单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 11801 - 11820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11801 | 2024-08-04 |
Establishment and validation of a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature for predicting clinical outcomes and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01092-z
PMID:38900330
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研究论文 | 本文建立并验证了一个新的CD8+ T细胞相关预后标志，通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据来预测肝细胞癌的临床结果和免疫治疗反应 | 提出了基于CD8+ T细胞的预后标志，这为肝细胞癌患者临床结果和免疫治疗反应的预测提供了强有力的模型 | 尚未提及研究的具体局限性 | 探讨CD8+ T细胞相关基因在肝细胞癌中的预后意义 | 利用来自不同数据库的HCC的单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | Cox-Lasso回归模型 | RNA数据 | NA |
| 11802 | 2024-08-05 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
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research paper | 本文探讨了MYCT1在调节人类造血干细胞（HSCs）环境感知和内吞作用中的重要性 | 发现MYCT1是人类HSC的重要调控因子，其缺失使HSC在培养中失去干性 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证结果 | 揭示MYCT1在保持人类造血干细胞干性中的作用 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 11803 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing of 3' RNA Transcripts
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_16
PMID:38907922
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research paper | 本研究描述了一种通过单细胞封闭和捕获mRNA转录本3'端聚腺苷酸尾巴的单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法 | 结合细胞和分子条形码的技术创新使得能对细胞中表达的基因进行更精确的识别 | NA | 探讨单细胞RNA测序在细胞状态和行为研究中的应用 | 单个细胞内的RNA表达 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | NA |
| 11804 | 2024-08-05 |
Sequencing: 10X Genomics 3' HT Assay for Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_15
PMID:38907921
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研究论文 | 本文章介绍了10X Genomics 3' HT试剂盒用于基因表达的单细胞RNA测序方法 | 此试剂盒引入了新的专有芯片，支持更高数量的细胞条形码和更大样本容量 | 没有提到特定的局限性 | 研究单细胞RNA测序技术以提升基因表达研究的准确性 | 研究对象为单个细胞及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达序列 | 每次实验最多可处理16个样本 |
| 11805 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals dysregulated fibroblast subclusters in prurigo nodularis
2023-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.29.526050
PMID:36778229
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研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了瘙痒结节病中失调的成纤维细胞亚群。 | 本研究首次识别了瘙痒结节病中的七个独特的成纤维细胞亚群，并揭示了成纤维细胞与神经元之间的相互作用。 | 研究仍未完全理解瘙痒结节病的发病机制，且样本主要集中在黑人患者。 | 本研究旨在揭示瘙痒结节病的致病机制及相关细胞组分。 | 研究对象为28,695个瘙痒结节病损及非病损皮肤细胞。 | 数字病理学 | 瘙痒结节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 28695个瘙痒结节病细胞 |
| 11806 | 2024-08-05 |
The spatial transcriptomic landscape of the healing mouse intestine following damage
2022-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28497-0
PMID:35149721
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学定义了小鼠肠道在稳态和愈合过程中的转录组景观 | 揭示了结肠在稳态条件下的分子区域化特征，及其在粘膜愈合过程中的显著变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全代表人类的相应机制 | 探讨小鼠肠道在愈合过程中转录组的空间组织 | 小鼠结肠的转录组及其在愈合过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本 |
| 11807 | 2024-08-04 |
Zinc ions regulate mitochondrial quality control in neurons under oxidative stress and reduce PANoptosis in spinal cord injury models via the Lgals3-Bax pathway
2024-Aug-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了锌离子如何通过Lgals3-Bax通路在脊髓损伤模型中调节线粒体质量控制并降低PANoptosis | 研究揭示了锌离子在氧化应激下通过靶向Lgals3-Bax通路保护线粒体的机制，为脊髓损伤的治疗提供了一种新的方法 | 研究对锌离子的作用机制进行了探讨，但可能需要更多的临床数据来进一步验证 | 本研究旨在探讨锌离子在脊髓损伤中的保护作用及其机制 | 研究对象为脊髓损伤模型中的神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 11808 | 2024-08-05 |
Comparison of genetic and epigenetic profiles of periodontitis according to the presence of type 2 diabetes
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.620
PMID:38903536
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研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病与牙周炎之间的遗传和表观遗传特征的比较 | 使用多组学方法揭示了与Fc-伽马受体介导的吞噬作用通路相关的特定遗传和表观遗传变化 | 暂无具体的限制说明 | 深入理解2型糖尿病与牙周炎之间的相互关系 | 2型糖尿病患者的牙周组织样本与健康参与者进行比较 | 数字病理学 | 牙周炎, 2型糖尿病 | 全基因组测序, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 甲基化数据, RNA测序数据 | 涉及牙周炎患者（含糖尿病与不含糖尿病）及健康参与者的样本 |
| 11809 | 2024-08-04 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 该论文研究了肠道病毒基因型网络的结构和动态 | 使用单细胞测序方法揭示了病毒种群结构的复杂性，并将宿主细胞转录表型与病毒基因型结构联系起来 | NA | 理解病毒种群如何适应选择环境的变化 | 肠道病毒的基因型及其与宿主细胞转录组的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | mRNA | 来自数百个感染细胞的病毒单倍型 |
| 11810 | 2024-08-04 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
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研究论文 | 该文章探讨了跨种杂交引发的学习能力扩展，特别是关于鸟类的歌唱学习 | 研究揭示了杂交鸟类在学习能力上超越亲本的机制，特别是在神经元转录特征方面的独特性 | 缺乏对环境因素及其影响的具体研究 | 探索物种特定的歌唱学习的神经遗传机制 | F杂交鸟类的学习能力及其神经元特征 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | F杂交鸟类的多个个体 |
| 11811 | 2024-08-04 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-Jun-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
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research paper | 本研究提出了一种新的深度学习方法SPACE，用于通过细胞相互作用意识的细胞嵌入分析单细胞分辨率的空间转录组数据 | SPACE能够识别具有特殊空间分布模式和不同邻近相互作用细胞类型的空间信息细胞亚型，并自动发现具有明显边界的细胞社区 | NA | 揭示个体细胞如何发挥组织特异性功能的空间组织原则 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 11812 | 2024-08-05 |
Knockdown of ATRX enhances radiosensitivity in glioblastoma
2024-Jun-19, Chinese neurosurgical journal
DOI:10.1186/s41016-024-00371-6
PMID:38898533
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研究论文 | 本研究探讨了ATRX在胶质母细胞瘤中的放射敏感性作用 | 揭示了ATRX突变对胶质母细胞瘤患者生存期的影响，并提出ATRX作为克服放射抗性的新靶点 | 未提供具体的临床试验数据支持 | 研究ATRX在胶质母细胞瘤放射抗性中的作用 | 胶质母细胞瘤患者的ATRX突变率及其表达 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从癌症基因组图谱中获取的胶质瘤患者数据 |
| 11813 | 2024-08-04 |
Traumatic brain injury promotes neurogenesis at the cost of astrogliogenesis in the adult hippocampus of male mice
2024-Jun-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49299-6
PMID:38890340
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研究论文 | 创伤性脑损伤(TBI)导致小鼠成年海马中的神经发生增加，同时减少星形胶质细胞生成 | 本研究揭示了创伤性脑损伤如何改变神经干细胞的命运，促进神经发生而代价于星形胶质细胞生成 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，未考虑性别对结果的影响 | 探讨创伤性脑损伤对成年小鼠海马神经干细胞及其衍生细胞线的影响 | 成年雄性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 受控皮层撞击模型 | 细胞、基因表达数据 | NA |
| 11814 | 2024-08-05 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-Jun-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
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研究论文 | 本研究探讨了趋化因子chemerin在中性粒细胞逆向迁移中的作用机制 | 首次揭示了chemerin通过与C-C动机趋化因子受体样2的相互作用，吸引中性粒细胞离开炎症部位的机制 | 该研究主要集中在急性肺损伤模型，尚未在其他疾病模型中验证 | 旨在探索中性粒细胞逆向迁移的机制 | 主要研究在急性肺损伤模型中逆向迁移的中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 血液样本 | 急性肺损伤模型中的白细胞 |
| 11815 | 2024-08-05 |
Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63542-6
PMID:38890395
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研究论文 | 本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征 | 采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成 | 样本稀缺性可能影响研究结果的全面性 | 探讨人类窦房结的细胞组成和功能 | 主要聚焦于人类窦房结的细胞群体 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | RNA-seq | 深度学习解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考 |
| 11816 | 2024-08-05 |
Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64567-7
PMID:38890346
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研究论文 | 本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应 | 首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征 | 研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证 | 旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果 | 研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，差异表达基因分析 | Cox回归分析，LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明 |
| 11817 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis
2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02613-2
PMID:38890734
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研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制 | 发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制 | 研究未提及样本数量和临床有效性验证 | 探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制 | 分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 分析了32724个细胞 |
| 11818 | 2024-08-04 |
Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations
2024-06-07, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02746-6
PMID:38847845
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研究论文 | 本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。 | 识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。 | 缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。 | 旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。 | 研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 包括多个次级群体（SGS I-VIII）的样本 |
| 11819 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18373
PMID:38894657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用 | 首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型 | 研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性 | 揭示胃癌快速进展的分子生物学机制 | 对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 27名胃癌患者的38个样本 |
| 11820 | 2024-08-05 |
Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction
2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374
PMID:38752343
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研究论文 | 本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。 | 通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。 | 该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。 | 研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。 | 38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞 |