单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11701	2024-08-05	Aberrant follicular regulatory T cells associate with immunoglobulin hyperproduction in nasal polyps with ectopic lymphoid tissues 2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.913 PMID:38072196	研究论文	这篇文章探讨了鼻息肉中异位淋巴组织中的卵泡调节性T细胞（TFR细胞）的存在和功能	研究首次揭示了鼻息肉中TFR细胞的特征和功能缺失，并表明维生素D治疗可以逆转其抑制功能	对TFR细胞在外周病变组织中的作用理解仍然有限	调查鼻息肉中TFR细胞的存在、表型和功能	鼻息肉中的TFR细胞	免疫学	鼻息肉	单细胞RNA测序，免疫荧光染色，流式细胞术，ELISA	NA	细胞数据	从鼻息肉中分离的多种T细胞亚群
11702	2024-08-05	Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets 2024-Mar-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-47158-y PMID:38553478	研究论文	该文章介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI，用于从scRNA-seq数据集中识别细胞谱系	GEMLI能够从缺乏谱系信息的scRNA-seq数据中可靠地识别小到中型细胞谱系，并重建多细胞结构	该方法在技术上复杂，通常受限于时间分辨率	研究细胞分化过程中的遗传信息传递	人类乳腺癌活检样本中的细胞谱系	数字病理学	乳腺癌	scRNA-seq	NA	转录组数据	人类乳腺癌活检样本
11703	2024-08-04	Research progress in isolation and identification of rumen probiotics 2024, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcimb.2024.1411482 PMID:38836057	研究论文	本文综述了瘤胃益生菌的分离和鉴定的经典技术及其最新进展	介绍了基于微滴的高通量细胞培养和单细胞测序的新技术及其在微生物培养和鉴定中的应用	大部分潜在益生菌仍未被成功培养，限制了相关研究的深入	旨在提供技术参考以促进瘤胃微生物学领域的发展	主要针对瘤胃益生菌的分离和鉴定技术	数字病理学	NA	高通量培养、单细胞测序	NA	NA	NA
11704	2024-08-05	Revealing molecular and cellular heterogeneity in hypopharyngeal carcinogenesis through single-cell RNA and TCR/BCR sequencing 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1310376 PMID:38720887	研究论文	本文揭示了在低级和高级上皮内瘤变到癌变过程中，头颈部肿瘤HSCC的分子和细胞异质性	通过单细胞RNA和TCR/BCR测序，首次构建了不同疾病阶段的细胞动态转录组图谱，并揭示了主要分子	尚未完全理解在肿瘤形成过程中TME内不同细胞簇的具体变化及其影响	探究HSCC发展过程中的肿瘤微环境动态变化及机制	对来自不同阶段的HSCC组织样本中的60854个细胞进行研究	数字病理学	喉下癌	单细胞RNA测序和TCR/BCR测序	NA	细胞	九个组织样本
11705	2024-08-05	Unraveling metabolic characteristics and clinical implications in gastric cancer through single-cell resolution analysis 2024, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2024.1399679 PMID:38831933	研究论文	本研究通过单细胞分辨率分析揭示了胃癌的代谢特征及其临床意义	利用单细胞RNA测序技术，首次深入探讨了不同细胞类型在胃癌中的代谢路径和调控机制	研究的局限性未在摘要中提及	综合研究胃癌中不同细胞类型的代谢路径及其调控机制	胃癌肿瘤样本和正常样本中的各种细胞类型	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	无监督聚类	RNA数据	NA
11706	2024-08-05	Single-Cell Multiomics 2023-08-10, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1 DOI:10.1146/annurev-biodatasci-020422-050645 PMID:37159875	review	本综述讨论了单细胞多组学技术和计算集成方法，旨在结合不同生物数据以获得更深入的生物学见解	提出了新颖的单细胞技术以测量基因组、表观基因组、蛋白组和空间数据，并探索计算集成方法	NA	旨在通过集成不同模态的数据来加深对细胞生物学的理解	探讨不同单细胞技术和计算集成方法	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因组、表观基因组、蛋白组、空间数据	NA
11707	2024-08-05	Emergence of highly profibrotic and proinflammatory Lrat+Fbln2+ HSC subpopulation in alcoholic hepatitis 2023-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1002/hep.32793 PMID:36181700	研究论文	本研究识别了在酒精性肝炎中HSC的高纤维化和促炎性亚群	发现了Lrat+Fbln2+细胞亚群在酒精性肝炎中的显著扩展及其功能	实验主要集中在小鼠模型，可能与人类疾病表现有差异	研究酒精性肝炎中HSC和门静脉成纤维细胞的相对作用	小鼠模型中的胶原蛋白1α1表达细胞亚群	数字病理学	肝病	单细胞RNA测序	NA	NA	涉及Col1a1-GFP小鼠的多种处理，包括酒精性肝炎、CCl4和胆管结扎
11708	2024-08-05	The mitochondrial unfolded protein response regulates hippocampal neural stem cell aging 2023-06-06, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2023.04.012 PMID:37146607	研究论文	这篇文章探讨了线粒体未折叠蛋白反应如何影响海马神经干细胞的衰老	创新点在于首次将线粒体蛋白折叠压力与神经干细胞衰老的关系建立起来	该研究可能仅限于小鼠模型，缺乏对人类的直接验证	研究线粒体蛋白折叠压力在神经干细胞衰老中的作用	年轻和老年小鼠的海马神经干细胞	数字病理学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	年轻和老年小鼠的单细胞样本
11709	2024-08-04	Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics 2023-05-11, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.86325 PMID:37166108	研究论文	本研究使用单细胞转录组学剖析了非同步细胞群体中非洲锥虫血流型和前周期型的细胞周期	该研究首次在未分选或同步的细胞中获得了高分辨率的细胞周期调控转录组，并提出了一种高效的冻融策略用于冷冻保存单细胞的转录组分析	研究中使用的细胞群体为非同步，可能影响结果的精确性	研究非洲锥虫不同生物型的细胞周期及其调控机制	分析了血流型和前周期型锥虫的细胞周期相关转录组	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组	NA
11710	2024-08-04	Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance 2023-May-03, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1 PMID:37205391	研究论文	本研究通过单细胞转录组学发现了肺毛细血管内皮细胞的新亚群及其功能意义	识别出五种具有不同分子特征和角色的新亚群，包括与血管分区和再生修复相关的细胞	未提及具体的实验数据或样本特征，可能影响所发现细胞的普遍性	探索肺毛细血管内皮细胞的多样性及其在肺部疾病中的作用	新鉴定的肺毛细血管内皮细胞亚群	数字病理学	肺癌	单细胞转录组学 (scRNAseq)	NA	基因表达数据	NA
11711	2024-08-04	IL-13-associated epithelial remodeling correlates with clinical severity in nasal polyposis 2023-05, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2022.12.826 PMID:36736797	研究论文	这篇文章探讨了上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系	本研究首次通过单细胞测序和RNA测序分析，揭示了IL-13介导的上皮重塑与鼻息肉临床严重程度之间的相关性	研究的样本主要来自于慢性鼻窦炎患者，未涵盖所有潜在的鼻窦炎类型及其相应的临床数据	本研究旨在理解上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系	研究对象为慢性鼻窦炎患者，比较有鼻息肉和无鼻息肉患者的上皮细胞特征	数字病理学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	参与研究的样本包括来自慢性鼻窦炎患者的筛查样本和健康对照样本
11712	2024-08-04	Apoptotic cell fragments locally activate tingible body macrophages in the germinal center 2023-03-16, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2023.02.004 PMID:36868219	研究论文	文章探讨了凋亡细胞碎片如何在生发中心局部激活蜕变体巨噬细胞	研究揭示了蜕变体巨噬细胞的前体来源及其对凋亡细胞的捕获机制	本文没有讨论其他类型巨噬细胞的潜在作用	研究凋亡细胞在免疫反应中的作用及其对巨噬细胞的影响	研究对象为在淋巴结的蜕变体巨噬细胞及其与凋亡细胞的相互作用	数字病理学	自身免疫病	单细胞转录组学	NA	细胞	免疫淋巴结中的单细胞簇
11713	2024-08-05	A single-cell atlas of murine reproductive tissues during preterm labor 2023-01-31, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111846 PMID:36599348	研究论文	本文生成了小鼠生殖组织在早产劳动期间的单细胞图谱。	使用单细胞RNA测序技术揭示了早产劳动对特定免疫和非免疫细胞亚群转录组特征的影响	研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于人类早产的情况	揭示早产劳动中生殖组织的细胞景观和细胞通讯	小鼠子宫、蜕膜和宫颈的单细胞数据	数字病理学	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	小鼠生殖组织的多个细胞类型
11714	2024-08-04	Statistical Inference for High-Dimensional Generalized Linear Models with Binary Outcomes 2023, Journal of the American Statistical Association IF:3.0Q1 DOI:10.1080/01621459.2021.1990769 PMID:37366472	研究论文	本文提出了一种高维二元广义线性模型统计推断的统一框架	引入了新的下界技术，提供了自适应的最优置信区间分析，并展示了对回归向量稀疏性的适应性	关于已知与未知设计分布的情况的讨论较为有限	研究高维二元广义线性模型的统计推断方法	研究高维二元广义线性模型，及其置信区间和假设检验的构建	统计	NA	仿真研究，单细胞RNA序列分析	广义线性模型	RNA-seq数据	单细胞RNA-seq数据集中的样本
11715	2024-08-04	Multimodal single-cell and whole-genome sequencing of small, frozen clinical specimens 2023-01, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-022-01268-9 PMID:36624340	研究论文	本文展示了从小型冷冻临床标本中进行多模态单细胞和全基因组测序的可能性	首次将多模态单核RNA/T细胞受体测序、空间转录组学和全基因组测序应用于小型冷冻组织	仍然面临一些实际和预分析挑战，可能影响方法的广泛临床应用	探索小型冷冻临床标本中进行单细胞基因组学的可行性和应用	研究对象包括皮肤黑色素瘤患者以及与之匹配的全基因组数据	数字病理学	皮肤黑色素瘤	snRNA/TCR测序, 全基因组测序	NA	基因组数据	从KEYNOTE-001试验中收集的多个黑色素瘤样本和与其匹配的全基因组数据
11716	2024-08-05	Cell types and molecular architecture of the Octopus bimaculoides visual system 2022-12-05, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2022.10.015 PMID:36318923	研究论文	该论文呈现了章鱼视觉系统的单细胞分子图谱	首次系统性描绘了章鱼视网膜的细胞类型及其分子特征	研究可能在未覆盖的细胞类型和功能连接性方面存在局限	探索章鱼视觉系统的细胞类型和分子架构	章鱼的视觉神经元及其分子特征	数字病理学	NA	单细胞RNA测序，RNA原位杂交	NA	细胞	NA
11717	2024-08-05	Single-cell sequencing: promises and challenges for human genetics 2022-Dec, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V IF:0.8Q4 DOI:10.1515/medgen-2022-2156 PMID:38836091	综述	这篇文章描述了单细胞测序在人的遗传学中的现状及其应用	该技术承诺在宏观规模上功能性地注释人类基因组中的每个区域及其所有可能的变异	文章未具体提及单细胞测序的局限性	研究单细胞测序在人的遗传学中的作用和应用	讨论该技术如何应用于表征和监测疾病，开发人类细胞图谱，以及注释基因组	NA	NA	单细胞测序	NA	NA	NA
11718	2024-08-05	The Vasculature in Pulmonary Fibrosis 2022-Dec, Current tissue microenvironment reports DOI:10.1007/s43152-022-00040-9 PMID:36712832	review	本文回顾了特发性肺纤维化（IPF）中血管的变化及其对纤维化病理生理的影响	此文通过单细胞RNA测序的进展，更好地表征了肺内皮细胞类型，并识别了IPF患者的血管变化	需要更多的研究来进一步定义这些血管变化的功能角色	研究血管在特发性肺纤维化中的作用及其变化	特发性肺纤维化患者的肺组织	数字病理学	肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	组织	涉及特发性肺纤维化患者的肺组织
11719	2024-08-05	Spatial transcriptomics demonstrates the role of CD4 T cells in effector CD8 T cell differentiation during chronic viral infection 2022-11-29, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111736 PMID:36450262	研究论文	本研究利用空间转录组学探讨了CD4 T细胞在慢性病毒感染中对效应CD8 T细胞分化的作用	揭示了在CD4细胞耗竭情况下，免疫调节CD4 T细胞相较于产生IL-21的Tfh细胞的数量占优，从而影响CD8 T细胞的应答	未详细探讨其他细胞类型在T细胞相互作用中可能的作用	研究CD4 T细胞异质性及其在慢性病毒感染中的功能	CD4和CD8 T细胞及其在慢性病毒感染中的相互作用	数字病理学	NA	空间转录组学，单细胞RNA测序	NA	NA	NA
11720	2024-08-05	TrkA+ Neurons Induce Pathologic Regeneration After Soft Tissue Trauma 2022-11-18, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1093/stcltm/szac073 PMID:36222619	研究论文	本研究探讨了TrkA+神经元在软组织创伤后诱导病理再生的作用	首次发现NGF响应的TrkA表达神经在软组织创伤后的侵袭与异位骨形成相关	研究主要基于小鼠模型，临床适用性尚待验证	研究TraK信号调控对创伤后异位骨形成的影响	使用小鼠模型研究异位骨形成及相关神经元活动	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	影像，组织学	小鼠模型，具体样本量未定