化 | 文章首次表明胆管细胞通过与免疫细胞的交叉对话发挥作用，并强调了其在病理机制中的主动、促炎角色 | 研究主要依赖于特定小鼠模型，可能无法完全反映人类病理过程 | 理解原发性硬化性胆管炎相关的病理机制 | 主要研究胆管细胞与免疫细胞之间的相互作用及其在病理过程中的角色 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 空间转录组学、免疫成像、高维流式细胞术、RNA测序 | 细胞共培养模型 | 组织活检样本和细胞 | 涉及从变异特异性小鼠中提取的脾细胞及患者材料的多种样本 |