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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2026-05-06 |
The dual molecular identity of vestibular kinocilia bridges structural and functional traits of primary and motile cilia
2026-Apr-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108071
PMID:42029006
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研究论文 | 揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的结构与功能特征 | 首次通过单细胞RNA测序发现前庭毛细胞中动纤毛同时表达初级和运动纤毛相关基因,并证实其具有自发运动能力 | 未明确动纤毛自发运动在机械传导中的具体功能机制 | 阐明前庭动纤毛的分子组成、结构特征和功能特性 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1162 | 2026-05-06 |
Decoding Organ-Specific Vulnerability to Triptolide Toxicity: A Systems Toxicology Approach Targeting Glucose Metabolism
2026-Apr-24, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 利用系统毒理学方法解析雷公藤甲素多器官毒性的分子机制,重点关注葡萄糖代谢紊乱 | 首次通过整合网络药理学、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟和单细胞RNA测序分析,系统揭示雷公藤甲素通过靶向糖酵解和磷酸戊糖途径关键酶导致器官特异性毒性的双重机制 | 该研究主要基于计算分析,缺乏体内外实验验证;孟德尔随机化分析受限于现有GWAS数据质量;分子对接结果需进一步晶体学验证 | 阐明雷公藤甲素导致多器官毒性的分子机制,为设计更安全的雷公藤甲素类似物提供理论基础 | 雷公藤甲素对肝脏、肾脏、心脏和生殖系统的毒性作用及其靶点 | 系统毒理学 | 药物毒性 | 网络药理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1163 | 2026-05-06 |
Mechanisms Underlying the Therapeutic Effects of GeXiaZhuYu Decoction Treating Colorectal Cancer based on Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations
2026-Apr-23, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟,揭示了膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在分子机制 | 首次结合网络药理学、分子对接、分子动力学模拟和MM-GBSA结合自由能分析的多层次计算策略,从系统层面解析膈下逐瘀汤的活性成分与结直肠癌相关靶点的相互作用,并利用单细胞RNA-seq数据验证关键靶点的细胞类型特异性表达 | 研究结果基于计算分析,不直接暗示药理效应或因果机制,需要进一步实验验证 | 从系统层面表征膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在药理机制 | 膈下逐瘀汤的活性成分(槲皮素、木犀草素、山奈酚)与结直肠癌相关靶点(HSP90AA1、AKT1、TP53) | 机器学习 | 结直肠癌 | 网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、MM-GBSA分析、单细胞RNA-seq | NA | 文本、基因表达数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE144735 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1164 | 2026-05-06 |
Single-Cell Ligand-Receptor Profiling Identifies Targetable Signaling Axes and Therapeutic Candidates in Lupus Nephritis
2026-Apr-22, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 通过单细胞配体-受体分析鉴定狼疮性肾炎中可靶向的信号轴及治疗候选药物 | 首次基于高关联配体-受体对进行狼疮性肾炎亚型分类,并结合分子对接和动力学模拟筛选老药新用候选物 | 仅基于公共单细胞数据,缺乏前瞻性队列验证;体内实验尚未开展 | 阐明配体-受体信号在狼疮性肾炎免疫微环境中的作用并发现治疗靶点 | 狼疮性肾炎患者肾脏组织的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个公开单细胞RNA-seq数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序 |
| 1165 | 2026-05-06 |
Divergent Macrophage-Regulated T cell States Determine Response to Bacillus Calmette-Guérin vaccine in High-Risk Bladder Cancer
2026-Apr-21, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200442
PMID:42081487
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1166 | 2026-05-06 |
Single-cell TCR mapping reveals spatially coordinated T cell states in head and neck cancer
2026-Apr-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aec3133
PMID:41961948
|
研究论文 | 提出一种空间TCR图谱分析策略,以单细胞分辨率解析头颈鳞癌中T细胞克隆、转录状态和空间位置的关系 | 首次实现单细胞层面同时解析T细胞克隆身份、转录状态和空间位置,揭示肿瘤微环境中T细胞状态的空间协调性 | 标题和摘要未提及明显局限性 | 开发空间TCR图谱方法,解析头颈癌肿瘤微环境中T细胞的空间组织与功能状态 | 人原发性头颈部鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 空间TCR图谱分析 | NA | 空间转录组与TCR测序数据 | 多例头颈鳞癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1167 | 2026-05-06 |
CD55-expressing myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) drive cancer immunoevasion
2026-Apr-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012980
PMID:41963079
|
研究论文 | 发现表达CD55的髓系来源抑制细胞(MDSCs)驱动肿瘤免疫逃逸 | 首次鉴定CD55作为MDSCs的保守表面标志物,并揭示其通过代谢重编程(促进糖原磷酸化酶PYGL磷酸化驱动糖酵解)维持免疫抑制表型的新机制 | 主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证规模有限;托马替丁等小分子抑制剂的体内应用效果需进一步评估 | 阐明MDSCs表面分子CD55在肿瘤免疫逃逸中的作用机制及治疗潜力 | MDSCs及其表达的CD55分子 | 数字病理学 | 多种癌症类型(八种癌症) | 单细胞RNA测序、RNA测序、DNA pulldown、染色质免疫共沉淀、荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、免疫印迹、免疫沉淀-质谱、分子对接、表面等离子共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 八种癌症类型的公共单细胞RNA测序数据集、人类患者样本及小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1168 | 2026-05-06 |
QuantumXCT: Learning Interaction-Induced State Transformation in Cell-Cell Communication via Quantum Entanglement and Generative Modeling
2026-Apr-09, ArXiv
PMID:41958473
|
research paper | 提出一个混合量子-经典生成框架QuantumXCT,从单细胞转录组中推断细胞间通讯,通过量子纠缠学习相互作用诱导的状态变换 | 将细胞间通讯推断从静态配体-受体数据库查询转变为学习数据驱动的状态变换,利用量子电路的可解释性揭示生物通信网络,无需先验生物学假设 | 未明确说明,但可能受限于量子电路的规模及对合成数据的验证而非大规模真实数据 | 开发一种无先验知识依赖的细胞间通讯推断方法,通过量子机器学习建模信号导致的细胞状态变化 | 卵巢癌-成纤维细胞共培养模型中的单细胞转录组数据及合成数据中的已知交互 | machine learning, quantum machine learning, computational biology | ovarian cancer | single-cell RNA-seq, quantum computing | hybrid quantum-classical generative model, parameterized quantum circuits | gene expression data, synthetic data | 未知具体样本数量,涉及卵巢癌-成纤维细胞共培养的scRNA-seq数据 | Illumina(假设用于scRNA-seq测序,从上下文推断) | single-cell RNA-seq | NA(未在标题或摘要中指定具体平台产品) | NA |
| 1169 | 2026-05-06 |
Generation of a prop1 knock-in zebrafish enables single-cell transcriptomics of early pituitary development
2026-Apr-07, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag043
PMID:42035243
|
研究论文 | 通过生成prop1敲入斑马鱼,利用单细胞转录组学研究早期垂体发育 | 首次创建了prop1基因敲入GAL4报告基因斑马鱼品系,实现了对早期垂体发育的单细胞分辨率和活体成像研究,并提供了首个斑马鱼早期垂体发育的单细胞图谱 | 未明确提及 | 研究脊椎动物腺垂体原基发育的早期分子机制及内分泌细胞谱系分化 | 斑马鱼和小鼠的早期垂体组织 | 单细胞转录组学 | 垂体发育相关疾病(如侏儒症、性成熟障碍) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼和小鼠垂体组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1170 | 2026-05-06 |
Cardiac Fibrosis: Mechanobiology, Epigenetics, and the Path to Precision Therapy
2026-Apr, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-026-00896-z
PMID:42080143
|
综述 | 全面综述心脏纤维化的机械生物学、表观遗传学机制及精准治疗路径 | 整合单细胞和空间转录组学、生物力学及表观遗传学数据,系统阐述纤维化细胞异质性与分子环路;提出CRISPR基因编辑、FAP靶向CAR-T、纳米RNA递送及患者心脏类器官等新兴可逆疗法;构建结合基因组学、生物标志物、AI和环境风险评估的精准抗纤维化策略 | 作为综述,未提供原创实验数据;新兴疗法的临床转化尚处于早期阶段,缺乏大规模验证 | 阐明心脏纤维化的机械生物学与表观遗传学机制,并规划从基础研究到临床精准治疗的转化路线图 | 心脏纤维化中的成纤维细胞、心肌细胞-细胞外基质串扰、机械传导信号及表观遗传调控网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学,空间转录组学,基因编辑,CAR-T免疫疗法,纳米医学,类器官技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学平台 |
| 1171 | 2026-05-06 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-03-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
|
研究论文 | 结合长和短读长测序及Hi-C染色质构象捕获技术,构建了环节动物Capitella teleta实验室品系的染色体级别核和线粒体基因组,并提供了功能性基因组资源 | 首次组装了环节动物C. teleta的染色体级别基因组,并揭示了核与线粒体基因组的重排现象,为进化发育生物学和比较基因组学提供了高质量参考资源 | 未具体说明局限性,但可能包括样品来源单一(实验室品系)或基因组注释的潜在不完整性 | 为模式环节动物Capitella teleta创建现代化基因组资源,提升其作为进化发育生物学和生态毒理学模型的实用性 | 环节动物Capitella teleta(多毛纲)的实验室品系 | 基因组学 | NA | 长读长测序、短读长测序、Hi-C染色质构象捕获、RNA-seq、ATAC-seq、EM-seq | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、ATAC-seq数据、EM-seq数据 | C. teleta实验室品系的一个样本 | NA | 长读长测序、短读长测序、Hi-C、RNA-seq、ATAC-seq、EM-seq | NA | NA |
| 1172 | 2026-05-06 |
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09921-z
PMID:41501470
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研究论文 | 本文揭示了TRPV1伤害感受器与化学感受性上皮簇细胞协同作用,驱动2型免疫反应和组织适应的神经-上皮回路 | 首次证明TRPV1伤害感受器通过CGRP信号与上皮簇细胞耦合,形成感觉整合回路,为2型免疫启动提供上游调控机制 | 未明确TRPV1神经元感知的具体环境刺激因子类型 | 阐明感觉神经元、上皮细胞和免疫细胞如何协调整合多样感觉输入以驱动2型炎症 | 肠道TRPV1伤害感受器、上皮簇细胞、簇细胞前体细胞及2型免疫细胞 | 数字病理学 | 寄生虫感染相关疾病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、化学遗传学沉默/激活技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未提供) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组及10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1173 | 2026-05-06 |
NETosis-Dependent Generation of Immunodeficient Low-Density Neutrophils Exacerbates Sepsis-Induced Acute Lung Injury
2026-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27042042
PMID:41752177
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研究论文 | 使用脂多糖模拟脓毒症微环境,结合单细胞RNA测序等技术,发现脓毒症通过NETosis依赖性途径产生具有免疫缺陷特征的低密度中性粒细胞,从而加剧急性肺损伤 | 首次揭示低密度中性粒细胞(LDN)通过NETosis依赖途径产生的机制,并阐明其免疫缺陷表型(延迟凋亡、迁移和吞噬功能受损、抑制T细胞增殖)在脓毒症急性肺损伤中的作用 | 未提供明确的局限性信息 | 探究脓毒症中低密度中性粒细胞的产生机制、表型特征及其在器官损伤(特别是急性肺损伤)中的作用 | 脓毒症相关低密度中性粒细胞(LDN)及其在急性肺损伤中的角色 | 数字病理学 | 脓毒症, 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 密度梯度离心, 流式细胞术, 免疫组化, 盲肠结扎穿刺脓毒症小鼠模型 | NA | 基因表达数据, 图像 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1174 | 2026-05-06 |
Stereo-cell deciphers the spatial and functional heterogeneity of polyploid hepatocytes
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag023
PMID:41770024
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研究论文 | 利用空间分辨单细胞测序技术Stereo-cell解析多倍体肝细胞的空间和功能异质性 | 开发了基于成像的倍性识别技术SCIPI,整合明场细胞轮廓识别、DAPI核面积和数量定量以及UMI条形码单细胞转录组学,实现对6种核心肝细胞亚型的精确鉴定 | 文献中未明确提及局限性 | 解析二倍体、四倍体和八倍体肝细胞间的功能差异 | 多倍体肝细胞(二倍体、四倍体、八倍体及其不同核型) | 数字病理学 | NA | 空间分辨单细胞测序 | NA | 图像和转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | Stereo-cell | Stereo-cell成像倍性识别技术(SCIPI) |
| 1175 | 2026-05-06 |
DeepSpaceDB: a spatial transcriptomics atlas for interactive in-depth analysis of tissues and tissue microenvironments
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1117
PMID:41160880
|
研究论文 | 介绍DeepSpaceDB——一个用于交互式深度分析组织及组织微环境的空间转录组图谱数据库 | 该数据库专注于10X Genomics Visium样本,提供高级交互式分析工具与跨样本比较功能,区别于仅注重平台覆盖而忽视功能的数据库 | 当前版本仅支持10X Genomics Visium样本,且分析需依赖用户上传或已有的数据集 | 构建一个用户友好的空间转录组数据库,支持灵活探索、交互式比较及高级分析 | 健康及疾病状态下的组织样本,如阿尔茨海默病模型小鼠的海马区域 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体数量,但包含多个组织和疾病模型的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE或新鲜冰冻组织分析 |
| 1176 | 2026-05-06 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
|
研究论文 | 利用癌症来源的小细胞外囊泡生成靶向单克隆抗体,并将其功能化于T细胞来源的小细胞外囊泡上,用于靶向癌症治疗 | 首次利用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原,生成高特异性或细胞毒性单克隆抗体,并通过抗体功能化T细胞来源的小细胞外囊泡实现肿瘤靶向药物递送 | 未提及研究的局限性,如样本类型单一(仅卵巢癌细胞系)或临床转化潜力的评估不足 | 开发一种基于癌症来源小细胞外囊泡的抗体生成平台,用于靶向癌症治疗和个性化医学 | 人卵巢癌细胞系OVCAR-8来源的小细胞外囊泡及CD8⁺ T细胞来源的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录数据, 空间转录数据 | 小鼠模型(具体数量未提及),OVCAR-8肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium 空间转录组学平台用于分析抗体功能化小细胞外囊泡诱导的转录变化 |
| 1177 | 2026-05-06 |
DrugSurvPlot: A Novel Web-Based Platform Harnessing Drug Sensitivity Scores as Molecular Biomarkers for Pan-Cancer Survival Prognosis
2026, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 介绍DrugSurvPlot,一种利用药物敏感性评分作为泛癌症生存预后分子生物标志物的新型网络平台 | 建立药物敏感性评分作为肿瘤生存分析的新型预后生物标志物,整合大规模多癌种数据集并提供无需登录的交互式分析工具 | 药物覆盖范围有限,数据集多样性不足,未来需扩展药理学数据库并整合新兴数据模态(如单细胞转录组学) | 利用预测药物敏感性评分作为生存生物标志物,提高精准医学水平并克服基因组指导方法在临床试验中的局限性 | 189个GEO数据集(含10个免疫检查点抑制剂治疗数据集)和33个TCGA数据集,共85,531条记录,覆盖52种癌症类型和13种生存状态数据类型,以及GDSC2中的198种抗癌药物 | 计算肿瘤学 | 泛癌症 | NA | NA | 药物敏感性评分数据 | 85,531条记录,涵盖189个GEO数据集和33个TCGA数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1178 | 2026-05-06 |
Tumor-Promoting Crosstalk of MMP11⁺ Fibroblasts and SPP1⁺ Macrophages Drive Poor Prognosis in Breast Cancer: Integrated Multi-Omics Analysis
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S564498
PMID:42083565
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了MMP11阳性的癌症相关成纤维细胞与SPP1阳性巨噬细胞之间的相互作用对乳腺癌预后不良的驱动作用 | 首次发现MMP11+ CAFs和SPP1+巨噬细胞的相互作用与乳腺癌患者不良预后及免疫治疗反应受损相关 | 仅基于公共数据库和有限样本分析,需更多临床样本验证,且机制研究缺乏直接功能实验 | 探索乳腺癌肿瘤微环境中基质-免疫相互作用及其对预后的影响 | 乳腺癌肿瘤微环境中的MMP11+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1179 | 2026-05-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05317-9
PMID:40750734
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学,研究心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边界动态 | 首次整合单细胞和空间转录组分析,揭示了TREM2高表达巨噬细胞在心肌梗死后组织修复中的关键作用及其在梗死边界的动态变化 | 未提供 | 探究心肌梗死后细胞和分子水平的复杂动态变化,特别是免疫细胞的作用和调控网络 | 心肌梗死小鼠模型和缺血再灌注模型中的心肌细胞和免疫细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量 | Illumina | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 10x Genomics | 10x Genomics 单细胞RNA测序和空间转录组学平台 |
| 1180 | 2026-05-06 |
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002903
PMID:40607924
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研究论文 | 通过多组学泛癌分析揭示MS4A2在肺腺癌中的功能景观,并将其重新定义为肥大细胞驱动的肿瘤进展守护者 | 首次整合四个生存指标(OS/DSS/PFI/DFI)的预后评估,并发现MS4A2通过双向趋化因子调控建立免疫抑制微环境,同时高表达肿瘤对化疗药物敏感 | 未在独立外部队列中验证其预后模型的泛化性,且MS4A2调控免疫微环境的具体分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明MS4A2在肺腺癌中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 33种癌症类型的转录组数据(TCGA/GTEx)和非小细胞肺癌单细胞转录组数据 | 机器学习 | 肺腺癌 | 转录组测序,单细胞转录组测序 | Cox回归,Kaplan-Meier模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据,药物敏感性数据 | 33种癌症的bulk RNA-seq样本和NSCLC单细胞测序队列 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | TCGA/GTEx数据库和GDSC药物基因组学数据 |