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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11721 | 2025-10-07 |
The cell-type-specific spatial organization of the anterior thalamic nuclei of the mouse brain
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113842
PMID:38427564
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术揭示了小鼠前丘脑核团的细胞类型组成和空间组织原则 | 首次在单细胞和空间分辨率水平绘制了前丘脑核团的细胞类型组成,发现了离散和连续的空间组织模式 | 研究仅限于小鼠模型,人类或其他物种的适用性需要进一步验证 | 解析前丘脑核团的细胞类型组成和空间组织结构 | 小鼠前丘脑核团 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
11722 | 2025-10-07 |
Single-cell spatial transcriptomic and translatomic profiling of dopaminergic neurons in health, aging, and disease
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113784
PMID:38386560
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组和多巴胺能神经元翻译组分析,研究健康、衰老和疾病状态下小鼠大脑多巴胺能神经元的表达特征 | 首次结合单细胞空间转录组和多巴胺能神经元翻译组分析,在空间背景下深度表征多巴胺能神经元特征,并识别出CASR作为多巴胺能钙处理的调节因子 | 研究基于帕金森病转基因小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究大脑多巴胺能神经元在健康、衰老和疾病状态下的空间基因表达特征 | 年轻和年老小鼠大脑中的多巴胺能神经元及其他27种细胞类型 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 单细胞空间转录组学, 翻译组分析 | NA | 空间基因表达数据 | 年轻和年老小鼠大脑样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
11723 | 2025-10-07 |
A molecular atlas of adult C. elegans motor neurons reveals ancient diversity delineated by conserved transcription factor codes
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113857
PMID:38421866
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了成年秀丽隐杆线虫运动神经元的全面分子图谱,揭示了由保守转录因子编码定义的神经元多样性 | 首次系统描绘成年线虫运动神经元分子图谱,发现同源域转录因子组合编码在不同物种间保守地定义运动神经元多样性 | 研究主要聚焦线虫模型,在哺乳动物中的验证仍需进一步扩展 | 解析成年动物运动神经元的分子组成特征和组织原则 | 成年秀丽隐杆线虫运动神经元 | 单细胞基因组学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,200个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11724 | 2025-10-07 |
Mosaic deletion of claudin-5 reveals rapid non-cell-autonomous consequences of blood-brain barrier leakage
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113911
PMID:38446668
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研究论文 | 通过诱导成年小鼠内皮细胞特异性Cldn5基因嵌合缺失,研究血脑屏障渗漏的非细胞自主性后果 | 首次在成熟大脑中诱导内皮特异性Cldn5嵌合缺失,揭示血脑屏障渗漏引起的快速非细胞自主性转录组变化 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 研究CLDN5缺失对成熟血脑屏障功能的影响及其分子机制 | 成年小鼠脑内皮细胞、小胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 血脑屏障相关疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11725 | 2025-10-07 |
The TET-Sall4-BMP regulatory axis controls craniofacial cartilage development
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113873
PMID:38427557
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了TET-Sall4-BMP调控轴在颅面软骨发育中的关键作用机制 | 首次发现Sall4通过介导Tet2/3共相分离形成凝聚物,促进bmp4启动子区域5mC氧化,从而激活bmp4表达的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究颅面微畸形的分子发病机制 | 斑马鱼胚胎的咽弓软骨发育过程 | 发育生物学 | 颅面微畸形 | 单细胞RNA测序, 生化分析, 遗传学分析 | 斑马鱼模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11726 | 2025-10-07 |
Transgenic tools targeting the basal ganglia reveal both evolutionary conservation and specialization of neural circuits in zebrafish
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113916
PMID:38484735
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研究论文 | 本研究通过创建转基因工具揭示了斑马鱼基底神经节神经回路的进化保守性与特异性 | 首次在成年斑马鱼中开发了靶向基底神经节特定亚群的转基因工具,并发现了与哺乳动物不同的神经通路连接方式 | 研究主要聚焦于斑马鱼模型,需要进一步验证在更高等生物中的普适性 | 研究基底神经节神经回路的进化保守性与物种特异性 | 成年斑马鱼的基底神经节神经回路 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 转基因技术 | NA | 基因表达数据, 神经解剖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11727 | 2025-10-07 |
Stem-like progenitor and terminally differentiated TFH-like CD4+ T cell exhaustion in the tumor microenvironment
2024-02-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113797
PMID:38363680
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和小鼠模型揭示了肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞耗竭的分化特征及其抗肿瘤免疫机制 | 首次发现肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞存在干细胞样祖细胞和终末分化的细胞毒性亚群,并阐明其与CD8+ T细胞耗竭模式的相似性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究肿瘤微环境中TFH样CD4+ T细胞的耗竭特征及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肿瘤浸润性CD4+ T细胞和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11728 | 2025-10-07 |
Optimization of Tissue Digestion Methods for Characterization of Photoaged Skin by Single Cell RNA Sequencing Reveals Preferential Enrichment of T Cell Subsets
2024-01-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13030266
PMID:38334658
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研究论文 | 比较三种人体皮肤组织消化方法,评估细胞产量和活力,并发现顺序消化法能提高非抗原呈递肥大细胞和CD8 T细胞比例 | 首次系统比较皮肤组织消化方法对单细胞RNA测序中免疫细胞亚群富集的影响,揭示顺序消化法对特定T细胞亚群的偏好性富集 | 仅比较三种消化方法,样本量有限,未评估长期保存样本的效果 | 优化皮肤组织消化方法以提高单细胞RNA测序的细胞产量和活力 | 人体皮肤组织 | 单细胞测序 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11729 | 2025-10-07 |
Ancestry-based differences in the immune phenotype are associated with lupus activity
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169584
PMID:37606045
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研究论文 | 通过多组学方法揭示系统性红斑狼疮中与种族相关的免疫表型差异及其对疾病严重程度的影响 | 首次结合质谱流式、单细胞转录组/蛋白质组和血浆介质分析,系统揭示黑人SLE患者特有的免疫细胞活化和表观遗传特征 | 研究样本仅限于黑人和白人群体,未涵盖其他种族群体 | 探究种族相关的免疫表型差异如何影响系统性红斑狼疮的疾病严重程度 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的免疫细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式技术, 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, 多重血浆介质检测 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量(包含SLE患者和健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于液滴的单细胞转录组学和蛋白质组学技术 |
11730 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct T cell populations in immune-related adverse events of checkpoint inhibitors
2023-01-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100868
PMID:36513074
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示检查点抑制剂免疫相关不良事件中不同的T细胞群体 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合K近邻网络图分析,识别了不同免疫相关不良事件中特定的T细胞亚群和基因特征 | 样本量有限,仅分析了特定几种免疫相关不良事件,需要更大规模研究验证 | 研究抗PD-1治疗期间T细胞的细胞变化,探索免疫相关不良事件的机制 | 癌症患者的循环T细胞 | 单细胞组学 | 癌症免疫治疗相关不良事件 | 单细胞RNA测序 | K近邻网络图布局 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11731 | 2025-10-07 |
Acly Deficiency Enhances Myelopoiesis through Acetyl Coenzyme A and Metabolic-Epigenetic Cross-Talk
2022-12-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2200086
PMID:36547387
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研究论文 | 本研究揭示了ATP柠檬酸裂解酶(Acly)通过调控乙酰辅酶A代谢和表观遗传交叉对话来影响骨髓分化的机制 | 首次证明Acly缺陷通过乙酰辅酶A剥夺和组蛋白乙酰化修饰改变,调控C/EBP转录因子家族活性,从而促进骨髓分化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类系统中验证 | 探究Acly在造血过程中对骨髓分化的调控机制 | 小鼠谱系阴性、c-Kit富集的造血干细胞和祖细胞 | 表观遗传学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
11732 | 2025-10-07 |
Archetype tasks link intratumoral heterogeneity to plasticity and cancer hallmarks in small cell lung cancer
2022-09-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.07.006
PMID:35981544
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研究论文 | 通过原型任务分析将小细胞肺癌的瘤内异质性与可塑性和癌症标志联系起来 | 应用原型分析将SCLC表型异质性重新构建为多任务进化理论,定义了五个优化任务的原型空间 | NA | 研究小细胞肺癌细胞状态异质性和可塑性机制 | 小细胞肺癌细胞系和肿瘤样本 | 计算生物学 | 肺癌 | 转录组测序 | 原型分析、马尔可夫过程模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11733 | 2025-10-07 |
Urine Proteomics and Renal Single-Cell Transcriptomics Implicate Interleukin-16 in Lupus Nephritis
2022-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42023
PMID:34783463
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研究论文 | 通过尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学分析,揭示白细胞介素-16在狼疮性肾炎中的重要作用 | 首次结合纵向尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学,发现IL-16在狼疮性肾炎中的关键作用 | 样本量较小(30例患者),需要更大规模研究验证 | 探索狼疮性肾炎的新型生物标志物和治疗靶点 | 狼疮性肾炎患者和健康对照 | 生物信息学 | 狼疮性肾炎 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 30例狼疮性肾炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | NA |
11734 | 2025-10-07 |
Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.038
PMID:34019793
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研究论文 | 通过单细胞蛋白活性分析鉴定与肾癌复发相关的肿瘤巨噬细胞亚群 | 首次应用VIPER算法量化单细胞蛋白活性,发现传统基因表达分析无法检测的TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞亚群与肾癌复发相关 | 研究基于治疗初期的肾癌切除样本,未涉及治疗后的肿瘤微环境变化 | 构建透明细胞肾癌肿瘤微环境图谱并鉴定预后相关细胞亚群 | 透明细胞肾癌患者的肿瘤和癌旁组织中的造血和非造血细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨定量多光谱免疫荧光 | VIPER算法 | 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 影像数据 | 治疗初期肾癌切除样本的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11735 | 2025-10-07 |
Targeting In Vivo Metabolic Vulnerabilities of Th2 and Th17 Cells Reduces Airway Inflammation
2021-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2001029
PMID:33558372
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研究论文 | 本研究通过靶向Th2和Th17细胞的代谢脆弱性来减轻气道炎症 | 首次揭示Th2和Th17细胞在气道炎症中的代谢依赖性,并证明靶向葡萄糖和谷氨酰胺代谢可增强糖皮质激素疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索Th2和Th17细胞的代谢特性及其在气道炎症中的作用 | 哮喘患者外周血T细胞、小鼠肺部T细胞 | 免疫代谢 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 哮喘患者和健康对照的外周血T细胞,两种小鼠气道炎症模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11736 | 2025-10-07 |
Recent advances in sarcoidosis genomics: epigenetics, gene expression, and gene by environment (G × E) interaction studies
2020-09, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000000719
PMID:32701681
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综述 | 本文综述了结节病基因组学的最新研究进展,包括表观遗传学、基因表达和基因-环境相互作用研究 | 识别了新的风险基因位点,应用机器学习技术提出药物重定位建议,首次开展表观基因组学研究 | 缺乏大规模多样化队列研究,需要更多先进测序方法和分析技术的应用 | 总结结节病基因组学最新发现并指出该领域的研究空白 | 结节病及其亚型(如世贸中心相关病例和眼结节病) | 基因组学 | 结节病 | 全外显子组测序,表观基因组学,基因表达分析,机器学习 | 机器学习 | 基因组数据,表观遗传数据,基因表达数据 | NA | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序,表观基因组学 | NA | NA |
11737 | 2025-01-15 |
Characterizing tertiary lymphoid structures associated single-cell atlas in breast cancer patients
2025-Jan-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03635-y
PMID:39806382
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,研究了乳腺癌患者中与三级淋巴结构(TLS)相关的区域,并识别了18种细胞类型及其相互作用 | 首次在单细胞水平上详细描述了乳腺癌中TLS相关区域的细胞组成和细胞间通讯,揭示了巨噬细胞在TLS中的谱系转变和特定T细胞与B细胞的强相互作用 | 研究主要依赖于高分辨率技术,可能受限于样本量和技术的覆盖范围 | 探索乳腺癌中TLS相关区域的细胞组成和功能,以增强对免疫治疗反应的理解 | 乳腺癌患者的TLS相关区域 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学(ST) | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 四个独立的乳腺癌数据集,包括一个来自10×Xenium平台的细胞级分辨率数据集和三个来自10×Visium平台的斑点级数据集 | NA | NA | NA | NA |
11738 | 2025-01-15 |
Rapid and quantitative functional interrogation of human enhancer variant activity in live mice
2025-Jan-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55500-7
PMID:39762235
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dual-enSERT的Cas9双色荧光报告系统,用于快速定量比较活体小鼠中增强子等位基因的活性 | 开发了dual-enSERT系统,能够在不到两周的时间内对活体小鼠中的增强子等位基因活性进行快速定量比较,并结合单细胞转录组学分析基因表达 | NA | 研究非编码变异在先天性障碍中的功能影响 | 增强子变异 | 基因功能分析 | 先天性障碍、自闭症谱系障碍、颅面畸形 | Cas9双色荧光报告系统、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 十五种未表征的罕见和常见非编码变异 | NA | NA | NA | NA |
11739 | 2025-01-15 |
CORTADO: Hill Climbing Optimization for Cell-Type Specific Marker Gene Discovery
2024-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630040
PMID:39763976
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研究论文 | 本文介绍了一种基于爬山优化的计算框架CORTADO,用于高效发现细胞类型特异性标记基因 | CORTADO通过优化差异表达、基因表达谱的独特性和稀疏性,确保所选标记基因在保持生物学相关性的同时,唯一代表其所属的细胞群,相比传统方法具有更高的敏感性和特异性 | NA | 解决标记基因选择中的挑战,提高细胞类型特异性标记基因的发现效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其分子标记 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 爬山优化 | 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集,包括DLPFC 151507数据集、Zeisel小鼠脑数据集和外周血单核细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
11740 | 2025-01-15 |
Mechanisms of HIF1A-mediated immune evasion in gastric cancer and the impact on therapy resistance
2024-10-10, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09917-x
PMID:39384651
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌中静止癌细胞(QCCs)通过HIF1A介导的免疫逃逸机制及其对治疗抵抗的影响 | 揭示了QCCs通过HIF1A介导的糖酵解相关基因上调来抵抗T细胞介导的免疫反应的分子机制,并展示了HIF1A沉默在增强免疫治疗效果方面的潜力 | 研究主要依赖于小鼠模型和体外实验,需要进一步在人类临床试验中验证这些发现 | 探索胃癌中QCCs的免疫抑制机制及其对免疫治疗抵抗的影响,以改进治疗策略 | 胃癌中的静止癌细胞(QCCs)及其与免疫细胞的相互作用 | 癌症研究 | 胃癌 | 基因编辑技术、转录组测序、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、细胞实验数据 | 未明确提及具体样本数量,但使用了小鼠模型和体外细胞实验 | NA | NA | NA | NA |