单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 11761 - 11780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11761 | 2024-08-05 |
DLL1/NOTCH1 signaling pathway maintain angiogenesis in meniscus development and degeneration
2024-Jul, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106589
PMID:38772475
|
研究论文 | 本研究探讨了DLL1/NOTCH1信号通路在髌骨发育和退化过程中对血管生成的影响 | 首次揭示了DLL1/NOTCH1信号通路在胎儿和退化髌骨的血管生成中的重要性 | 本研究主要基于组织学分析，缺乏临床试验数据支持 | 研究髌骨组织内内皮细胞和血管的特征，以揭示血管完整性保持与退化的关系 | 人类胚胎和成熟髌骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类胚胎和成熟髌骨 |
| 11762 | 2024-08-05 |
scRNA-seq reveals the diversity of the developing cardiac cell lineage and molecular players in heart rhythm regulation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110083
PMID:38872974
|
研究论文 | 本文利用scRNA-seq delineate了斑马鱼心脏中细胞类型的多样性 | 首次描述了发育心脏中多种细胞谱系和心律调节的新分子参与者 | 未提及具体的样本大小与实验范围 | 揭示发育中心脏的细胞和分子机制 | 斑马鱼心脏中的50,000多个细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过50,000个细胞 |
| 11763 | 2024-08-04 |
DCRELM: dual correlation reduction network-based extreme learning machine for single-cell RNA-seq data clustering
2024-06-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64217-y
PMID:38866896
|
研究论文 | 提出了一种基于双重相关降低网络的极限学习机DCRELM，用于单细胞RNA-seq数据的聚类 | DCRELM结合了极限学习机和双重相关降低网络的方法，增强了对高维、噪声和稀疏数据的处理能力 | 未提及具体的限制 | 研究单细胞RNA-seq数据的聚类方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 极限学习机（ELM） | 自编码器 | RNA序列数据 | 未提及具体样本量 |
| 11764 | 2024-08-04 |
Progress of single-cell RNA sequencing combined with spatial transcriptomics in tumour microenvironment and treatment of pancreatic cancer
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05307-3
PMID:38867230
|
综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序结合空间转录组学在肿瘤微环境和胰腺癌治疗中的进展 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学的方法为胰腺癌的肿瘤异质性研究提供了新的视角 | 单细胞RNA测序在空间信息分析上存在局限，无法独立处理细胞的物理位置 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在胰腺癌微环境及治疗中的应用 | 肿瘤微环境及胰腺癌的单细胞分析 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11765 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptomic analysis unveils macrophage-associated genes for establishing an abdominal aortic aneurysm diagnostic model and molecular therapeutic framework
2024-Jun-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01900-w
PMID:38867262
|
研究论文 | 该研究旨在识别与腹主动脉瘤（AAA）相关的新生物标志物和治疗靶点 | 研究首次揭示了六个巨噬细胞相关的中心基因，这些基因在AAA的诊断中具有良好的效果 | 缺乏大规模临床验证，仅在AAA小鼠模型和临床样本中进行了测试 | 通过转录组分析识别腹主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 关注腹主动脉瘤患者及相应的巨噬细胞亚群体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习算法 | NA | 基因表达数据 | 六个巨噬细胞相关中心基因在临床样本和AAA小鼠模型中的验证 |
| 11766 | 2024-08-05 |
Macrophage and fibroblast trajectory inference and crosstalk analysis during myocardial infarction using integrated single-cell transcriptomic datasets
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05353-x
PMID:38867219
|
研究论文 | 本研究综合分析了心肌梗死后成纤维细胞和巨噬细胞亚群的动态的变化 | 发现了不同时间出现的两种ECM产生的成纤维细胞亚群及其不同的转录特征 | NA | 探究心肌梗死后成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 心肌梗死后不同类型的成纤维细胞和巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心脏病 | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 基因数据 | 12个不同研究的数据集 |
| 11767 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals secretin as a hallmark of human enteroendocrine cell maturation
2024-06-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63699-0
PMID:38866945
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了secretin作为人类肠内分泌细胞成熟的标志。 | 研究质疑了传统的'一个细胞-一个激素'的教条，表明人类肠内分泌细胞中存在多激素共表达的现象。 | 该研究可能只涉及人类和小鼠来源的肠内分泌细胞，可能未涵盖其他物种或细胞类型。 | 研究的目的在于重新审视肠内分泌细胞的分类以及激素表达的特征。 | 研究对象包括来自人类肠道的各种肠内分泌细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11768 | 2024-08-05 |
Assessing transcriptomic heterogeneity of single-cell RNASeq data by bulk-level gene expression data
2024-Jun-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05825-3
PMID:38867193
|
研究论文 | 本文提出了一种模型框架，整合了Bulk级别和单细胞RNA测序数据，以解决数据的不足之处。 | 提出了逆向去卷积的框架，同时采用了多种去卷积算法进行Bulk级别数据的分解。 | 研究中对于Bulk级别数据的混合系数未知，且对于零条目的入选标准需要进一步研究。 | 研究的目的是整合不同类型的转录组数据，以更全面地推断转录组异质性。 | 研究对象包括小鼠的单细胞RNASeq数据、自闭症谱系障碍和正常对照、大肠癌和低级别胶质瘤的数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌、低级别胶质瘤、自闭症谱系障碍 | RNA测序 | 去卷积算法 | 基因表达数据 | 涉及五个数据集的验证 |
| 11769 | 2024-08-05 |
Linearly Amplified Single-Stranded RNA-Derived Transcriptome Sequencing (LAST-seq)
2024-Jun-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4998
PMID:38873015
|
研究论文 | 本文开发了一种新方法LAST-seq，可以直接扩增原始的单链RNA，以提高RNA检测的灵敏度 | LAST-seq无需逆转录和第二链合成，提供高灵敏度的RNA检测，并降低单细胞转录组分析中的技术噪声 | 本文没有提及LAST-seq在临床应用或更大样本规模中的表现 | 研究单细胞转录组分析中RNA的检测灵敏度和转录爆发动力学 | 人类细胞中的转录爆发动力学 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 单细胞水平 |
| 11770 | 2024-08-04 |
Spatial transition tensor of single cells
2024-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02266-x
PMID:38755322
|
研究论文 | 本文提出了一种新的方法STT，用于表征单细胞的空间状态转变和动力学 | 引入空间转移张量，通过多尺度动态模型结合信使RNA剪接和空间转录组技术，能够捕获多种细胞状态和转变路径的动力学 | 尚未提及STT方法的具体局限性 | 研究单细胞转录组数据中空间状态转变的特征 | 使用转录组数据对不同细胞状态的动态及其相关基因进行重建 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 四维转移张量 | 转录组数据 | 多个转录组数据集 |
| 11771 | 2024-08-04 |
Anoikis and SPP1 in idiopathic pulmonary fibrosis: integrating bioinformatics, cell, and animal studies to explore prognostic biomarkers and PI3K/AKT signaling regulation
2024-Jun, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2315218
PMID:38318669
|
研究论文 | 本研究探讨了在特发性肺纤维化中anoikis的相关性，并识别相关的生物标志物和信号通路 | 揭示了与anoikis相关的两种亚型并建立了预后签名，强调了SPP1作为PI3K/AKT信号通路的关键调节因子 | 研究限制在于样本量和受试者的多样性可能影响结果的普遍适用性 | 探讨anoikis在特发性肺纤维化中的相关性及其预后生物标志物的识别 | 特发性肺纤维化患者及其相关的生物标志物和信号通路 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞测序，Lasso回归，多变量Cox回归 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11772 | 2024-08-05 |
Single-cell proteomics by mass spectrometry: Advances and implications in cancer research
2024-Jun, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300210
PMID:38727198
|
review | 此综述总结了质谱法单细胞蛋白组学在癌症研究中的应用 | 介绍了质谱法单细胞蛋白组学技术的最新进展和应用前景 | 未具体提到该研究的局限性 | 总结单细胞蛋白组学在癌症研究中的应用和技术进步 | 单细胞蛋白组学及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 质谱法 | NA | NA | NA |
| 11773 | 2024-08-05 |
Unveiling blood pressure-associated genes in aortic cells through integrative analysis of GWAS and RNA modification-associated variants
2024-Jun, Chronic diseases and translational medicine
DOI:10.1002/cdt3.124
PMID:38872756
|
研究论文 | 本研究通过GWAS和RNA修饰相关的单核苷酸多态性（RNAm-SNPs）阐明了与血压（BP）相关的主动脉功能基因。 | 本研究识别了355个与m6A及其他RNA修饰相关的RNAm-SNPs，并强调m6A在影响血压的生理过程中的潜在功能相关性。 | 本研究主要集中在主动脉细胞，可能未能涵盖其他类型细胞中的相关基因功能。 | 阐明与主动脉中血压相关的潜在功能基因。 | 对来自UK Biobank和国际血压联盟的757,601个个体的遗传数据进行分析。 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | RNA修饰相关单核苷酸多态性（RNAm-SNPs） | 无 | 基因组数据 | 757,601个个体 |
| 11774 | 2024-08-05 |
Therapeutic Inducers of Natural Killer cell Killing (ThINKK): preclinical assessment of safety and efficacy in allogeneic hematopoietic stem cell transplant settings
2024-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008435
PMID:38754915
|
研究论文 | 该研究评估了自然杀伤（NK）细胞杀伤的治疗诱导剂（ThINKK）在异基因造血干细胞移植中的安全性和有效性 | 本研究首次展示了ThINKK细胞具有产量型I干扰素的特性，并且在异基因T细胞激活能力较低 | 未明确指出研究的限制 | 本研究旨在改善异基因HSCT后早期的移植物抗白血病效应 | 该研究的对象为从造血干细胞扩增和分化而来的ThINKK细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | 人类小鼠异种移植模型 | 细胞数据 | NA |
| 11775 | 2024-08-04 |
[Mechanism of Fuzheng Huayu Tablets against hepatic fibrosis based on transcriptome and single-cell sequencing]
2024-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究探讨了复正化瘤片(FZHY)在肝纤维化治疗中巨噬细胞极化的作用 | 识别出与肝纤维化巨噬细胞极化相关的26个潜在基因，并筛选出10个核心蛋白 | 未提及具体的局限性 | 研究FZHY在肝纤维化治疗中的机制 | 主要研究肝纤维化相关的巨噬细胞及其极化 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序、转录组测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型的具体样本数量未提及 |
| 11776 | 2024-08-05 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2024-Apr-16, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01858-23
PMID:38445887
|
研究论文 | 本研究重新分析了单细胞RNA测序数据，未能支持小鼠非神经节细胞中的疱疹病毒1型潜伏状态 | 提出了原有结论的几项方法论缺陷，挑战了HSV-1可以在免疫细胞中建立潜伏的现有观点 | 使用的方法导致了神经元的严重破坏，干扰了数据的分析 | 研究疱疹病毒1型在小鼠非神经节细胞中是否存在潜伏状态 | 小鼠的免疫细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 11777 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals Hippo signaling as a driver of fibrosis in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169225
PMID:38051587
|
研究论文 | 这篇文章整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫染色，为慢性脓肿性皮肤病的发病机制提供了前所未有的视角 | 首次揭示了Hippo信号通路在脓肿性皮肤病纤维化中的核心作用 | 尚未明确临床验证和实际应用的效果 | 研究脓肿性皮肤病的发病机制及其纤维化反应 | 主要关注脓肿性皮肤病中的细胞参与者及其相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11778 | 2024-08-05 |
Epigenetic and transcriptional responses in circulating leukocytes are associated with future decompensation during SARS-CoV-2 infection
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108288
PMID:38179063
|
研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2感染期间循环白血球的表观遗传和转录反应与未来失代偿之间的关联 | 该研究首次将单细胞RNA测序和单细胞可接近染色质测定结合，用于识别COVID-19患者中即将失代偿的早期免疫失调 | 该研究的样本主要来自住院患者，可能不适用于轻症病例 | 研究SARS-CoV-2感染期间即将失代偿的宿主反应元素 | 招募了因COVID-19住院的被试，他们在入院时的疾病严重程度和合并症相匹配 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞基因组数据 | NA |
| 11779 | 2024-08-04 |
A deep learning method for classification of HNSCC and HPV patients using single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1395721
PMID:38872916
|
研究论文 | 本研究开发了一种使用单细胞转录组学对HNSCC和正常样本进行分类的深度学习方法 | 提出了一种新颖的模型来区分HNSCC样本和正常样本，并将HNSCC样本分为HPV阳性和HPV阴性类别 | 只有20个HNSCC原发癌样本，样本量较小可能影响结果的泛化性 | 旨在通过机器学习和深度学习技术提高HNSCC的早期检测能力 | 研究对象为HNSCC样本和正常组织样本 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学 | 人工神经网络 | 基因数据 | 20个HNSCC原发癌样本和9个正常组织样本 |
| 11780 | 2024-08-04 |
Unlocking ovarian cancer heterogeneity: advancing immunotherapy through single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1388663
PMID:38873253
|
综述 | 本文讨论了利用单细胞转录组学解析卵巢癌异质性以提高免疫疗法效果 | 探索单细胞测序技术在卵巢癌免疫细胞群体和肿瘤微环境中的应用以解决异质性问题 | 当前研究可能未能全面覆盖卵巢癌的所有形态学组和其免疫逃逸机制 | 旨在理解卵巢癌的异质性及其对免疫治疗的影响 | 主要研究卵巢癌及其相关免疫细胞和微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |