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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11781 | 2025-10-07 |
Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405818
PMID:39503290
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别X连锁视网膜劈裂症的多组学特征,并验证慢性内质网应激/eIF2α通路作为潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和时空转录组学分析XLRS疾病模型,发现两种模型间保守的慢性内质网应激通路激活 | 研究仅针对特定p.R209C突变,可能不适用于所有XLRS病例 | 解析X连锁视网膜劈裂症的分子病理机制并寻找治疗靶点 | 基因工程Rs1小鼠和患者来源视网膜类器官 | 空间转录组学 | X连锁视网膜劈裂症 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学, Western blot, 蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 两种XLRS样模型(Rs1小鼠和患者来源视网膜类器官) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11782 | 2025-10-07 |
Advances on the Role of Lung Macrophages in the Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease in the Era of Single-Cell Genomics
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.100160
PMID:39781522
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学时代肺巨噬细胞在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的作用研究进展 | 整合单细胞RNA测序技术揭示COPD中巨噬细胞分子异质性的新认识 | NA | 探讨肺巨噬细胞在COPD发病机制中的复杂作用 | 肺巨噬细胞及其亚群 | 单细胞基因组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11783 | 2025-10-07 |
Construction and validation of prognosis and treatment outcome models based on plasma membrane tension characteristics in bladder cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18816
PMID:39790460
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研究论文 | 基于膀胱癌中质膜张力特征构建并验证预后和治疗结局模型 | 首次系统研究质膜张力相关基因在膀胱癌中的预后价值,并鉴定出DCBLD2作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索质膜张力相关基因在膀胱癌预后和治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组测序, scRNA-seq, qRT-PCR, 伤口愈合实验, Transwell实验 | LASSO回归, Cox回归分析 | 转录组数据, 临床数据, 突变数据 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11784 | 2025-10-07 |
PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407284
PMID:39494472
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外实验揭示了PD-1+CD8+ T细胞通过诱导肝细胞焦亡促进自身免疫性肝病发展的新机制 | 首次发现PD-1+CD8+ T细胞通过颗粒酶B和穿孔素-1诱导肝细胞GSDMD介导的焦亡在自身免疫性肝病中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究自身免疫性肝病中效应T细胞的具体致病机制 | dnTGFβRII Aire转基因小鼠模型中的肝组织和免疫细胞 | 免疫学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞测序, 体外细胞分析, CAR-T细胞治疗 | NA | 单细胞测序数据, 体外实验数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11785 | 2025-10-07 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308174
PMID:39494578
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析早期乳腺癌患者术中放疗联合手术引发的外周免疫反应变化 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示术中放疗联合手术对早期乳腺癌患者外周免疫细胞组成和功能的动态影响 | 研究样本量有限,仅关注外周免疫反应而未分析肿瘤微环境变化 | 探究术中放疗联合手术对乳腺癌患者免疫系统的调节作用 | 早期乳腺癌患者的外周血单核细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 早期乳腺癌患者治疗前后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
11786 | 2025-10-07 |
Are oligodendrocytes bystanders or drivers of Parkinson's disease pathology?
2025-Jan, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002977
PMID:39777410
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综述 | 探讨少突胶质细胞在帕金森病病理中可能扮演的角色 | 提出少突胶质细胞可能是帕金森病早期驱动因素的新观点,挑战了传统认为该病纯粹是神经元障碍的认知 | 当前对少突胶质细胞在帕金森病中的功能作用仍高度推测性,缺乏明确实验证据 | 阐明少突胶质细胞在帕金森病发病机制中的潜在作用 | 帕金森病患者的中脑黑质多巴胺能神经元和少突胶质细胞 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11787 | 2025-10-07 |
Inhibition of Abdominal Aortic Aneurysm Progression Through the CXCL12/CXCR4 Axis via MiR206-3p Sponge
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70328
PMID:39779470
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研究论文 | 本研究探讨通过MiR206-3p海绵抑制CXCL12/CXCR4轴对腹主动脉瘤进展的影响 | 首次提出MiR206-3p海绵作为通过抑制CXCL12/CXCR4信号通路治疗腹主动脉瘤的创新治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床应用效果需进一步验证 | 阐明CXCL12/CXCR4信号通路在腹主动脉瘤发展中的具体作用机制 | 人类腹主动脉瘤患者和小鼠模型中的血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,ELISA,细胞转染,谱系追踪 | 小鼠腹主动脉瘤模型 | 基因表达数据,蛋白质水平数据,细胞表型数据 | 人类患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11788 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
11789 | 2025-10-07 |
Global identification of mammalian host and nested gene pairs reveal tissue-specific transcriptional interplay
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279430.124
PMID:39578100
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研究论文 | 本研究通过构建小鼠和人类宿主/嵌套基因对的全面目录,揭示了组织特异性转录互作模式 | 提供了最新的宿主/嵌套基因对目录,发现转录共现具有组织特异性,特别是在睾丸组织中尤为普遍 | NA | 系统识别哺乳动物宿主和嵌套基因对,揭示其组织特异性转录互作机制 | 小鼠和人类基因组中的宿主/嵌套基因对 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11790 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Sheds Light on Tumor Evolution: Perspectives from City of Hope's Clinical Trial Teams
2024-Dec-10, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247507
PMID:39768430
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在临床肿瘤研究中的应用及其对理解肿瘤演化的意义 | 提出了整合单细胞RNA测序到临床实验设计的实践经验,并强调了计算团队与临床团队协作的'团队医学'方法 | 实施单细胞方法面临高质量细胞获取、技术变异性和复杂计算分析等挑战 | 理解肿瘤异质性对肿瘤演化和治疗反应的影响,以开发更有效的治疗方法 | 乳腺癌、脑癌和卵巢癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多种癌症(乳腺癌、脑癌、卵巢癌) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11791 | 2025-10-07 |
Deciphering progressive lesion areas in breast cancer spatial transcriptomics via TGR-NMF
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae707
PMID:39780487
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研究论文 | 本研究开发了TGR-NMF方法,用于解析乳腺癌空间转录组数据中的疾病进展相关区域 | 提出了三图正则化非负矩阵分解方法和单元化策略,整合基因表达和空间位置邻域拓扑,能够利用完整的基因表达计数数据并提高可解释性 | 未明确说明样本数量和具体的技术验证细节 | 解析乳腺癌组织异质性,识别与疾病进展相关的空间区域 | 乳腺癌空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | TGR-NMF(三图正则化非负矩阵分解) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11792 | 2025-10-07 |
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331117
PMID:38744443
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研究论文 | 本研究探讨了角鲨烯环氧酶在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎诱导的肝细胞癌中通过调节肿瘤免疫微环境影响抗PD-1疗效的机制 | 首次揭示SQLE通过胆固醇积累导致CD8+ T细胞线粒体功能障碍和髓源性抑制细胞活化,从而介导免疫抑制并影响抗PD-1疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究SQLE在MASH-HCC肿瘤免疫微环境调节中的作用及对抗PD-1疗效的影响 | 肝细胞特异性SQLE转基因和敲除小鼠、原位移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 转基因小鼠模型、敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11793 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional atlas of human breast cancers and model systems
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70044
PMID:39417215
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研究论文 | 构建了人类乳腺癌的单细胞转录图谱,包含患者样本和多种模型系统 | 整合了多种乳腺癌模型系统的单细胞RNA测序数据,开发了动态细胞样本注释方法 | 样本数量有限,模型系统与真实患者样本仍存在差异 | 深入理解乳腺癌细胞多样性,识别有效治疗方法 | 乳腺癌患者肿瘤组织、淋巴结转移灶、减乳成形术样本、PDX模型、PDXO类器官和细胞系 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCSubtype, TNBCtype细胞分型预测器 | 单细胞转录组数据 | 117个样本,共506,719个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11794 | 2025-10-07 |
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-Sep-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101711
PMID:39232498
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型证明在KRAS野生型背景下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失可诱导自发性胰腺癌发生 | 首次建立KRAS野生型自发性胰腺癌小鼠模型,揭示p53和SMAD4/TGFBR2缺失可独立于致癌KRAS突变驱动胰腺癌发生 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究KRAS野生型胰腺癌的发病机制 | 基因工程小鼠模型(PPSSC和PPTTC模型) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 多个基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11795 | 2025-10-07 |
The Effect of Exposure to Neighborhood Violence on Glucocorticoid Receptor Signaling in Lung Tumors
2024-07-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0032
PMID:38912926
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研究论文 | 本研究探讨了居住区暴力犯罪暴露对肺肿瘤中糖皮质激素受体信号通路的影响 | 首次将社区暴力犯罪暴露与肺肿瘤中糖皮质激素受体染色质招募的重新编程联系起来 | 样本量较小(仅15个肺肿瘤样本),研究结果需要更大样本验证 | 研究社会压力暴露与肺肿瘤基因表达之间的关系 | 肺肿瘤样本和居住区暴力犯罪率 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,CUT&RUN(ChIP测序技术) | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 15个肺肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
11796 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
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研究论文 | 构建了迄今为止最全面的小鼠视网膜单细胞图谱,整合了约33万个细胞的数据 | 创建了最大的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,首次整合多个数据集构建综合细胞图谱,识别了138种细胞类型 | 仅使用C57BL/6J野生型小鼠,可能不适用于其他品系或疾病模型 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞图谱以解决现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗体磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(本研究),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11797 | 2025-10-07 |
Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection
2024-02-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01290-y
PMID:38317183
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示致病性慢病毒感染引发促炎反馈环路导致疾病进展的免疫机制 | 利用遗传相似但毒力不同的SIV变异株感染模型,结合纵向单细胞转录组和细胞通讯分析,首次发现致病性慢病毒通过逃逸干扰素应答并激活CXCL10/CXCL16驱动的促炎放大环路 | 研究局限于猪尾猕猴模型,未在人类HIV感染中直接验证 | 揭示慢病毒致病性差异的免疫学基础 | 感染不同毒力SIV变异株的猪尾猕猴免疫细胞 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞转录组测序,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪尾猕猴感染队列的纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11798 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Global Markers of Transcriptional Diversity across Different Forms of Cellular Senescence
2023, Aging biology
DOI:10.59368/agingbio.20230008
PMID:39781544
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析不同形式细胞衰老中的转录多样性全局标志物 | 首次通过单细胞转录组学系统比较三种主要衰老形式(癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老),发现不同衰老形式共有的细胞亚群及其特征 | 研究基于基因同质的克隆细胞系,可能无法完全反映体内衰老细胞的复杂性 | 探索不同形式细胞衰老中的转录多样性及其共同特征 | 基因同质的克隆细胞系(包括癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老) | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种衰老形式的克隆细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11799 | 2025-01-11 |
Targeting pathological brain activity-related to neuroinflammation through scRNA-seq for new personalized therapies in Parkinson's disease
2025-Jan-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02086-7
PMID:39788941
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11800 | 2025-10-07 |
Tigulixostat Alleviates Hyperuricemic Nephropathy by Promoting M2 Macrophage Polarization
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S500101
PMID:39780982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术探讨Tigulixostat对高尿酸血症肾病的影响 | 发现Tigulixostat通过促进M2巨噬细胞极化改善高尿酸血症肾病,且比别嘌呤醇更有效且不引起肝损伤 | 研究仅使用Uox-KO小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究Tigulixostat对尿酸水平和高尿酸血症肾病的影响 | 尿酸氧化酶敲除(Uox-KO)小鼠模型 | 生物医学研究 | 高尿酸血症肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 血浆代谢组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据, 细胞表型数据 | Uox-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |