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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2026-03-20 |
Inhibition of glutathione peroxidase 4 suppresses gastric cancer peritoneal metastasis via regulation of RCC2 homeostasis
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103519
PMID:39908861
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研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽过氧化物酶4(GPx4)通过调节RCC2的稳态来驱动胃癌腹膜转移的分子机制 | 首次阐明了GPx4通过ROS积累激活Aurora A磷酸化,进而导致RCC2在K377位点泛素化降解,从而抑制胃癌腹膜转移的具体信号通路 | 研究主要基于体外和体内实验模型,临床样本验证的规模可能有限,且具体治疗策略的转化潜力有待进一步评估 | 探究GPx4在胃癌进展和转移中的作用机制,并寻找新的治疗靶点 | 胃癌细胞及临床样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 回顾性临床样本及实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1162 | 2026-03-20 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638726
PMID:40027680
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研究论文 | 本文比较了空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法,并提出了一种基于广义估计方程框架的广义得分检验作为稳健解决方案 | 提出了一种新的广义得分检验方法,有效整合空间相关性,以克服现有方法如Wilcoxon秩和检验在空间转录组数据分析中的局限性 | 研究主要基于模拟数据和特定癌症数据集,可能未涵盖所有空间转录组学应用场景或组织类型 | 比较并改进空间转录组学中差异表达基因识别的统计方法,以提高分析准确性 | 空间转录组学数据,特别是来自乳腺癌和前列腺癌的数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程, Wilcoxon秩和检验, 稳健Wald检验 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1163 | 2026-03-20 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
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研究论文 | 本文介绍了Seq-Scope-X技术,一种结合组织膨胀的测序空间转录组学方法,实现了亚微米级分辨率,超越传统光学限制 | 通过物理组织膨胀技术,Seq-Scope-X将空间特征密度提升一个数量级,首次在肝脏组织中实现单细胞核质区室分辨,并揭示代谢角色动态转换 | 未明确说明技术在不同组织类型中的普适性验证范围及样本量细节 | 开发超高分率空间组学技术以突破测序空间转录组学的分辨率限制 | 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏及人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 测序空间转录组学、组织膨胀技术、空间蛋白质组分析 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于Seq-Scope的亚微米级分辨率组织膨胀改良系统 |
| 1164 | 2026-03-20 |
The quality of SIV-specific fCD8 T cells limits SIV RNA production in Tfh cells during antiretroviral therapy
2025-01-31, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00812-24
PMID:39641620
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研究论文 | 本研究通过建立SIV慢性感染cART模型,揭示了SIV-Gag特异性fCD8 T细胞的质量与Tfh细胞中SIV RNA产量之间的负相关关系,特别是在cART治疗或自然控制者中 | 首次在SIV感染猕猴模型中,结合组织切片分析和单细胞测序,系统研究了不同感染状态下(未治疗、cART治疗、自然控制)Tfh和fCD8 T细胞的特性,并揭示了cART下fCD8 T细胞更易耗竭和免疫衰老的转录组特征 | 研究样本量较小(15只猕猴),且为动物模型,结果向人类HIV感染的直接外推需谨慎 | 探究在慢性持续性HIV/SIV感染中,淋巴组织内HIV/SIV特异性滤泡CD8 T细胞(fCD8 T细胞)对潜伏感染细胞(主要存在于滤泡辅助T细胞,Tfh)的影响,以寻找潜在的治愈策略 | 15只感染SIVmac239的食蟹猴,分为进展者(8只,建立慢性期cART模型)和自然控制者(7只) | 传染病学,免疫学 | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),激活诱导标记物(AIMs)分析,组织切片分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,组织学数据 | 15只食蟹猴 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1165 | 2026-03-20 |
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-Dec-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgae369
PMID:38820087
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了HIV感染者皮下脂肪中与内脏脂肪体积相关的促纤维化细胞变化 | 首次在HIV感染者中利用单细胞RNA测序技术,系统性地分析了皮下脂肪组织细胞组成和转录程序与内脏脂肪体积的关联 | 研究为横断面设计,无法确定因果关系,需要进一步的纵向研究来明确方向性和机制 | 探究HIV感染者皮下脂肪组织特异性细胞和分子程序与内脏脂肪体积的关系 | 接受长期抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 | 数字病理学 | 心血管代谢疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,计算机断层扫描 | NA | RNA测序数据,影像数据 | 92名参与者进行bulk RNA测序,43名进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1166 | 2026-03-20 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本文探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调与嘌呤信号通路异常的关系 | 揭示了STAT3 GOF变异通过改变嘌呤信号通路(CD39上调,CD73和A2AR下调)导致CD8+ T细胞功能失调的新机制 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型,具体分子机制仍需进一步阐明 | 研究STAT3 GOF变异如何驱动CD8+ T细胞病理学机制 | STAT3 GOF综合征患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 单细胞RNA测序,高维免疫分析,功能评估 | NA | 基因表达数据,功能数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1167 | 2026-03-20 |
The astrocyte-enriched gene deathstar plays a crucial role in the development, locomotion, and lifespan of D. melanogaster
2024-12, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2368336
PMID:38884422
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在果蝇大脑中鉴定出一个星形胶质细胞富集表达的新基因deathstar,并揭示了其在个体发育、运动能力和寿命中的关键作用 | 首次在果蝇中鉴定出星形胶质细胞特异性表达的新基因deathstar,并系统阐明了其在发育、运动行为和寿命调控中的生理功能 | 研究主要基于果蝇模型,其发现向哺乳动物系统的直接推广性有待验证;RNA干扰技术可能存在脱靶效应 | 探究果蝇大脑星形胶质细胞特异性表达基因的功能及其在生理和行为调控中的作用 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的大脑组织,特别是星形胶质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA干扰,免疫染色 | NA | 单细胞基因表达数据,图像数据 | 果蝇视叶和全脑的单细胞RNA测序数据,转基因成年果蝇脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1168 | 2026-03-20 |
Optimization of hybridization chain reaction for imaging single RNA molecules in Drosophila larvae
2024-12, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2409968
PMID:39351922
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研究论文 | 本文提出了一种优化的杂交链式反应(HCR)流程,用于在果蝇幼虫中实现单RNA分子的成像 | 开发了优化的HCR探针设计开源代码,仅需五对探针即可实现高特异性、高灵敏度且可多重检测的RNA可视化,显著降低了实验成本和时间 | 未明确说明该方法在其他生物体系或更复杂组织中的适用性,也未提供与其他现有成像方法的定量比较数据 | 优化单RNA分子成像技术,以支持基于单细胞RNA测序数据的筛选项目 | 果蝇幼虫中的特定RNA分子 | 分子成像 | NA | 杂交链式反应(HCR) | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1169 | 2026-03-20 |
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-Oct-22, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183984
PMID:39436695
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研究论文 | 本研究探讨了1型糖尿病年轻成人患者肾脏氧化代谢减弱与胰岛素敏感性及早期肾脏结构变化的关系 | 首次在1型糖尿病年轻成人中,结合高胰岛素-正常血糖钳夹、多模态成像、肾脏活检、单细胞RNA测序和空间代谢组学,系统揭示了近端肾小管细胞从稳定状态向适应/适应不良亚型转变的谱系,并发现其与氧化代谢减弱和早期肾脏结构损伤相关 | 样本量相对较小(T1D组30人,健康对照组20人),且研究对象为年轻成人,结果可能无法推广至其他年龄段的1型糖尿病患者或疾病晚期阶段 | 探究1型糖尿病中胰岛素敏感性受损是否通过改变肾脏氧化代谢而促进糖尿病肾病的发生 | 年轻1型糖尿病成人患者和健康对照者 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,空间代谢组学,高胰岛素-正常血糖钳夹,MRI,11C-乙酸盐PET,肾脏活检 | Slingshot算法(用于伪时间轨迹分析) | 单细胞转录组数据,空间代谢组数据,影像数据,临床生化数据 | 1型糖尿病患者30人,健康对照20人 | NA | 单细胞RNA-seq,空间代谢组学 | NA | NA |
| 1170 | 2026-03-20 |
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101095
PMID:38986165
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研究论文 | 本研究探讨了FAT1基因突变作为头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性标志物,及其对免疫治疗效果的影响 | 首次在头颈部鳞状细胞癌中揭示FAT1基因突变与高肿瘤突变负荷及免疫治疗耐药性的特异性关联,并利用单细胞RNA测序技术解析了高TMB样本中免疫微环境的特征细胞群 | 样本量较小(仅33例患者),且为单中心研究,需要更大规模的多中心队列进行验证 | 探究头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性遗传突变及其对免疫治疗反应的影响机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 二代测序,单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因组测序数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 33例头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1171 | 2026-03-20 |
A distinct subset of urothelial cells with enhanced EMT features promotes chemotherapy resistance and cancer recurrence by increasing COL4A1-ITGB1 mediated angiogenesis
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101116
PMID:38968684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在尿路上皮癌中发现了一个具有上皮-间质转化特征的细胞亚群,该亚群通过介导COL4A1-ITGB1相互作用促进血管生成,从而导致化疗耐药和癌症复发 | 首次在尿路上皮癌中通过单细胞RNA测序鉴定出具有EMT特征的特定尿路上皮细胞亚群,并揭示了其通过COL4A1-ITGB1相互作用介导血管生成和化疗耐药的新机制 | 研究未明确说明单细胞测序样本的具体数量,且EMT-UC样细胞是通过过表达ZEB1和DES构建的,可能与体内天然存在的EMT-UC存在差异 | 探究尿路上皮癌化疗耐药和肿瘤复发的潜在机制 | 尿路上皮癌患者组织样本、构建的EMT-UC样细胞 | 单细胞组学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1172 | 2026-03-20 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.20.585926
PMID:38585819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | PreTSA在保持与最先进方法结果一致的同时,显著减少了计算时间,为研究极大数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 | NA | 开发一种计算高效的方法来建模时空基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1173 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-03-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01805-23
PMID:38323810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了南美白对虾血细胞在感染白斑综合征病毒后的异质性反应和功能分化 | 首次应用单细胞RNA测序技术绘制对虾血细胞在病毒感染下的转录组图谱,并识别出16个转录不同的细胞簇,揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的功能分化 | 研究仅关注白斑综合征病毒感染,未涉及其他病原体或环境因素对血细胞反应的影响 | 探究对虾血细胞在病毒感染下的免疫反应机制和功能分化 | 南美白对虾的血细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 无监督伪时间分析 | 转录组数据 | 健康与感染白斑综合征病毒的对虾血细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1174 | 2026-03-20 |
Drug resistance mechanisms in dopamine agonist-resistant prolactin pituitary neuroendocrine tumors and exploration for new drugs
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101056
PMID:38277755
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研究论文 | 本研究探讨了多巴胺激动剂耐药性催乳素垂体神经内分泌肿瘤的耐药机制,并通过类器官模型筛选出潜在有效药物金雀异黄素 | 首次结合转录组测序和单细胞测序分析催乳素瘤的DA耐药机制,并成功建立DA耐药催乳素瘤类器官模型进行药物筛选 | 样本量相对较小(27例耐药和10例敏感肿瘤),类器官模型仅使用8个进行药物筛选 | 探究多巴胺激动剂耐药性催乳素瘤的耐药机制并寻找新的潜在治疗药物 | 多巴胺激动剂耐药性和敏感性的催乳素垂体神经内分泌肿瘤 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 转录组测序,单细胞测序,类器官培养,药物筛选 | 类器官模型 | RNA测序数据,单细胞测序数据,体外实验数据 | 27例DA耐药催乳素瘤,10例敏感催乳素瘤,3例耐药和3例敏感肿瘤进行单细胞测序,8个类器官用于药物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1175 | 2026-03-20 |
MAFF confers vulnerability to cisplatin-based and ionizing radiation treatments by modulating ferroptosis and cell cycle progression in lung adenocarcinoma
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101057
PMID:38266355
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研究论文 | 本研究通过CRISPR筛选和单细胞RNA测序,发现MAFF在肺腺癌中通过调控铁死亡和细胞周期进程,影响肿瘤生长和对顺铂及电离辐射治疗的敏感性 | 首次将MAFF识别为肺腺癌中调控铁死亡和细胞周期进程的关键因子,并揭示其通过cAMP/PKA/CREB1通路上调,增强肿瘤对顺铂和电离辐射治疗的脆弱性 | 研究主要基于细胞和异种移植模型,临床样本验证有限,且MAFF的药理学激动剂开发尚未在人体试验中验证 | 探索肺腺癌中肿瘤生长和治疗抵抗的机制,以改善顺铂和电离辐射治疗的效果 | 肺腺癌细胞系、小鼠模型和患者样本 | 癌症生物学 | 肺癌 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序 | 细胞模型、异种移植模型 | 基因表达数据、转录组数据 | 未明确指定样本数量,涉及细胞和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1176 | 2026-03-20 |
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.101027
PMID:38290407
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白H1.2在胰腺癌转移和化疗耐药中的作用,并开发了一个基于基因表达的评分系统来预测患者生存 | 开发了一个新颖的转移和化疗耐药特征评分系统,并首次将组蛋白H1.2与c-MYC信号通路在胰腺癌中的调控联系起来 | 研究主要基于基因表达数据和实验模型,临床验证和机制细节有待进一步探索 | 探索胰腺癌化疗耐药与肿瘤转移之间的关联及其分子细胞机制 | 胰腺癌患者基因表达数据、单细胞RNA测序数据以及体外和体内实验模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、体外增殖、侵袭、迁移、药物敏感性实验、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1177 | 2026-03-20 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-03, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101059
PMID:38295753
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中组蛋白乳酸化与顺铂耐药之间的关联 | 首次在单细胞层面揭示了H3K18乳酸化通过富集于靶基因启动子区域激活转录,从而驱动膀胱癌顺铂耐药的新机制,并鉴定出YBX1和YY1为关键转录因子 | 未在文中明确说明,可能包括样本量有限、机制验证主要在细胞层面进行、临床转化潜力需进一步验证等 | 探究膀胱癌顺铂耐药的分子机制,特别是组蛋白乳酸化在其中的作用 | 膀胱癌细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1178 | 2026-03-20 |
Unique lymphocyte transcriptomic profiles in septic patients with chronic critical illness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1478471
PMID:39691721
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了脓毒症患者中慢性危重症患者淋巴细胞独特的转录组特征 | 首次在单细胞水平上比较了脓毒症患者不同临床轨迹(快速恢复与慢性危重症)的淋巴细胞转录组差异,并关联了功能验证 | 样本量相对较小,且仅基于外周血样本,可能无法完全反映组织局部免疫状态 | 探究脓毒症后慢性危重症患者的免疫细胞转录组变化及其与临床结局的关系 | 健康受试者、急性脓毒症患者、快速恢复患者及慢性危重症患者 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | scRNA-seq队列:12名健康人、4名急性脓毒症患者、4名快速恢复患者、5名慢性危重症患者;功能验证队列:19名健康人、68名急性脓毒症患者、27名快速恢复患者、20名慢性危重症患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1179 | 2026-03-20 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.17.553733
PMID:37645822
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖症中血小板反应蛋白-1(THBS1)如何促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍 | 首次确立THBS1作为肥胖诱导膈肌基质重塑和收缩功能障碍的必要介质,并识别其作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;未详细探讨THBS1下游信号通路 | 探究THBS1在肥胖相关膈肌功能障碍中的作用机制 | 野生型和THBS1敲除小鼠的膈肌组织 | NA | 肥胖症 | bulk转录组学, single-cell转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和THBS1敲除小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1180 | 2026-03-20 |
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01429-5
PMID:36038632
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研究论文 | 本研究描述了从人类多能干细胞高效分化出输尿管芽类器官和功能性集合管细胞,模拟肾脏发育过程 | 首次实现人类多能干细胞在无血清条件下高效分化为输尿管芽类器官,并展示其分支形态发生和功能性集合管细胞分化 | NA | 肾脏再生医学,旨在通过干细胞分化模拟肾脏发育和功能 | 人类多能干细胞、输尿管芽类器官、集合管细胞 | 再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |