单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 11681 - 11700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11681 | 2024-08-05 |
Identification of novel biomarkers related to neutrophilic inflammation in COPD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410158
PMID:38873611
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研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学预测和实验验证识别与COPD中中性粒细胞炎症相关的新型中心基因 | 发现了9个与COPD相关的新型中心基因，并确定了其中两个基因为 COPD 的风险因素 | 数据分析依赖于现有的数据库和特定的样本，可能不完全代表所有COPD患者的特征 | 识别与慢性阻塞性肺病（COPD）中中性粒细胞炎症相关的新型生物标志物 | 本研究的研究对象是COPD患者的细胞和基因组数据 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和RNA测序（RNA-seq） | 无 | 基因表达数据 | 在COPD患者和对照组中使用了临床样本和公共数据库数据 |
| 11682 | 2024-08-05 |
Systematic Analysis of Tumor Stem Cell-related Gene Characteristics to Predict the PD-L1 Immunotherapy and Prognosis of Gastric Cancer
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究开发了一种与肿瘤干性相关的基因预后模型，用于评估胃癌患者的预后和免疫治疗反应性 | 提出了一种基于9个基因的干性标志物，以进行胃癌预后的准确预测 | 本研究局限于单细胞RNA测序数据，可能未全面涵盖所有相关的生物标志物 | 开发一种基于干性相关基因的预后模型，评估胃癌的预后和免疫治疗反应性 | 胃癌患者的肿瘤干性相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 预后模型 | 基因表达数据 | 使用了GEO数据库中的胃癌患者数据 |
| 11683 | 2024-08-04 |
Immune profiling of murine cardiac leukocytes identifies triggering receptor expressed on myeloid cells 2 as a novel mediator of hypertensive heart failure
2023-10-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad093
PMID:37314125
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研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中Trem2在高血压性心力衰竭中的新型介导作用 | 发现Trem2在高血压性心力衰竭中的心脏保护作用，并表明其在心脏免疫细胞中的调控 | 尚未确定Trem2在高血压性心力衰竭具体机制的详细信息 | 研究心脏免疫细胞在HFpEF中的改变及其潜在的治疗策略 | 高血压性心力衰竭小鼠模型及其心脏免疫细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行实验 |
| 11684 | 2024-08-04 |
MuDCoD: multi-subject community detection in personalized dynamic gene networks from single-cell RNA sequencing
2023-10-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad592
PMID:37740957
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研究论文 | 本文提出MuDCoD算法用于在个性化动态基因网络中进行多主体社区检测 | 本研究开发了MuDCoD，通过谱聚类框架促进不同主体及时间点网络之间的信息共享 | 暂无明显的研究限制信息 | 研究如何利用scRNA-seq数据在基因共表达网络水平上进行个性化动态社区检测 | 个性化动态基因网络中的基因簇和社区 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谱聚类 | 基因表达数据 | 涉及多名个体的群体规模单细胞RNA-seq数据集 |
| 11685 | 2024-08-05 |
Gene signature from cutaneous autoimmune diseases provides potential immunotherapy-relevant biomarkers in melanoma
2023-09-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42238-3
PMID:37700026
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研究论文 | 本研究探讨了自身免疫性皮肤病中T细胞基因特征在黑色素瘤免疫治疗中的应用潜力 | 提出了自身免疫性皮肤病的基因特征可以作为预测黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物 | 研究可能限制于特定类型的自身免疫性皮肤病，样本数量和多样性尚需进一步验证 | 探讨自身免疫性皮肤病的免疫细胞在黑色素瘤免疫治疗中的有效性 | 自身免疫性皮肤病（系统性红斑狼疮、特应性皮炎、银屑病）中的T细胞基因特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种自身免疫性皮肤病的样本，具体数量未在摘要中明确 |
| 11686 | 2024-08-05 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
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研究论文 | 本文重新分析了单细胞RNA测序数据，未能支持小鼠非神经节细胞中存在单纯疱疹病毒1型的潜伏感染。 | 研究证明了在小鼠模型中，数据分析的不准确性导致了对潜伏病毒存在的错误结论。 | 该研究依赖于现有数据，未能提供新的实验数据。 | 重新分析与单纯疱疹病毒潜伏感染相关的RNA测序数据。 | 小鼠模型中的非神经节细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA |
| 11687 | 2024-08-07 |
Chemoenzymatic Measurement of LacNAc in Single-Cell Multiomics Reveals It as a Cell-Surface Indicator of Glycolytic Activity of CD8+ T Cells
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c02602
PMID:37276352
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研究论文 | 本文报道了一种化学酶法用于单细胞水平检测N-乙酰乳糖胺（LacNAc），并通过特定DNA条形码标记LacNAc，揭示了其在CD8+ T细胞中的糖酵解活性指示作用。 | 开发了一种新的化学酶法用于单细胞水平的LacNAc检测，该方法与多种单细胞RNA测序平台兼容，并能与TCR序列和细胞表面表位信息（如scTCR和CITE-seq）结合进行多组学分析。 | NA | 研究单细胞水平上LacNAc作为CD8+ T细胞糖酵解活性指示的生物学作用。 | CD8+ T细胞的糖酵解活性和LacNAc水平。 | 生物化学 | NA | 化学酶法 | NA | 单细胞RNA测序 | 未具体说明样本数量 |
| 11688 | 2024-08-04 |
Regulators of male and female sexual development are critical for the transmission of a malaria parasite
2023-02-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2022.12.011
PMID:36634679
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研究论文 | 本研究探讨了在疟疾寄生虫性别发育中起关键作用的基因 | 首次系统识别了对男性或女性性别形态形成至关重要的基因，并揭示了其在疟疾传播中的重要性 | 未探讨其他可能影响性别决定的因素 | 研究疟疾寄生虫在性别发育和传播过程中的基因调控机制 | 关注疟疾寄生虫Plasmodium berghei中的性别发育基因 | 数字病理学 | NA | 高分辨率单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据 | 十个突变体寄生虫 |
| 11689 | 2024-08-05 |
The astroglial and stem cell functions of adult rat folliculostellate cells
2023-02, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24267
PMID:36093576
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研究论文 | 本研究揭示了成年大鼠卵泡星状细胞的星形胶质细胞和干细胞功能 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组化分析探索成年大鼠垂体非激素细胞类型的转录组特征 | 研究主要集中在成年女性大鼠，未考虑性别或年龄的影响 | 探索垂体前叶卵泡星状细胞在干细胞特性和星形胶质细胞功能中的作用 | 成年雌性大鼠的垂体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据 | 成年雌性大鼠的整个垂体及其前后叶细胞 |
| 11690 | 2024-08-05 |
Creeping fat exhibits distinct Inflammation-specific adipogenic preadipocytes in Crohn's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198905
PMID:38111581
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研究论文 | 本研究分析了克罗恩病患者中的爬行脂肪及其与炎症特异性脂肪前体细胞的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了爬行脂肪中与炎症和纤维化相关的脂肪前体细胞的特征 | 尚未完全理解爬行脂肪在克罗恩病纤维化发展中的潜在机制 | 分析克罗恩病中爬行脂肪的转录组特征，探索与纤维化和炎症的关系 | 研究了克罗恩病患者的爬行脂肪及其相关的预脂肪细胞群体 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11691 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
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研究论文 | 本研究揭示了在PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 通过单细胞测序与工程细胞结合，本研究首次揭示了PRC2缺失导致的肿瘤细胞转录程序改变与干细胞特征的关系 | 本研究未涉及PRC2缺失在其他类型肿瘤中的影响 | 阐明PRC2缺失的肿瘤发生机制 | 针对PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤细胞进行研究 | 数字病理学 | 恶性周围神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 11692 | 2024-08-05 |
Systematic pan-cancer analysis identifies APOC1 as an immunological biomarker which regulates macrophage polarization and promotes tumor metastasis
2022-09, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106376
PMID:35914680
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研究论文 | 本文通过系统的全癌症分析发现APOC1是一个免疫生物标志物，调节巨噬细胞极化并促进肿瘤转移 | 阐明了APOC1在肿瘤免疫中的作用及其在肾细胞癌中异常表达的机制 | 研究主要集中于肾细胞癌，缺乏对其他癌种中APOC1作用的深入探讨 | 探讨APOC1在肿瘤免疫中的角色及其对巨噬细胞极化的影响 | APOC1在不同癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织和血清样本 | 涉及多种癌症的系统分析和肾细胞癌患者的样本 |
| 11693 | 2024-08-05 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
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研究论文 | 本研究构建了CD4 T细胞的参考图，以描述急性和慢性病毒感染期间亚型特异性的适应性变化 | 首次提供了针对病毒的CD4 T细胞转录状态适应性的深入理解，并建立了新的计算资源用于CD4 T细胞分析 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类病毒感染的情况 | 阐明CD4 T细胞在急性和慢性病毒感染中的转录状态适应 | 小鼠模型中的CD4 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 多个个体的病毒特异性CD4 T细胞 |
| 11694 | 2024-08-05 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序探讨了局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞中的炎症特征 | 首次利用尿液单细胞RNA测序识别出与局灶性节段性肾小管硬化症相关的单核细胞亚群和足细胞表达特征 | 研究仅基于12名FSGS患者的尿液样本，样本量可能不足以绘制全貌 | 探究局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞的疾病相关分子特征 | 分析来自12名局灶性节段性肾小管硬化症患者的尿液样本 | 数字病理 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液细胞 | 收集了来自12名FSGS患者的17个尿液样本，捕获为23个尿液细胞样本 |
| 11695 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of Antigen-Specific CD8+ T Cells Using Surface-Trapped TNF-α and Single-Cell Sequencing
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100535
PMID:34810222
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研究论文 | 本研究介绍了一种快速识别和表征抗原特异性CD8 T细胞的新系统 | 该系统利用表面捕获的TNF-α和单细胞测序的重大进展，构建了几乎无限的实验试剂 | 实验方法依然受到初级细胞数量的限制，且MHC结合肽/TCR相互作用的高度变异性仍然是挑战 | 研究抗原特异性CD8 T细胞的识别和表征，促进疾病研究和治疗开发 | 来自猕猴和HIV感染供体的抗原特异性CD8 T细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 来自猕猴的CMV特异性CD8 T细胞和HIV感染供体的样本 |
| 11696 | 2024-08-05 |
TNF plays a crucial role in inflammation by signaling via T cell TNFR2
2021-12-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109972118
PMID:34873037
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研究论文 | 这篇文章探讨了TNF在炎症中的关键角色及其通过T细胞TNFR2信号传导的机制 | 该研究首次阐明了TNF不仅作为效应因子，还作为炎症Th分化的启动因子 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病状态中验证 | 研究TNF在调节炎症和Th细胞分化中的作用 | 小鼠CD4 T细胞及其在实验性自体免疫性脑脊髓炎中的表现 | 免疫学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CD4 T细胞和来自多发性硬化患者的脑脊液浸润CD4 T细胞 |
| 11697 | 2024-08-05 |
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease
2021-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009912
PMID:34784346
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研究论文 | 该研究探讨了α1-抗胰蛋白酶在慢性阻塞性肺病（COPD）中的表达与选择性聚腺苷酸化之间的关系 | 本研究揭示了影响SERPINA1 mRNA翻译的多种RNA结合蛋白，并确定了QKI作为一种调节剂的作用 | 本研究的局限性在于只在特定样本中进行观察，无法广泛推广这些发现 | 研究α1-抗胰蛋白酶在非缺乏个体中的作用及其在COPD中的调控机制 | 该研究对象包括82例COPD患者和64名对照组，以及独立验证的376例COPD患者和267名对照组 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq | NA | RNA | 82例COPD患者和64名对照组，及独立研究中的376例COPD患者和267名对照组 |
| 11698 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
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研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 |
| 11699 | 2024-08-05 |
Improved integration of single-cell transcriptome and surface protein expression by LinQ-View
2021-08-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100056
PMID:35475142
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研究论文 | 提出了一种名为LinQ-View的工具包，用于单细胞数据的多模态可视化和分析 | LinQ-View能够整合转录组和细胞表面蛋白表达数据，提供量化的群体纯度评估指标 | 目前数据的应用主要集中在CITE-seq数据上，可能限制了其广泛适用性 | 研究单细胞转录组与表面蛋白表达的集成分析 | 针对受SARS-CoV-2感染患者的单细胞转录组和蛋白表达数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组与蛋白表达数据 | 多个公共CITE-seq数据集 |
| 11700 | 2024-08-05 |
Distinct populations of antigen-specific tissue-resident CD8+ T cells in human cervix mucosa
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149950
PMID:34156975
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研究论文 | 研究了人类宫颈黏膜中抗原特异性组织驻留CD8+ T细胞的不同群体 | 首次通过单细胞RNA测序定义了人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的表型和TCR克隆型 | 缺乏广泛关于人类FRT中T细胞受体库的全面知识 | 研究人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的特征及其与特定病毒抗原的关系 | 主要研究人类宫颈黏膜中的CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 性传播感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HSV-2血清阳性个体中的Cervical CD8+ TRM克隆型，具体数量未提供 |