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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11741 | 2025-01-14 |
Major cell types in the coronary thrombosis of acute myocardial infarction patients revealed by scRNA-seq
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70181
PMID:39804415
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11742 | 2025-10-07 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629650
PMID:39764057
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研究论文 | 开发了一种名为IN-DEPTH的空间多组学整合方法,用于分析肿瘤微环境中的空间重组 | 提出IN-DEPTH方法实现同一切片的空间蛋白质组学和转录组学整合分析,并开发SGCC算法进行多模态空间数据分析 | 未明确说明样本数量的具体限制和方法的适用范围 | 开发空间多组学整合方法以深入理解肿瘤微环境的空间组织 | 淋巴组织和弥漫性大B细胞淋巴瘤(EBV阳性和阴性) | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞分析 | k-bandlimited Spectral Graph Cross-Correlation (SGCC) | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
11743 | 2025-10-07 |
Mechanistic insights into sevoflurane-induced hippocampal neuronal damage and cognitive dysfunction through the NEAT1/Nrf2 signaling axis in aged rats
2024-12-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09964-4
PMID:39707048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了七氟醚通过NEAT1/Nrf2信号轴诱导老年大鼠海马神经元损伤和认知功能障碍的分子机制 | 首次发现lncRNA NEAT1通过抑制Nrf2/ARE/HO-1通路在七氟醚诱导的神经元损伤中发挥关键作用 | 研究仅针对老年大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 阐明七氟醚麻醉导致老年患者神经损伤和认知功能障碍的分子机制 | 老年大鼠海马神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,TUNEL染色,H&E染色,免疫组化,免疫荧光,流式细胞术 | 大鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 老年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11744 | 2025-10-07 |
Durable complete response after combined treatment with tumor-infiltrating lymphocytes and oncolytic adenovirus (TILT-123) in a patient with metastatic mucosal melanoma
2024-Dec, Immuno-oncology technology
DOI:10.1016/j.iotech.2024.100726
PMID:39801682
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病例报告 | 报道一例转移性黏膜黑色素瘤患者通过肿瘤浸润淋巴细胞与溶瘤腺病毒联合治疗获得持久完全缓解的病例 | 首次展示TILT-123溶瘤病毒与肿瘤浸润淋巴细胞联合治疗在不使用预处理化疗或后处理白介素-2的情况下实现完全缓解 | 单病例报告,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索联合免疫疗法在转移性黏膜黑色素瘤治疗中的效果 | 48岁女性转移性鼻窦黏膜黑色素瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,免疫组织化学分析 | NA | 临床数据,单细胞测序数据,免疫组织化学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
11745 | 2025-10-07 |
Spatial multiomics atlas reveals smooth muscle phenotypic transformation and metabolic reprogramming in diabetic macroangiopathy
2024-10-12, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02458-x
PMID:39395983
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研究论文 | 本研究首次构建了糖尿病大血管病变的空间多组学图谱,揭示了平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的特征 | 首次构建了胫前动脉的空间基因-代谢图谱,揭示了平滑肌细胞表型转化的转录驱动网络和代谢重编程关键基因 | 样本仅来自11例截肢糖尿病患者,样本量有限 | 探索糖尿病大血管病变中平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的分子机制 | 糖尿病患者的胫前动脉组织 | 空间多组学 | 糖尿病大血管病变 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,空间代谢组测序 | 多组学整合分析,细胞通讯分析,时间序列分析,网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,空间代谢组数据 | 11例糖尿病截肢患者的胫前动脉 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
11746 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in thyroid eye disease
2024 Oct-Dec, Taiwan journal of ophthalmology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/tjo.TJO-D-23-00096
PMID:39803402
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综述 | 总结单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的最新突破和应用前景 | 首次系统综述单细胞RNA测序技术在甲状腺眼病研究中的应用,揭示疾病发病机制的新见解 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要依赖已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的应用价值和未来方向 | 甲状腺眼病患者眼眶后组织 | 数字病理学 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
11747 | 2025-10-07 |
Interferon signaling and ferroptosis in tumor immunology and therapy
2024-Aug-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00668-w
PMID:39127858
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研究论文 | 本研究阐明了干扰素信号通路通过调控铁死亡影响CD8+T细胞耗竭的机制及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次揭示干扰素信号通路与铁死亡的相互作用机制,并发现沉默HSPA6或DNAJB1可增强PD-1疗法疗效 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究干扰素信号通路对肿瘤细胞铁死亡的影响及其与CD8+T细胞耗竭的关联机制 | 肿瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、体外实验、体内验证 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞活性数据 | TCGA数据库数据及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11748 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals gene interactions and signaling pathway dynamics in rat embryos with anorectal malformation
2024-05-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09878-1
PMID:38769159
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了大鼠胚胎肛门直肠畸形的基因表达特征和信号通路动态 | 首次在胚胎发育过程中应用空间转录组学技术,揭示了肛门直肠畸形中位置特异性基因表达模式和信号通路协同作用 | 研究仅针对GD14-GD16胚胎期,缺乏更早期或更晚期的发育阶段分析 | 探究肛门直肠畸形的分子机制和基因调控网络 | 大鼠胚胎(正常组和肛门直肠畸形组) | 空间转录组学 | 肛门直肠畸形 | 空间转录组学,免疫荧光染色,WGCNA,GSEA,PROGENy | NA | 空间基因表达数据,图像数据 | GD14-GD16胚胎期大鼠样本(包含正常和畸形病例) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11749 | 2025-10-07 |
Bioinformatics and system biology analysis revealed the crosstalk between COVID-19 and osteoarthritis
2023-12, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1123
PMID:38156385
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研究论文 | 通过生物信息学和系统生物学分析揭示COVID-19与骨关节炎之间的相互作用机制 | 首次通过生物信息学方法系统识别COVID-19与骨关节炎的共同病理机制,发现4个关键枢纽基因及相关调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探索COVID-19与骨关节炎之间的共同病理机制和潜在治疗靶点 | COVID-19患者和骨关节炎患者的基因表达数据,以及OA小鼠模型 | 生物信息学 | COVID-19, 骨关节炎 | 差异表达基因分析, 蛋白互作网络分析, 功能富集分析, qPCR, Western Blot, 单细胞RNA测序 | OA小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
11750 | 2025-10-07 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
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综述 | 本文探讨转录组学在动脉粥样硬化斑块表型研究中的应用价值及方法论挑战 | 系统阐述整合多组学数据与机器学习在动脉粥样硬化研究中的创新价值 | 研究结果可重复性低且缺乏标准化流程 | 通过转录组学研究揭示动脉粥样硬化斑块表型及推进精准医疗 | 动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | bulk sequencing, single-cell sequencing | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11751 | 2025-10-07 |
Size matters: the impact of nucleus size on results from spatial transcriptomics
2023-04-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04129-z
PMID:37081484
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研究论文 | 本研究探讨了连续切片数据整合方法对空间转录组学分析结果的影响 | 提出了连续切片数据整合方法,解决了细胞核尺寸超过组织切片厚度时对转录组数据捕获的负面影响 | 研究仅针对人类死后大脑组织,未验证在其他组织类型中的适用性 | 评估连续切片数据整合对空间转录组学spot聚类和解卷积准确性的影响 | 人类死后大脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据,组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium Spatial Gene Expression |
11752 | 2025-10-07 |
The role of histone lactylation genes in hepatocellular carcinoma prognostic models and their immune cell infiltration features: a comprehensive analysis of single-cell, spatial transcriptome, Mendelian randomization and experiment
2025-Jan-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01775-1
PMID:39789404
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研究论文 | 本研究通过综合分析构建了组蛋白乳酸化基因相关的肝细胞癌预后模型,并探讨其与免疫细胞浸润特征的关系 | 首次整合单细胞分析、空间转录组、孟德尔随机化和实验验证,系统研究组蛋白乳酸化基因在肝细胞癌中的作用 | 研究样本量有限,需要更大规模的数据验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌的新型诊断生物标志物和识别模型 | 肝细胞癌患者和细胞系(Huh7, LO2) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 孟德尔随机化, qRT-PCR | 多种机器学习方法, Cox回归, 决策曲线 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个数据库整合数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
11753 | 2025-10-07 |
An antagonistic role of clock genes and lima1 in kidney regeneration
2025-Jan-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07455-8
PMID:39789202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了时钟基因与lima1在斑马鱼肾脏再生中的拮抗作用机制 | 首次发现时钟基因通过抑制lima1a表达促进肾脏祖细胞形成和肾单位再生的新机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物中验证 | 探究时钟基因在肾脏再生过程中的作用机制 | 斑马鱼急性肾损伤模型中的近端小管上皮细胞 | 单细胞生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除斑马鱼模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11754 | 2025-10-07 |
Rapamycin improves satellite cells' autophagy and muscle regeneration during hypercapnia
2025-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182842
PMID:39589836
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研究论文 | 本研究探讨高碳酸血症如何损害卫星细胞自噬和肌肉再生,并验证雷帕霉素的治疗效果 | 首次在体内证实高碳酸血症导致卫星细胞自噬功能障碍和肌生成受损,并发现雷帕霉素可通过AMPK/mTOR通路改善这些缺陷 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 | 研究高碳酸血症对骨骼肌卫星细胞功能和肌肉再生的影响及治疗策略 | 骨骼肌卫星细胞、小鼠模型、培养的成肌细胞 | 细胞生物学 | 危重症肌病 | 单细胞测序、批量测序、卫星细胞移植、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和细胞培养样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
11755 | 2025-10-07 |
Idebenone Protects Photoreceptors Impaired by Oxidative Phosphorylation Disorder in Retinal Detachment
2025-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.1.17
PMID:39774627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和动物实验探讨了视网膜脱离后氧化磷酸化功能障碍对视网膜细胞的损伤机制,并验证了艾地苯醌的治疗效果 | 首次在视网膜脱离研究中系统分析氧化磷酸化通路异常,并发现艾地苯醌可通过改善氧化磷酸化功能保护光感受器 | 研究主要基于动物模型,缺乏人类临床试验验证 | 探究视网膜脱离后氧化磷酸化功能障碍机制及艾地苯醌的治疗潜力 | 人类视网膜样本和小鼠视网膜脱离模型 | 单细胞基因组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11756 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of pediatric Burkitt lymphoma reveals intra-tumor heterogeneity and markers of therapy resistance
2025-Jan, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02431-3
PMID:39424708
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析儿童伯基特淋巴瘤,揭示肿瘤异质性和治疗耐药性标志物 | 首次在儿童伯基特淋巴瘤中应用单细胞转录组学技术,发现TPM2作为独立于TP53突变的治疗耐药性生物标志物 | 研究样本仅限EBV阴性伯基特淋巴瘤患者,样本量相对有限 | 探究伯基特淋巴瘤的肿瘤异质性特征及治疗耐药机制 | 儿童伯基特淋巴瘤患者的诊断标本(EBV阴性) | 单细胞组学 | 伯基特淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 儿童伯基特淋巴瘤患者诊断标本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11757 | 2025-10-07 |
Autophagy Associated Genes (ARGs) -Based Predictive Model AIDPS for Prostate Cancer
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70213
PMID:39789383
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研究论文 | 本研究基于自噬相关基因构建了前列腺癌预后预测模型AIDPS | 首次结合自噬相关基因和人工智能算法构建前列腺癌预后模型,并在多个数据集中验证其优于现有模型 | 使用公开数据库数据,缺乏外部验证队列 | 识别和评估自噬相关特征以预测前列腺癌患者的临床结局 | 前列腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序, RNA测序 | Ridge, 101种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11758 | 2025-10-07 |
Miltefosine reinvigorates exhausted T cells by targeting their bioenergetic state
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101869
PMID:39657666
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研究论文 | 本研究通过筛选FDA批准的小分子库,发现米替福新能够通过改善T细胞的生物能量状态来逆转T细胞耗竭 | 首次发现米替福新能够以不依赖PD-1/PD-L1的方式逆转T细胞耗竭,即使在PD-1抗体治疗无效的终末耗竭状态下仍能增强CAR-T细胞活性 | 研究主要基于体外模型和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发针对T细胞耗竭的新型免疫治疗策略 | 耗竭的CAR-T细胞和T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞测序,小分子筛选 | CAR-T细胞模型,同种异体和同基因肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11759 | 2025-10-07 |
Upregulation of multiple key molecules is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma by bulk and single-cell RNA-seq
2024-Nov-12, Aging
DOI:10.18632/aging.206151
PMID:39537209
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研究论文 | 本研究通过bulk和单细胞RNA-seq分析,构建了基于关键基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次结合三种差异分析方法和单细胞测序技术鉴定肝细胞癌关键基因,并建立与免疫细胞浸润相关的预后模型 | 研究主要基于TCGA数据库,缺乏外部验证队列 | 构建肝细胞癌预后预测模型并探索关键基因与免疫浸润的关系 | 肝细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11760 | 2025-10-07 |
Sex specific molecular networks and key drivers of Alzheimer's disease
2023-06-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00624-5
PMID:37340466
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研究论文 | 通过系统生物学方法研究阿尔茨海默病中性别特异性分子网络和关键驱动因子 | 首次通过多组学网络分析识别LRP10作为AD性别差异的关键网络调节因子,并验证其在性别和APOE基因型特异性中的作用机制 | 研究主要基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病发展过程中的动态变化 | 阐明阿尔茨海默病性别差异的分子机制 | 人类死后脑组织样本和AD小鼠模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、单细胞RNA测序、酵母双杂交系统、基因扰动实验 | 网络分析、共表达网络 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 两个队列(MSBB和ROSMAP)的大规模人类死后脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |