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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11761 | 2025-10-07 |
Defining the nature of human pluripotent stem cell-derived interneurons via single-cell analysis
2021-10-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.08.006
PMID:34506726
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研究论文 | 通过单细胞分析比较人类多能干细胞来源的中间神经元与体内中间神经元的异同 | 首次应用单核和单细胞转录组学直接比较体外培养与体内来源的人类中间神经元 | 干细胞来源的中间神经元仅能模拟妊娠中期前的发育阶段,且仅代表脑内潜在亚型的一小部分 | 评估体外培养方法生成人类中间神经元的完整性和相似性 | 人类皮质中间神经元和多能干细胞来源的中间神经元 | 单细胞分析 | NA | 单核转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11762 | 2025-10-07 |
Transcriptome analysis of heterogeneity in mouse model of metastatic breast cancer
2021-09-27, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-021-01468-x
PMID:34579762
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研究论文 | 通过MMTV-PyMT小鼠模型研究转移性乳腺癌细胞转录组异质性 | 结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析转移性乳腺癌的器官趋向性和克隆异质性 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 研究乳腺癌转移过程中肿瘤异质性和器官趋向性的分子机制 | MMTV-PyMT转基因小鼠模型的转移性乳腺癌细胞 | 转录组学 | 乳腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Monocle2, Seurat | RNA测序数据 | 10只雌性MMTV-PyMT小鼠的器官来源转移细胞系 | Illumina, BioRad | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NextSeq 500, ddSeq | Illumina NextSeq 500平台用于批量RNA测序,BioRad ddSeq平台用于单细胞RNA测序 |
11763 | 2025-10-07 |
Identification of cancer cell-intrinsic biomarkers associated with tumor progression and characterization of SFTA3 as a tumor suppressor in lung adenocarcinomas
2025-Jan-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-13395-z
PMID:39780110
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺腺癌进展相关基因特征,发现SFTA3作为新型肿瘤抑制因子 | 构建了包含8个基因的预后模型,首次系统阐明SFTA3在肺腺癌中的肿瘤抑制功能及其在液体活检中的潜在价值 | SFTA3在肺腺癌中的具体分子机制仍需进一步验证,临床样本量有限 | 识别肺腺癌进展相关的癌症细胞内在生物标志物并研究其功能 | 肺腺癌患者血清样本和肺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 细胞活力检测, 划痕愈合实验, 集落形成实验 | 预后模型 | 基因表达数据, 血清样本数据 | 肺腺癌患者血清样本 | NA | 单细胞RNA测序, 液体活检 | NA | NA |
11764 | 2025-10-07 |
Tokay gecko tail regeneration involves temporally collinear expression of HOXC genes and early expression of satellite cell markers
2025-Jan-08, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02111-9
PMID:39780185
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研究论文 | 本研究通过比较壁虎尾部再生与胚胎尾部发育的分子机制,揭示了壁虎尾部再生的独特特征 | 发现壁虎尾部再生缺乏顶端生长区,HOXC基因呈现时间共线性表达,且卫星细胞标记物早期激活 | 研究仅针对壁虎模型,结论是否适用于其他蜥蜴物种尚需验证 | 探究壁虎尾部再生的分子机制及其与胚胎发育的差异 | 壁虎尾部再生组织和胚胎尾部组织 | 发育生物学 | 组织再生 | 转录组学,单细胞测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 7个尾部再生阶段和3个胚胎尾部发育阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11765 | 2025-10-07 |
Role and mechanism of LINC02390 and its potential target genes, CLECL1 and CD69, in immune microenvironment of lung adenocarcinoma
2025, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine
IF:1.4Q3
DOI:10.3233/THC-241452
PMID:39269874
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研究论文 | 探讨LINC02390及其潜在靶基因CLECL1和CD69在肺腺癌免疫微环境中的作用机制 | 首次发现LINC02390通过调控CLECL1和CD69影响免疫细胞浸润,可能成为肺腺癌免疫治疗新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 寻找能预测肺腺癌预后的生物标志物并探索其在免疫微环境中的作用 | 肺腺癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 生存分析、GO/KEGG富集分析、基因突变分析、免疫组化染色、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床组织样本、单细胞测序数据 | 使用GSE111894单细胞测序数据集和临床组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11766 | 2025-10-07 |
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406684
PMID:39465672
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示牙髓中三级淋巴结构在细菌感染免疫应答中的形成机制 | 首次在牙髓组织中鉴定出三级淋巴结构,发现CCL3可能是驱动其形成的关键因子 | 牙髓特殊组织结构可能限制研究结果的普适性 | 探究三级淋巴结构在牙髓细菌感染免疫应答中的作用和形成机制 | 健康与发炎的人类牙髓组织及小鼠牙髓炎模型 | 单细胞生物学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 人类健康与发炎牙髓组织,小鼠牙髓炎模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11767 | 2025-10-07 |
Targeting SLITRK4 Restrains Proliferation and Liver Metastasis in Colorectal Cancer via Regulating PI3K/AKT/NFκB Pathway and Tumor-Associated Macrophage
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400367
PMID:39499724
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研究论文 | 本研究揭示SLITRK4通过调控PI3K/AKT/NFκB通路和肿瘤相关巨噬细胞促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次发现SLITRK4在结直肠癌肝转移中显著上调并通过PI3K/AKT/NFκB通路调控肿瘤微环境 | 未明确说明样本量大小及具体实验模型数量 | 探索结直肠癌肝转移的新驱动因子及治疗靶点 | 结直肠癌患者组织样本及多种体外体内模型 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,siRNA递送 | 体外细胞模型,体内动物模型,共培养模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11768 | 2025-10-07 |
Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405818
PMID:39503290
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别X连锁视网膜劈裂症的多组学特征,并验证慢性内质网应激/eIF2α通路作为潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和时空转录组学分析XLRS疾病模型,发现两种模型间保守的慢性内质网应激通路激活 | 研究仅针对特定p.R209C突变,可能不适用于所有XLRS病例 | 解析X连锁视网膜劈裂症的分子病理机制并寻找治疗靶点 | 基因工程Rs1小鼠和患者来源视网膜类器官 | 空间转录组学 | X连锁视网膜劈裂症 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学, Western blot, 蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 两种XLRS样模型(Rs1小鼠和患者来源视网膜类器官) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11769 | 2025-10-07 |
Advances on the Role of Lung Macrophages in the Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease in the Era of Single-Cell Genomics
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.100160
PMID:39781522
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学时代肺巨噬细胞在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的作用研究进展 | 整合单细胞RNA测序技术揭示COPD中巨噬细胞分子异质性的新认识 | NA | 探讨肺巨噬细胞在COPD发病机制中的复杂作用 | 肺巨噬细胞及其亚群 | 单细胞基因组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11770 | 2025-10-07 |
Construction and validation of prognosis and treatment outcome models based on plasma membrane tension characteristics in bladder cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18816
PMID:39790460
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研究论文 | 基于膀胱癌中质膜张力特征构建并验证预后和治疗结局模型 | 首次系统研究质膜张力相关基因在膀胱癌中的预后价值,并鉴定出DCBLD2作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索质膜张力相关基因在膀胱癌预后和治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组测序, scRNA-seq, qRT-PCR, 伤口愈合实验, Transwell实验 | LASSO回归, Cox回归分析 | 转录组数据, 临床数据, 突变数据 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11771 | 2025-10-07 |
PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407284
PMID:39494472
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外实验揭示了PD-1+CD8+ T细胞通过诱导肝细胞焦亡促进自身免疫性肝病发展的新机制 | 首次发现PD-1+CD8+ T细胞通过颗粒酶B和穿孔素-1诱导肝细胞GSDMD介导的焦亡在自身免疫性肝病中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究自身免疫性肝病中效应T细胞的具体致病机制 | dnTGFβRII Aire转基因小鼠模型中的肝组织和免疫细胞 | 免疫学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞测序, 体外细胞分析, CAR-T细胞治疗 | NA | 单细胞测序数据, 体外实验数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11772 | 2025-10-07 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308174
PMID:39494578
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析早期乳腺癌患者术中放疗联合手术引发的外周免疫反应变化 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示术中放疗联合手术对早期乳腺癌患者外周免疫细胞组成和功能的动态影响 | 研究样本量有限,仅关注外周免疫反应而未分析肿瘤微环境变化 | 探究术中放疗联合手术对乳腺癌患者免疫系统的调节作用 | 早期乳腺癌患者的外周血单核细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 早期乳腺癌患者治疗前后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
11773 | 2025-10-07 |
Are oligodendrocytes bystanders or drivers of Parkinson's disease pathology?
2025-Jan, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002977
PMID:39777410
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综述 | 探讨少突胶质细胞在帕金森病病理中可能扮演的角色 | 提出少突胶质细胞可能是帕金森病早期驱动因素的新观点,挑战了传统认为该病纯粹是神经元障碍的认知 | 当前对少突胶质细胞在帕金森病中的功能作用仍高度推测性,缺乏明确实验证据 | 阐明少突胶质细胞在帕金森病发病机制中的潜在作用 | 帕金森病患者的中脑黑质多巴胺能神经元和少突胶质细胞 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11774 | 2025-10-07 |
Inhibition of Abdominal Aortic Aneurysm Progression Through the CXCL12/CXCR4 Axis via MiR206-3p Sponge
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70328
PMID:39779470
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研究论文 | 本研究探讨通过MiR206-3p海绵抑制CXCL12/CXCR4轴对腹主动脉瘤进展的影响 | 首次提出MiR206-3p海绵作为通过抑制CXCL12/CXCR4信号通路治疗腹主动脉瘤的创新治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床应用效果需进一步验证 | 阐明CXCL12/CXCR4信号通路在腹主动脉瘤发展中的具体作用机制 | 人类腹主动脉瘤患者和小鼠模型中的血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,ELISA,细胞转染,谱系追踪 | 小鼠腹主动脉瘤模型 | 基因表达数据,蛋白质水平数据,细胞表型数据 | 人类患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11775 | 2025-10-07 |
Lactylation-driven TNFR2 expression in regulatory T cells promotes the progression of malignant pleural effusion
2024-Dec-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010040
PMID:39721754
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控调节性T细胞中TNFR2表达的机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 首次发现乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化调控NF-κB p65转录因子,进而上调TNFR2表达的新表观遗传机制 | NA | 探索调节性T细胞中TNFR2表达的调控机制及其在恶性胸腔积液进展中的作用 | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本及调节性T细胞 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
11776 | 2025-10-07 |
Global identification of mammalian host and nested gene pairs reveal tissue-specific transcriptional interplay
2024-Dec-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279430.124
PMID:39578100
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研究论文 | 本研究通过构建小鼠和人类宿主/嵌套基因对的全面目录,揭示了组织特异性转录互作模式 | 提供了最新的宿主/嵌套基因对目录,发现转录共现具有组织特异性,特别是在睾丸组织中尤为普遍 | NA | 系统识别哺乳动物宿主和嵌套基因对,揭示其组织特异性转录互作机制 | 小鼠和人类基因组中的宿主/嵌套基因对 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11777 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Sheds Light on Tumor Evolution: Perspectives from City of Hope's Clinical Trial Teams
2024-Dec-10, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13247507
PMID:39768430
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学在临床肿瘤研究中的应用及其对理解肿瘤演化的意义 | 提出了整合单细胞RNA测序到临床实验设计的实践经验,并强调了计算团队与临床团队协作的'团队医学'方法 | 实施单细胞方法面临高质量细胞获取、技术变异性和复杂计算分析等挑战 | 理解肿瘤异质性对肿瘤演化和治疗反应的影响,以开发更有效的治疗方法 | 乳腺癌、脑癌和卵巢癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多种癌症(乳腺癌、脑癌、卵巢癌) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11778 | 2025-10-07 |
Deciphering progressive lesion areas in breast cancer spatial transcriptomics via TGR-NMF
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae707
PMID:39780487
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研究论文 | 本研究开发了TGR-NMF方法,用于解析乳腺癌空间转录组数据中的疾病进展相关区域 | 提出了三图正则化非负矩阵分解方法和单元化策略,整合基因表达和空间位置邻域拓扑,能够利用完整的基因表达计数数据并提高可解释性 | 未明确说明样本数量和具体的技术验证细节 | 解析乳腺癌组织异质性,识别与疾病进展相关的空间区域 | 乳腺癌空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | TGR-NMF(三图正则化非负矩阵分解) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11779 | 2025-10-07 |
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331117
PMID:38744443
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研究论文 | 本研究探讨了角鲨烯环氧酶在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎诱导的肝细胞癌中通过调节肿瘤免疫微环境影响抗PD-1疗效的机制 | 首次揭示SQLE通过胆固醇积累导致CD8+ T细胞线粒体功能障碍和髓源性抑制细胞活化,从而介导免疫抑制并影响抗PD-1疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究SQLE在MASH-HCC肿瘤免疫微环境调节中的作用及对抗PD-1疗效的影响 | 肝细胞特异性SQLE转基因和敲除小鼠、原位移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 转基因小鼠模型、敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11780 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional atlas of human breast cancers and model systems
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70044
PMID:39417215
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研究论文 | 构建了人类乳腺癌的单细胞转录图谱,包含患者样本和多种模型系统 | 整合了多种乳腺癌模型系统的单细胞RNA测序数据,开发了动态细胞样本注释方法 | 样本数量有限,模型系统与真实患者样本仍存在差异 | 深入理解乳腺癌细胞多样性,识别有效治疗方法 | 乳腺癌患者肿瘤组织、淋巴结转移灶、减乳成形术样本、PDX模型、PDXO类器官和细胞系 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCSubtype, TNBCtype细胞分型预测器 | 单细胞转录组数据 | 117个样本,共506,719个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |