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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2026-03-01 |
EZH2 Inhibition Restores Tumor Suppressor SFRP1 Activity by Reprogramming Extrachromosomal Circular DNA Dynamics in Ovarian Cancer
2026-Feb-15, Biology
DOI:10.3390/biology15040340
PMID:41744650
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研究论文 | 本研究揭示了EZH2抑制剂Tazemetostat通过重编程卵巢癌中的染色体外环状DNA动态,从而恢复肿瘤抑制因子SFRP1活性的新机制 | 首次建立了EZH2抑制与eccDNA动态重编程之间的关联,并发现了SFRP1作为关键效应因子;通过整合多组学与空间单细胞转录组学,揭示了一个新的表观遗传-eccDNA轴 | 研究主要基于体外实验和组学数据分析,体内功能验证和临床相关性有待进一步探索;效应基因的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究EZH2抑制剂如何通过调控eccDNA动态影响卵巢癌的基因表达和肿瘤抑制功能 | 卵巢癌细胞 | 表观遗传学与癌症生物学 | 卵巢癌 | Circle-seq, RNA测序, 空间单细胞转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1162 | 2026-03-01 |
Multi-Modal Metabolomics Deciphers Pan-Cancer Metabolic Landscapes and Spatial-Niche-Specific Alternations
2026-Feb-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16020129
PMID:41745610
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研究论文 | 本研究通过整合批量代谢组学和空间代谢组学,解析了泛癌症代谢景观及空间生态位特异性变化 | 首次在泛癌症层面结合批量与空间代谢组学,揭示代谢重编程的跨癌种共性和空间异质性,并识别出在多个分析层面一致改变的代谢物 | NA | 系统理解癌症代谢重编程的跨癌种共性和肿瘤微环境内的空间异质性 | 多种癌症类型的肿瘤组织和正常组织 | 代谢组学 | 泛癌症 | 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | NA | NA | 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1163 | 2026-02-10 |
CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39168-1
PMID:41656346
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1164 | 2026-03-01 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Feb-07, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析,揭示了慢性肺移植功能障碍中内皮和上皮细胞协调性激活蛋白-1激活的机制 | 首次在CLAD中利用空间转录组学技术,同时揭示了上皮和内皮细胞中AP-1靶基因的协同激活及其在促炎、促纤维化基因网络中的枢纽作用 | 研究样本量有限,且为观察性研究,需要进一步的功能实验验证机制 | 阐明慢性肺移植功能障碍的基因表达特征和发病机制 | 人类肺组织样本(来自CLAD患者、非CLAD移植受者和非移植对照) | 空间转录组学 | 肺移植功能障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1165 | 2026-03-01 |
Advances in Spatial Transcriptomics for Infectious Disease Research: Insight for Vaccine Development
2026-Feb-07, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines14020158
PMID:41746079
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在传染病研究中的进展及其对疫苗开发的启示 | 系统总结了空间转录组学如何通过保留组织架构来揭示宿主-病原体相互作用,并比较了测序与成像两类平台的优势,强调了其在识别组织特异性免疫程序和疫苗设计中的应用潜力 | 面临RNA质量限制、分辨率与转录本广度之间的权衡、高成本以及分析复杂性等约束 | 探讨空间转录组学在传染病研究中的应用,以促进疫苗开发 | 传染病(包括病毒、细菌和寄生虫感染)中的宿主组织与病原体相互作用 | 空间转录组学 | 传染病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据与组织图像 | NA | 10x Genomics, NanoString, BGI, Vizgen, NanoString, Vizgen | 空间转录组学 | Visium, GeoMx, Stereo-seq, Xenium, CosMx, MERFISH | 测序方法(如Visium、GeoMx、Stereo-seq)提供全转录组覆盖但分辨率适中,成像平台(如Xenium、CosMx、MERFISH)提供单细胞或亚细胞细节但基因面板靶向 |
| 1166 | 2026-03-01 |
Advances in Single-Cell Transcriptomics for Livestock Health
2026-Feb-06, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13020161
PMID:41745955
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在解析家畜物种细胞异质性、免疫系统复杂性及宿主-病原体相互作用方面的最新进展与应用 | 系统总结了单细胞转录组学在家畜健康研究中的关键应用,包括构建大规模多组织细胞图谱(如牛细胞图谱)、揭示物种特异性免疫特征(如反刍动物中γδ T细胞的重要作用),并探讨了整合空间转录组学与多组学方法的未来方向 | 面临基因组注释不完整、组织处理限制、跨平台数据整合等技术与分析挑战 | 提升家畜疾病抵抗力、疫苗效力及转化研究,为家畜健康提供新的研究框架 | 牛、猪、家禽及小型反刍动物 | 单细胞组学 | 家畜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞免疫受体测序、空间转录组学、多组学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1167 | 2026-03-01 |
Tumour-brain crosstalk restrains cancer immunity via a sensory-sympathetic axis
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-10028-8
PMID:41639447
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研究论文 | 本研究揭示了肺癌通过迷走感觉神经元与大脑之间的双向通讯,建立免疫抑制微环境,从而促进肿瘤生长的机制 | 首次发现肺癌通过激活迷走感觉神经元传递信号至脑干,驱动交感神经输出增强,进而通过β肾上腺素信号抑制肺泡巨噬细胞的抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肿瘤与大脑之间的通讯机制及其对癌症免疫的影响 | 肺癌小鼠模型、迷走感觉神经元、交感神经系统、肺泡巨噬细胞 | 神经免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、神经示踪、组织成像 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1168 | 2026-03-01 |
A multi-omics study unravels the mechanism of water pollutants in gastric cancer: integrating network toxicology, machine learning, and tumor microenvironment remodeling
2026-Feb, Toxicology research
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/toxres/tfag015
PMID:41756097
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、机器学习和肿瘤微环境重塑,探讨了水污染物在胃癌中的多靶点作用机制 | 首次将网络毒理学、机器学习与单细胞测序相结合,系统解析水污染物通过关键靶点(如预测的基因)影响胃癌发生及肿瘤微环境重塑的机制 | 研究主要基于计算和生物信息学方法,缺乏实验验证;污染物与靶点的相互作用仅通过分子对接模拟,需进一步体内外实验确认 | 探究水污染物促进胃癌发生的多靶点分子机制,为环境风险评估提供假设框架 | 美国环保署列出的69种水污染物及其在胃癌中的潜在作用靶点 | 机器学习 | 胃癌 | 网络毒理学、机器学习算法、分子对接、单细胞测序 | 三种机器学习算法(未具体说明类型) | 基因表达数据(GSE54129数据集)、污染物靶点预测数据 | 基于公共数据集GSE54129,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1169 | 2026-03-01 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Identify ID1 as a Candidate Gene Associated with Abdominal Aortic Aneurysm
2026-Jan-30, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48020156
PMID:41751419
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与机器学习方法,识别出ID1作为与腹主动脉瘤相关的候选基因,并探讨其在血管免疫重塑和细胞外基质通路中的作用 | 首次结合多组学数据(包括两个批量转录组数据集和单细胞RNA测序)与三种机器学习算法(LASSO、随机森林和SVM-RFE)系统识别并验证ID1在腹主动脉瘤中的稳定下调及其与免疫细胞浸润的关联 | 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证以确认ID1的功能机制;样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 探究腹主动脉瘤的分子机制,特别是ID1基因在疾病发生发展中的作用 | 腹主动脉瘤患者的相关基因表达数据,包括ID1和CYP4B1等候选基因 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 转录组数据 | 涉及两个批量转录组数据集(GSE232911和GSE183464)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE226492),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1170 | 2026-03-01 |
Field-Evolved Resistance to Bt Cry Toxins in Lepidopteran Pests: Insights into Multilayered Regulatory Mechanisms and Next-Generation Management Strategies
2026-Jan-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins18020060
PMID:41745726
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综述 | 本文综述了鳞翅目害虫对Bt Cry毒素田间进化抗性的多层次调控机制,并探讨了下一代管理策略 | 提出了一个综合统一的机制框架,整合了Bt毒素作用模式、多层抗性调控机制(包括信号转导、免疫逃避、微生物群互作)以及基于CRISPR、AlphaFold3和AI的下一代抗性管理策略 | 这是一篇综述文章,主要总结现有研究,未报告新的原始实验数据 | 阐明鳞翅目害虫对Bt Cry毒素田间进化抗性的机制,并提出可持续的管理策略 | 鳞翅目害虫及其对Bt Cry毒素的抗性 | NA | NA | 单细胞转录组学、CRISPR/Cas9基因编辑、噬菌体辅助连续进化(PACE)、AlphaFold3结构预测、AI加速蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1171 | 2026-03-01 |
Multimodal single-cell protein and RNA profiling unveils dysregulated immature neutrophil dynamics in gestational diabetes mellitus
2026-Jan-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09468-9
PMID:41501166
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研究论文 | 本研究通过多模态单细胞蛋白质和RNA分析,揭示了妊娠期糖尿病中未成熟中性粒细胞动态的失调 | 首次结合InfinityFlow表面标记分析和单细胞RNA测序,在妊娠期糖尿病中识别出低密度未成熟中性粒细胞亚群及其与胰岛素敏感性的关联 | 研究样本量有限,且未深入探讨未成熟中性粒细胞功能机制 | 探究妊娠期糖尿病中中性粒细胞的异质性及其与疾病的关系 | 健康孕妇和妊娠期糖尿病孕妇的外周血中性粒细胞 | 数字病理学 | 妊娠期糖尿病 | InfinityFlow表面标记分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1172 | 2026-03-01 |
Extracellular Matrix-Associated Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma: Insights From Machine Learning and Single-Cell Analysis
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6654142
PMID:41755885
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研究论文 | 本研究通过整合组学数据和机器学习,识别了肝细胞癌中与细胞外基质相关的关键生物标志物,并利用单细胞RNA测序验证了其表达模式 | 结合系统生物学框架、机器学习与单细胞分析,首次识别出八个上调的ECM相关基因作为诊断生物标志物,并揭示了它们在单细胞水平上的表达特异性 | 研究主要基于公共数据库(如TCGA)的数据,可能需要进一步实验验证这些生物标志物的功能机制和临床适用性 | 识别肝细胞癌中与细胞外基质相关的生物标志物,以改善早期检测、预后评估和治疗靶向 | 肝细胞癌患者的基因表达和调控网络 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 基于TCGA、GSE104310和GSE144269数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1173 | 2026-03-01 |
Machine learning and single-cell RNA sequencing analyses identify MS-related monocytes and a five-gene candidate biomarker signature
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1739231
PMID:41756175
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研究论文 | 本研究结合机器学习与单细胞RNA测序分析,识别了与多发性硬化相关的单核细胞及一个五基因候选生物标志物签名 | 首次整合机器学习算法与单细胞RNA测序数据,系统性识别并验证了五个关键基因作为多发性硬化的候选生物标志物 | 研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型数据,临床样本验证有限 | 识别与多发性硬化相关的单核细胞生物标志物,以改善疾病诊断和风险分层 | 多发性硬化相关的单核细胞及基因表达 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光 | 逻辑回归, LDA, SVM, 朴素贝叶斯, KNN, Rpart, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1174 | 2026-03-01 |
Repurposed Acarbose Targets Nidogen-1 to Remodel the Tumor Stroma and Suppress Portal Vein Tumor Thrombus in Hepatocellular Carcinoma
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1161
PMID:41756725
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌门静脉癌栓的免疫-基质特征,并发现阿卡波糖可通过靶向Nidogen-1重塑肿瘤基质,抑制癌栓进展 | 首次构建了PVTT微环境的空间图谱,揭示了巨噬细胞向肌成纤维样癌症相关成纤维细胞的转化过程,并首次将已获批药物阿卡波糖重新用于靶向NID1轴以改善免疫治疗反应 | 样本量相对有限(99个样本来自47名患者),且临床队列为回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床试验验证 | 探究肝细胞癌门静脉癌栓的分子机制和免疫特征,并开发新的治疗策略 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和门静脉癌栓) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | nCounter分析、单细胞RNA测序、数字空间分析、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 | 99个样本来自47名患者,另有一个独立临床队列包含810名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 1175 | 2026-03-01 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamic reprogramming of testicular immunity in Brucella-infected goat testis
2025-Nov-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了布鲁氏菌感染的山羊睾丸组织中免疫微环境的动态转录重编程 | 首次在单细胞分辨率下描绘了布鲁氏菌感染后睾丸免疫微环境的动态重塑,并识别出硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究仅在山羊模型中进行,结果向其他物种或人类的直接外推需谨慎;机制验证实验(如功能缺失/获得)未在文中报告 | 阐明布鲁氏菌感染导致睾丸免疫病理的分子机制,并寻找免疫调节干预的潜在靶点 | 山羊睾丸组织(生理状态与布鲁氏菌感染状态) | 数字病理学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1176 | 2026-03-01 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.21.665156
PMID:40777431
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性和X染色体失活状态 | 首次结合单核RNA-seq和空间转录组学分析SCTs,发现X染色体双等位基因表达与细胞身份和性别偏见的关联 | 样本量较小(仅8个肿瘤),且未检测到假定的多能细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层和性别偏见机制 | 人类骶尾部畸胎瘤组织样本 | 数字病理学 | 骶尾部畸胎瘤 | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 8个SCTs样本(6个产后,2个产前) | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1177 | 2026-03-01 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
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综述 | 本文探讨了心血管与造血系统在发育中的相互调控关系,特别聚焦于心内膜造血这一进化保守过程及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的作用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序,并阐明了心内膜来源巨噬细胞在心脏形态发生中的独特贡献 | NA | 探讨心血管与造血系统发育的分子机制和调控相互作用 | 心内膜造血过程、心脏发育、巨噬细胞形成 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1178 | 2026-03-01 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组学分析,揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的独特免疫和基质微环境 | 首次提供了成人皮肌炎中免疫和基质细胞的空间映射,发现了与癌症相关的DM皮肤病变中分散的免疫浸润特征,以及非癌症相关DM中独特的细胞对和IFN-β表达 | NA | 探究成人皮肌炎的免疫和基质微环境特征及其与癌症的关联 | 成人皮肌炎患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1179 | 2026-03-01 |
Comprehensive biomarker profiles in hematological malignancies: improving diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Mar, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/17520363.2025.2471745
PMID:40015744
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综述 | 本文全面概述了血液系统恶性肿瘤中生物标志物的最新进展及其在诊断、预后和治疗中的应用 | 整合了从传统形态学到先进分子技术(如PCR、NGS、质谱和单细胞RNA测序)的生物标志物发现历程,并强调了新兴技术在揭示先前无法检测的生物标志物方面的作用 | NA | 提供血液系统恶性肿瘤生物标志物的全面概述,探讨其诊断和治疗应用及未来发展方向 | 血液系统恶性肿瘤及其相关生物标志物 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 聚合酶链反应(PCR)、下一代测序(NGS)、质谱、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1180 | 2026-03-01 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
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综述 | 本章强调多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,结合单细胞测序、空间转录组学和高通量质谱等工具,重建分子网络并实现患者分子亚型分层 | 面临数据异质性和标准化不足等挑战 | 推动神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化(ALS) | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、质谱分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |