单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11701 - 11720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11701 | 2024-08-05 |
Whole transcriptome analysis to identify non-coding RNA regulators and hub genes in sperm of non-obstructive azoospermia by microarray, single-cell RNA sequencing, weighted gene co-expression network analysis, and mRNA-miRNA-lncRNA interaction analysis
2024-Jun-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10506-9
PMID:38858625
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研究论文 | 本研究通过全转录组分析识别非梗阻性无精症精子中的非编码RNA调节因子和核心基因 | 发现并识别了与非梗阻性无精症相关的新的关键基因和非编码RNA | 样本量仅限于三名无精症患者，可能限制结果的普遍适用性 | 识别参与非梗阻性无精症的关键基因和非编码RNA，改善遗传诊断 | 三名经过遗传筛查未发现精子问题的无精症患者的精子样本 | 数字病理学 | 无精症 | 微阵列技术，单细胞RNA测序，权重基因共表达网络分析 | NA | 转录组数据 | 三名无精症患者的样本 |
| 11702 | 2024-08-04 |
Integrative molecular and spatial analysis reveals evolutionary dynamics and tumor-immune interplay of in situ and invasive acral melanoma
2024-Jun-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.012
PMID:38759655
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研究论文 | 本研究揭示了体内和侵袭性肢端黑色素瘤的进化动态及肿瘤-免疫相互作用 | 提供了针对147个肢端黑色素瘤的综合分子和空间特征分析，揭示了垂直侵袭和区域扩展模式 | 本研究的样本量和背景可能无法完全代表所有类型的肢端黑色素瘤 | 探讨肢端黑色素瘤从原位到侵袭性发展的进化动态 | 147个肢端黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因组学、整体和单细胞转录组学、空间转录组学和蛋白质组学 | NA | NA | 147个肢端黑色素瘤样本 |
| 11703 | 2024-08-05 |
Pathomics and single-cell analysis of papillary thyroid carcinoma reveal the pro-metastatic influence of cancer-associated fibroblasts
2024-Jun-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12459-4
PMID:38858612
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研究论文 | 本研究分析了乳头状甲状腺癌中癌相关成纤维细胞对转移的促进影响 | 揭示了CAFs在乳头状甲状腺癌中的新作用，特别是其在转移过程中与肿瘤细胞的相互作用 | 未明确讨论CAFs的具体机制以及在不同患者中的变异性 | 探讨乳头状甲状腺癌中癌相关成纤维细胞的作用及其对淋巴结转移的影响 | 包括984名乳头状甲状腺癌患者的术后病理切片和两种细胞系（TPC1和K1）的体外实验 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，HE染色，深度学习 | NA | 病理切片数据，RNA测序数据 | 984名乳头状甲状腺癌患者，2种细胞系 |
| 11704 | 2024-08-05 |
Integrated multi-omics analyses revealed the association between rheumatoid arthritis and colorectal cancer: MYO9A as a shared gene signature and an immune-related therapeutic target
2024-Jun-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12466-5
PMID:38858644
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研究论文 | 本研究探讨了类风湿关节炎与结直肠癌之间的关系及共享基因特征 | 本研究首次揭示了MYO9A作为类风湿关节炎与结直肠癌的共享基因标志物及免疫相关治疗靶点的潜力 | 本研究未能详细探讨类风湿关节炎对结直肠癌的精确机制和影响 | 研究目的在于探索类风湿关节炎与结直肠癌之间的关联及其机制 | 研究对象包括类风湿关节炎和结直肠癌相关基因 | 数字病理学 | 类风湿关节炎，结直肠癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 11705 | 2024-08-05 |
Comprehensive characterization of B7 family members in breast cancer: B7-H5 switch reverses breast cancer from "immuno-cold" into "immuno-hot" status
2024-Jun-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03392-4
PMID:38858701
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研究论文 | 本研究综合分析了B7家族成员在乳腺癌中的表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次阐明了B7-H5在乳腺癌免疫微环境中的重要作用，并提出其作为将肿瘤免疫状态从'免疫冷'转变为'免疫热'的开关 | 样本量较小，仅涉及来自一家医院的10名乳腺癌患者 | 研究B7家族成员在乳腺癌肿瘤免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者的B7家族分子及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和多重免疫组化 (mIHC) | NA | RNA序列数据和组织样本 | 10名乳腺癌患者 |
| 11706 | 2024-08-05 |
Detection of novel PPP1R1B::STARD3 fusion transcript in acute myeloid leukemia: a case report
2024-Jun-05, Journal of medical case reports
IF:0.9Q3
DOI:10.1186/s13256-024-04536-w
PMID:38835078
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case report | 本文首次报告了急性髓性白血病患者中PPP1R1B::STARD3融合转录本的存在 | 首次发现PPP1R1B::STARD3融合转录本在急性髓性白血病中的作用 | 研究仅基于单一病例，缺乏大规模样本支持 | 探索PPP1R1B::STARD3融合转录本在急性髓性白血病中的存在及其可能机制 | 一名12岁男孩急性髓性白血病患者 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | RNA测序 | NA | 转录本 | 1 |
| 11707 | 2024-08-04 |
System analysis based on Anoikis-related genes identifies MAPK1 as a novel therapy target for osteosarcoma with neoadjuvant chemotherapy
2024-Jun-04, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-07547-2
PMID:38835052
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研究论文 | 该文章探讨了与Anoikis相关的基因，并确定MAPK1作为神经母细胞瘤的新治疗靶点 | 首创基于Anoikis相关基因的风险评分模型，并鉴定MAPK1作为新的治疗靶点 | 尚未探讨Anoikis在骨肉瘤中的具体机制 | 评估Anoikis相关基因对骨肉瘤患者预后的影响 | 研究对象为骨肉瘤患者，并针对其肿瘤微环境和药物敏感性进行分析 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 11708 | 2024-08-05 |
Glucagon-like peptide 1 receptor is a T cell-negative costimulatory molecule
2024-Jun-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.05.001
PMID:38838642
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研究论文 | 本文研究了GLP-1R在T淋巴细胞免疫应答中的角色 | 发现GLP-1R作为T细胞的负共刺激分子，并且其信号通路可以延长异种移植物存活 | 目前仅在小鼠模型中进行测试，尚未在人类研究中验证 | 探讨GLP-1R在免疫应答中对T淋巴细胞的影响 | 主要针对在异移植过程中表达GLP-1R的T淋巴细胞进行研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11709 | 2024-08-04 |
Gut-Derived Exosomes Mediate the Microbiota Dysbiosis-Induced Spermatogenesis Impairment by Targeting Meioc in Mice
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310110
PMID:38526201
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研究论文 | 这项研究展示了肠来源的外泌体如何通过靶向Meioc导致肠道微生物失调引起的精子发生障碍 | 本研究首次揭示了非生殖组织来源的外泌体在精子发生调节中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚需在人类模型中验证 | 探讨肠道微生物失调对小鼠精子发生的影响及其机制 | 本研究以肠道微生物失调的小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 肥胖症和肠道炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 循环外泌体 | 使用肠道微生物失调的小鼠与野生小鼠进行对比 |
| 11710 | 2024-08-04 |
The 9p21.3 coronary artery disease risk locus drives vascular smooth muscle cells to osteochondrogenic state
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.25.595888
PMID:38853913
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研究论文 | 这篇文章探讨了9p21.3 CAD风险位点如何驱动血管平滑肌细胞转变为骨软骨生成状态 | 本研究揭示了9p21.3风险单倍型促使VSMCs获取具有骨软骨生成特征的新细胞状态，并识别了一组在这一转录程序中至关重要的标志基因 | 在本文中没有提及具体的局限性 | 研究9p21.3风险位点及其在VSMCs中导致疾病倾向状态的作用 | 诱导性多能干细胞源的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 使用了来自风险和非风险供体的iPSC细胞系 |
| 11711 | 2024-08-04 |
Investigating the basis of lineage decisions and developmental trajectories in the dorsal spinal cord through pseudotime analyses
2024-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202209
PMID:38804879
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研究论文 | 本研究通过伪时间分析探讨了背侧脊髓内神经元的谱系决策和发育轨迹 | 本研究结合小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内神经元单细胞RNA测序图谱和伪时间分析，提供了一种新的资源来研究背侧内神经元的命运特异性 | 本研究主要是基于小鼠模型，可能无法完全适用于其他物种 | 研究背侧内神经元的发育过程和基因表达时机 | 小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11712 | 2024-08-04 |
Clustering and visualization of single-cell RNA-seq data using path metrics
2024-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012014
PMID:38809943
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的单细胞RNA-seq数据分析框架，称为单细胞路径度量分析（scPMP），以改善聚类效果。 | 该文章的创新点在于提出了一种基于功率加权路径度量的新方法，能够更好地保持局部聚类结构和全局数据几何。 | 没有提到具体的研究限制 | 该研究旨在改善单细胞数据分析中的聚类质量和几何保真度。 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据，涉及组织和癌症组成的高分辨率表征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 路径度量结合多维缩放 | NA | NA |
| 11713 | 2024-08-05 |
Single-cell and single-nucleus RNA-sequencing from paired normal-adenocarcinoma lung samples provide both common and discordant biological insights
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011301
PMID:38814983
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研究论文 | 本文比较了配对正常-腺癌肺样本中单细胞RNA测序和单核RNA测序的生物学洞见 | 首次系统比较了scRNA-seq和snRNA-seq在正常和腺癌肺组织样本中的一致性和差异性 | 免疫细胞去除的额外操作影响了细胞活力，并放大了与应激反应相关的转录特征 | 探讨正常肺组织向腺癌组织转变的细胞过渡，以及不同RNA测序技术所捕获的生物信息 | 配对的正常及腺癌人类肺样本 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 细胞转录组 | 160,621个细胞/细胞核 |
| 11714 | 2024-08-05 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 该文章识别了新生儿肺发育过程中肌成纤维细胞分化程序 | 文章创新性地识别了不同于其他间质细胞类型的肌成纤维细胞分化程序 | 文章未提及具体的实验限制或局限性 | 研究新生儿肺中的间质细胞类型及其发育过程 | 研究对象为新生小鼠肺中的间质细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用Fgf18CreER谱系追踪小鼠线，有多个亚型细胞 |
| 11715 | 2024-08-05 |
Long noncoding RNA Malat1 protects against osteoporosis and bone metastasis
2024-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46602-3
PMID:38493144
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研究论文 | 本研究发现长链非编码RNA Malat1在骨质疏松和骨转移中的保护作用 | 本研究首次揭示了MALAT1在骨吸收过程中的关键调控角色及其对骨质疏松和肿瘤骨转移的保护机制 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用性尚需进一步验证 | 探讨MALAT1在生理和病理过程中对骨质疏松及骨转移的影响 | 研究了MALAT1缺失对小鼠骨质疏松和黑色素瘤及乳腺肿瘤细胞骨转移的影响 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 临床骨样本 | NA |
| 11716 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Transcriptome of Bovine Milk Somatic Cells
2024-03-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15030349
PMID:38540408
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析牛奶中细胞，探讨乳腺的生物学特性 | 首次在单细胞水平上分析了高产乳牛的牛奶转录组 | 研究仅使用了两只荷斯坦奶牛的样本，结果的普遍适用性可能有限 | 探索牛奶产生过程中的细胞级机制 | 来自两只荷斯坦奶牛的乳液样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 2只牛的乳液样本，获得9313和14544个细胞 |
| 11717 | 2024-08-04 |
Commensal protist Tritrichomonas musculus exhibits a dynamic life cycle that induces extensive remodeling of the gut microbiota
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae023
PMID:38366179
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研究论文 | 本研究探讨了共生原生动物Tritrichomonas musculus与肠道细菌之间的动态关系及其对肠道微生物群的影响 | 首次揭示了Tritrichomonas musculus的不同生活阶段及其通过营养竞争对细菌的影响 | 研究主要在小鼠模型上进行，可能无法直接推广至其他物种 | 提高对共生原生动物与肠道细菌之间复杂关系的理解 | Tritrichomonas musculus及其与肠道细菌的相互作用 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 微生物组数据 | 健康和缺乏B细胞的小鼠 |
| 11718 | 2024-08-04 |
Magnetic Yeast Glucan Particles for Antibody-Free Separation of Viable Macrophages from Drosophila melanogaster
2024-01-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.3c01199
PMID:38048070
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研究论文 | 本文介绍了一种无标签和无抗体的分离小鼠巨噬细胞的新方法 | 通过喷雾干燥的方法，成功制备了具有较高铁氧体纳米颗粒含量的酵母葡聚糖颗粒，从而实现巨噬细胞的有效分离 | 目前仅针对果蝇的巨噬细胞，其对其他生物的适用性尚未验证 | 开发一种新方法，用于分离活体巨噬细胞以进行后续分析 | 以果蝇为研究对象，分离其体内的活体巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 喷雾干燥 | NA | NA | NA |
| 11719 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomic and immunological profiling reveals new diagnostic and prognostic models for cutaneous melanoma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1389550
PMID:38863979
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研究论文 | 本研究结合转录组和免疫学分析，为皮肤黑色素瘤提供了新的诊断和预后模型 | 通过整合转录组数据和免疫学特征，识别了与SKCM相关的新模型基因，增强了对其分子机制的理解 | 该研究依赖于公开的数据库，可能存在数据异质性及样本选择偏倚 | 深入理解皮肤黑色素瘤的分子机制，并开发新的诊断和预后模型 | 利用TCGA和GEO数据库的转录组数据、突变和临床数据以及单细胞测序数据分析 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序、单细胞测序、LASSO机器学习算法 | NA | 基因表达数据 | SKCM队列中的多个样本，具体样本数量未提供 |
| 11720 | 2024-08-05 |
The dysadherin/FAK axis promotes individual cell migration in colon cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.86699
PMID:38725858
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研究论文 | 本研究探讨了dysadherin/FAK轴如何促进结肠癌细胞的迁移和侵袭 | 发现dysadherin通过FAK信号通路调节癌细胞迁移的分子机制 | 本研究主要基于细胞模型，临床相关性需要进一步验证 | 探讨dysadherin在结肠癌细胞迁移中的作用 | 结肠癌患者的细胞和肿瘤模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自结肠癌患者的单细胞数据 |