单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30193 篇文献，本页显示第 1161 - 1180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2025-07-20 |
CFTR represses a PDX1 axis to govern pancreatic ductal cell fate
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111393
PMID:39687022
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研究论文 | 该研究揭示了CFTR蛋白通过调控PDX1表达影响胰腺导管细胞命运的机制 | 发现了CFTR蛋白水平（而非其通道功能）调控PDX1表达的新机制，解释了CF突变如何影响胰腺外分泌/内分泌重塑 | 研究主要基于CF雪貂模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究CFTR蛋白缺失对胰腺导管细胞命运及胰岛功能的影响机制 | CF雪貂模型的胰腺导管细胞 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | CF雪貂模型（具体数量未明确说明） |
| 1162 | 2025-07-20 |
Cycling alpha cells in regenerative drug-treated human pancreatic islets may serve as key beta cell progenitors
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101832
PMID:39626675
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了DYRK1A抑制剂单独或与GLP-1或LY联合使用时对人类胰腺胰岛中α细胞的影响，揭示了循环α细胞可能作为β细胞前体细胞的机制 | 首次发现循环α细胞对DYRK1A抑制最为敏感，并可能通过转分化成为β细胞前体细胞 | 研究未明确DYRK1A抑制剂促使α细胞转分化的具体分子机制 | 探索恢复糖尿病患者β细胞数量的潜在治疗方法 | 人类胰腺胰岛中的α细胞和β细胞 | 再生医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类胰腺胰岛样本（具体数量未提及） |
| 1163 | 2025-07-20 |
Elucidating Sex-Specific Immune Profiles in a Breast Cancer Model
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313113
PMID:39684829
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，探讨了雌雄小鼠乳腺癌模型中性别特异的免疫和激素特征差异 | 首次在雌雄ER+乳腺癌转基因小鼠模型中系统揭示性别依赖的肿瘤免疫微环境差异 | 研究局限于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明乳腺癌中性别特异的免疫特征差异 | MMTV-PyMT转基因雌雄小鼠的ER+乳腺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq, 全片免疫组化, 流式细胞术 | MMTV-PyMT转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 图像数据, 细胞计数数据 | 未明确说明数量的雌雄转基因小鼠样本 |
| 1164 | 2025-07-20 |
Sex-specific regulatory architecture of pancreatic islets from subjects with and without type 2 diabetes
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00313-z
PMID:39567827
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和单核ATAC测序技术，探讨了2型糖尿病和非糖尿病供体胰岛细胞的性别特异性调控差异 | 揭示了2型糖尿病胰岛细胞在性染色体和常染色体基因上的性别差异，并提出了线粒体功能在女性向2型糖尿病转变中的作用 | 样本量相对较小（52名供体），且仅针对胰岛细胞进行研究 | 探究2型糖尿病胰岛细胞性别差异的分子机制 | 人类胰岛细胞（来自52名2型糖尿病和非糖尿病供体） | 基因组学 | 2型糖尿病 | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因组数据 | 52名供体的胰岛细胞 |
| 1165 | 2025-07-20 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
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research paper | 研究机械张力如何通过细胞培养基底刚度影响衰老细胞标志物和分泌表型 | 揭示了机械力如何塑造细胞衰老及其分泌表型，特别是在高刚度条件下 | 研究主要基于体外实验，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探索物理刺激对细胞衰老和SASP的影响 | 人原代肺成纤维细胞(IMR-90) | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 人原代肺成纤维细胞在不同刚度基底上的培养 |
| 1166 | 2025-07-20 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
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research paper | 本文介绍了一种用于视网膜单细胞RNA测序的样本多重标记方法，以提高稀有细胞群体的表征效率 | 开发了一种使用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本多重标记的scRNA-seq流程，能够解析样本来源并与表型数据结合 | 方法主要应用于小鼠视网膜神经节细胞，尚未在其他细胞类型或物种中验证 | 解决稀有细胞群体在单细胞RNA测序中的表征挑战 | 小鼠视网膜神经节细胞 | digital pathology | NA | scRNA-seq, 样本多重标记技术 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个视网膜样本 |
| 1167 | 2025-07-20 |
Collapsible tree: interactive web app to present collapsible hierarchies
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae645
PMID:39460943
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research paper | 介绍了一个名为Collapsible Tree的JavaScript框架和交互式网络应用，用于展示可折叠的层次结构 | 提出了一个能够同时展示细胞状态和基因表达的交互式层次图，克服了t-SNE和UMAP需要分开展示的局限性 | 未提及具体的技术限制或性能瓶颈 | 开发一个直观的数据可视化工具，用于展示层次树结构 | 单细胞转录组学数据 | 数据可视化 | NA | JavaScript框架 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1168 | 2025-07-20 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
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研究论文 | 通过单细胞多组学测序技术，研究Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）的组织特异性反应 | 首次使用单细胞转录组、表面蛋白质组和T细胞受体（TCR）测序技术，全面解析SJS/TEN患者的免疫病理机制 | 样本量较小（15名患者），且为罕见疾病，可能限制结果的普遍性 | 揭示SJS/TEN的细胞免疫病理机制，并识别潜在的治疗靶点 | 15名SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水疱液 | 单细胞测序 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体（TCR）测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 15名患者的109,888个细胞 |
| 1169 | 2025-07-20 |
Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia
2024-Oct-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-24-0200
PMID:39099209
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research paper | 该研究探讨了CD73小分子抑制剂AB-680在K-Ras突变胰腺上皮内瘤变（PanIN）中的免疫预防作用 | 首次证明CD73抑制剂AB-680可增强免疫监视，减少PanIN进展，并改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成 | 研究仅在KrasG12D; PdxCre1基因工程小鼠模型中进行，尚未在人体试验验证 | 探索CD73抑制作为胰腺导管腺癌（PDAC）免疫预防新策略的潜力 | KrasG12D; PdxCre1基因工程小鼠模型中的胰腺上皮内瘤变（PanIN） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | KrasG12D; PdxCre1（KC）基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | KC小鼠模型（具体数量未明确说明） |
| 1170 | 2025-07-20 |
Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339
PMID:39303666
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了甲氨蝶呤（MTX）和TNF抑制剂对类风湿关节炎相关间质性肺病（RA-ILD）的影响 | 揭示了MTX通过促进免疫细胞浸润、Th17激活和纤维化加剧肺炎症，而TNF抑制剂则改善这些特征并抑制ILD进展 | 研究主要基于SKG小鼠模型，人类队列数据仍需进一步验证 | 评估MTX和TNF抑制剂对RA-ILD的影响 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞转录组学 | SKG小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 1171 | 2025-07-20 |
Deciphering the role of LGALS2: insights into tertiary lymphoid structure-associated dendritic cell activation and immunotherapeutic potential in breast cancer patients
2024-Sep-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02126-4
PMID:39350165
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研究论文 | 本文通过整合分析乳腺癌样本的转录组数据，揭示了LGALS2在三级淋巴结构（TLSs）相关树突状细胞激活中的关键作用及其免疫治疗潜力 | 首次发现LGALS2作为TLSs中的关键标志物，并揭示了其在乳腺癌免疫微环境中的复杂作用及其与患者生存期的关联 | 研究主要基于计算分析和实验验证，但未涉及LGALS2在临床治疗中的实际应用效果 | 探索LGALS2在乳腺癌免疫微环境中的作用及其免疫治疗潜力 | 乳腺癌患者样本 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、免疫组织化学（IHC）、体内验证分析 | 机器学习（ML） | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 超过6000个乳腺癌样本 |
| 1172 | 2025-07-20 |
Permethrin exposure primes neuroinflammatory stress response to drive depression-like behavior through microglial activation in a mouse model of Gulf War Illness
2024-Sep-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03215-3
PMID:39272155
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研究论文 | 本研究探讨了氯菊酯暴露如何通过小胶质细胞激活引发神经炎症应激反应，从而在模拟海湾战争疾病的小鼠模型中诱导抑郁样行为 | 首次揭示了氯菊酯暴露可通过小胶质细胞激活引发神经炎症应激反应，并与心理压力协同作用导致抑郁样行为 | 研究仅使用小鼠模型，结果需在人类中进一步验证 | 评估氯菊酯暴露是否会导致神经炎症应激反应并引发与海湾战争疾病相关的精神症状 | 海湾战争疾病小鼠模型 | 神经科学 | 海湾战争疾病 | 单细胞RNA测序分析 | DREADD受体技术 | 基因表达数据 | 21,566个来自小鼠海马区的单细胞核 |
| 1173 | 2025-07-20 |
SCIntRuler: guiding the integration of multiple single-cell RNA-seq datasets with a novel statistical metric
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae537
PMID:39226185
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研究论文 | 介绍了一种名为SCIntRuler的新型统计指标，用于指导多个单细胞RNA测序数据集的整合 | 提出了SCIntRuler这一新型统计指标，帮助研究人员决定是否需要数据整合以及选择合适的整合方法 | 未明确提及具体局限性 | 解决多个单细胞RNA测序数据集整合中的挑战，提高分析稳健性 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1174 | 2024-08-07 |
Advancing sequencing-based spatial transcriptomics with a comprehensive benchmarking study
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02326-2
PMID:38977827
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1175 | 2025-07-20 |
Morphogenic, molecular, and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2024-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608866
PMID:39229219
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研究论文 | 本研究通过多尺度3D成像和单细胞转录组学技术，揭示了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了一种鸡特有的肺泡细胞类型（KRT14表达的腔细胞），并阐明了鸡肺中单向气流的形成机制 | 研究仅聚焦于鸡肺发育，未与其他鸟类物种进行直接比较 | 探索鸟类肺脏单向气流的发育机制及其与哺乳动物双向气流的差异 | 鸡肺的发育过程 | 发育生物学 | NA | 多尺度3D成像、单细胞转录组学、Stereo-seq空间转录组学 | NA | 3D图像数据、转录组数据 | 鸡肺发育关键阶段样本 |
| 1176 | 2025-07-20 |
Heavy Metal Exposure-Mediated Dysregulation of Sphingolipid Metabolism
2024-Aug-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox13080978
PMID:39199224
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研究论文 | 本研究探讨了重金属暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响 | 首次研究了特定重金属局部高浓度对鞘脂代谢稳态的影响，并利用体外模型和三维离体人体组织模型进行了分析 | 研究主要基于体外和离体模型，可能无法完全反映体内情况 | 探究重金属暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响 | 鞘脂代谢和氧化应激 | 生物医学 | 哮喘 | 空间转录组学、实时定量PCR | 体外模型系统、三维离体人体组织模型 | 分子生物学数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 1177 | 2025-07-20 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2024-Jul-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175047
PMID:38954467
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研究论文 | 探讨血栓反应蛋白-1（THBS1）在肥胖引起的膈肌纤维脂肪化基质扩张和收缩功能障碍中的作用 | 首次揭示THBS1通过促进纤维脂肪化祖细胞（FAPs）增殖，驱动膈肌基质重塑和收缩功能障碍 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 阐明肥胖相关膈肌功能障碍的病理机制 | 野生型和Thbs1敲除小鼠的膈肌组织 | 病理生理学 | 肥胖相关呼吸功能障碍 | 批量转录组学和单细胞转录组学 | Thbs1敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 野生型和Thbs1敲除小鼠的膈肌组织样本 |
| 1178 | 2025-07-20 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究探讨了在小鼠TDP-43神经退行性变模型中，杆状小胶质细胞如何通过与神经元树突的相互作用调节皮质兴奋性 | 首次发现并描述了一种独特的杆状小胶质细胞亚群，该亚群通过调节神经元活动来减轻皮质过度兴奋 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 探究TDP-43相关神经退行性变中皮质过度兴奋的调节机制 | TDP-43神经退行性变小鼠模型(rNLS8)中的小胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 多通道探针记录、纵向钙成像、空间和单细胞RNA测序 | TDP-43神经退行性变小鼠模型(rNLS8) | 电生理记录数据、成像数据、RNA测序数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 1179 | 2025-07-20 |
Integration of spatial and single-cell data across modalities with weakly linked features
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01935-0
PMID:37679544
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research paper | 提出了一种名为MaxFuse的跨模态数据整合方法，能够在特征弱关联的情况下实现高质量的数据整合 | MaxFuse通过迭代共嵌入、数据平滑和细胞匹配，利用每种模态中的所有信息，在特征弱关联的情况下实现高质量整合 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够在特征弱关联情况下实现高质量跨模态数据整合的方法 | 单细胞测序数据和空间测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间测序 | MaxFuse | 蛋白质组数据、转录组数据、表观基因组数据 | 未提及具体样本数量 |
| 1180 | 2025-07-20 |
Challenges and opportunities in cancer immunotherapy: a Society for Immunotherapy of Cancer (SITC) strategic vision
2024-Jun-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009063
PMID:38901879
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review | 本文总结了癌症免疫疗法在过去10-15年的发展，并提出了未来十年的战略愿景 | 提出了七个高优先级领域和三个关键指导原则，以促进癌症免疫疗法的未来发展 | 未提及具体实验数据或样本量，更多是基于专家共识的战略性讨论 | 识别癌症免疫疗法领域的当前机遇和挑战，优先考虑具有最高临床潜力的领域 | 癌症免疫疗法的科学和临床进展 | 癌症免疫疗法 | 癌症 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |