单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11741	2024-08-04	Identification of Surface Markers and Functional Characterization of Myeloid Derived Suppressor Cell-Like Adherent Cells 2024-03, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300159 PMID:37986133	研究论文	本研究识别了髓源抑制细胞样附着细胞的基因特征及功能	本研究首次识别了特定的MLAC表面标记，为进一步研究这种细胞类型提供了重要工具	缺乏对MLAC特异性标记的了解在进一步特性化该细胞类型时造成限制	研究髓源抑制细胞样附着细胞在肿瘤微环境中的角色以及其特征	髓源抑制细胞样附着细胞的基因签名和功能特性	数字病理学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	使用公共单细胞RNA-seq数据分析特定细胞群体
11742	2024-08-04	Insight into Tetrabromobisphenol A-Associated Liver Transcriptional Landscape via Single Cell RNA Sequencing 2024-02, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300477 PMID:37867281	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术描述了四溴双酚A引起的小鼠肝脏转录组特征	揭示了四溴双酚A（TBBPA）对肝细胞和内皮细胞的功能障碍及其对免疫细胞招募的影响	研究仅在小鼠模型中进行，需在其他模型和人类样本中验证	探讨环境毒素四溴双酚A引发的肝脏损伤机制	小鼠肝脏中的主要细胞类型	数字病理学	肝病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型
11743	2024-08-05	Identification and Validation of Glomeruli Cellular Senescence-Related Genes in Diabetic Nephropathy by Multiomics 2024-02, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300453 PMID:37957539	研究论文	本研究旨在识别和验证与糖尿病肾病相关的肾小球细胞衰老相关基因	研究首次揭示FOS和ZFP36可能在糖尿病肾病中发挥抗衰老作用	研究中只是验证了部分核心基因的表达，仍需更大规模的验证	提供新的线索以基于抗衰老策略治疗糖尿病肾病	研究对象包括糖尿病肾小球和对照肾小球样本	数字病理学	糖尿病肾病	微阵列分析, scRNA-seq	NA	基因表达数据	41个糖尿病肾小球和20个对照肾小球样本
11744	2024-08-04	Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of B cells and tertiary lymphoid structures in muscle-invasive bladder cancer 2024-01-12, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-04860-1 PMID:38216927	研究论文	该研究揭示了肌肉侵袭性膀胱癌(MIBC)中B细胞和三级淋巴结构的异质性	本研究提供了关于MIBC中B细胞亚型的异质性及TLSs在MIBC结果中的重要作用的新见解	本研究的局限性在于样本大小较小，仅涉及12名膀胱癌患者	探索肌肉侵袭性膀胱癌中肿瘤浸润B细胞和三级淋巴结构的功能和机制	该研究的对象为12名膀胱癌患者的B细胞和T细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	细胞	12名膀胱癌患者的11612个B细胞和55392个T细胞
11745	2024-08-05	Single-cell transcriptome sequencing reveals aberrantly activated inter-tumor cell signaling pathways in the development of clear cell renal cell carcinoma 2024-01-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-023-04818-9 PMID:38191424	研究论文	本研究探讨了在透明细胞肾细胞癌发展过程中异常激活的肿瘤细胞间信号传导通路	首次揭示了透明细胞肾细胞癌中异常激活的细胞间信号通路及其特定的癌干细胞亚群体的作用	只分析了少量病例，且未深入探讨信号通路的具体机制	研究透明细胞肾细胞癌发展相关的细胞间信号传导	6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本	数字病理学	透明细胞肾细胞癌	scRNA-seq	NA	NA	6个透明细胞肾细胞癌样本和6个正常肾组织样本
11746	2024-08-05	Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneous features of myeloid-derived suppressor cells in newborns 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1367230 PMID:38919617	研究论文	本研究揭示了新生儿骨髓源抑制细胞的异质性特征和成熟轨迹	首次通过单细胞RNA测序明确了新生儿多形核骨髓源抑制细胞的分化阶段	尚未深入探讨新生儿MDSCs在免疫系统中的具体功能和机制	探讨新生儿骨髓源抑制细胞的组成及功能异质性	新生儿外周血中的多形核骨髓源抑制细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	生物样本数据	新生儿的外周血样本
11747	2024-08-05	Single-Cell RNA Transcriptome of the Human Endometrium Reveals Epithelial Characterizations Associated with Recurrent Implantation Failure 2024-01, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300110 PMID:37690851	研究论文	本研究利用单细胞转录组测序揭示了与反复植入失败（RIF）相关的子宫内膜上皮特征	首次表明RIF患者子宫内膜腺体中MAP2K6 EPCAM上皮细胞替代腺上皮细胞，并表明RIF患者衍生的腺体类器官对性激素反应减弱	研究样本量较小，仅包括3名RIF患者，可能影响结果的普适性	探讨反复植入失败患者中子宫内膜的细胞和分子机制	研究对象为3名反复植入失败患者的子宫内膜细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组测序（scRNA-seq）	NA	细胞	3名反复植入失败患者，分析25,315个单个细胞
11748	2024-08-05	T cell-related ubiquitination genes as prognostic indicators in hepatocellular carcinoma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1424752 PMID:38919610	研究论文	本研究开发了一种基于T细胞相关泛素化基因的HCC预后风险评分	提出了一种新的预后和免疫治疗效果预测指标，基于T细胞相关泛素化基因	未提及具体的限制	为肝细胞癌患者设计新的预后评估工具	肝细胞癌患者的T细胞相关泛素化基因	数字病理	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	风险评分模型	RNA数据	3050个T细胞标记基因，结合TCGA的临床数据
11749	2024-08-05	Relative effect size-based profiles as an alternative to differentiation analysis in multi-species single-cell transcriptional studies 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0305874 PMID:38917129	研究论文	该文章展示了一种基于效应大小的替代方法，用于多物种单细胞RNA测序的差异分析	提出了一种基于效应大小的分析管道，适用于小样本和多物种数据的融合	涉及的样本小，且可能存在批次效应导致的偏差	旨在展示效应大小配置文件作为单细胞转录组分析的有效替代	探讨来自于人类和牛的外周血单核细胞的转录组数据	数字病理学	其他	scRNA-seq	NA	RNA序列数据	多个物种的小样本数据，包括人类和牛的外周血单核细胞
11750	2024-08-04	Construction and Validation of a Prognostic Model Based on Novel Senescence-Related Genes in Non-Small Cell Lung Cancer Patients with Drug Sensitivity and Tumor Microenvironment 2023-12, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300190 PMID:37518773	研究论文	本文开发了一种基于新颖衰老相关基因的预后模型，以评估非小细胞肺癌患者的药物敏感性和肿瘤微环境	提出了一种新的预后系统，基于12个衰老基因的表达，评估肺腺癌患者的生存风险	研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能会受到数据集的限制	研究衰老相关基因在非小细胞肺癌中对预后的影响	非小细胞肺癌（LUAD）患者以及相关细胞系	数字病理学	肺癌	LASSO Cox回归	NA	基因表达数据	基于TCGA和GEO数据集的样本，具体数量未在摘要中说明
11751	2024-08-04	Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome 2023-06-26, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1 DOI:10.1002/cphy.c210053 PMID:37358516	评论	本文总结了空间单细胞技术在探索胃肠组织转录组方面的最新进展	提出了利用空间转录组技术提供基因表达的基因组范围全景，以揭示胃肠组织的分子组成	未在摘要中明确指出具体的局限性	推广对胃肠生理的理解	胃肠道组织及其单细胞层次的功能和表达	数字病理学	NA	空间转录组技术	NA	NA	NA
11752	2024-08-04	HSV-2 triggers upregulation of MALAT1 in CD4+ T cells and promotes HIV latency reversal 2023-06-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI164317 PMID:37079384	研究论文	本研究探讨了单纯疱疹病毒2型（HSV-2）如何促进CD4+ T细胞中MALAT1的上调以及HIV的潜伏期逆转	研究首次揭示了HSV-2通过上调MALAT1和其他机制促进HIV-1的再激活	本研究没有提及样本的多样性和长期观察的结果	探究HSV-2感染如何影响HIV-1的潜伏期和再激活机制	研究的对象是人类CD4+ T细胞和2D10细胞模型	数字病理学	HIV/AIDS	单细胞RNA测序	2D10细胞模型	RNA序列数据	使用了人类CD4+ T细胞和若干2D10细胞样本
11753	2024-08-04	Dissociation protocols used for sarcoma tissues bias the transcriptome observed in single-cell and single-nucleus RNA sequencing 2023-May-31, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-023-10977-1 PMID:37254069	研究论文	本文研究了不同肉瘤亚型的细胞分离方法对转录组的影响	首次阐明了分离方法对肉瘤患者衍生肿瘤样本分子特征解读的影响	仅探讨了三种肉瘤亚型，可能不适用于所有肉瘤类型	评估不同的细胞分离方法如何影响肉瘤样本的转录组数据	患者来源的肉瘤样本及其相应的单细胞和单核RNA测序数据	数字病理	肉瘤	RNA测序	NA	基因表达数据	125,831个细胞和细胞核
11754	2024-08-05	Clonally expanded, thyrotoxic effector CD8+ T cells driven by IL-21 contribute to checkpoint inhibitor thyroiditis 2023-05-17, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adg0675 PMID:37196065	研究论文	本研究揭示了IL-21驱动的克隆扩展的效应CD8+ T细胞在免疫检查点抑制剂相关甲状腺炎中的作用	首次直接比较了免疫检查点抑制剂甲状腺炎与自身免疫性桥本甲状腺炎的免疫浸润，揭示了IL-21在甲状腺毒性CD8 T细胞中的关键作用	研究主要依赖于小鼠模型，缺乏临床试验数据支持	探讨免疫检查点抑制剂相关副作用的免疫机制及潜在治疗靶点	包括接受免疫检查点抑制剂治疗的患者和桥本甲状腺炎患者的甲状腺样本	数字病理学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序	小鼠模型	组织样本	涉及多个患者的甲状腺样本
11755	2024-08-05	C5aR1-positive neutrophils promote breast cancer glycolysis through WTAP-dependent m6A methylation of ENO1 2021-07-26, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-021-04028-5 PMID:34312368	研究论文	本文探讨了C5aR1阳性中性粒细胞如何通过WTAP依赖性m6A甲基化促进乳腺癌的糖酵解。	识别出一种新类型的C5aR1阳性中性粒细胞，与乳腺癌进展和不良预后相关。	当前对中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用尚不明确，仍需进一步研究。	研究C5aR1阳性中性粒细胞在乳腺癌进展中的作用及其机制。	C5aR1阳性中性粒细胞及其在乳腺癌中的作用。	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	临床乳腺癌样本及单细胞数据
11756	2024-08-05	Crosstalk among proximal tubular cells, macrophages, and fibroblasts in acute kidney injury: single-cell profiling from the perspective of ferroptosis 2024-Jul, Human cell IF:3.4Q3 DOI:10.1007/s13577-024-01072-z PMID:38753279	研究论文	本文研究了近端小管细胞、巨噬细胞和成纤维细胞在急性肾损伤中的相互作用，尤其关注铁死亡的视角	文章首次揭示了急性肾损伤中细胞之间的相互作用及其与铁死亡的关系	尚未详细探讨急性肾损伤中铁死亡的具体机制	探讨急性肾损伤中细胞的相互作用及其对铁死亡的影响	近端小管细胞、巨噬细胞和成纤维细胞	数字病理学	急性肾损伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	急性肾损伤小鼠和人类样本
11757	2024-08-05	Vanin-2 is expressed in peripheral blood T cells and upregulated in SLE patients 2024-Jun-26, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae145 PMID:38920355	研究论文	该研究探讨了Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的表达及其在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的上调情况	发现Vanin-2在T细胞中的独特表达，并与SLE患者T细胞功能变化相关	研究中未探讨其他vanin家族成员在T细胞中的作用	阐明Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的重要性	外周血T淋巴细胞及其在SLE患者中的表达	数字病理学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序，流式细胞术，西方印迹	NA	NA	NA
11758	2024-08-04	Long-read single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of spermatogenesis in obstructive azoospermia and Sertoli cell-only patients 2024-Jun-25, QJM : monthly journal of the Association of Physicians DOI:10.1093/qjmed/hcae009 PMID:38192002	研究论文	本研究展示了阻塞性无精症和仅有塞尔托利细胞患者中生精过程的长读转录组特征	首次利用PacBio长读测序揭示了人类生精过程中的新转录本和新基因	研究样本量较小，仅限于患者的睾丸活检样本	揭示阻塞性无精症患者中生精的转录组特征	阻塞性无精症和非阻塞性无精症患者的睾丸细胞	数字病理学	生育不孕	PacBio长读单细胞测序	NA	转录组数据	OA患者3个样本，NOA患者3个样本
11759	2024-08-05	SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity 2024-Jun-24, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae340 PMID:38709881	研究论文	本文提出了一种新的单细胞转录复杂性指标(SCTC)，用于更准确地推断单细胞的发育潜力。	引入了经济复杂性理论的见解，以改进对单细胞发育潜力的测量，比现有指标SCTD更精确。	在某些情况下，G表达并不会单调减少，这可能影响现有发育潜力估计的准确性。	研究单细胞分析中发育潜力的推断及伪时间重建方法。	关注单细胞转录组数据，这些数据能够提供细胞的发育潜力信息。	数字病理	NA	scRNA-Seq	NA	NA	NA
11760	2024-08-05	Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling 2024-Jun-19, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011 PMID:38599212	研究论文	本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮Norrin/β-连环蛋白信号通路来调控视网膜血管生成和血-retinal屏障的成熟	研究首次表明谷氨酸能活动在视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟中扮演重要角色	研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类	探讨谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟	小鼠视网膜中的神经元和血管内皮细胞	数字病理	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)和药理学激活	NA	基因组数据和功能验证结果	使用了若干小鼠视网膜样本