单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11681	2024-08-04	Specialized Tfh cell subsets driving type-1 and type-2 humoral responses in lymphoid tissue 2024-Jun-04, Cell discovery IF:13.0Q1 DOI:10.1038/s41421-024-00681-0 PMID:38834551	研究论文	该研究探讨了T滤泡辅助细胞(Tfh)在类型1和类型2免疫反应中的特化功能	通过机器学习方法建立了能够区分Tfh1和Tfh2细胞的基因表达特征	缺乏对人类免疫反应的全面验证，主要基于小鼠模型	研究在不同免疫状况下Tfh细胞的特殊化以及其在生发中心中的功能	聚焦于Tfh细胞在类型1和类型2免疫反应下的特化及其在淋巴结中的定位	免疫学	NA	单细胞转录组学，空间转录组学，机器学习	NA	基因表达数据	小鼠样本和人类个体样本
11682	2024-08-04	Single-cell transcriptome atlas of testes from mice with high-fat diets 2024-Jun-04, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-03435-5 PMID:38834587	研究论文	本文利用单细胞RNA测序分析了高脂饮食导致肥胖小鼠睾丸中的细胞变化	这是首个在饮食诱导肥胖小鼠睾丸中应用单细胞RNA测序的研究，提供了对肥胖相关男性生殖损伤的新见解	在分子水平上，肥胖对睾丸的影响仍然缺乏全面探讨	研究肥胖对小鼠睾丸非生精细胞和生精过程的影响	分析来自肥胖和瘦小鼠的睾丸细胞数据	数字病理学	肥胖相关生殖健康问题	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	70,000个细胞
11683	2024-08-05	A Subpopulation of Luminal Progenitors Secretes Pleiotrophin to Promote Angiogenesis and Metastasis in Inflammatory Breast Cancer 2024-Jun-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2640 PMID:38507720	研究论文	本文揭示了在炎性乳腺癌中，某一亚群的腔道祖细胞分泌多效生长因子以促进血管生成和转移	发现腔道祖细胞通过分泌多效生长因子PTN与内皮尖细胞相互作用，从而促进炎性乳腺癌的血管生成和转移	未提及本研究的局限性	探讨炎性乳腺癌中微环境对疾病表型的影响	炎性乳腺癌患者的单细胞RNA测序和血清分析	数字病理学	炎性乳腺癌	单细胞RNA测序、复合染色、血清分析	NA	NA	在炎性乳腺癌患者中进行的分析样本量未明确提及
11684	2024-08-05	The ω-3 Polyunsaturated Fatty Acid Docosahexaenoic Acid Enhances NK-Cell Antitumor Effector Functions 2024-Jun-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0359 PMID:38526128	研究论文	本研究探讨了ω-3多不饱和脂肪酸二十二碳六烯酸（DHA）在免疫 competent 小鼠中抑制肿瘤生长的免疫调节作用	揭示了DHA通过上调PGC-1α信号介导的线粒体氧化磷酸化活性增强NK细胞抗肿瘤效应的机制	未具体说明其他免疫细胞的变化	研究DHA在抑制肿瘤生长方面的作用及其机制	DHA对免疫 competent 小鼠中NK细胞抗肿瘤效应的影响	数字病理学	肿瘤	单细胞RNA测序	小鼠B16F10黑色素瘤模型	细胞和组织样本	使用Rag2-/-小鼠和NK细胞耗竭的实验
11685	2024-08-07	Author Correction: Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets 2024-Jun-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48978-8 PMID:38834555	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
11686	2024-08-04	Single-cell and genome-wide Mendelian randomization identifies causative genes for gout 2024-Jun-03, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-024-03348-z PMID:38831441	研究论文	本研究探讨了痛风疾病中基因表达调控的机制及其发病机制	识别了17个与痛风相关的独特遗传位点以及三个与痛风因果关联的蛋白	未在标题和摘要中具体提及研究的限制	研究痛风的发病机制及基因表达调控	基于GWAS、单细胞转录组学和相关数据分析痛风基因	数字病理学	痛风	GWAS, scRNA-seq, eQTL, mQTL, 孟德尔随机化	NA	基因组数据	NA
11687	2024-08-04	Single-cell and spatial transcriptomics reveal alterations in trophoblasts at invasion sites and disturbed myometrial immune microenvironment in placenta accreta spectrum disorders 2024-Jun-03, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00598-6 PMID:38831319	研究论文	本研究揭示了胎盘植入谱系障碍（PAS）中滋养层细胞的变化及子宫肌层免疫微环境的干扰	通过单细胞RNA测序和空间转录组学，首次系统描述了PAS中滋养层细胞的细胞组成和空间组织	样本数量较小，仅包括四名PAS患者，可能影响结论的广泛适用性	探讨胎盘植入谱系障碍的机制，特别是滋养层细胞在其中的作用	来自四名PAS患者和三名健康孕妇的组织样本	数字病理学	胎盘植入谱系障碍	空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	组织样本	7个样本（包括4个PAS患者的组织样本和3个健康孕妇的子宫肌层样本）
11688	2024-08-04	Single-cell RNA-seq of in vitro expanded cells from cranial neural crest reveals a rare odontogenic sub-population 2024-Jun, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13598 PMID:38196265	研究论文	本文研究了体外扩增的颅神经嵴细胞的单细胞RNA测序，揭示了稀有的成牙亚群体	首次分析了体外培养的颅神经嵴细胞的细胞图谱，并识别了稀有的Alx3+/Barx1+亚群体	仅在小鼠模型中进行实验，可能限制了结果的广泛性	探讨体外培养的颅神经嵴细胞在成牙过程中的细胞异质性	体外培养的小鼠颅神经嵴细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	包括初级细胞和传代5的细胞
11689	2024-08-05	Neutrophil and macrophage crosstalk might be a potential target for liver regeneration 2024-Jun, FEBS open bio IF:2.8Q3 DOI:10.1002/2211-5463.13803 PMID:38710666	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞与巨噬细胞之间的相互作用在肝脏再生中的潜在作用	研究揭示了中性粒细胞在肝脏再生中的关键作用及其与巨噬细胞之间复杂的相互作用	该研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类	探讨中性粒细胞在肝脏再生中的角色	小鼠部分肝切除模型中的肝细胞和非实质细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型中的多个样本
11690	2024-08-05	The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling 2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202305605 PMID:38581131	研究论文	这篇文章探讨了金黄色葡萄球菌的Sortase A与核酸的相互作用及其在哺乳动物细胞标记中的应用	发现Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了CellID技术	未详细阐述Sortase A在其他细胞类型中的普遍适用性	研究Sortase A与核酸的相互作用及其在细胞标记中的应用	金黄色葡萄球菌Sortase A及其与哺乳动物细胞的相互作用	生物技术	NA	CRISPR筛选，scRNA-seq	NA	核酸，细胞表面标记	涉及金黄色葡萄球菌和哺乳动物细胞的多样本
11691	2024-08-05	Impact of benzo[a]pyrene, PCB153 and sex hormones on human ESC-Derived thyroid follicles using single cell transcriptomics 2024-Jun, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2024.108748 PMID:38763096	研究论文	本研究探讨了人类胚胎干细胞衍生的甲状腺小体在不同性别激素环境下对内分泌干扰物的反应	该研究首次应用单细胞转录组学研究了内分泌干扰物在不同激素背景下的影响	研究仅在体外环境中进行，未能模拟完整的生理状态	研究内分泌干扰物如何影响人类甲状腺功能及不同性别激素的作用	人类胚胎干细胞衍生的甲状腺小体	数字病理学	甲状腺疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
11692	2024-08-05	Insights into the heterogeneity of the tumor microenvironment in lung adenocarcinoma and squamous carcinoma through single-cell transcriptomic analysis: Implications for distinct immunotherapy outcomes 2024-Jun, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3694 PMID:38847309	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌和鳞癌肿瘤微环境的异质性及其对免疫治疗结果的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示肺腺癌与鳞癌在肿瘤免疫微环境上的显著差异	研究仅基于38例非小细胞肺癌患者，样本量较小	探讨肺腺癌和鳞癌之间在肿瘤微环境及免疫治疗反应上的差异	38例非小细胞肺癌患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	38例非小细胞肺癌患者
11693	2024-08-04	Single-cell metabolomics in rare disease: From technology to disease 2024-May-31, Intractable & rare diseases research IF:1.1Q2 DOI:10.5582/irdr.2023.01073 PMID:38836176	研究论文	该文章探讨了单细胞代谢组学在稀有疾病中的应用和潜力	文章创新性地提出单细胞代谢组学能够彻底改变稀有疾病的诊断、治疗和管理策略	文章未具体说明现有研究的局限性	推动稀有疾病的准确和快速诊断，并促进治疗药物的发展	稀有疾病，特别是代谢类稀有疾病	数字病理学	稀有疾病	单细胞测序技术	NA	NA	NA
11694	2024-08-05	CD47, a novel YAP target gene, contributes to hepatic stellate cell activation and liver fibrosis induced by high-fat diet 2024-May-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31621 PMID:38831842	研究论文	本研究探讨了CD47在高脂饮食诱导的肝星状细胞活化和肝纤维化中的作用	本研究首次揭示了CD47作为YAP的转录靶点，在高脂饮食条件下促进肝星状细胞活化的机制	关于CD47在肝星状细胞中的具体调控机制仍不完全明了	研究CD47在肝星状细胞活化及肝纤维化中的角色及其调控机制	小鼠肝星状细胞及其在高脂饮食条件下的行为	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型
11695	2024-08-04	Harnessing TME depicted by histological images to improve cancer prognosis through a deep learning system 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101536 PMID:38697103	研究论文	本研究提供了一种强大的深度学习系统，通过组织学图像增强肿瘤微环境(TME)信息以改善癌症预后	提出了整合图像和图形深度学习的模型(IGI-DL)，并开发了基于TME的癌症预后预测模型	研究未涉及空间转录组学(ST)的临床可用性限制	改善癌症预后，尤其是在没有ST数据的患者中	使用组织学图像来预测癌症预后和TME	数字病理学	乳腺癌和结直肠癌	深度学习	IGI-DL模型	组织学图像	使用The Cancer Genome Atlas的乳腺癌和结直肠癌队列，以及外部的Molecular and Cellular Oncology结直肠癌队列
11696	2024-08-04	Targeting PDGF signaling of cancer-associated fibroblasts blocks feedback activation of HIF-1α and tumor progression of clear cell ovarian cancer 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101532 PMID:38670097	研究论文	该研究探讨了与卵巢透明细胞癌相关的癌症相关成纤维细胞的PDGF信号通路。	该研究揭示了在卵巢透明细胞癌中的化疗抗性机制，并提出了针对CAFs的治疗策略。	该研究主要基于体外和小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证。	研究卵巢透明细胞癌的化疗抗性机制及潜在的治疗方法。	卵巢透明细胞癌患者的手术标本及其相关的癌症相关成纤维细胞。	数字病理学	卵巢癌	单细胞分析和空间转录组学	NA	显微镜图像	手术标本分析及共培养实验
11697	2024-08-05	A comprehensive single-cell breast tumor atlas defines epithelial and immune heterogeneity and interactions predicting anti-PD-1 therapy response 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101511 PMID:38614094	研究论文	我们展示了一个包含236,363个细胞的初级乳腺肿瘤微环境单细胞RNA测序综合图谱	首次通过InteractPrint方法揭示了肿瘤上皮细胞与免疫细胞的相互作用，并能够预测抗PD-1治疗的反应	在这项研究中没有提到样本的时间顺序或长期效果的评估	目标是分析乳腺肿瘤微环境中免疫和肿瘤上皮细胞的异质性	本研究的对象包括来自119个活检样本的肿瘤微环境中的免疫细胞和癌上皮细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	InteractPrint	细胞数据	119个活检样本
11698	2024-08-05	Monocyte bioenergetics: An immunometabolic perspective in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101564 PMID:38733988	研究论文	本文揭示了代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者外周单核细胞的生物能量特征	首次指出在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中，外周单核细胞表现出特定的高糖酵解和线粒体呼吸特征	研究主要基于小鼠模型，临床适用性可能受限	探讨单核细胞的生物能量特征在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的作用	代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者的外周单核细胞	免疫代谢	代谢功能障碍相关脂肪肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	基因表达数据	NA
11699	2024-08-05	Chemoradiotherapy-induced ACKR2+ tumor cells drive CD8+ T cell senescence and cervical cancer recurrence 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101550 PMID:38723624	研究论文	该文章探讨了化学放疗（CCRT）后宫颈癌复发的机制，发现ACKR2+肿瘤细胞在驱动CD8+ T细胞衰老中的作用	创新点在于识别出了一种特定的CCRT耐药性ACKR2+肿瘤细胞亚群，以及其在CD8+ T细胞衰老与肿瘤复发中的作用	本研究的局限性在于主要依赖回顾性分析，可能存在选择偏倚	研究化学放疗后宫颈癌复发的机制及预测指标	研究对象为宫颈癌患者的肿瘤组织样本，特别关注化学放疗前后的变化	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	组织样本	NA
11700	2024-08-05	IL-7-primed bystander CD8 tumor-infiltrating lymphocytes optimize the antitumor efficacy of T cell engager immunotherapy 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101567 PMID:38744277	研究论文	本研究探讨了Fc融合IL-7如何优化T细胞接合物免疫疗法的抗肿瘤效果	发现rhIL-7-hyFc能显著增加肿瘤浸润的非反应性旁观者CD8 T细胞，这些细胞在特定的T细胞接合物的作用下可转化为具有肿瘤杀伤能力的细胞	本研究主要集中在固体肿瘤中CD8 T细胞的变化，可能未涵盖其他类型肿瘤或免疫细胞的作用	探讨如何通过IL-7增强T细胞接合物免疫疗法在固体肿瘤中的效果	研究目的是分析IL-7对肿瘤浸润CD8 T细胞的影响及其在免疫疗法中的应用	NA	肿瘤	单细胞转录组分析	NA	细胞	多种固体肿瘤中的CD8肿瘤浸润淋巴细胞