单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 11721 - 11740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11721 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional gene signature analysis identifies IL-17 signaling pathway as the key pathway in sepsis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763
PMID:38039751
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定IL-17信号通路为脓毒症的关键致病通路 | 首次通过单细胞转录组技术系统揭示IL-17信号通路在脓毒症不同免疫细胞中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 识别与脓毒症临床严重程度和结局相关的关键通路 | 健康对照和脓毒症患者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, t-SNE, UMAP, GO/KEGG富集分析 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据 | 来自三个公共数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 11722 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of multilineage cardiac organoids derived from human induced pluripotent stem cells
2022-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac002
PMID:39871934
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析解析人多能干细胞来源的多谱系心脏类器官的发育过程 | 首次建立包含心肌细胞、内皮细胞和平滑肌细胞的多谱系心脏类器官模型，并揭示3D微环境促进心肌细胞成熟的分子机制 | 研究主要基于体外类器官模型，在体验证仅使用大鼠心肌梗死模型 | 探索人多能干细胞来源心脏类器官的发育机制及其在心脏修复中的应用 | 人诱导多能干细胞来源的多谱系心脏类器官 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11723 | 2025-10-07 |
The construction of a breast cancer prognostic model by combining genes related to hypoxia and endoplasmic reticulum stress
2025-Jan-27, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453941
PMID:39868728
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研究论文 | 通过结合缺氧和内质网应激相关基因构建乳腺癌预后预测模型 | 首次将缺氧和内质网应激相关基因联合构建乳腺癌预后模型，并分析其与免疫浸润和药物敏感性的关联 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 预测乳腺癌患者的预后并探索个体化治疗新视角 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞测序分析 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 11724 | 2025-10-07 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示人类胚胎发育期前额叶皮层背侧和眶基底区域早期细胞构筑差异 | 首次在转录组水平发现人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域瞬时细胞区室的基因表达差异，证实前额叶皮层区域特化在胎儿发育早期即已出现 | 研究仅聚焦于15孕周这一特定发育时期，样本量有限 | 探究人类胚胎前额叶皮层背侧和眶基底区域细胞构筑特征的转录组基础 | 人类胚胎发育期前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 15孕周人类胚胎前额叶皮层样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组分析平台 |
| 11725 | 2025-10-07 |
Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
2024-11-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.09.007
PMID:39395421
|
研究论文 | 本研究揭示了髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的关键作用及其受组蛋白突变调控的分子机制 | 首次在免疫活性小鼠模型中证明组蛋白突变和肿瘤位置共同塑造髓系细胞异质性，并发现靶向CCL8/CCL12-CCR1/CCR5轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 探究髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用机制 | 儿童高级别胶质瘤（包括半球pHGGs和弥漫中线胶质瘤）及其微环境中的髓系细胞 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，组织切片图像 | 免疫活性小鼠模型和人类pHGG样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11726 | 2025-10-07 |
Progressive polyadenylation and m6A modification of Ighg1 mRNA maintain IgG1 antibody homeostasis in antibody-secreting cells
2024-11-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.10.004
PMID:39476842
|
研究论文 | 本研究揭示了抗体分泌细胞中通过Ighg1 mRNA的渐进式多聚腺苷酸化和m6A修饰维持IgG1抗体稳态的机制 | 首次发现m6A阅读蛋白YTHDF1通过调控Ighg1 mRNA稳定性维持IgG1抗体产生，并证实该机制在系统性红斑狼疮中的病理作用 | 研究主要聚焦于IgG1亚型，其他IgG亚型的调控机制尚未明确 | 探究RNA转录后修饰如何影响抗体分泌细胞中的抗体稳态 | 抗体分泌细胞（ASCs）、IgG重链转录本（Ighg）、m6A阅读蛋白YTHDF1 | 分子生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、基因敲除、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 狼疮小鼠模型、系统性红斑狼疮患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11727 | 2025-10-07 |
Overcoming tyrosine kinase inhibitor resistance in lung cancer brain metastasis with CTLA4 blockade
2024-Nov-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.012
PMID:39423817
