单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 32684 篇文献,本页显示第 11721 - 11740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
11721 2025-10-07
Decoding Müllerian Duct Epithelial Regionalization
2025-Feb, Molecular reproduction and development IF:2.7Q2
综述 本文系统综述了苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制及其在女性生殖道器官形成中的作用 整合了遗传小鼠模型、单细胞测序和类器官培养等多方面研究进展,全面解析苗勒氏管区域分化的关键调控因子 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有研究进行总结和分析 阐明苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制 苗勒氏管及其衍生的女性生殖道器官(输卵管、子宫、宫颈和上阴道) 发育生物学 苗勒氏管异常和女性生殖道疾病 单细胞测序, 类器官培养, 遗传小鼠模型 NA NA NA NA single-cell RNA-seq NA NA
11722 2025-10-07
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法,用于分析细胞组成差异 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据,并在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验 NA 识别细胞类型频率变化的统计分析方法 单细胞RNA测序数据集(衰老、结核感染、前列腺癌骨转移、SARS-CoV-2感染) 生物信息学 结核病, 前列腺癌, COVID-19 单细胞RNA测序 线性混合模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11723 2025-10-07
Optimizing duodenal tissue acquisition for mechanistic studies of duodenal ablation in type 2 diabetes
2025, Endoscopy international open IF:2.2Q2
研究论文 本文开发了一种优化的十二指肠组织采集方案,用于研究十二指肠消融对2型糖尿病和代谢综合征的影响 设计了使用十二指肠冷圈套切除术创建组织微阵列和进行单细胞RNA测序的优化组织采集方案 样本量相对较小(DIRECT研究9名患者),需要进一步验证 优化十二指肠组织采集方法,以支持十二指肠消融在2型糖尿病和代谢综合征中的机制研究 接受上消化道介入内镜检查的患者 数字病理学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,组织微阵列技术 NA 组织样本,基因表达数据 DIRECT研究:9名患者,16个冷圈套切除术;EMINENT-2研究:38个冷圈套样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11724 2025-10-07
Integrated Bioinformatic Analyses Reveal Thioredoxin as a Putative Marker of Cancer Stem Cells and Prognosis in Prostate Cancer
2025, Cancer informatics IF:2.4Q3
研究论文 通过生物信息学分析发现硫氧还蛋白可作为前列腺癌干细胞标记物和预后预测因子 首次通过单细胞RNA测序数据识别硫氧还蛋白作为前列腺癌干细胞的潜在标记物,并揭示其与预后的关联 样本量有限,需要进一步的体外和体内实验验证TXN对前列腺癌干细胞的功能调控作用 识别调控前列腺癌干细胞特性并预测预后的新因子 前列腺癌组织和前列腺癌干细胞 生物信息学 前列腺癌 单细胞RNA测序,基因集富集分析,轨迹分析 Seurat,monocle 3 单细胞RNA测序数据 2个前列腺癌组织的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11725 2025-10-07
Gestational diabetes induces autistic-like behaviors in offspring by disrupting the GABAergic system
2025, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过小鼠模型探讨妊娠期糖尿病如何通过破坏GABA能系统诱导子代出现自闭症样行为 首次结合单细胞转录组学和代谢组学揭示GDM通过GAD2启动子区DNA高甲基化减少GABA能神经元和GABA水平的新机制 研究仅使用小鼠模型,结果需要进一步在人类研究中验证 阐明妊娠期糖尿病导致子代自闭症风险的神经生物学机制 妊娠期糖尿病小鼠模型的雄性子代 神经科学 自闭症谱系障碍 单细胞转录组学, 代谢组学, c-Fos染色, DNA甲基化分析 小鼠疾病模型 行为学数据, 基因表达数据, 代谢物数据, 免疫组织化学数据 妊娠期糖尿病小鼠模型的子代 NA 单细胞RNA-seq, 代谢组学 NA NA
11726 2025-10-07
Seurat function argument values in scRNA-seq data analysis: potential pitfalls and refinements for biological interpretation
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 探讨单细胞RNA测序数据分析中Seurat函数参数设置的潜在问题及生物学解释优化方法 采用生物学与生物信息学相结合的集成方法,揭示数据处理过程中的生物学见解 未讨论这些数学方法在生物学中应用的理论依据 优化单细胞RNA测序数据分析中参数设置的生物学解释 单细胞RNA测序数据处理方法 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 机器学习聚类方法 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
11727 2025-10-07
Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过多组学分析和机器学习预测输卵管对配子和胚胎存在的响应机制 开发了基于transformer的机器学习模型整合转录组和蛋白质组数据,首次系统揭示输卵管对配子和胚胎的时空特异性响应 小鼠模型与人类输卵管炎症反应存在部分差异,样本采集时间点有限 阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用机制 小鼠输卵管组织及输卵管液样本 机器学习 生殖系统疾病 RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 transformer 转录组数据, 蛋白质组数据 小鼠输卵管组织在不同交配后时间点的样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
11728 2025-10-07
Type I interferon signaling pathway enhances immune-checkpoint inhibition in KRAS mutant lung tumors
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损,恢复该通路可增强免疫检查点抑制疗效 首次揭示KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损是贯穿肿瘤发展的关键特征,证明恢复该通路可使免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探索KRAS突变肺肿瘤早期发展阶段的功能性改变及其对免疫治疗的影响 表达KRAS致癌基因的小鼠肺泡II型细胞及携带p53或LKB1突变的小鼠和人类晚期肿瘤 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
11729 2025-10-07
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过生物材料纤维化模型开发了体内衰老特征,并利用迁移学习识别了跨物种和多种病理条件下的衰老细胞异质性 建立了体内来源的衰老特征(SenSig),首次鉴定出周细胞和'软骨样'成纤维细胞作为衰老细胞,并发现了IL34-CSF1R-TGFβR信号轴介导的细胞间通讯机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展 阐明体内衰老细胞的表型特征及其在组织修复和病理过程中的作用机制 p16-CreER;Ai14报告基因小鼠、小鼠和人类单细胞RNA测序数据 生物信息学 组织纤维化 单细胞RNA测序(scRNAseq) 迁移学习 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11730 2025-10-07
Spatial Transcriptomics Depict Ligand-Receptor Cross-talk Heterogeneity at the Tumor-Stroma Interface in Long-Term Ovarian Cancer Survivors
2023-05-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中配体-受体交互的异质性及其与长期生存的关系 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,开发计算方法研究肿瘤微环境中不同肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞亚型之间的空间配体-受体相互作用 需要进一步研究确认这种交互是否在调节高级别浆液性卵巢癌恶性表型中发挥作用 探索卵巢癌肿瘤微环境中基质异质性及其与患者长期生存的关系 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的治疗初治肿瘤组织 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 计算方法 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的肿瘤样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
11731 2025-10-07
Multiplexed LNP-mRNA vaccination against pathogenic coronavirus species
2022-08-02, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 开发针对多种致病性冠状病毒的LNP-mRNA多价疫苗并评估其免疫效果 首次开发针对SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV的三价LNP-mRNA疫苗,并通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后的系统性免疫反应 研究仅在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验 开发针对多种致病性冠状病毒的广谱疫苗 SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV三种冠状病毒 疫苗开发 冠状病毒感染 单细胞RNA测序,LNP-mRNA疫苗技术 NA 基因表达数据,抗体反应数据 动物模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
11732 2025-10-07
Variant-specific vaccination induces systems immune responses and potent in vivo protection against SARS-CoV-2
2022-05-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究评估了针对不同SARS-CoV-2变异株的特异性LNP-mRNA疫苗的免疫反应和保护效果 首次系统比较野生型和变异株特异性疫苗的免疫反应,并通过单细胞转录组学揭示免疫细胞群体和基因表达的系统性变化 研究主要在动物模型中进行,尚未在人体验证 评估变异株特异性LNP-mRNA疫苗的免疫效果和保护效力 SARS-CoV-2病毒变异株(野生型、B.1.351、B.1.617) 免疫学 COVID-19 单细胞转录组测序,BCR-seq,TCR-seq,中和抗体检测 动物模型 基因表达数据,免疫受体序列数据 动物模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,免疫受体测序 NA NA
11733 2025-10-07
IL-7 receptor alpha defines heterogeneity and signature of human effector memory CD8+ T cells in high dimensional analysis
2020-09, Cellular immunology IF:3.7Q2
研究论文 通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,研究IL-7Rα在定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性中的作用 首次揭示IL-7Rα在人类效应记忆CD8+ T细胞中具有多样化但有序的表达模式,并定义了细胞亚群的异质性景观 未明确说明样本规模和研究人群特征 探究IL-7Rα是否可作为定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性的关键分子 人类效应记忆CD8+ T细胞 免疫学 NA 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 蛋白质表达数据, 基因表达数据 NA NA 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA NA
11734 2025-10-07
New insight into GABAergic neurons in the hypothalamic feeding regulation
2018-Nov, The journal of physiological sciences : JPS
综述 综述下丘脑GABA能神经元在摄食调节中的研究进展 整合光遗传学、在体钙成像和单细胞RNA-seq三大前沿技术揭示GABA能神经元的多样性与摄食调控功能 NA 探讨下丘脑不同区域GABA能神经元在摄食调节中的作用机制 下丘脑弓状核(ARC)、背内侧下丘脑(DMH)和外侧下丘脑(LH)的GABA能神经元 神经科学 代谢疾病 光遗传学, 化学遗传学, 在体钙成像, 单细胞RNA测序 NA 神经活动数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11735 2025-10-07
Loss of ATG7 in microglia impairs UPR, triggers ferroptosis, and weakens amyloid pathology control
2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨了微胶质细胞中ATG7缺失如何通过影响未折叠蛋白反应和氧化应激导致铁死亡,从而削弱对淀粉样斑块的控制 首次揭示ATG7缺失通过降低未折叠蛋白反应和增加氧化应激导致微胶质细胞铁死亡的具体机制 研究主要基于AD小鼠模型,人类微胶质细胞的反应可能有所不同 探究ATG7在微胶质细胞中对淀粉样斑块控制的分子机制 阿尔茨海默病小鼠模型中的微胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,生化分析,免疫荧光分析 NA 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 AD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11736 2025-10-07
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的正向调控作用及其机制 首次通过单细胞测序发现牙周炎中成骨细胞谱系Ephrin-B2信号缺陷,并构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与内皮细胞共移植系统证实其促进血管化骨再生的作用 研究主要基于体外共培养和动物实验,尚未进行临床验证 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的作用机制,为牙周组织工程提供指导 牙周组织、成骨细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 单细胞转录组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自公共数据库GEO: GSE171213的牙周组织单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
11737 2025-10-07
Single-cell transcriptional footprint for pseudogene SsCLEC9A is associated with antigen processing and presentation in Sus scrofa
2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究首次发现猪的CLEC9A基因因远古突变成为假基因,但其突变转录本仍影响树突状细胞的抗原呈递功能 首次揭示猪CLEC9A基因成为假基因的进化事件,并发现其突变转录本仍具有生物学功能 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 探究假基因SsCLEC9A的转录适应及其在抗原呈递中的作用 猪树突状细胞和骨髓造血细胞 免疫学 NA 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
11738 2025-10-07
Pan-cancer characterization of m6A-mediated regulation of T cell exhaustion dynamics and clinical relevancies in human cancers
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 通过整合多组学数据对m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的泛癌作用进行系统性分析 首次在泛癌层面揭示m6A修饰与T细胞耗竭动态的相互作用,并基于此识别出三个具有不同临床预后的分子亚型 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证m6A调控T细胞耗竭的具体机制 探索m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的作用及其临床相关性 人类多种癌症类型中的T细胞耗竭动态 生物信息学 泛癌分析 单细胞RNA测序,多组学数据分析 多变量分析 多组学数据,单细胞RNA测序数据,免疫治疗数据集 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11739 2025-10-07
Liver transcriptome analysis reveals PSC-attributed gene set associated with fibrosis progression
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 通过肝脏转录组分析识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 首次系统识别PSC特异性胆道纤维化基因特征,并通过单细胞RNA测序数据揭示不同细胞类型在纤维化中的特异性作用 样本量相对有限,需要进一步功能验证研究 识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者的肝脏活检样本 转录组学 肝脏疾病 RNA测序,单细胞RNA测序,差异基因表达分析 NA 转录组数据 47例肝脏活检(PSC 16例,PBC 15例,MASLD 16例),外部验证集73例PSC样本 NA RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
11740 2025-10-07
Intratumoral Injection of Cytotoxic Drugs Plus Hapten Elicits Significant Immune Responses in Sentinel Lymph Nodes: Implications for Cancer Immunotherapy
2025-Mar-01, Pancreas IF:1.7Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析前哨淋巴结在胰腺癌原发灶经细胞毒性药物加半抗原瘤内注射治疗后的细胞和基因组变化 首次结合细胞毒性药物与半抗原进行瘤内注射,系统揭示前哨淋巴结微环境的动态重组机制 研究仅针对胰腺癌模型,未验证其他癌症类型的普适性 探索前哨淋巴结在癌症免疫治疗中的作用机制及远隔效应 胰腺癌患者的前哨淋巴结 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部