单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11781	2024-08-05	Neurog3-Independent Methylation Is the Earliest Detectable Mark Distinguishing Pancreatic Progenitor Identity 2019-01-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.048 PMID:30620902	研究论文	本文展示了Neurog3独立的甲基化是区分胰腺祖细胞身份的最早可检测标志	通过单细胞RNA-seq和轨迹分析，揭示了Myt1与Neurog3的共表达在胰腺细胞命运选择中的作用	研究中甲基化状态的变化与能否定义的亚群体之间的关系尚不明确	探讨Neurog3细胞在胰腺发育中的细胞命运选择机制	胰腺内的Neurog3表达祖细胞及其甲基化状态	数字病理学	NA	单细胞RNA-seq，轨迹分析	NA	RNA数据	NA
11782	2024-08-05	Quantitative Clonal Analysis and Single-Cell Transcriptomics Reveal Division Kinetics, Hierarchy, and Fate of Oral Epithelial Progenitor Cells 2019-01-03, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2018.10.015 PMID:30472156	研究论文	本文探讨了口腔上皮祖细胞的分裂动力学、层级和命运	通过定量克隆分析和单细胞转录组学，揭示了口腔上皮祖细胞的独特分裂特性和细胞组织模型	没有提供具体的临床数据支持研究结果	了解口腔上皮祖细胞在稳态和疾病中的角色	口腔上皮祖细胞（OEPCs）	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	文本	NA
11783	2024-08-05	Successful Anti-PD-1 Cancer Immunotherapy Requires T Cell-Dendritic Cell Crosstalk Involving the Cytokines IFN-γ and IL-12 2018-12-18, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2018.09.024 PMID:30552023	研究论文	本研究揭示了抗PD-1免疫疗法中T细胞与树突细胞之间的相互作用及其依赖的细胞因子IFN-γ和IL-12	揭示了树突细胞产生IL-12的机制及其在抗肿瘤免疫中的关键作用	本研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证	研究抗PD-1免疫疗法在肿瘤内的作用机制	重点研究肿瘤浸润性树突细胞的功能和T细胞的作用	数字病理学	肿瘤	单细胞RNA测序和活体实时成像	小鼠模型	细胞和分子水平的数据	特定小鼠模型的树突细胞样本，具体数量未提供
11784	2024-08-05	Single-cell transcriptional analysis reveals ILC-like cells in zebrafish 2018-11-16, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.aau5265 PMID:30446505	研究论文	这篇文章利用单细胞RNA测序生成了斑马鱼淋巴细胞的全面图谱	发现了斑马鱼中存在ILC样细胞，并识别了新的免疫型受体和标记	对其他脊椎动物ILCs的存在和功能了解较少	研究斑马鱼中ILCs的存在及其在组织稳态和免疫应答中的功能	斑马鱼的淋巴细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	14,080个细胞
11785	2024-08-05	Renal compartment-specific genetic variation analyses identify new pathways in chronic kidney disease 2018-11, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-018-0194-4 PMID:30275566	研究论文	本文探讨了肾脏慢性疾病的基因变异及相关通路	通过建立肾脏不同部分的表达数量性状位点（eQTL）图谱，识别了与慢性肾病相关的新基因	GWAS结果的生物学基础仍然不够清晰	识别与慢性肾病发展相关的新基因和细胞通路	人类肾脏的肾小球和肾小管部分	数字病理学	慢性肾病	单细胞RNA测序、表达数量性状位点图谱	NA	基因组数据、RNA序列数据	NA
11786	2024-08-05	LC3-Associated Phagocytosis in Myeloid Cells Promotes Tumor Immune Tolerance 2018-10-04, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2018.08.061 PMID:30245008	研究论文	本文展示了髓系细胞中的LC3相关吞噬作用在肿瘤免疫耐受中的作用	研究指出LAP在髓系细胞中影响肿瘤生长，而不仅仅是经典自噬	本文未探讨不同类型肿瘤对LAP的影响	探讨自噬在肿瘤微环境中的不同功能及其对免疫反应的影响	研究重点为肿瘤相关巨噬细胞及其对肿瘤细胞的吞噬作用	数字病理学	肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	NA
11787	2024-08-05	Regulated Capture of Vκ Gene Topologically Associating Domains by Transcription Factories 2018-08-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2018.07.091 PMID:30157436	研究论文	本文探讨了淋巴细胞抗原受体多样性表达的机制，重点研究了Vκ基因的转录和重组过程	该研究首次揭示了Vκ基因如何通过转录工厂在核矩阵上被选择性捕获，从而实现单拷贝基因的转录	本文未提供单细胞转录组数据的详细样本量和具体实验条件	研究Vκ基因在淋巴细胞中的单拷贝转录与重组的机制	研究对象为预B细胞中Vκ基因的转录和重组	数字病理学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA	NA
11788	2024-08-05	RNA velocity of single cells 2018-08, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-018-0414-6 PMID:30089906	研究论文	本文展示了如何通过区分未剪接和剪接的mRNA来直接估计单细胞RNA测序中的RNA速度	提出了RNA速度作为时间导数来预测单个细胞未来状态的创新方法	没有提及具体的限制因素	研究RNA速度在分析发育谱系和细胞动态中的应用	单细胞RNA测序数据，特别是在神经嵴谱系和人类胚胎大脑中	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	高维向量模型	RNA数据	多种发布的数据集和技术平台
11789	2024-08-05	Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing 2018-05-03, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2018.03.041 PMID:29681456	研究论文	该文章探讨了三阴性乳腺癌中的化疗耐药性演变	该研究使用单细胞测序揭示了耐药基因型的存在与适应选择	样本数量较小，仅涉及20名患者，可能限制了结论的普遍性	研究三阴性乳腺癌在新辅助化疗中的耐药性机制	20名接受新辅助化疗的三阴性乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	单细胞DNA和RNA测序，整体外显子组测序	NA	细胞数据	20名三阴性乳腺癌患者，分析900个单细胞和6862个单细胞RNA
11790	2024-08-05	Developmental and oncogenic programs in H3K27M gliomas dissected by single-cell RNA-seq 2018-04-20, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aao4750 PMID:29674595	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了H3K27M胶质瘤中的致癌和发育程序。	首次使用单细胞分辨率解析H3K27M胶质瘤的细胞架构和发育程序，提供了潜在的治疗靶点。	研究仅在六个原发H3K27M胶质瘤模型中进行，样本数量相对较少，可能限制结果的普适性。	探索H3K27M胶质瘤的细胞组成及其发展机制。	本研究的对象为六个原发H3K27M胶质瘤和相匹配的模型中的细胞。	数字病理学	脑瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	3321个细胞来自六个原发H3K27M胶质瘤
11791	2024-08-05	Early emergence of cortical interneuron diversity in the mouse embryo 2018-04-06, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aar6821 PMID:29472441	研究论文	本研究使用单细胞转录组学研究小鼠胚胎中皮层抑制神经元的多样性起源	首次揭示了小鼠胚胎中皮层抑制神经元前体细胞和新生神经元的不同类型	研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种	探讨小鼠胚胎中皮层抑制神经元的多样性及其起源	小鼠胚胎中皮层抑制神经元的前体细胞和新生神经元	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	NA	NA
11792	2024-08-05	Depletion of Maternal Cyclin B3 Contributes to Zygotic Genome Activation in the Ciona Embryo 2018-04-02, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2018.02.046 PMID:29576477	研究论文	本文探讨了母体Cyclin B3在Ciona胚胎中对合子基因组激活的影响	揭示母体Cyclin B3在合子转录激活过程中的重要作用	研究主要基于Ciona intestinalis，可能不适用于所有动物	探索Ciona胚胎中合子基因组激活的机制	Ciona intestinalis的胚胎	生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	8细胞和16细胞阶段的胚胎
11793	2024-08-05	Developmental diversification of cortical inhibitory interneurons 2018-03-22, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature25999 PMID:29513653	研究论文	本文探讨了皮层抑制性中间神经元的发育多样性及其生成机制	通过单细胞RNA测序揭示了小鼠细胞的转录组异质性及其在发育过程中的动态变化	NA	研究皮层内神经元如何在发育过程中产生多样性	小鼠的皮层抑制性中间神经元及其前体细胞	数字病理学	神经精神疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	小鼠细胞沿发展时间过程的样本
11794	2024-08-05	A Novel Approach to Single Cell RNA-Sequence Analysis Facilitates In Silico Gene Reporting of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Retinal Cell Types 2018-03, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1002/stem.2755 PMID:29230913	研究论文	本研究提出了一种新的单细胞RNA测序分析方法，以促进对人类多能干细胞衍生视网膜细胞类型的基因报告。	创新点在于开发了一种简单、通用的方法，通过排名单个细胞的基因表达水平来生成与报告基因线相似的表达数据。	传统单细胞RNA测序分析方法基于无偏算法的应用未能揭示结果，可能限制了细胞鉴定的明确性。	研究旨在分析人类多能干细胞衍生的多种视网膜细胞类型的基因表达谱。	研究对象为人类多能干细胞衍生的视网膜细胞类型及其基因表达特征。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	基因表达数据	来自光感受器样结构的单细胞
11795	2024-08-05	Single-cell analysis of experience-dependent transcriptomic states in the mouse visual cortex 2018-01, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-017-0029-5 PMID:29230054	研究论文	本文探讨了小鼠视觉皮层中经历依赖的转录组状态的单细胞分析	识别了30种细胞类型中显著且不同的刺激响应，揭示了611个刺激响应基因	尚缺乏对所有皮层细胞类型转录响应多样性的全面理解	研究小鼠视觉皮层在光照刺激后的转录变化	小鼠视觉皮层中的不同细胞类型	数字病理学	发育性脑障碍	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	30种细胞类型
11796	2024-08-05	Somatic Mutations Activating the mTOR Pathway in Dorsal Telencephalic Progenitors Cause a Continuum of Cortical Dysplasias 2017-12-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2017.11.106 PMID:29281825	研究论文	本文探讨了在背侧端脑祖细胞中激活mTOR通路的体细胞突变导致皮层发育不良的连续性。	本研究揭示了mTOR通路基因突变导致的局灶性皮层发育不良和半侧脑巨头症之间的连续性，并且确认了特定神经元谱系中激活mTOR的机制。	样本数量相对有限，仅涵盖66个病例，可能影响结果的普遍适用性。	研究mTOR通路突变在神经发育缺陷中的作用，特别是在皮层发育不良和半侧脑巨头症中的作用。	研究对象为局灶性皮层发育不良和半侧脑巨头症脑组织中的mTOR通路基因变异。	数字病理	NA	深度测序	小鼠模型	脑组织样本	66个病例
11797	2024-08-05	Dissecting Cell-Type Composition and Activity-Dependent Transcriptional State in Mammalian Brains by Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq 2017-Dec-07, Molecular cell IF:14.5Q1 DOI:10.1016/j.molcel.2017.11.017 PMID:29220646	研究论文	本文提出了一种新的单核RNA测序方法，可以有效地分析成年哺乳动物大脑中的细胞类型组成和活性依赖的转录状态	创新点在于结合了蔗糖梯度纯化和液滴微流体技术，开发出无酶解和无核Sorting的高通量单核RNA-seq方法	研究未提及样本来源的具体多样性和可能的生物学变异性	研究成年哺乳动物大脑中细胞多样性及其活性依赖的转录状态	成年小鼠皮层组织中的约18,000个细胞核	数字病理学	NA	单核RNA-seq	NA	RNA数据	约18,000个细胞核
11798	2024-08-05	Single-cell transcriptomics reconstructs fate conversion from fibroblast to cardiomyocyte 2017-11-02, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature24454 PMID:29072293	研究论文	本研究通过单细胞转录组学重构了成纤维细胞向心肌细胞的命运转换	揭示了在成纤维细胞转化为心肌细胞过程中，细胞异质性及重编程的分子机制	重编程过程的异步特性以及细胞间的固有异质性使得传统的批量基因组技术难以研究这一过程	探索成纤维细胞向心肌细胞转化的机制及相关基因表达变化	小鼠成纤维细胞及其转化为诱导心肌细胞的过程	数字病理	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
11799	2024-08-05	Single-cell transcriptomics to explore the immune system in health and disease 2017-10-06, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aan6828 PMID:28983043	研究论文	本文概述了单细胞转录组学在健康与疾病中的应用，探讨免疫系统的复杂性	提出了利用单细胞RNA测序等最新技术推动免疫学研究的创新观点	未提及具体的实验数据或样本研究结果	研究单细胞分辨率下的免疫系统的多样性和复杂性	免疫细胞及其在健康和疾病状态下的表型	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
11800	2024-08-05	The neuropeptide NMU amplifies ILC2-driven allergic lung inflammation 2017-09-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature24029 PMID:28902842	研究论文	这篇文章探讨了神经肽NMU在ILC2驱动的过敏性肺炎症中的作用	首次揭示了NMUR1信号通路在促进ILC2炎性反应中的重要性	尚未详细阐明ILC2在维持稳态与促进炎症之间的信号转导机制	识别指引ILC2促进稳态与炎症的分子信号	小鼠肺部常驻ILC的单细胞RNA测序和刺激后的分析	数字病理学	过敏性哮喘	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	小鼠模型