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肺癌脑转移中TKI耐药机制，并证明CTLA4阻断可有效克服耐药 | 首次发现TKI治疗通过肿瘤来源的HMGB1上调T细胞CTLA4表达，创建免疫抑制微环境，并证明CTLA4阻断联合TKI在TKI耐药模型中优于PD1阻断 | 研究样本来源于手术获取的LCBM样本，样本量有限，且依赖小鼠模型验证 | 阐明肺癌脑转移中酪氨酸激酶抑制剂耐药机制并探索有效治疗策略 | 肺癌脑转移患者样本和具有TKI敏感或耐药EGFR突变的同源小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具有不同遗传背景和TKI治疗史的LCBM手术样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11728 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Applied in Plants
2024-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181561
PMID:39329745
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物研究中的应用现状、挑战与未来方向 | 首次系统梳理了scRNA-seq技术在植物科学中的研究进展，并提供了五个有助于识别不同细胞类型标记基因的数据库 | 主要关注模式植物、作物和木材植物，可能未完全覆盖所有植物物种 | 探索scRNA-seq技术在植物研究中的应用潜力 | 植物组织，特别是模式植物、作物和木材 | 植物科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11729 | 2025-10-07 |
Deep Immunoprofiling of Large-Scale Tuberculosis Dataset at Single Cell Resolution Reveals a CD81bright γδ T Cell Population Associated with Latency
2024-09-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181529
PMID:39329713
|
研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序分析揭示了与结核潜伏感染相关的CD81高表达γδ T细胞亚群 | 首次在大规模结核病数据集中通过单细胞分辨率免疫分析发现CD81bright γδ T细胞亚群与潜伏感染相关 | 研究主要关注外周血γδ T细胞，未深入探讨其他免疫细胞类型或组织特异性反应 | 探索γδ T细胞不同亚群在结核病保护性免疫或疾病进展中的作用 | 结核病患者外周血γδ T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 流式细胞数据 | 大规模结核病数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11730 | 2025-10-07 |
Characterizing the Tumor Microenvironment and Its Prognostic Impact in Breast Cancer
2024-09-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181518
PMID:39329702
|
研究论文 | 通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，系统表征乳腺癌肿瘤微环境的免疫景观和细胞间通讯 | 识别了三种不同的免疫浸润患者亚型，发现中等免疫浸润患者预后最佳，并揭示了SPP1和EGF信号通路在低免疫浸润组中的特异性激活 | NA | 研究乳腺癌肿瘤微环境的免疫特征及其预后价值 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11731 | 2025-10-07 |
SPANN: annotating single-cell resolution spatial transcriptome data with scRNA-seq data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad533
PMID:38279647
|
研究论文 | 提出一种名为SPANN的注释方法，用于将单细胞RNA测序数据的细胞类型标签转移到空间转录组数据并发现新型细胞 | SPANN能够自动检测未见细胞类型的新型细胞，同时在已知细胞类型上保持高注释准确性，并通过寻找空间转录组样本与RNA数据原型之间的映射实现细胞类型级别的对齐 | NA | 开发空间转录组数据的注释工具，解决现有方法在细胞类型映射和新细胞检测方面的不足 | 单细胞分辨率空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11732 | 2025-10-07 |
Aberrant c-AMP signalling in richter syndrome revealed by single-cell transcriptome and 3D chromatin analysis
2025-Jan-23, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00723-5
PMID:39849544
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和3D染色质分析揭示Richter综合征中异常的cAMP信号通路 | 首次整合单细胞RNA测序和Hi-C技术分析Richter综合征，揭示染色质重构和cAMP信号异常在疾病转化中的关键作用 | 仅基于单个患者的配对样本进行分析，样本量有限 | 阐明Richter综合征的发病机制 | DLBCL-RS患者的配对样本（CLL和DLBCL细胞） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, Hi-C测序, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据, 3D染色质构象数据 | 超过10,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量染色体构象捕获 | NA | NA |
| 11733 | 2025-10-07 |
Invasive growth of brain metastases is linked to CHI3L1 release from pSTAT3-positive astrocytes
2024-06-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae013
PMID:38271182
|
研究论文 | 本研究揭示了pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过释放CHI3L1促进脑转移瘤侵袭性生长的机制 | 首次发现pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过分泌CHI3L1驱动脑转移瘤的侵袭性生长，并证实STAT3和CHI3L1可作为治疗靶点 | NA | 探究脑转移瘤侵袭模式与pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞的关系及其作为STAT3抑制预测生物标志物的潜力 | 人类脑转移瘤样本、患者来源异种移植模型、小鼠模型、脑切片-肿瘤共培养体系 | 肿瘤学 | 脑转移瘤 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、脑切片-肿瘤共培养实验 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11734 | 2025-10-07 |
Epigenomics-guided precision oncology: Chromatin variants in prostate tumor evolution
2025-Jan-23, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35327
PMID:39853587
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综述 | 探讨表观基因组异质性在前列腺癌中的作用，重点关注染色质变异如何促进肿瘤进化和治疗抵抗 | 提出染色质变异作为表观基因组异质性的基本单位，强调其在细胞可塑性和治疗抵抗中的关键作用 | NA | 支持精准肿瘤学新时代，利用表观基因组学见解改善前列腺癌患者预后 | 前列腺癌 | 表观基因组学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、液体活检表观基因组分析 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11735 | 2025-10-07 |
The role of MRO as an M2 macrophage-associated gene in non-small cell lung cancer: insights into immune infiltration, prognostic significance, and therapeutic implications
2025-Jan-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01817-8
PMID:39838218
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研究论文 | 本研究探讨M2巨噬细胞相关基因MRO在非小细胞肺癌中的免疫浸润、预后意义和治疗潜力 | 首次系统揭示MRO基因作为M2巨噬细胞标志物在非小细胞肺癌中的预后价值和免疫治疗预测意义 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证MRO的具体功能机制 | 探索MRO基因在非小细胞肺癌免疫微环境中的作用和临床意义 | 非小细胞肺癌患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, ESTIMATE算法, TIDE分析, Submap分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的非小细胞肺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11736 | 2025-10-07 |
Characterizing the diabetes-induced pathological changes of the mouse lung by single-cell RNA sequencing
2025-Jan-18, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123408
PMID:39832739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术表征糖尿病对小鼠肺部造成的病理变化 | 首次在晚期糖尿病小鼠肺中发现免疫细胞显著增加且主要为未成熟PMN-MDSCs，并揭示了肺泡细胞在糖尿病早期呈现间质表型及免疫功能下降的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病对肺部病理变化的影响机制 | 糖尿病小鼠模型肺组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11737 | 2025-10-07 |
Novel Integration of Spatial and Single-Cell Omics Data Sets Enables Deeper Insights into IPF Pathogenesis
2025-Jan-13, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13010003
PMID:39846634
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据，识别特发性肺纤维化中与疾病相关的细胞类型和潜在治疗靶点 | 创新性地整合空间多组学与单细胞RNA测序数据，并验证了空间蛋白质组学与单细胞RNA测序整合方法的有效性 | NA | 深入理解特发性肺纤维化发病机制，识别与组织病理区域相关的细胞类型 | 人类特发性肺纤维化肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割质谱, 空间蛋白质组学 | Query方法, Overlap方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 11738 | 2025-10-07 |
Galaxy as a gateway to bioinformatics: Multi-Interface Galaxy Hands-on Training Suite (MIGHTS) for scRNA-seq
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae107
PMID:39775842
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研究论文 | 开发了一个多界面Galaxy实践培训套件(MIGHTS)，用于单细胞RNA测序分析 | 提供并行分析方法，支持图形界面和代码两种操作方式，促进不同编程水平科学家的同步培训 | NA | 解决生物信息学学习曲线陡峭的问题，为生物学家和临床医生提供单细胞分析培训工具 | 生物学家、临床医生和初学生物信息学的研究人员 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Galaxy平台 | Galaxy Training Network，支持Python-based (Scanpy)和R-based (Seurat & Monocle)分析 |
| 11739 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Traits as an Intrinsic Feature of Undifferentiated Cells
2024-Dec-24, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb13010001
PMID:39846630
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研究论文 | 本研究通过分析公开单细胞转录组数据集，探讨间充质表型与未分化细胞状态的内在联系 | 挑战传统观点，提出间充质表型不仅是结构支持特征，更是未分化多能状态的形态学表达 | 基于公开数据集的分析，缺乏实验验证 | 探索间充质表型在胚胎发育和成体器官中与细胞未分化状态的关系 | 早期胚胎阶段和成体组织的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公开单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11740 | 2025-10-07 |
TRIM44, a Novel Prognostic Marker, Supports the Survival of Proteasome-Resistant Multiple Myeloma Cells
2024-08-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171431
PMID:39273003
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM44在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗抵抗机制 | 首次系统阐明TRIM44通过连接泛素-蛋白酶体系统和自噬途径，支持蛋白酶体抑制剂耐药性骨髓瘤细胞生存的新机制 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要进一步的前瞻性研究验证TRIM44的临床价值 | 探讨TRIM44在多发性骨髓瘤预后和治疗抵抗中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 858例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |