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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2025-11-23 |
Efferocytosis-Driven Polyamine Metabolism in Macrophages Enhances Cancer Stem Cell Enrichment after Chemotherapy in Ovarian Cancer
2025-Nov-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512508
PMID:41271556
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研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞通过胞葬作用驱动的多胺代谢促进卵巢癌化疗后癌症干细胞富集的新机制 | 首次发现胞葬作用通过ODC1介导的多胺代谢重编程促进癌症干细胞富集,为克服化疗耐药提供了新靶点 | 研究机制尚未在更广泛的癌症类型中验证,临床转化潜力需进一步评估 | 探究化疗后肿瘤微环境变化如何促进卵巢癌癌症干细胞富集及化疗耐药 | 卵巢癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和癌症干细胞 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 单细胞测序,多重免疫组化分析,代谢组学,转录组学 | NA | 单细胞测序数据,代谢组数据,转录组数据,免疫组化图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1162 | 2025-11-23 |
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08232-5
PMID:41271615
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研究论文 | 本研究揭示了HNRNPA2B1通过调控乳酸代谢和铁死亡促进非小细胞肺癌免疫逃逸的分子机制 | 首次发现m6A阅读器HNRNPA2B1通过增强LDHA mRNA稳定性和乳酸积累,介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 | NA | 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞系和CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1163 | 2025-11-23 |
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08226-3
PMID:41271669
|
研究论文 | 本研究揭示了LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动胶质母细胞瘤对替莫唑胺化疗耐药的机制 | 首次发现LMNA-PRKDC轴在胶质母细胞瘤化疗耐药中的作用机制,并证明PRKDC抑制剂可逆转耐药 | NA | 探索胶质母细胞瘤化疗耐药机制并寻找逆转耐药的策略 | 胶质母细胞瘤患者来源的异种移植模型、原发和复发胶质母细胞瘤标本 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、靶向免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 患者来源的异种移植模型和患者队列标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1164 | 2025-11-23 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and molecular features during postnatal pig testis development
2025-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12280-8
PMID:41272432
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统分析猪出生后睾丸发育过程中的细胞异质性和分子特征 | 首次在猪睾丸发育过程中识别出三种罕见细胞群体(周细胞、平滑肌细胞和中性粒细胞),并揭示了PRDX5和LUZP2的阶段特异性表达模式 | 研究仅基于8头猪的样本,样本量相对有限 | 揭示猪出生后睾丸发育过程中的细胞异质性和分子调控机制 | 猪睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、RNA速率建模 | 单细胞转录组数据 | 8头猪的115,248个睾丸细胞,采样时间点为0、2、5、24和48个月 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1165 | 2025-11-23 |
Spatial Location of SPP1+TAMs and Mutually Exclusive Subsets Based on Single-Cell and Transcriptome Data
2025-Nov-21, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70247
PMID:41273053
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组数据分析揭示了SPP1+TAMs在肺腺癌中的空间定位和互斥细胞亚群特征 | 首次系统阐明SPP1+TAMs和MARCO+M2巨噬细胞在肺腺癌不同发展阶段形成互斥细胞亚群,并揭示其空间分布特征与肿瘤侵袭性的关系 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明SPP1+TAMs在肺腺癌中的空间定位和细胞亚群特征,为精准治疗提供科学依据 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组,免疫组化 | UMAP | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化数据 | TCGA、GTEx、GEO和HPA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1166 | 2025-11-23 |
Single-cell activation screen identifies hepatic maturation regulators with zonal resolution
2025-Nov-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.10.014
PMID:41270741
|
研究论文 | 通过单细胞激活筛选鉴定具有区域分辨率的肝脏成熟调控因子 | 结合发育参考图谱和dCas9激活筛选与单细胞转录组学,首次在单细胞水平对胚胎肝细胞进行功能筛选并识别关键转录调控因子 | 研究仅使用小鼠胚胎肝细胞,尚未在人类细胞或体内模型中验证 | 揭示肝脏成熟过程中的基因调控网络重编程机制 | 小鼠胚胎肝细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,dCas9激活筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1167 | 2025-11-23 |
Stem cell-based approach to identify regulatory TFs during mammalian cell differentiation
2025-Nov-20, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102716
PMID:41270744
|
研究论文 | 开发了一种结合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR基因筛选的方法来识别哺乳动物细胞分化过程中的关键转录因子 | 首次将干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR筛选相结合,系统识别运动神经元分化过程中的关键转录因子 | 仅验证了三个候选基因,需要进一步验证其他重要转录因子的功能 | 识别哺乳动物细胞分化过程中关键的转录调控因子 | 小鼠和人类脊髓运动神经元分化过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据 | 涉及1,370个转录因子的筛选,最终验证69个候选基因 | NA | 单细胞RNA测序, 基因功能筛选 | NA | NA |
| 1168 | 2025-11-23 |
Deciphering the role of RGS1-overexpressing CD8+T cells in immune evasion of bone metastatic cancer in the urinary system via single-cell sequencing analysis
2025-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152893
PMID:41176933
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示RGS1过表达的CD8+T细胞在泌尿系统骨转移癌免疫逃逸中的作用机制 | 首次阐明RGS1在骨转移癌免疫微环境中对CD8+T细胞功能的调控作用,并发现其与T细胞耗竭表型的关联 | 样本量相对有限(17例患者),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明RGS1在肿瘤骨转移免疫微环境中的调控机制及CD8+T细胞功能 | 肾细胞癌和前列腺癌患者的骨转移病灶组织及小鼠骨转移模型 | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 单细胞RNA测序数据 | 8例肾细胞癌患者和9例前列腺癌患者的骨转移病灶,共215,864个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1169 | 2025-11-23 |
Loss of Actrt1 in non-hematopoietic stroma suppresses pathological angiogenesis and tumor progression
2025-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152916
PMID:41197408
|
研究论文 | 本研究揭示了Actrt1蛋白通过非造血基质细胞促进肿瘤血管生成和肿瘤进展的新机制 | 首次发现Actrt1在肿瘤微环境非造血内皮细胞中的关键作用,并证明其特异性调控病理性血管生成而不影响发育性血管生成 | 研究主要使用小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Actrt1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤血管生成的影响 | 小鼠肿瘤模型(B16F1和MC38肿瘤细胞)、血管内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,骨髓嵌合体实验,主动脉环分析,后肢缺血模型 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | Actrt1敲除小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1170 | 2025-11-23 |
scCausalVI disentangles single-cell perturbation responses with causality-aware generative model
2025-Nov-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101443
PMID:41197632
|
研究论文 | 提出了一种因果关系感知的生成模型scCausalVI,用于解耦单细胞RNA测序数据中的内在细胞状态和外部刺激效应 | 通过深度结构因果网络显式建模细胞状态特异性对外部扰动的响应机制,整合结构因果建模与跨条件计算机预测 | NA | 区分单细胞数据中固有细胞变异与外部刺激诱导的外在效应 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 生成模型, 深度结构因果网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1171 | 2025-11-23 |
Non-visual photoreceptive brain specification in sea urchin larvae
2025-Nov-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65628-9
PMID:41258319
|
研究论文 | 本研究在海胆幼虫中发现了一个对光敏感的神经元簇,这些神经元表达紫外线敏感蛋白Opsin5及多个保守的调控基因 | 首次在海胆幼虫中鉴定出具有非视觉光感受功能的神经中枢,揭示了其与脊椎动物脑区共享的分子特征 | 需要进一步研究以完全建立神经回路与行为之间的完整关系 | 探索后口动物中枢神经系统的进化起源 | 海胆幼虫 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交,基因敲低 | NA | 基因表达数据,行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1172 | 2025-11-23 |
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2025-Nov-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.103074
PMID:41259237
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠迁移原始生殖细胞及其周围体细胞,揭示前后位置差异对细胞信号通路的影响 | 首次系统比较前后位置迁移原始生殖细胞的转录组差异,发现非经典Wnt信号和Nodal-Lefty信号通路的区域特异性表达模式 | 研究仅基于小鼠模型,人类数据为重新分析已发表数据集,需要进一步实验验证 | 阐明原始生殖细胞迁移过程中与不同体细胞微环境相互作用的分子机制 | 小鼠原始生殖细胞和周围体细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,全胚胎免疫荧光染色 | 轨迹推断方法 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 13,262个小鼠原始生殖细胞和7,868个周围体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1173 | 2025-11-23 |
Inference of cell-type composition and single-cell spatial maps from spatial transcriptomics data with SWOT
2025-Nov-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09001-y
PMID:41261170
|
研究论文 | 提出一种名为SWOT的空间加权最优传输方法,可从基于spot的空间转录组数据推断细胞类型组成和单细胞空间图谱 | 首次通过细胞到spot的映射方法同时推断细胞类型比例和单细胞空间位置,能够重建单细胞空间图谱 | 方法依赖于spot分辨率的空间转录组数据,在单细胞定位精度方面可能存在限制 | 开发从空间转录组数据重建单细胞分辨率空间图谱的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型和空间位置 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,最优传输算法 | 空间加权最优传输模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 基于spot的空间转录组数据 |
| 1174 | 2025-11-23 |
SpatialFusion: A Unified Model for Integrating Spatial Transcriptomics to Unveil Cell-type Distribution, Interaction, and Functional Heterogeneity in Tissue Microenvironments
2025-Nov-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169535
PMID:41237948
|
研究论文 | 提出SpatialFusion深度学习模型,通过整合基因表达和空间坐标数据改进空间域识别和细胞类型反卷积 | 使用图神经网络和注意力机制通过空间数据多维度嵌入捕获复杂空间关系,采用双编码策略和自监督对比学习 | NA | 提高空间转录组数据分析的准确性、鲁棒性和计算效率 | 组织微环境中的细胞类型分布、相互作用和功能异质性 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN), 注意力机制, 深度学习 | 基因表达数据, 空间坐标数据 | 人类DLPFC数据集和乳腺癌肿瘤微环境数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1175 | 2025-11-23 |
Harnessing spatial transcriptomics to understand host-parasite interactions in plants and animals
2025-Nov-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108760
PMID:41260341
|
综述 | 探讨空间转录组技术在动植物宿主-寄生虫相互作用研究中的应用与挑战 | 提出将动物寄生虫研究中成熟的空间转录组技术跨学科应用于植物-寄生虫互作研究的新视角 | 植物领域空间转录组技术的应用仍存在技术限制 | 通过空间转录组技术揭示宿主-寄生虫相互作用的分子机制 | 动植物宿主与专性寄生虫的相互作用 | 空间转录组学 | 寄生虫感染 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1176 | 2025-11-23 |
Spatial multi-omics guides ASCT2-targeted delivery of glycolysis inhibitor for cervical cancer suppression and chemoresistance reversal
2025-Nov-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.035
PMID:41253274
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学分析识别宫颈癌糖酵解重编程特征,并开发靶向ASCT2的纳米平台递送糖酵解抑制剂用于肿瘤抑制和化疗增敏 | 首次通过空间多组学技术验证宫颈癌糖酵解脆弱性,并基于ASCT2过表达设计谷氨酰胺功能化脂质体实现肿瘤选择性药物递送 | 未明确说明样本规模和研究人群特征,临床前研究需进一步验证 | 建立宫颈癌糖酵解重编程的空间验证并开发靶向纳米递送系统 | 宫颈癌临床标本、小鼠模型和多种宫颈癌细胞系 | 空间多组学 | 宫颈癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 纳米递送系统 | 空间多组学数据, 基因组数据, 实验数据 | 包含TCGA队列、配对患者标本、匹配小鼠样本和多种细胞系 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1177 | 2025-11-23 |
Hypertension-induced neurovascular and cognitive dysfunction at single-cell resolution
2025-Nov-14, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.10.018
PMID:41240912
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高血压诱导的神经血管和认知功能障碍的细胞分子机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘高血压发展过程中脑细胞的动态转录组变化,发现内皮细胞、中间神经元和少突胶质细胞的早期脆弱性 | 研究基于小鼠模型,需要在人类样本中验证;机制研究仍需进一步深入 | 阐明高血压如何影响脑细胞并导致认知功能障碍的分子机制 | 高血压小鼠模型的新皮质细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高血压小鼠模型在不同时间点(3天和42天)的新皮质样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1178 | 2025-11-23 |
Single-cell RNA sequencing in osteosarcoma: applications in diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Nov-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03121-5
PMID:41231422
|
综述 | 本文通过文献综述探讨单细胞RNA测序技术在骨肉瘤诊断、预后和治疗中的应用 | 系统评估单细胞RNA测序在揭示骨肉瘤肿瘤微环境异质性、识别治疗靶点和发现新型治疗策略方面的创新贡献 | 存在单细胞方案的技术偏倚和非英语文献排除的问题,可能影响结果的普适性 | 评估单细胞RNA测序对骨肉瘤发生发展的贡献 | 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于107项研究的分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1179 | 2025-11-23 |
RGS proteins: Potential regulators of mouse melanopsin's signaling phototransduction cascade across ipRGC subtypes
2025-Nov-07, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.11.006
PMID:41204666
|
研究论文 | 本研究探讨了RGS蛋白如何调节小鼠黑视蛋白在不同ipRGC亚型中的信号转导级联 | 首次发现ipRGC亚型选择性富集特定RGS蛋白,揭示了单个GPCR在不同细胞类型中启动不同信号转导级联的潜在机制 | 研究主要基于异源表达系统和体外实验,需要在更接近生理条件下进一步验证 | 探索单个GPCR在不同ipRGC亚型中启动不同信号转导级联的分子机制 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs)亚型 | 分子神经生物学 | NA | 单细胞转录组学, RNAscope, 异源表达系统, DREADD技术 | NA | 转录组数据, 图像数据, 电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1180 | 2025-11-23 |
Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis
2025-Nov-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf210
PMID:41206594
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TRAP测序技术,评估Trem2、Folr2和Slc7a7作为动脉粥样硬化巨噬细胞相关生物标志物的潜力 | 首次系统性地在多个组织中表征巨噬细胞功能多样性,并发现可溶性Trem2作为循环生物标志物及Folr2/Slc7a7作为PET示踪剂靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明动脉粥样硬化中巨噬细胞驱动的机制并识别相关生物标志物 | 动脉粥样硬化小鼠模型的主动脉、脂肪组织和肝脏中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, TRAP测序, PET成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |