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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11781 | 2025-10-07 |
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-Sep-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101711
PMID:39232498
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型证明在KRAS野生型背景下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失可诱导自发性胰腺癌发生 | 首次建立KRAS野生型自发性胰腺癌小鼠模型,揭示p53和SMAD4/TGFBR2缺失可独立于致癌KRAS突变驱动胰腺癌发生 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究KRAS野生型胰腺癌的发病机制 | 基因工程小鼠模型(PPSSC和PPTTC模型) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 多个基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11782 | 2025-10-07 |
The Effect of Exposure to Neighborhood Violence on Glucocorticoid Receptor Signaling in Lung Tumors
2024-07-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0032
PMID:38912926
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研究论文 | 本研究探讨了居住区暴力犯罪暴露对肺肿瘤中糖皮质激素受体信号通路的影响 | 首次将社区暴力犯罪暴露与肺肿瘤中糖皮质激素受体染色质招募的重新编程联系起来 | 样本量较小(仅15个肺肿瘤样本),研究结果需要更大样本验证 | 研究社会压力暴露与肺肿瘤基因表达之间的关系 | 肺肿瘤样本和居住区暴力犯罪率 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,CUT&RUN(ChIP测序技术) | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 15个肺肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
11783 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
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研究论文 | 构建了迄今为止最全面的小鼠视网膜单细胞图谱,整合了约33万个细胞的数据 | 创建了最大的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,首次整合多个数据集构建综合细胞图谱,识别了138种细胞类型 | 仅使用C57BL/6J野生型小鼠,可能不适用于其他品系或疾病模型 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞图谱以解决现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗体磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(本研究),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11784 | 2025-10-07 |
Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection
2024-02-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01290-y
PMID:38317183
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示致病性慢病毒感染引发促炎反馈环路导致疾病进展的免疫机制 | 利用遗传相似但毒力不同的SIV变异株感染模型,结合纵向单细胞转录组和细胞通讯分析,首次发现致病性慢病毒通过逃逸干扰素应答并激活CXCL10/CXCL16驱动的促炎放大环路 | 研究局限于猪尾猕猴模型,未在人类HIV感染中直接验证 | 揭示慢病毒致病性差异的免疫学基础 | 感染不同毒力SIV变异株的猪尾猕猴免疫细胞 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞转录组测序,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪尾猕猴感染队列的纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11785 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Global Markers of Transcriptional Diversity across Different Forms of Cellular Senescence
2023, Aging biology
DOI:10.59368/agingbio.20230008
PMID:39781544
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析不同形式细胞衰老中的转录多样性全局标志物 | 首次通过单细胞转录组学系统比较三种主要衰老形式(癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老),发现不同衰老形式共有的细胞亚群及其特征 | 研究基于基因同质的克隆细胞系,可能无法完全反映体内衰老细胞的复杂性 | 探索不同形式细胞衰老中的转录多样性及其共同特征 | 基因同质的克隆细胞系(包括癌基因诱导衰老、复制性衰老和DNA损伤诱导衰老) | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种衰老形式的克隆细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11786 | 2025-01-11 |
Targeting pathological brain activity-related to neuroinflammation through scRNA-seq for new personalized therapies in Parkinson's disease
2025-Jan-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02086-7
PMID:39788941
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11787 | 2025-10-07 |
Tigulixostat Alleviates Hyperuricemic Nephropathy by Promoting M2 Macrophage Polarization
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S500101
PMID:39780982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术探讨Tigulixostat对高尿酸血症肾病的影响 | 发现Tigulixostat通过促进M2巨噬细胞极化改善高尿酸血症肾病,且比别嘌呤醇更有效且不引起肝损伤 | 研究仅使用Uox-KO小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究Tigulixostat对尿酸水平和高尿酸血症肾病的影响 | 尿酸氧化酶敲除(Uox-KO)小鼠模型 | 生物医学研究 | 高尿酸血症肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 血浆代谢组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据, 细胞表型数据 | Uox-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
11788 | 2025-10-07 |
KLRD1 (CD94): A Prognostic Biomarker and Therapeutic Candidate in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104762
PMID:39781341
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了KLRD1在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 首次系统评估KLRD1在多种癌症中的表达模式及其与预后的关系,并发现其在头颈鳞状细胞癌中作为独立预后因子的价值 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索KLRD1在癌症中的表达特征、预后价值和免疫治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和多种癌症类型的基因组数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析, 免疫浸润分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 来自TCGA、GTEx和GEO数据库的多癌症类型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11789 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis unveils cell subtypes of acral melanoma cells at the early and late differentiation stages
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.102045
PMID:39781353
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示肢端黑色素瘤在早期和晚期分化阶段的细胞亚型 | 首次识别出C3 ID2+黑色素瘤细胞作为早期亚群和C4 PCLAF+细胞作为晚期亚群在肢端黑色素瘤演化中的作用 | 仅包含6例患者样本,样本量有限,且黑色素瘤相关研究仍需进一步完善 | 研究肢端黑色素瘤的异质性及其进展机制 | 肢端黑色素瘤患者的黑色素瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 6例黑色素瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11790 | 2025-10-07 |
Elucidating the Role of Estrogen Effects in Leukemia: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100610
PMID:39781360
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法探索雌激素及其受体与白血病之间的因果关系 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法相结合研究雌激素与白血病的分子关系 | 方法学间存在不一致性,需要更大样本量和更高测序深度来阐明相互作用的复杂性 | 阐明雌激素效应在白血病中的作用机制 | 雌激素及其受体、白血病及相关蛋白 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 遗传风险评分分析 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞转录组数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11791 | 2025-10-07 |
TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3-mediated Mechano-metabolic Axis Promotes Skin Fibrosis
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.104484
PMID:39781462
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研究论文 | 本研究揭示了TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3机械代谢轴在皮肤纤维化疾病中的作用机制 | 首次发现TAGLN通过RhoA/ROCK2通路调控SLC2A3表达,建立机械环境与细胞代谢之间的联系 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探究TAGLN在皮肤纤维化发病机制中的作用 | 皮肤成纤维细胞和博来霉素诱导的小鼠皮肤纤维化模型 | 细胞生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序,RNA-seq,Transwell,伤口愈合实验,胶原凝胶收缩实验,免疫荧光 | NA | 基因表达数据,细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |
11792 | 2025-10-07 |
An Analysis Regarding the Association Between DAZ Interacting Zinc Finger Protein 1 (DZIP1) and Colorectal Cancer (CRC)
2025-Feb, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01065-1
PMID:38334905
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床样本分析,揭示了DZIP1在结直肠癌间质表型调控中的关键作用 | 首次发现DZIP1在成纤维细胞和癌细胞中表达,并证实其通过调控成纤维细胞活化和上皮间质转化促进结直肠癌进展 | 分子机制研究仍需深入,临床转化潜力有待进一步验证 | 探索DZIP1在结直肠癌发生发展中的作用机制 | 结直肠癌患者临床样本、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 假时序分析, 动物模型实验 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 临床样本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11793 | 2025-10-07 |
Intestinal Subtype as a Biomarker of Response to Neoadjuvant Immunochemotherapy in Locally Advanced Gastric Adenocarcinoma: Insights from a Prospective Phase II Trial
2025-Jan-06, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2436
PMID:39495175
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研究论文 | 本研究通过前瞻性II期临床试验发现肠道亚型可作为局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗疗效的生物标志物 | 首次发现Lauren分型中的肠道亚型与NAIC疗效相关,并构建了基于DNA损伤修复活性癌细胞和CLEC9A+树突状细胞的机器学习预测模型 | 单臂II期研究设计,样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探索局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗的疗效预测生物标志物 | 局部晚期胃腺癌患者 | 数字病理学 | 胃腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NaiveBayes | 转录组数据 | 104个样本(来自两个独立队列的75名患者)和105个初治胃腺癌单细胞RNA测序数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
11794 | 2025-10-07 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究人类皮肤衰老中表皮和真皮细胞衰老的特征 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并首次在单细胞水平系统揭示光老化和时序性衰老中不同皮肤细胞类型的衰老特征 | 研究主要关注特定细胞类型(黑色素细胞和成纤维细胞),可能未完全覆盖所有皮肤细胞类型的衰老特征 | 探究人类皮肤衰老过程中表皮和真皮细胞衰老的分子机制和空间分布特征 | 人类皮肤组织中的黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
11795 | 2025-10-07 |
Senescence landscape in the liver following sepsis and senolytics as potential therapeutics
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14354
PMID:39444093
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研究论文 | 本研究揭示了脓毒症诱导的肝脏细胞衰老景观及其对预后的影响 | 首次描述了脓毒症肝脏中的衰老景观,并证明衰老清除剂可显著降低脓毒症死亡率 | 研究仅使用小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究脓毒症诱导的肝脏细胞衰老机制及潜在治疗策略 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型肝脏组织 | 生物医学研究 | 脓毒症 | 单细胞测序,RNAscope,共聚焦显微镜,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据,流式数据 | 脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11796 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 本研究通过整合大量和单细胞转录组数据,揭示自噬在血液组织衰老过程中的关键作用及机制 | 首次通过整合大规模正常组织和AML样本的转录组数据,在单细胞分辨率水平确定经典单核细胞是衰老过程中自噬水平升高的关键细胞类型,并发现缺氧是重要调控因素 | 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证;样本来源和数量可能存在偏差 | 识别自噬与衰老相关性最强的组织,探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄血液样本、急性髓系白血病样本 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、不同年龄血液单细胞数据、2000多个AML样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
11797 | 2025-10-07 |
Non-glycanated ΔDCN isoform in muscle invasive bladder cancer mediates cancer stemness and gemcitabine resistance
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00998-8
PMID:39466536
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研究论文 | 本研究鉴定出膀胱癌干细胞中非糖基化ΔDCN亚型,揭示其通过诱导干细胞表型和赋予吉西他滨化疗耐药性促进肿瘤进展 | 首次在膀胱癌干细胞中发现非糖基化ΔDCN亚型,揭示其与糖基化DCN在细胞定位和功能上的对立作用 | 研究机制尚未完全阐明,临床样本量有限 | 阐明DCN对膀胱癌干细胞调控作用及在肌层浸润性膀胱癌中的机制 | 膀胱癌干细胞、膀胱癌细胞系、临床组织样本 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、慢病毒转染、CCK8检测、球体形成实验 | NA | 基因表达数据、临床病理特征、生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11798 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组学构建小鼠大脑时空图谱,开发空间衰老时钟模型揭示衰老和 rejuvenation 过程中的细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型(空间衰老时钟),系统揭示衰老过程中细胞对邻近细胞的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类大脑的适用性需要进一步验证 | 探究大脑衰老过程中细胞间相互作用的分子机制及其对组织功能衰退的影响 | 小鼠大脑细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞空间转录组测序 | 深度学习, 机器学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞,来自20个不同年龄阶段的小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
11799 | 2025-10-07 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322864121
PMID:38976727
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研究论文 | 本研究揭示了涡虫在伤口诱导下通过NFY转录因子调控神经元分化的机制 | 首次发现伤口诱导的NFY转录因子结合在脑再生早期启动神经分化通路 | 研究仅聚焦于涡虫模型,机制在其他再生动物中的普适性尚未验证 | 探究伤口诱导的转录调控事件如何启动神经元分化和脑再生 | 具有高再生能力的涡虫 | 发育生物学 | NA | 染色质可及性分析,单细胞转录组测序,功能研究 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11800 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境,并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |