单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 11781 - 11800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11781 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
|
研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 |
| 11782 | 2024-08-05 |
Targeting ARNT attenuates chemoresistance through destabilizing p38α-MAPK signaling in glioblastoma
2024-May-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06735-1
PMID:38806469
|
研究论文 | 本研究探讨了芳香烃受体核转运蛋白(ARNT)在胶质母细胞瘤(GBM)发病机制中的功能意义 | 发现ARNT作为GBM的致癌驱动因子，并且通过干扰p38α-MAPK信号通路来降低化疗耐药性 | 本研究未提及样本规模或临床试验数据的应用，可能限制了结果的普遍性 | 研究ARNT在胶质母细胞瘤的发病机制中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞系及其相关的分子机制 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因沉默技术 (lentiviral shRNAs) | NA | 公共数据集，RNA序列数据 | NA |
| 11783 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
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研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA |
| 11784 | 2024-08-05 |
Interleukin 21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T-Cell-Associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2024-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.026
PMID:38266738
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研究论文 | 本研究探讨了IL21在慢性肠道炎症中驱动Tregs代谢异常及其相关性。 | 首次揭示了IL21通过代谢重组影响Tregs的炎症反应，从而调节肠道稳态。 | 研究主要依赖于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究IL21在慢性肠道炎症中对Tregs代谢及其功能的影响。 | 人类Tregs以及小鼠模型中的CD4+ T细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，质谱细胞分析，粤角程分析 | 小鼠模型 | 基因组数据，代谢组学数据 | 使用了人类和小鼠的生物样本 |
| 11785 | 2024-08-05 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-May, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
|
综述 | 这篇文章总结了肿瘤相关中性粒细胞（TAN）生物学的最新数据和模型，关注在肿瘤内在信号影响下演变的多样性 | 文章通过对不同癌症实体的转录组特征进行分类，提出了一种新的中性粒细胞亚群分类，以超越传统的N1/N2二元分类 | 文章的局限性在于未能提供关于中性粒细胞在抗癌治疗中的具体应用实例 | 研究肿瘤微环境中中性粒细胞的多样性及其对抗癌治疗的影响 | 主要研究非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 11786 | 2024-08-04 |
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-Apr-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172014
PMID:38564300
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研究论文 | 本文揭示了NFκB信号在心肌病理中的作用，特别是通过CCR2+巨噬细胞驱动的心肌损伤机制 | 首次定义了NFκB信号在心肌细胞和巨噬细胞中对心律失常性心肌病自然进展的贡献 | 本研究主要基于Dsg2mut/mut小鼠模型，可能限制了对人类病理的广泛适用性 | 揭示心律失常性心肌病中的免疫信号机制及其对心肌损伤的影响 | 采用Dsg2mut/mut小鼠模型研究心肌细胞和巨噬细胞在心律失常性心肌病中的相互作用 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Dsg2mut/mut小鼠模型进行研究，具体样本量未提及 |
| 11787 | 2024-08-04 |
MEF2C Hypofunction in GABAergic Cells Alters Sociability and Prefrontal Cortex Inhibitory Synaptic Transmission in a Sex-Dependent Manner
2024-Mar, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100289
PMID:38390348
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研究论文 | 本研究探讨了MEF2C在GABA能细胞中的低功能对社交性和前额叶皮层抑制突触传递的影响，并呈现性别差异。 | 首次揭示了MEF2C在发育GABA能细胞中的低功能导致的性别特异性社交偏好缺陷和行为改变。 | 只在小鼠模型中进行研究，可能无法完全反映人类的情况。 | 研究MEF2C在GABA能细胞中的低功能如何影响社交行为及前额叶皮层的突触传递。 | 以小鼠为研究对象，聚焦于MEF2C低功能对GABA能细胞的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 电生理、单细胞转录组学、光遗传学 | 小鼠模型 | 基因表达数据、脑电图数据 | 使用了多个小鼠样本，具体样本数量未提及 |
| 11788 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
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研究论文 | 本研究探讨了CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中的潜在致病性 | 未提供具体实验验证结果的详细信息 | 研究CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤中的致病机制 | 研究了91种循环炎症蛋白与主动脉瘤之间的因果关系 | 数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了731种免疫特征和91种循环炎症蛋白 |
| 11789 | 2024-08-04 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
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研究论文 | 本文介绍了一种新的空间转录组分析方法STew，用于联合分析空间信息和基因表达 | STew通过引入空间转录组多角度表示学习方法，克服了有效利用空间信息的挑战 | 未提及具体的实验限制或适用范围 | 旨在提高空间转录组数据分析的准确性和可扩展性 | 研究涉及不同的空间转录组数据，包括单细胞和多细胞分辨率的技术 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多角度表示学习 | 转录组数据 | 使用来自人类背外侧前额叶和小鼠主嗅 bulb 的数据进行基准测试 |
| 11790 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and transcriptional drivers of triple-negative breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113564
PMID:38100350
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研究论文 | 本研究通过结合功能和分子 profiling 以及计算分析，定义了三阴性乳腺癌（TNBC）的转录、表观遗传和代谢亚型及其亚型驱动的超级增强子和转录因子 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌的转录亚型在单细胞水平上的相对均一性，并发现 PRRX1 转录因子是驱动间质型 TNBC 的关键因素 | NA | 旨在表征三阴性乳腺癌的异质性及其转录驱动因素 | 三阴性乳腺癌的转录、表观遗传和代谢亚型及其驱动因素 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 大规模多平台多组学研究 |
| 11791 | 2024-08-05 |
A longitudinal single-cell atlas of treatment response in pediatric AML
2023-12-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.008
PMID:37977148
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序剖析儿童急性髓系白血病(pAML)的治疗反应。 | 揭示了在治疗过程中，亚型特异性的细胞塑性出现，并识别了可能的靶向过程。 | 该研究样本规模较小，仅涉及28名患者。 | 研究儿童急性髓系白血病不同亚型的细胞组成及其对治疗反应的影响。 | 28名代表不同pAML亚型的儿童患者，涵盖诊断、缓解和复发阶段。 | 数字病理学 | 儿童急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 28名患者 |
| 11792 | 2024-08-05 |
Cell-in-Cell-Mediated Entosis Reveals a Progressive Mechanism in Pancreatic Cancer
2023-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.08.035
PMID:37657757
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研究论文 | 该文章探讨了细胞间介导的细胞吞噬在胰腺癌中的作用机制 | 研究首次揭示了NET1作为胰腺癌进展的一个新型相关基因，且细胞吞噬与胰腺癌预后不良相关 | 未能全面探索细胞吞噬在所有胰腺癌表现中发挥的作用 | 阐明细胞吞噬在胰腺导管腺癌进展中的作用 | 研究对象包括胰腺导管腺癌细胞和其在不同培养条件下的表现 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌样本及其肝转移样本 |
| 11793 | 2024-08-05 |
Stricturing Crohn's Disease Single-Cell RNA Sequencing Reveals Fibroblast Heterogeneity and Intercellular Interactions
2023-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.07.014
PMID:37507073
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研究论文 | 这篇文章通过单细胞RNA测序揭示了克罗恩病狭窄中的成纤维细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次生成了狭窄肠道的单细胞RNA测序图谱，揭示了成纤维细胞异质性和相互作用 | 该研究可能未涵盖所有克罗恩病狭窄的生物学特征，且主要集中于成纤维细胞 | 探索克罗恩病中狭窄形成的机制并识别新的治疗靶点 | 克罗恩病的全厚度组织样本，特别是成纤维细胞的异质性和功能 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和细胞数据 | 99个组织样本和409,001个细胞 |
| 11794 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558911
PMID:37790561
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research paper | 本研究探讨了AML患者样本与T细胞相互作用对患者预后的影响及ICAM1的关键作用 | 揭示了与AML敏感性或抗性相关的转录程序，并发现ICAM1在T细胞介导的杀伤中扮演重要角色 | 研究可能未涵盖所有AML患者的异质性 | 探讨T细胞与急性髓性白血病之间的相互作用及其对患者预后的影响 | 急性髓性白血病患者样本及其与工程化CD4 T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 多例AML患者样本及CD4 T细胞 |
| 11795 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3296446/v1
PMID:37720050
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研究论文 | 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 | 提出了一种新的浆细胞过渡状态，促使功能性浆细胞前体的生成 | 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 | 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 | 研究抗原特异性的浆细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq+BCR-seq | NA | NA | NA |
| 11796 | 2024-08-04 |
The Use of Single-Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics in Understanding the Pathogenesis and Treatment of Skin Diseases
2023-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2023.100198
PMID:37205302
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review | 本论文回顾了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤疾病研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学来剖析皮肤疾病的关键细胞成分及其空间排列 | NA | 提升皮肤疾病治疗的精准医学水平 | 皮肤疾病，包括异常伤口愈合、炎症性皮肤疾病和癌症 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11797 | 2024-08-05 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪组织中一种特定的前脂肪细胞群体及其分化路径 | 通过单细胞RNA测序发现了一种新的人类CD31 CD45细胞群，并将其放置于已知前脂肪细胞群之前的表观遗传路径上 | 研究可能受到样本选择和细胞异质性的限制 | 揭示脂肪细胞的分化过程及其生理机制 | 研究了脂肪组织中的间质血管部分(SVF)中细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 11798 | 2024-08-05 |
Osteoblast-intrinsic defect in glucose metabolism impairs bone formation in type II diabetic male mice
2023-05-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85714
PMID:37144869
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病小鼠骨生成受损的机制，强调了骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷 | 首次识别糖尿病小鼠中骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷是糖尿病性骨质疏松的潜在原因 | 仅在小鼠模型中进行研究，限制了结果对人类的直接适用性 | 探讨2型糖尿病对骨生成的影响及其机制 | 以青少年2型糖尿病小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病性骨质疏松 | 稳定同位素追踪，Seahorse测定，单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 11799 | 2024-08-05 |
High-content CRISPR screening
2022, Nature reviews. Methods primers
DOI:10.1038/s43586-022-00098-7
PMID:37214176
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研究论文 | 该文章介绍了高内容CRISPR筛选技术及其应用于生物发现的潜力 | 文章强调了高内容方法如何提供前所未有的细节，以直接获得生物学见解 | NA | 探索CRISPR筛选的基本和高级概念及其在生物医学研究和药物开发中的应用 | 各种基因功能的非偏见探讨，包括癌症研究、免疫学和微生物学等领域 | 数字生物学 | 癌症 | CRISPR | NA | RNA测序, 空间成像 | NA |
| 11800 | 2024-08-05 |
Dense and accurate whole-chromosome haplotyping of individual genomes
2017-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01389-4
PMID:29101320
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研究论文 | 本文介绍了一种整合相位策略，用于对个体基因组进行密集且准确的全染色体单倍型分析 | 提出了一种新颖的整合相位策略，通过结合不同的测序技术实现高效的单倍型分析 | 缺乏对更广泛生物样本的验证，目前结果主要基于特定个体NA12878 | 研究旨在提高基因组分析中对单倍型信息的获取和利用 | 研究对象为人类基因组中的单倍型信息 | 数字病理学 | NA | 链特异性单细胞测序、PacBio数据、10X Genomics链接读测序 | NA | 基因组数据 | 使用了10个Strand-seq文库和10倍覆盖的PacBio数据或10X Genomics链接读数据 |