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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11801 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
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研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案,用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案,具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记,可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |
11802 | 2025-10-07 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-05-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
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研究论文 | 本研究揭示了LYVE-1+巨噬细胞通过调节透明质酸细胞外基质促进乳腺肿瘤生长的机制 | 首次证明LYVE-1+巨噬细胞通过降解透明质酸和调节免疫微环境促进肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质和肿瘤微环境中的功能 | 小鼠乳腺组织和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
11803 | 2025-10-07 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-05-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究揭示了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌进展中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现MUC1-C通过整合STAT1炎症通路与∆Np63、SOX2基因表达,驱动头颈部鳞癌干细胞状态 | 主要基于细胞系研究,需要更多体内实验验证 | 探索MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系和肿瘤样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11804 | 2025-10-07 |
Role of ferroptosis in neuroimmunity and neurodegeneration in multiple sclerosis revealed by multi-omics data
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18396
PMID:38801304
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研究论文 | 通过多组学数据揭示铁死亡在多发性硬化症神经免疫和神经退行性变中的作用 | 开发了铁死亡水平的计算指标,首次通过整合单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学数据系统研究铁死亡在多发性硬化症中的作用机制 | 铁死亡在多发性硬化症中的确切作用机制仍需进一步验证 | 探究铁死亡在多发性硬化症发病机制中的作用 | 多发性硬化症患者样本 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | snRNA-seq, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, AUCell方法 | 诊断模型 | 多组学数据 | 七个不同白质病变区域的样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
11805 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示海胆胚胎细胞命运特化的进化重配置 | 首次利用比较单细胞RNA-seq发育时间序列揭示胚胎模式形成中的多样化进化变化 | 需要后续实验验证候选调控相互作用的假设 | 研究发育进化中调控互作的改变如何影响表型多样性 | 海胆Heliocidaris erythrogramma和其近缘物种的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海胆物种的发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11806 | 2025-10-07 |
Single-cell insights: pioneering an integrated atlas of chromatin accessibility and transcriptomic landscapes in diabetic cardiomyopathy
2024-04-25, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02233-y
PMID:38664790
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据,揭示了糖尿病心肌病中染色质可及性和转录组景观的细胞状态和分子变化 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据构建糖尿病心肌病的综合图谱,识别了关键的转录因子和细胞亚群特异性变化 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明糖尿病心肌病的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 野生型和糖尿病心肌病小鼠的心脏组织 | 单细胞多组学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色 | Seurat, Signac, chromVAR, Cicero | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | WT和DCM小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Multiome | 10x Multiome单细胞RNA和ATAC联合测序文库 |
11807 | 2025-10-07 |
Mechanisms of imbalanced testicular homeostasis in infancy due to aberrant histone acetylation in undifferentiated spermatogonia under different concentrations of Di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) exposure
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123742
PMID:38460586
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研究论文 | 本研究探讨了婴儿期不同浓度DEHP暴露通过组蛋白乙酰化异常导致睾丸稳态失衡的分子机制 | 首次揭示了婴儿期DEHP暴露通过线粒体功能障碍和组蛋白乙酰化异常导致未分化精原细胞命运差异的机制,并发现其对睾丸稳态的长期影响持续至成年期 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;DEHP暴露剂量和时程可能无法完全模拟真实环境暴露情况 | 阐明婴儿期DEHP暴露对睾丸发育和生殖系统功能的毒性机制 | 新生小鼠睾丸组织中的未分化精原细胞、支持细胞和间质细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第5天小鼠,分别接受40μg/kg和80μg/kg DEHP暴露10天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11808 | 2025-10-07 |
Rejuvenated iPSC-derived GD2-directed CART Cells Harbor Robust Cytotoxicity Against Small Cell Lung Cancer
2024-03-11, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0259
PMID:38380966
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研究论文 | 本研究开发了源自iPSC的年轻化GD2-CARrejT细胞,显著增强了对小细胞肺癌的细胞毒性 | 首次将GD2-CAR导入iPSC来源的年轻化细胞毒性T淋巴细胞,并通过单细胞RNA测序揭示了TIGIT低表达与细胞毒性增强的机制关联 | 研究主要聚焦于机制探索,临床前验证阶段尚未进入人体试验 | 增强GD2导向CAR-T细胞对小细胞肺癌的杀伤效果 | 小细胞肺癌细胞及GD2-CAR修饰的免疫细胞 | 免疫治疗 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,细胞重编程 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据,细胞功能数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11809 | 2025-10-07 |
MEF2C Hypofunction in GABAergic Cells Alters Sociability and Prefrontal Cortex Inhibitory Synaptic Transmission in a Sex-Dependent Manner
2024-Mar, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100289
PMID:38390348
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研究论文 | 本研究探讨了GABA能细胞中MEF2C功能低下对小鼠社交行为和前额叶皮层抑制性突触传递的影响,并发现这些影响具有性别特异性 | 首次揭示了MEF2C在发育中GABA能细胞的功能缺陷会导致雌性特异性的社交行为异常和前额叶皮层抑制性突触传递改变 | 研究仅限于小鼠模型,人类MCHS患者中未观察到明显的性别偏倚,机制尚未完全阐明 | 探究MEF2C在GABA能神经元中的功能低下对MEF2C单倍体不足综合征样表型的影响 | 转基因小鼠模型,特别是GABA能细胞中Mef2c杂合缺失的小鼠 | 神经科学 | 神经发育障碍,自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学,膜片钳电生理学,光遗传学,脑电图 | 转基因小鼠模型 | 行为学数据,电生理记录,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,使用转基因小鼠进行研究 | NA | 单细胞RNA测序,电生理记录,光遗传学 | NA | NA |
11810 | 2025-10-07 |
Kidney double positive T cells have distinct characteristics in normal and diseased kidneys
2024-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54956-3
PMID:38396136
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研究论文 | 本研究揭示了肾脏中TCR+CD4+CD8+双阳性T细胞在正常和疾病状态下的独特特征 | 首次系统描述了正常和疾病状态下肾脏双阳性T细胞的表型、功能和代谢特征 | 双阳性T细胞在肾脏中为次要群体,样本量有限 | 探究肾脏双阳性T细胞在生理和病理条件下的特征与功能 | 小鼠和人类肾脏组织 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏和人类肾细胞癌患者肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11811 | 2025-10-07 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
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研究论文 | 本研究对七种单细胞哈希寡核苷酸(HTO)解复用工具进行了性能评估和比较 | 首次使用遗传变异数据作为'地面真实值'来系统评估HTO解复用工具的性能 | 研究结果可能受限于所使用的特定数据集和实验条件 | 评估和比较单细胞HTO解复用方法的准确性和可靠性 | 七种HTO解复用工具(hashedDrops, HTODemux, GMM-Demux, demuxmix, deMULTIplex, BFF, HashSolo) | 单细胞测序数据分析 | NA | 单细胞RNA测序, 哈希寡核苷酸标记 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11812 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic interrogation of the murine bone marrow signaling landscape
2023-11-06, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00298-1
PMID:37926705
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,探索小鼠骨髓中骨骼干细胞和祖细胞的信号调控网络 | 首次将空间转录组学应用于完全矿化组织,并开发结合空间和单细胞转录组学的分析方法 | 研究仅限于成年小鼠股骨组织,尚未验证于其他物种或病理条件 | 解析骨骼干细胞和祖细胞在骨髓微环境中的空间分布和调控机制 | 成年小鼠股骨中的骨骼干细胞和祖细胞及其微环境 | 空间转录组学 | 骨骼疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重反卷积分析 | 预测建模流程 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠股骨样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11813 | 2025-10-07 |
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
2023-10, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00870-x
PMID:37642933
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研究论文 | 本研究通过Navitoclax/ABT263清除衰老细胞,逆转全脑照射导致的小鼠血脑屏障破坏 | 首次证明清除衰老内皮细胞可逆转辐射引起的血脑屏障破坏 | 样本量有限,仅在小鼠模型中进行研究 | 探究全脑照射诱导内皮细胞衰老与血脑屏障破坏的因果关系 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 脑转移瘤 | 双光子显微镜、成像流式细胞术、免疫标记、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 图像、序列数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11814 | 2025-10-07 |
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13832
PMID:37243381
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研究论文 | 本研究探讨了紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老在化疗脑认知功能下降中的作用机制 | 首次证明紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老是化疗脑的关键致病机制,并通过遗传和药理学方法清除衰老细胞逆转了认知功能障碍 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 阐明紫杉醇诱导认知功能障碍的分子机制并探索潜在治疗策略 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 化疗相关认知障碍 | 流式细胞术,单细胞转录组测序 | NA | 生理功能数据,分子生物学数据,行为学数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
11815 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies senescent cerebromicrovascular endothelial cells in the aged mouse brain
2020-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-020-00177-1
PMID:32236824
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了老年小鼠大脑中的衰老脑血管内皮细胞 | 首次在野生型衰老小鼠模型中利用单细胞RNA测序技术识别和量化衰老的脑血管内皮细胞 | 研究仅限于小鼠模型,需要在其他物种和人类样本中验证 | 检测衰老小鼠大脑中衰老内皮细胞的存在并评估其比例 | 年轻(3月龄)和老年(28月龄)C57BL/6小鼠的脑血管内皮细胞和神经血管单元相关细胞 | 单细胞基因组学 | 血管性认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4233个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11816 | 2025-01-07 |
Integrative transcriptome analysis reveals Serpine2 promotes glomerular mesangial cell proliferation and extracellular matrix accumulation via activating ERK1/2 signalling pathway in diabetic nephropathy
2025-Feb, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16069
PMID:39557806
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研究论文 | 本文通过整合转录组分析揭示了Serpine2通过激活ERK1/2信号通路促进糖尿病肾病中肾小球系膜细胞增殖和细胞外基质积累的机制 | 首次通过整合批量数据集和单细胞转录组数据集,发现Serpine2在糖尿病肾病中的关键作用,并揭示了其通过ERK1/2信号通路调控的分子机制 | 研究主要基于动物模型和细胞模型,尚未在人类患者中进行验证 | 探索糖尿病肾病的发病机制,特别是Serpine2在其中的作用 | 糖尿病肾病模型中的肾小球系膜细胞和细胞外基质 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 转录组分析、Western blotting、免疫荧光染色 | db/db小鼠模型、肾小球系膜细胞模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据 | db/db小鼠和肾小球系膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
11817 | 2025-01-07 |
Targeting MAPK14 in microglial cells: neuroimmune implications of Panax ginseng in post-stroke inflammation
2025-Jan-06, The Journal of pharmacy and pharmacology
IF:2.8Q2
DOI:10.1093/jpp/rgae067
PMID:38902954
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研究论文 | 本研究探讨了人参和三七皂苷(PNS)通过分子机制减轻缺血性中风后的神经炎症损伤并促进神经修复 | 揭示了Ginsenoside-Rc通过调节MAPK14活性抑制神经炎症的创新机制 | 研究主要基于实验模型,尚未进行临床试验验证 | 阐明人参和三七皂苷在缺血性中风后神经炎症损伤中的作用及其分子机制 | 小胶质细胞和神经炎症反应 | 神经科学 | 中风 | 单细胞测序、转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
11818 | 2025-01-07 |
A pan-immune panorama of bacterial pneumonia revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2025-Jan-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02093-8
PMID:39757231
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研究论文 | 本文通过大规模单细胞转录组图谱揭示了细菌性肺炎的全免疫全景 | 首次使用单细胞RNA测序技术对444,146个支气管肺泡灌洗液细胞进行分析,揭示了细菌性肺炎中免疫反应的异质性及其与疾病严重程度的关系 | 样本量相对较小,仅包括74名个体,且未涵盖所有可能的细菌性肺炎亚型 | 深入了解细菌性肺炎的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 | 74名个体,包括58名轻度(n=22)和重度(n=36)细菌性肺炎患者以及16名健康捐赠者 | 数字病理学 | 细菌性肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 444,146个支气管肺泡灌洗液细胞,来自74名个体 | NA | NA | NA | NA |
11819 | 2025-01-07 |
Single-cell RNA-sequencing and genome-wide Mendelian randomisation along with abundant machine learning methods identify a novel B cells signature in gastric cancer
2025-Jan-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01759-1
PMID:39760915
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和全基因组孟德尔随机化结合多种机器学习方法,识别出胃癌中的一种新型B细胞特征 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和机器学习方法,识别出胃癌中的新型B细胞特征,并发现NFKBIE作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本选择偏差 | 识别胃癌中的新型B细胞特征,并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 胃癌患者的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序、孟德尔随机化、机器学习 | 机器学习集成方法 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
11820 | 2025-01-07 |
Optimized methods for scRNA-seq and snRNA-seq of skeletal muscle stored in nucleic acid stabilizing preservative
2025-Jan-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07445-2
PMID:39755918
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研究论文 | 本文开发了一种从保存在Allprotect®组织试剂中的人类骨骼肌中获取高质量细胞和细胞核的协议,用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | 开发了一种从存档组织中获取高质量单细胞基因组材料的新协议,解决了国际多中心研究和存档组织研究中新鲜起始材料的障碍 | 流式细胞仪分选虽然成功富集了更高质量的细胞和细胞核,但导致输入材料总体减少 | 优化从存档骨骼肌组织中获取高质量单细胞和单核RNA测序材料的方法 | 人类骨骼肌组织 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |