单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11801 - 11820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11801 | 2024-08-05 |
CBP/Catenin antagonists: Targeting LSCs' Achilles heel
2017-08, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2017.04.010
PMID:28479420
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评论 | 这篇文章讨论了利用小分子特异性CBP/catenin拮抗剂靶向白血病干细胞的机制 | 创新点在于识别和验证了一种针对LSCs/CSCs的共同“阿基琉斯之踵”的安全有效机制 | 对LSCs和正常内源性造血干细胞之间关键机制的识别仍然是一个主要挑战 | 本文旨在研究针对白血病干细胞的治疗策略 | 研究对象为慢性髓细胞白血病和急性淋巴细胞白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序，单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 11802 | 2024-08-05 |
Aging increases cell-to-cell transcriptional variability upon immune stimulation
2017-03-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah4115
PMID:28360329
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研究论文 | 本研究探讨了衰老如何影响在免疫刺激下的转录动态 | 发现衰老增加了细胞间的转录变异性，这是衰老的一个显著特征 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的衰老过程 | 揭示衰老对免疫细胞转录动态的影响 | 来自年轻和老年小鼠的天真和效应记忆CD4 T细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自两个不同物种的年轻和老年小鼠中的天真和效应记忆CD4 T细胞 |
| 11803 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq and computational analysis using temporal mixture modelling resolves Th1/Tfh fate bifurcation in malaria
2017-Mar-03, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aal2192
PMID:28345074
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学和计算分析重构了小鼠血液阶段感染中的Th1和Tfh细胞的发育轨迹 | 研究首次在种群和单克隆水平上展示了Th1/Tfh分叉的发生，并揭示了Galectin-1在支持Th1分化中的T细胞内在作用 | 研究未讨论单细胞RNA测序和模型的潜在偏差或限制 | 阐明CD4 T细胞在疟疾感染中的分化过程和命运分叉机制 | 小鼠的CD4 T细胞及其向Th1和Tfh的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | NA |
| 11804 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of an In Vitro Model of Human Interneuron Development Reveals Temporal Dynamics of Cell Type Production and Maturation
2017-Mar-08, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2017.02.014
PMID:28279351
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research paper | 这篇文章描述了一种从人类胚胎干细胞生成皮质抑制神经元的协议，并分析了不同细胞类型的特性和成熟时间过程 | 文章创新性在于揭示了细胞类型的产生和成熟时间动态，模拟了体内神经元和胶质细胞的生成时间模式 | 文中未具体提及实验样本的多样性和研究的长期效果 | 研究人类抑制神经元的生成及其在神经精神疾病中的潜在应用 | 主要研究对象为从人类胚胎干细胞生成的皮质抑制神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 使用人类胚胎干细胞产生的皮质抑制神经元样本 |
| 11805 | 2024-08-05 |
Single-Cell Resolution of Temporal Gene Expression during Heart Development
2016-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2016.10.001
PMID:27840107
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研究论文 | 本文研究了小鼠心脏发育过程中单细胞水平的基因表达特征 | 揭示了特定细胞谱系在心脏发育中具有时间和空间特异性的基因程序 | 未提及具体的实验局限性和样本限制 | 探究心脏发育过程中细胞谱系特异性的基因表达动态 | 对来自多个时间点的小鼠心脏细胞进行分析 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过1200个小鼠细胞 |
| 11806 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of mixed-lineage states leading to a binary cell fate choice
2016-09-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature19348
PMID:27580035
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序结合新的分析工具，揭示了在小鼠中导致中性粒细胞或巨噬细胞分化的基因组和调控状态 | 本文引入了一种新的分析工具——迭代聚类和指导基因选择，并结合克隆形成实验，揭示了混合谱系中间状态及其动态不稳定性 | NA | 阐明细胞分化的层次状态，包括稀有的中间状态和调控基因网络 | 造血多能祖细胞和双潜能中间体的混合谱系基因表达模式 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 11807 | 2024-08-05 |
Resolving early mesoderm diversification through single-cell expression profiling
2016-07-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18633
PMID:27383781
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研究论文 | 本研究通过单细胞表达分析解决了早期中胚层的多样化问题 | 首次通过单细胞RNA测序提供了哺乳动物胚胎发育中早期中胚层形成的转录组全景视图 | 研究中未明确细胞类型特异性转录因子的功能 | 探索小鼠胚胎中中胚层形成的分子机制 | 分析小鼠胚胎中来自胚胎上胚层和新生Flk1(+)中胚层的1,205个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,205个细胞 |
| 11808 | 2024-08-05 |
Oligodendrocyte heterogeneity in the mouse juvenile and adult central nervous system
2016-Jun-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaf6463
PMID:27284195
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞的异质性和分化动态 | 首次通过单细胞RNA测序识别出13个不同的少突胶质细胞群体，阐明了其分化与成熟的动态过程 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全推导至其他物种 | 探索小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞的异质性及其功能 | 5072个来自小鼠不同区域的少突胶质细胞谱系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 5072个细胞 |
| 11809 | 2024-08-05 |
Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq
2016-Apr-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aad0501
PMID:27124452
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索转移性黑色素瘤的多细胞生态系统 | 揭示了黑色素瘤肿瘤中细胞的转录异质性及其与细胞周期和空间背景的关系 | 研究仅分析了19名患者的样本，样本量相对较小 | 探讨黑色素瘤肿瘤的基因型和表型状态 | 4645个来自19名患者的单细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4645个单细胞来自19名患者 |
| 11810 | 2024-08-05 |
Parallel single-cell sequencing links transcriptional and epigenetic heterogeneity
2016-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.3728
PMID:26752769
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞基因组范围内的甲基组和转录组平行测序方法 | 该方法揭示了异质甲基化的远程调控元件与关键多能性基因转录之间的未知关联 | NA | 探索转录变异与表观遗传变异之间的关联 | 61个小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | scM&T-seq | NA | 基因组甲基组和转录组数据 | 61个小鼠胚胎干细胞 |
| 11811 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals coordinated ectopic gene-expression patterns in medullary thymic epithelial cells
2015-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3246
PMID:26237553
|
研究论文 | 本研究揭示了髓质胸腺上皮细胞中组织特异性自身抗原的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了髓质胸腺上皮细胞中TRAs的协同表达模式 | 研究未阐明单个mTEC中TRAs表达的具体调控机制 | 探讨髓质胸腺上皮细胞中自身抗原表达的调控机制 | 针对髓质胸腺上皮细胞中的组织特异性自身抗原进行研究 | 数字病理学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个mTECs样本 |
| 11812 | 2024-08-05 |
Aire controls gene expression in the thymic epithelium with ordered stochasticity
2015-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3247
PMID:26237550
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研究论文 | Aire转录因子通过诱导外源性胸腺特异性基因的表达来控制免疫耐受性 | 本研究揭示了Aire靶基因在小部分胸腺髓样上皮细胞中的特异性激活，与DNA甲基化模式无关 | 未提及具体样本数量和限制因素 | 探讨Aire对胸腺上皮基因表达的特异性调控机制 | Aire充足和缺乏的胸腺髓样上皮细胞(mTECs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA甲基化分析 | NA | NA | NA |
| 11813 | 2024-08-05 |
Droplet barcoding for single-cell transcriptomics applied to embryonic stem cells
2015-May-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.04.044
PMID:26000487
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研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学的高通量液滴条形码技术。 | 提出了一种高效的液滴微流控方法，可以从成千上万个单细胞中标记RNA，并进行后续的下一代测序分析。 | 没有明确提到该方法在特定样本上的适用性或潜在的技术障碍 | 旨在有效识别和分析单细胞水平的基因表达。 | 分析小鼠胚胎干细胞以揭示细胞群体结构和分化异质性。 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA数据 | 数千个单细胞 |
| 11814 | 2024-08-05 |
Recent advances in genomic DNA sequencing of microbial species from single cells
2014-Sep, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3785
PMID:25091868
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研究论文 | 本文讨论了通过单细胞测序对微生物物种的基因组DNA进行测序的最新进展 | 揭示了通过单细胞测序技术填补未培养物种的基因组序列空白的潜力 | 对微生物物种的研究仍然受到技术和样本可得性的限制 | 研究未培养微生物的基本生物学、分类和进化 | 未培养的微生物物种及其基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组DNA | NA |
| 11815 | 2024-08-05 |
Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2694
PMID:24141493
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研究论文 | 该文章比较了不同的单细胞RNA扩增方法的敏感性和准确性 | 系统评估了多种单细胞RNA-seq方法的性能，并显示出在较小的测序读取数下仍能准确测量单细胞转录组 | 未提及具体的限制 | 探讨单细胞转录组分析的有效性 | 比较不同的单细胞RNA扩增方法 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了不同数量的单细胞样本 |
| 11816 | 2024-08-05 |
A tripartite transcription factor network regulates primordial germ cell specification in mice
2013-Aug, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/ncb2798
PMID:23851488
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研究论文 | 本文探讨了三种转录因子网络在小鼠原始生殖细胞(PGC)特定中的调控作用 | 揭示了BLIMP1、AP2γ和PRDM14之间相互依赖的转录网络对PGC特异性命运的影响 | 未提及具体的实验范围或潜在的不确定性 | 研究转录因子如何调控原始生殖细胞的规范化 | 研究小鼠的原始生殖细胞 | NA | NA | 转录组分析和染色质免疫沉淀测序 | NA | NA | 使用了正常和突变的PGC的单细胞转录组数据 |
| 11817 | 2024-08-05 |
Development and applications of single-cell transcriptome analysis
2011-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.1557
PMID:21451510
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评论 | 本文回顾了单细胞转录组分析的历史、进展、潜在应用和未来发展 | 结合活细胞成像和谱系追踪的方法，能够揭示个体细胞的基因表达网络 | NA | 探讨基因型与表型之间的关系 | 单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 11818 | 2024-08-04 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-Jun-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
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研究论文 | 本文研究了CD8+ T细胞中的体细胞突变与克隆扩增之间的关系 | 揭示了非恶性T细胞中的突变谱，并首次确认CD8细胞中的非同义变异频率高于同义变异 | 未明确提及对样本选择和其他T细胞类型的影响 | 了解体细胞突变对CD8 T细胞扩增的影响 | 来自90位血液和免疫疾病患者的CD8和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 90名患者的T细胞 |
| 11819 | 2024-08-05 |
Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature
2024-Jun-07, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014
PMID:38851995
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研究论文 | 该文章分析了与胶原相关的转录组、蛋白组和尿液组的变化，以检测临床显著性前列腺癌 | 通过胶原相关转录组、蛋白组和尿液组的特征建立了机器学习模型，显著优于传统的前列腺特异抗原 (PSA) 方法 | 本研究的一个局限性是其回顾性特征 | 研究胶原在前列腺癌检测中的作用 | 涉及临床显著性前列腺癌患者的转录组、蛋白组和尿液组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据，蛋白组数据，尿液组数据 | 转录组1393个，蛋白组104个，尿液组923个 |
| 11820 | 2024-08-05 |
Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.010
PMID:38697109
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研究论文 | 该研究探讨了人类多能干细胞来源的β细胞的功能成熟过程 | 揭示了蜕膜代谢重塑，尤其是对神经酰胺代谢活动的下调对β细胞成熟的重要性 | 研究中具体的细胞标志物和环境因素对成熟过程的影响未深入探讨 | 研究人类胰腺β细胞的成熟机制及其功能获得 | 人类多能干细胞来源的β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞转座酶易接触染色质测序 (scATAC-seq) | NA | NA | NA |