单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11721 - 11740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11721 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-sequencing and RNA-tomography of the avian embryo extending body axis
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1382960
PMID:38863942
|
研究论文 | 本研究利用高通量测序方法生成小鸡胚胎的分子图谱。 | 该研究结合单细胞RNA测序和RNA成像技术，创建了胚胎躯干的高分辨率转录组图，揭示了与身体轴发育相关的分子通路。 | 缺乏对小鸡胚胎不同发育阶段的多样性探索，可能限制了结果的广泛适用性。 | 旨在通过建立小鸡胚胎发展的分子图谱，理解体轴发育过程中涉及的细胞谱系和基因表达。 | 研究对象为小鸡胚胎的不同细胞谱系，包括体节、神经管、神经脊、侧板中胚层等。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA成像 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11722 | 2024-08-05 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
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研究论文 | 本研究探讨了IL-17介导的细胞因子信号在视网膜色素上皮退化中的保护作用。 | 首次揭示了脉络膜γδ T细胞在视网膜色素上皮损伤后的保护性细胞因子信号机制。 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性。 | 探讨IL-17信号通路在视网膜色素上皮退化中的作用。 | 研究对象是小鼠脉络膜中的免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞免疫资料 | 小鼠模型 |
| 11723 | 2024-08-05 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
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研究论文 | 这篇文章研究了肝细胞癌患者的肿瘤微环境如何影响固有淋巴细胞（ILCs）。 | 文章揭示了肿瘤微环境中的细胞因子如何影响ILCs的组成和功能，并与患者的生存预后相关。 | 该研究主要基于肝细胞癌患者的样本，可能无法普遍适用于其他类型的肿瘤。 | 探讨肝细胞癌中局部细胞因子环境如何影响ILCs的变化。 | 研究的对象为来自48名肝细胞癌患者的ILCs，特别是肿瘤组织和非肿瘤组织中的ILCs。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 48名肝细胞癌患者 |
| 11724 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Unveils the Role of the Tumor Immune Microenvironment and Notch Signaling in Dormant Minimal Residual Disease
2022-Mar-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-1230
PMID:34965936
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研究论文 | 该研究揭示了肿瘤免疫微环境和Notch信号通路在休眠微小残留疾病中的角色 | 首次利用新的免疫竞争转基因模型研究休眠微小残留疾病，并发现Jagged-1/Notch信号通路在肿瘤发生中的多重调控作用 | 尚未完全阐明肿瘤休眠的复杂生态系统及其影响因素 | 探讨休眠的分子通路和微环境的作用，提供新的策略延长癌症休眠 | 休眠微小残留疾病及其相关的肿瘤细胞和免疫细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因模型 | RNA序列数据 | NA |
| 11725 | 2024-08-05 |
B-cells are abnormal in psychosocial stress and regulate meningeal myeloid cell activation
2021-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2021.08.002
PMID:34371135
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研究论文 | 该文章研究了心理社会压力下B细胞的异常表现及其对脑膜髓系细胞激活的调控作用 | 首次揭示了心理社会压力下B细胞的活化及其对脑膜免疫细胞功能的影响 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探究B细胞在心理社会压力下对脑功能的影响 | 小鼠模型中的B细胞和脑膜髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 11726 | 2024-08-05 |
Automated quality control and cell identification of droplet-based single-cell data using dropkick
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271908.120
PMID:33837131
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研究论文 | 开发了一种名为dropkick的全自动软件工具，用于单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞识别 | dropkick能够自动确定数据集特定的训练标签，并学习真实细胞和环境噪声的基因表示，从而提高细胞识别的准确性和效率 | 在特定情况下，dropkick的性能可能受到数据集的技术噪声和背景变化的影响 | 研究单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞筛选方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的真正细胞与非信息条形码的区分 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 弱监督模型 | 模拟和真实的单细胞RNA测序数据 | NA |
| 11727 | 2024-08-05 |
Single-cell analyzing of tumor microenvironment and cell adhesion between early and late-stage lung cancer
2024-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.04.013
PMID:38696904
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研究论文 | 本研究探讨了早期和晚期肺腺癌肿瘤微环境及细胞粘附的单细胞分析 | 提出了TNS1作为早期肺腺癌细胞免疫微环境中的粘附分子，并且可能成为新的预后标志物 | 对调控早期与晚期肺腺癌肿瘤迁移进展的具体因素的理解仍然不完全 | 研究肺腺癌中早期与晚期阶段细胞粘附和肿瘤微环境的差异 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的LUAD样本 |
| 11728 | 2024-08-04 |
A novel single-cell model reveals ferroptosis-associated biomarkers for individualized therapy and prognostic prediction in hepatocellular carcinoma
2024-Jun-10, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01931-z
PMID:38853238
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研究论文 | 本研究探讨了一种与铁死亡相关的单细胞预测模型，以改善肝细胞癌(HCC)的治疗反应和预后预测。 | 通过LASSO-Cox算法构建了一个包含10个与铁死亡相关的单细胞生物标志物的新模型，提供了个性化治疗和预后预测的新视角。 | 未明确提及研究的局限性 | 旨在提高肝细胞癌患者的治疗反应和预后预测准确性。 | 研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的单细胞生物标志物。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO-Cox模型 | 基因表达数据 | 涉及HCC细胞亚群体的单细胞样本 |
| 11729 | 2024-08-04 |
Deciphering the genetic code of neuronal type connectivity through bilinear modeling
2024-Jun-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91532
PMID:38857169
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研究论文 | 本研究提出了一种新的双线性建模方法，用于解码神经元类型之间的遗传连接方式 | 该模型首次将基因表达与连接组数据相结合，成功捕捉了神经元之间的遗传相互作用 | 样本数据有限，模型在特定类型神经元的连接解读中可能存在局限性 | 研究神经元类型之间的遗传连接及其对大脑功能的影响 | 利用小鼠视网膜神经元数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 双线性模型 | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经元数据集中包含的样本数量未具体说明 |
| 11730 | 2024-08-04 |
SCSMD: Single Cell Consistent Clustering based on Spectral Matrix Decomposition
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae273
PMID:38855914
|
研究论文 | 本文提出了一种基于谱矩阵分解的单细胞一致性聚类方法SCSMD | SCSMD融合了多种聚类方法的优势，以确定最佳聚类方案 | NA | 研究单细胞测序数据分析中的聚类问题 | 真实的scRNA-seq数据集，总共15个数据集 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | scRNA-seq | NA | 数据集 | 15个真实的scRNA-seq数据集 |
| 11731 | 2024-08-05 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
|
研究论文 | 该文章介绍了一种名为CACIMAR的工具，用于通过单细胞RNA测序数据进行跨物种分析 | CACIMAR提供了不同的保守评分来测量细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性，这是目前很少有方法能做到的 | 目前尚未提及任何限制 | 开发一种工具以识别跨物种的细胞身份、标记、调控和相互作用 | 研究对象包括小鼠、斑马鱼和小鸡的视网膜再生的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 转录组数据 | 公开可用的多个物种的单细胞RNA测序数据 |
| 11732 | 2024-08-04 |
High-density generation of spatial transcriptomics with STAGE
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae294
PMID:38647109
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研究论文 | 本文开发了一种名为STAGE的空间位置监督自编码生成器，用于生成高密度的空间转录组数据 | STAGE使用定制的自监督编码器学习基因表达的连续模式，从而能够生成高分辨率的基因表达，并提高空间转录组数据的质量 | 尚未提及关于STAGE的适用范围或者可能存在的局限性 | 研究旨在改善空间转录组技术中数据分辨率和质量的不足 | 研究对象是空间转录组数据集和基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 自编码生成器 | 自编码器 | 转录组数据 | 四个空间转录组数据集 |
| 11733 | 2024-08-04 |
Structural, Functional, and Genetic Changes Surrounding Electrodes Implanted in the Brain
2024-05-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00057
PMID:38630432
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研究论文 | 该文章研究植入电极周围的结构、功能和基因变化，旨在改善可植入神经技术的设计 | 创新点在于开发了新的'设备切片'技术，捕捉慢性植入电极与活体大鼠脑组织的相互作用，并揭示了电极周围组织重塑的新观察结果 | 尚需进一步的信息有效链接生物反应与设备设计的特定方面 | 探讨设备与组织整合的基本科学原理，以改善可植入神经技术的设计 | 研究植入电极周围细胞的结构、功能和基因变化 | 数字病理 | NA | 单细胞电生理学，双光子成像，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，细胞电生理数据 | 使用活体大鼠脑组织进行研究，具体样本大小未提供 |
| 11734 | 2024-08-04 |
Identification of prognostic risk model based on plasma cell markers in hepatocellular carcinoma through single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1363197
PMID:38859937
|
研究论文 | 本研究基于浆细胞标志物建立了一个肝细胞癌的预后风险模型 | 揭示了肝细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的异质性，并基于浆细胞标志物构建了预后风险模型 | 该研究的局限性在于依赖于单一的数据集进行模型验证 | 旨在探讨肝细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的特征及其在治疗中的影响 | 肝细胞癌患者中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其亚型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自TCGA-LIHC和肝癌研究所（LCI）队列的数据 |
| 11735 | 2024-08-05 |
The lncRNA TPT1-AS1 promotes the survival of neuroendocrine prostate cancer cells by facilitating autophagy
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/IMBV8599
PMID:38859837
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研究论文 | 这篇文章揭示了lncRNA TPT1-AS1在神经内分泌前列腺癌细胞存活中的作用。 | 这项研究首次提出TPT1-AS1在神经内分泌细胞存活中的保护作用，而非促进神经内分泌分化。 | 本研究未能证明TPT1-AS1在LNCaP细胞中对神经内分泌分化的刺激作用。 | 研究lncRNA TPT1-AS1在前列腺癌发展过程中的角色和机制。 | 研究神经内分泌前列腺癌细胞及相关的lncRNA表达。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了LNCaP和C4-2B细胞模型进行实验 |
| 11736 | 2024-08-05 |
Panoramic analysis of cell death patterns reveals prognostic and immune profiles of head and neck squamous cell carcinoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/PMDA6193
PMID:38859838
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研究论文 | 本研究探讨了细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的预测作用和免疫特征 | 提出了细胞死亡指数(CDI)签名作为预测头颈部鳞状细胞癌预后的生物标志物，且发现CAAP1缺失可增强抗肿瘤免疫 | 目前缺乏关于头颈部鳞状细胞癌进展和治疗效果的可靠预测模型 | 探索细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本及其临床信息 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 利用TCGA和GEO数据库的信息进行大规模转录组和单细胞转录组分析 |
| 11737 | 2024-08-05 |
LAYN Serves as a Prognostic Biomarker and Downregulates Tumor-Infiltrating CD8+ T Cell Function in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S464806
PMID:38859944
|
研究论文 | LAYN在肝细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次探讨了LAYN在肝细胞癌中与CD8+ T细胞功能障碍及临床预后之间的关系 | 尚未在临床试验中验证LAYN的治疗潜力 | 研究LAYN在肝细胞癌中的免疫功能和预后意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | IF，IHC，ELISA，流式细胞术，mRNA-seq | NA | 肿瘤样本 | 在研究中涉及新鲜样本的检测 |
| 11738 | 2024-08-05 |
Involvement of N4BP2L1, PLEKHA4, and BEGAIN genes in breast cancer and muscle cell development
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1295403
PMID:38859961
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研究论文 | 本研究探讨了乳腺癌患者在胸大肌细胞中基因表达的变化 | 识别了三种之前未被表征的肿瘤抑制基因，并发现它们在乳腺肿瘤中的表达下调 | 样本量较小，仅涉及50名乳腺癌患者 | 探讨乳腺癌及其与肌肉发育相关的基因表达 | 主要研究对象是乳腺癌患者的正常肌肉细胞基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 50名乳腺癌患者 |
| 11739 | 2024-08-05 |
Lymph node stromal cell responses to perinatal T cell waves, a temporal atlas
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316957120
PMID:38079541
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研究论文 | 这篇文章探讨了围产期T细胞在淋巴结中的独特环境及其演变。 | 文章创新性地利用单细胞RNA测序生成初期淋巴结生态的地图，并揭示了基质细胞和T细胞之间的相互作用。 | 没有提及本研究的具体局限性。 | 阐明围产期T细胞在淋巴结中如何生成和作用。 | 主要研究小鼠的围产期调节性T细胞及其在淋巴结中的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 未具体说明样本数量，但涉及小鼠的研究 |
| 11740 | 2024-08-04 |
The activation of SIRT1 by resveratrol reduces breast cancer metastasis to lung through inhibiting neutrophil extracellular traps
2023-12, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2023.2265585
PMID:37772906
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研究论文 | 这项研究探讨了白藜芦醇对乳腺癌转移到肺部的影响。 | 该研究首次将白藜芦醇与抑制中性粒细胞外陷阱的作用联系起来，展示了其对乳腺癌转移的治疗潜力。 | 该研究在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的生理条件。 | 研究白藜芦醇通过抑制中性粒细胞外陷阱来减少乳腺癌转移的机制。 | 主要研究对象为乳腺癌转移及中性粒细胞外陷阱。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 小鼠正位4T1乳腺癌模型 | 血清样本 | 小鼠乳腺癌模型中的样本数量未具体提到 |