单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 11721 - 11740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11721 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell chromatin and transcriptomic profiling of peripheral immune cells in nonsegmental vitiligo
2025-Jun-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf041
PMID:39888372
|
研究论文 | 通过单细胞多组学方法研究非节段型白癜风患者外周免疫细胞的转录组和染色质可及性特征 | 首个对非节段型白癜风患者外周血单核细胞进行的单细胞多组学研究，整合了转录组和染色质可及性数据 | 样本量相对有限（初始队列NSV患者11例，健康对照5例） | 探究非节段型白癜风的系统性免疫失调机制 | 非节段型白癜风患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 初始队列：NSV患者11例，健康对照5例；扩展队列：NSV患者16例，健康对照9例；共分析59,192个PBMCs | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 11722 | 2025-10-06 |
Colorectal cancer cell line-derived organoid model with stem cell properties captures the regrowing state of residual cancer cells after neoadjuvant chemotherapy
2025-Jun-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02567-w
PMID:40537472
|
研究论文 | 本研究建立了结直肠癌细胞系来源的类器官再生模型，用于研究新辅助化疗后残留癌细胞的再生状态 | 首次利用具有癌症干细胞特性的患者来源细胞系建立结直肠癌类器官再生模型，并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能显著抑制肿瘤生长 | 研究仅基于单一患者来源的细胞系，需要更多样本验证结果的普适性 | 研究结直肠癌新辅助化疗后残留癌细胞的再生机制并寻找治疗靶点 | 结直肠癌细胞系来源的类器官模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 单一患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11723 | 2025-10-06 |
Gap junction protein beta 5 interacts with Gαi3 to promote Akt activation and cervical cancer cell growth
2025-Jun-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07768-w
PMID:40537499
|
研究论文 | 本研究探讨了间隙连接蛋白β5在宫颈癌中的表达、功能及其通过Gαi3促进Akt信号通路激活的机制 | 首次发现GJB5与Gαi3相互作用并通过该机制激活Akt-mTOR信号通路促进宫颈癌进展 | NA | 探索GJB5在宫颈癌中的致癌作用及其分子机制 | 宫颈癌细胞系和异种移植模型 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | shRNA、CRISPR/Cas9基因敲除、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库宫颈癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11724 | 2025-10-06 |
scExtract: leveraging large language models for fully automated single-cell RNA-seq data annotation and prior-informed multi-dataset integration
2025-Jun-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03639-x
PMID:40537825
|
研究论文 | 开发了一个利用大语言模型自动化单细胞RNA测序数据分析的框架scExtract | 首次将大语言模型应用于单细胞RNA测序数据的全自动注释和先验信息引导的多数据集整合 | NA | 解决公共单细胞RNA测序数据集分析中的注释和整合挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本, 基因表达数据 | 44万个细胞，来自14个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11725 | 2025-10-06 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2025-Jun-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03648-w
PMID:40533768
|
研究论文 | 开发用于Visium空间转录组学的端到端自动化图像处理工具Vispro，提升成像分析质量 | 首个专门针对10x Visium数据优化的端到端图像处理工具，包含基准标记检测、图像恢复、组织区域检测和分离组织区域分割模块 | NA | 解决空间转录组学中组织学图像因基准标记和背景区域干扰而质量下降的问题 | Visium空间转录组学数据中的组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 11726 | 2025-10-06 |
Two types of regenerative cell populations appear in acute liver injury
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102503
PMID:40345206
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现急性肝损伤中同时出现两种不同的再生细胞群 | 首次揭示在相同再生过程中同时存在两种形态、分化、定位、增殖率和信号响应显著不同的再生细胞群，其中一种通过与坏死组织接触诱导产生 | 研究基于公开数据且仅使用对乙酰氨基酚处理的小鼠模型，可能无法完全代表所有类型的急性肝损伤 | 探究急性肝损伤中肝脏再生的细胞机制 | 对乙酰氨基酚诱导急性肝损伤的小鼠肝脏细胞 | 单细胞生物学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的对乙酰氨基酚处理小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11727 | 2025-10-06 |
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102532
PMID:40499510
|
综述 | 本文回顾了人类多能干细胞在基因表达异质性方面的研究，重点探讨其占据不同亚状态的能力及其对分化结果的影响 | 提出了一种建模荧光标记分布时间序列的新方法，表明亚状态间的转换可能受确定性混沌和基因表达随机波动的共同调控 | NA | 探索干细胞命运决定的动态机制和亚状态转换规律 | 人类多能干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、荧光标记动态分析 | NA | 基因表达数据、荧光标记分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11728 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Cancer and Stromal Cell Heterogeneity Between Center and Invasive Front of Pancreatic Cancer
2025-Jun, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100726
PMID:39889965
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示胰腺癌肿瘤中心与侵袭前沿的癌细胞和癌症相关成纤维细胞的转录异质性 | 首次在空间维度上系统比较胰腺癌肿瘤中心与侵袭前沿的癌细胞和CAFs转录组差异，发现侵袭前沿细胞具有更强的应激反应、增殖、糖酵解和上皮间质转化活性 | 仅分析了4例高分化胰腺癌样本，样本量较小；仅包含常规形态学病例 | 探究胰腺导管腺癌肿瘤内部空间异质性 | 人类胰腺导管腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 数字空间分析，全转录组测序，免疫组织化学验证 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 4例用于空间转录组分析的高分化PDAC，17例用于免疫组化验证的不同分化程度PDAC | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx系统 | GeoMx数字空间分析系统，全转录组检测 |
| 11729 | 2025-10-06 |
New Anti-Fibrotic Strategies for Keloids: Insights From Single-Cell Multi-Omics
2025-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13818
PMID:39902627
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术研究瘢痕疙瘩的细胞异质性和分子机制，识别关键成纤维细胞亚群及其在纤维化中的作用 | 首次在瘢痕疙瘩中识别POSTN阳性间充质成纤维细胞和IGFBP2阳性成纤维细胞两个关键亚群，揭示它们在纤维化中的相反作用 | 样本量较小（仅3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本），需要更大规模研究验证 | 探索瘢痕疙瘩的发病机制并开发新的抗纤维化治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3个瘢痕疙瘩组织, 3个正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11730 | 2025-10-06 |
GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data
2025-Jun, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110283
PMID:40311462
|
研究论文 | 本研究开发了一个结合自编码器和分类器的深度学习框架，通过血液单细胞RNA测序数据识别阿尔茨海默病的生物标志物 | 采用对抗自编码器框架整合差异表达基因和传统方法常忽略的细微遗传变异，首次在PBMC单细胞水平系统分析AD相关基因 | 单核细胞数据存在限制需依赖随机森林分类器处理，样本来源仅限于外周血单核细胞 | 识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器, 随机森林 | 基因表达数据 | AD患者和正常对照的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11731 | 2025-10-06 |
Targeting BATF2-RGS2 axis reduces T-cell exhaustion and restores anti-tumor immunity
2025-May-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02351-5
PMID:40442751
|
研究论文 | 本研究揭示BATF2-RGS2轴在调控T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 首次发现BATF2通过转录调控RGS2驱动T细胞耗竭，并证明靶向该轴可增强抗肿瘤免疫 | 样本量较小（6例患者），主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究RGS2在肺癌免疫调控中的作用及BATF2-RGS2轴的调控机制 | 肺癌患者样本、小鼠模型、CD8+ T细胞、3LL癌细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析、荧光素酶报告基因检测、体外共培养 | 基因敲除小鼠模型、肿瘤类器官模型 | 转录组数据、细胞实验数据 | 6例肺癌患者，多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11732 | 2025-10-06 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
|
研究论文 | 本研究首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴管，并揭示其在关节炎和疼痛中的作用机制 | 首次在颞下颌关节中鉴定出滑膜淋巴系统，并证明淋巴功能障碍会驱动关节炎和疼痛的发生 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究颞下颌关节滑膜淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 | 基因报告小鼠、人类组织样本 | 生物医学研究 | 颞下颌关节关节炎 | 基因报告技术、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11733 | 2025-10-06 |
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656468
PMID:40502104
|
研究论文 | 开发了一种结合高通量基因编辑和单细胞RNA测序的技术平台，用于斑马鱼胚胎的大规模遗传筛选 | 将多重混合CRISPR液滴技术与多重单细胞RNA测序相结合，实现了在脊椎动物胚胎中进行大规模基因功能筛选 | 技术主要应用于斑马鱼胚胎模型，在其他脊椎动物中的应用仍需验证 | 建立可扩展的基因功能映射平台，研究脊椎动物发育过程中的基因功能 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞测序技术 | 发育生物学 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1000个斑马鱼胚胎，靶向50个转录调控因子 | NA | 单细胞RNA测序 | MIC-Drop-seq | 多重混合CRISPR液滴与多重单细胞RNA测序结合平台 |
| 11734 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
|
研究论文 | 利用空间转录组技术分析小鼠肾脏冷缺血损伤期间的时空转录组变化 | 首次在肾脏冷缺血损伤中应用空间转录组技术进行全转录组表征，并开发了计算工作流程识别区室特异性变化 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 揭示冷缺血损伤的分子机制及其对肾脏移植结局的影响 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肾脏样本（0-48小时冷缺血时间系列） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11735 | 2025-10-06 |
Bridging Large Language Models and Single-Cell Transcriptomics in Dissecting Selective Motor Neuron Vulnerability
2025-May-12, ArXiv
PMID:40463696
|
研究论文 | 提出一个利用大语言模型和单细胞转录组学分析选择性运动神经元易损性的新框架 | 首次将基因特异性文本注释与单细胞RNA测序数据结合，通过表达加权平均生成生物学背景化的细胞嵌入表示 | NA | 解析选择性运动神经元易损性，改进细胞类型识别和功能分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 自然语言处理,计算生物学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型,BioBERT,SciBERT | 文本,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11736 | 2025-10-06 |
Oligodendroglia vulnerability in the human dorsal striatum in Parkinson's disease
2025-05-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-025-02884-5
PMID:40323467
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示帕金森病患者背侧纹状体中少突胶质细胞的脆弱性 | 首次在人类帕金森病背侧纹状体中系统鉴定出15种少突胶质细胞亚类，其中4种为疾病特异性群体，并发现其热休克蛋白过表达、髓鞘形成异常和细胞通讯受损等特征 | 研究样本量未明确说明，仅提及分析了约20万个少突胶质细胞核 | 阐明帕金森病中少突胶质细胞的多样性及其在疾病中的变化 | 人类尾状核和壳核（背侧纹状体）组织样本 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约200,000个少突胶质细胞核（来自帕金森病患者和对照脑组织捐赠者） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11737 | 2025-10-06 |
General and individualized changes in T cell immunity during aging
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkae033
PMID:40073079
|
综述 | 本文综述了T细胞免疫在衰老过程中的普遍性和个体化变化 | 系统区分了T细胞衰老的普遍性变化（影响所有个体）和特异性变化（个体独有），并整合了单细胞测序技术的新发现 | NA | 探讨衰老过程中T细胞亚群、转录组和TCR谱系的变化规律 | 人类T细胞免疫系统 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11738 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia
2025-May, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70051
PMID:40346907
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析前列腺癌和良性前列腺增生患者外周血单核细胞的转录组特征差异 | 首次在单细胞水平揭示前列腺癌与良性前列腺增生患者外周血免疫细胞的转录组差异和免疫微环境特征 | 样本量较小（4例前列腺癌和3例良性前列腺增生），需要更大规模研究验证 | 识别区分前列腺癌和良性前列腺增生的转录组生物标志物 | 前列腺癌和良性前列腺增生患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析、通路分析、CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 7例患者（4例前列腺癌，3例良性前列腺增生） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11739 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100076
PMID:40453149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示T细胞前淋巴细胞白血病中非恶性B细胞与肿瘤细胞共享的克隆特征 | 首次在单细胞水平证实T-PLL中非恶性B细胞与克隆性T细胞存在共享突变 | 样本量有限（16例患者），仅对9例患者获得复发样本 | 阐明T细胞前淋巴细胞白血病的克隆起源和进化动力学 | 16例T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 靶向二代测序, 液滴数字PCR, 单细胞多组学分析 | NA | 基因组DNA, 细胞表面蛋白标记 | 16例T-PLL患者，其中9例有配对的诊断和复发样本 | Mission Bio | 单细胞多组学 | Tapestri Platform | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 11740 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.10.579748
PMID:38405728
|
研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在其它哺乳动物中验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |