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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1161 | 2025-10-05 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-Feb-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探究肥胖饮食对动脉和毛细血管内皮细胞线粒体基因表达的影响 | 首次揭示肥胖饮食导致脂肪和肠系膜内皮细胞表型趋同的机制,发现PPAR-γ在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 探究肥胖对内皮细胞代谢表型,特别是线粒体基因表达的影响 | 小鼠和人类脂肪组织及肠系膜的内皮细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖相关代谢疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞,人类内脏脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
1162 | 2025-10-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
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研究论文 | 本文介绍了从狼疮易感小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在狼疮易感MRL/lpr小鼠模型中建立调节性B细胞的分离方案并应用于单细胞RNA测序分析 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 深入理解调节性B细胞在健康和疾病状态下的生物学特性 | 狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1163 | 2025-10-05 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-12-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
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研究论文 | 本研究探讨了肺间质细胞中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 首次揭示了在淋巴管平滑肌瘤病中,间质细胞通过旁分泌信号传导机制与内皮细胞通讯并驱动血管重塑 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本有限且为终末期肺组织 | 阐明LAM疾病中肺间质细胞与内皮细胞之间的通讯机制及其在肺血管重塑中的作用 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者肺组织和Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠 | 分子病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织形态学数据 | 终末期LAM患者肺组织和不同年龄段的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1164 | 2025-10-05 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
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研究论文 | 通过回顾性药物遗传学研究探索银屑病治疗反应的遗传基础,发现KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的重要作用 | 首次发现rs1991820和rs62264137两个新标记与银屑病治疗反应相关,并证实KLK7表达与抗TNF治疗反应的关联 | 回顾性研究设计,样本量相对有限(1942例患者),自我评估的治疗反应可能存在偏倚 | 探索银屑病治疗药物反应的遗传通路和生物标志物 | 1942例基因分型的银屑病患者 | 药物遗传学 | 银屑病 | 基因分型、线性回归、表观基因组学、转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 线性回归模型 | 基因型数据、表达数据、临床数据 | 1942例银屑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1165 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析评估了三种不同条件诱导的代谢功能障碍相关脂肪性肝病器官模型 | 首次系统评估MASLD器官模型的转化潜力,并通过单细胞分析揭示不同诱导条件对炎症和纤维化的差异化影响 | 研究仅评估了三种诱导条件,可能未涵盖MASLD所有病理生理机制 | 评估人类肝脏器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病研究中的转化潜力 | 人类肝脏器官模型 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | 器官模型 | 单细胞转录组数据 | 三种不同诱导条件的器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1166 | 2025-10-05 |
GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114060
PMID:38009297
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示肝细胞癌进展过程中GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞的免疫抑制和促癌作用 | 首次在单细胞水平识别了肝细胞癌进展中的三个关键肝实质细胞亚群,并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性 | 研究主要基于大鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的临床验证 | 探究肝细胞癌发展中特定细胞群体及其在肿瘤微环境形成中的作用 | 毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大鼠模型和HCC患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1167 | 2025-10-05 |
Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance
2023-12-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174528
PMID:38060331
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内出血通过激活巨噬细胞中NRF2信号通路促进癌症进展和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现出血激活的NRF2在肿瘤相关巨噬细胞中驱动癌症生长、侵袭和免疫治疗抵抗的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性需要进一步验证 | 探索肿瘤内出血如何影响癌症进展和治疗反应 | 肿瘤相关巨噬细胞和MC38结肠腺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 3D细胞培养球体功能分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1168 | 2025-10-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
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研究论文 | 本研究揭示了IL-27在急性疟疾感染期间通过调控CD4+ T细胞反应影响免疫记忆形成的机制 | 首次发现IL-27在急性疟疾感染期间靶向调控特定CD4+T细胞反应窗口,并鉴定出独特的Th1记忆前体细胞亚群 | 研究主要基于小鼠疟疾模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究IL-27在疟疾感染期间对CD4+ T细胞记忆反应的调控作用 | 疟疾感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 疟疾感染小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1169 | 2025-10-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-12-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
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研究论文 | 本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达导致骨折不愈合的分子机制 | 首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制,并证明表观遗传修饰的祖细胞治疗可恢复炎症条件下的骨再生能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和效果需要进一步验证 | 探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略 | 骨折愈合过程中的祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序,遗传动物模型,表观遗传调控 | 转基因小鼠模型(Ikk2ca,Dnmt3b功能缺失和转基因) | 单细胞转录组数据,遗传表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1170 | 2025-10-05 |
Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics
2023-11, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16900
PMID:37424435
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研究论文 | 本文提出了一个描述前列腺上皮动态的雄激素依赖性调控概念框架,并建立了相应的数学模型 | 区分了上皮和基质雄激素受体的不同功能,提出IGF1作为关键生长因子协调基质-上皮旁分泌通讯,并开发了能够定量拟合实验数据的数学模型 | 模型相对简单,可能需要更全面的建模来完全描述健康和患病前列腺的复杂性 | 阐明雄激素依赖性调控前列腺上皮动态的细胞和分子机制 | 前列腺上皮细胞和基质细胞 | 计算生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1171 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2023-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01455-9
PMID:37845544
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示小鼠前额叶皮层在慢性疼痛调控中的独特细胞类型和神经环路组织 | 首次利用空间分辨单细胞转录组分析揭示前额叶皮层细胞类型组成、基因表达模式和神经亚型投射的靶向特异性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 解析前额叶皮层调控多种功能(包括慢性疼痛)的细胞和环路组织机制 | 成年小鼠前额叶皮层 | 空间转录组学 | 慢性疼痛 | 空间分辨单细胞转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 成年小鼠前额叶皮层样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1172 | 2025-10-05 |
Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06120-6
PMID:37258678
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研究论文 | 本研究揭示了髓鞘功能障碍通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散斑块清除小胶质细胞来驱动阿尔茨海默病模型中β-淀粉样蛋白沉积的机制 | 首次发现髓鞘功能障碍是阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白沉积的上游风险因素,并揭示了其通过分散斑块清除小胶质细胞的新型机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究年龄相关髓鞘功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | 小鼠疾病模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1173 | 2025-10-05 |
Nonlesional lupus skin contributes to inflammatory education of myeloid cells and primes for cutaneous inflammation
2022-04-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abn2263
PMID:35476593
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示狼疮非皮损皮肤在炎症启动中的作用 | 首次全面表征狼疮皮损和非皮损皮肤的分子特征,发现非皮损皮肤是富含I型干扰素的预炎症环境 | 样本量有限,需要进一步功能验证 | 探究皮肤性红斑狼疮的免疫发病机制 | 狼疮患者的正常外观皮肤、皮损皮肤和循环免疫细胞 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 狼疮患者的皮肤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1174 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression
2021-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01338-7
PMID:34244611
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究AML起始细胞在疾病进展过程中的RNA克隆进化 | 首次在AML起始细胞中发现RNA克隆进化现象,而非传统的DNA突变进化 | 研究样本量有限,需要更大队列验证发现 | 探索AML疾病复发过程中白血病起始细胞的转录组变化机制 | 急性髓系白血病患者的匹配诊断和复发样本中的白血病起始细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 匹配的诊断和复发AML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1175 | 2025-10-05 |
Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses
2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw202
PMID:27153638
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA-seq数据分析的beta-Poisson混合模型,能够捕捉基因表达分布的双峰特征 | 开发了beta-Poisson混合模型来捕捉单细胞RNA-seq数据特有的双峰分布特征,并将其整合到广义线性模型框架中进行差异表达分析 | NA | 开发适用于单细胞RNA-seq数据分析的统计模型和方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | beta-Poisson混合模型, 广义线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1176 | 2025-10-05 |
Targeting CLK1/SRSF7 axis-dependent alternative splicing sensitizes pancreatic ductal adenocarcinoma to chemotherapy and immunotherapy
2025-Nov, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101292
PMID:40840404
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研究论文 | 本研究揭示了环状RNA cALG8通过调控选择性剪接促进胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫抑制的分子机制 | 首次发现cALG8作为蛋白支架促进CLK1磷酸化SRSF7,形成ATM203剪接变体,增强DNA损伤修复和免疫微环境重塑 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 阐明胰腺导管腺癌对吉西他滨耐药的分子机制并开发靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞、患者来源类器官、患者来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 环状RNA测序、液相色谱-质谱联用、单细胞测序、分子生物学技术 | NA | RNA测序数据、质谱数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1177 | 2025-10-05 |
Environmental nano-particulates induced pre-implantation embryonic toxicity in pluripotent stem cell-derived blastoids
2025-Oct-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.126809
PMID:40645264
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研究论文 | 本研究利用多能干细胞衍生的胚状体评估环境纳米颗粒污染物对胚胎发育的毒性作用 | 首次建立基于灵长类多能干细胞的胚状体平台用于环境暴露组研究,构建了多层级多维度的早期胚胎暴露组数据集 | 研究基于体外胚状体模型,与真实人类胚胎发育可能存在差异 | 评估环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性影响 | 灵长类多能干细胞衍生的胚状体 | 发育生物学 | 胚胎发育异常 | 单细胞RNA测序, 数据非依赖采集质谱 | 胚状体模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
1178 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics combined with spatial transcriptomics reveals a fibrotic microenvironment in hyperuricemic nephropathy
2025-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178062
PMID:40816527
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组和空间转录组技术揭示了高尿酸血症肾病纤维化微环境的关键细胞和分子机制 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组技术结合应用于高尿酸血症肾病研究,揭示了纤维化微环境中的关键细胞互作和分子通路 | 研究仅使用大鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 阐明高尿酸血症肾病纤维化微环境的细胞组成和分子机制 | 高尿酸血症肾病大鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 高尿酸血症肾病大鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
1179 | 2025-10-05 |
IGF2BP2 alleviates ulcerative colitis by inhibiting MEK1/2 and ERK1/2 signaling pathways in intestinal epithelial cells via m6A-dependent stabilization of LGI4 mRNA
2025-Oct-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115206
PMID:40663812
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研究论文 | 本研究揭示了m6A阅读蛋白IGF2BP2通过稳定LGI4 mRNA抑制MEK1/2-ERK1/2信号通路,从而缓解溃疡性结肠炎的分子机制 | 首次发现IGF2BP2通过m6A依赖性方式稳定LGI4 mRNA,并阐明其在溃疡性结肠炎中抑制MEK1/2-ERK1/2信号通路的新机制 | 研究主要聚焦于肠道上皮细胞,未全面评估其他细胞类型在溃疡性结肠炎中的作用 | 探究m6A阅读蛋白IGF2BP2在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及分子机制 | 人类组织样本、溃疡性结肠炎细胞模型、DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、IHC、Western blot、IF、RT-qPCR、meRIP-qPCR、RNA pulldown、RIP、mRNA稳定性检测 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据、蛋白质数据 | 人类UC患者组织样本、UC细胞模型、DSS诱导UC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1180 | 2025-10-05 |
Lonidamine alleviates inflammation and tissue remodeling in a mouse model of eosinophilic chronic sinusitis: A single-cell transcriptomics study
2025-Oct-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115258
PMID:40700828
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研究论文 | 通过单细胞转录组学研究揭示洛尼达明在嗜酸性慢性鼻窦炎小鼠模型中缓解炎症和组织重塑的作用机制 | 首次在ECRS模型中系统研究HK2的表达模式,并发现洛尼达明通过抑制Cxcl1-Cxcr2和Ptn-Ncl信号通路发挥抗炎和抗重塑作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究HK2抑制剂洛尼达明在嗜酸性慢性鼻窦炎中的治疗作用及机制 | ECRS小鼠模型和人类鼻上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 嗜酸性慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |