单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 11681 - 11700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11681 | 2024-08-04 |
SinglePointRNA, an user-friendly application implementing single cell RNA-seq analysis software
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300567
PMID:38889133
|
研究论文 | 该文章介绍了SinglePointRNA，这是一个用户友好的单细胞RNA测序分析应用程序 | SinglePointRNA提供了一个图形界面，简化了单细胞RNA-seq数据的分析过程，降低了对用户数学和编程技能的要求 | 该应用程序对复杂分析的先前知识仍然有一定要求，可能不适合所有用户 | 开发一个可访问的工具集，帮助研究者自主进行单细胞RNA-seq数据的详细分析 | 单细胞RNA-seq数据的分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据集 | NA |
| 11682 | 2024-08-05 |
Autoimmune uveitis attenuated in diabetic mice through imbalance of Th1/Th17 differentiation via suppression of AP-1 signaling pathway in Th cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347018
PMID:38887289
|
研究论文 | 本研究探讨了糖尿病对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响 | 首次揭示了糖尿病小鼠中Th1细胞分化的选择性抑制与AP-1信号通路下调的关系 | 仅使用小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理机制 | 研究糖尿病对器官特异性自身免疫疾病的影响 | 使用C57BL/6和Ins2Akita小鼠模型研究炎症和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | C57BL/6和Akita小鼠模型 |
| 11683 | 2024-08-05 |
Establishment of a prognostic model for hypoxia-associated genes in OPSCC and revelation of intercellular crosstalk
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371365
PMID:38887298
|
研究论文 | 该文章建立了一个与缺氧相关的预后模型，并揭示了细胞间的相互作用 | 提出了将缺氧亚型与免疫微环境和临床特征相结合的新方法 | 样本量和数据来源可能限制了模型的广泛适用性 | 探讨缺氧对口咽鳞状细胞癌（OPSCC）预后的影响 | OPSCC患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 口咽癌 | scRNA-seq, WGCNA, CIBERSORT | Cox模型, LASSO | 基因组数据 | 来源于GEO的OPSCC整体测序数据 |
| 11684 | 2024-08-05 |
Integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq to explore the differentiation mechanism of human nail stem cells mediated by onychofibroblasts
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1416780
PMID:38887517
|
研究论文 | 该研究探讨了人类指甲干细胞（NSC）由指甲成纤维细胞（OF）介导的分化机制 | 首次揭示了指甲成纤维细胞在调节指甲干细胞分化中的作用，并确定了BMP4信号通路的关键角色 | 对指甲成纤维细胞细胞特性和转录组学特征的理解仍有限 | 研究人类指甲成纤维细胞的特性及其在指甲干细胞分化中的作用 | 人类指甲成纤维细胞和干细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 三种来自人类指甲单位的指甲成纤维细胞样本和对照成纤维细胞 |
| 11685 | 2024-08-05 |
Evaluation of nanoscale versus hybrid micro/nano surface topographies for endosseous implants
2024-01-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2023.10.030
PMID:37918471
|
研究论文 | 我们研究了纳米级钛表面形态对粘附性间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞功能的影响 | 首次利用单细胞RNA测序识别植入表面的早期细胞群体，揭示了纳米级表面对骨形成过程的特异性影响 | 未明确提到样本的来源和数量，可能影响结果的广泛应用 | 研究纳米级表面形态对骨整合过程中细胞和组织水平的影响 | 粘附性间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养实验和体内实验数据 | NA |
| 11686 | 2024-08-05 |
ScnML models single-cell transcriptome to predict spinal cord neuronal cell status
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1413484
PMID:38894722
|
研究论文 | 本研究开发了一种机器学习预测模型ScnML，用于预测脊髓神经细胞的亚群体和标记基因。 | ScnML模型通过XGBoost算法在预测中实现了高度准确性，并发现了新的重要基因，提升了脊髓神经细胞状态预测的潜力。 | 现有实验技术识别脊髓神经细胞发展过程依然存在劳动密集和成本高的问题。 | 准确识别脊髓神经细胞的细胞状态，以促进新治疗和康复策略的发展。 | 脊髓神经细胞的亚群体及标记基因。 | 机器学习 | NA | XGBoost | NA | 转录组数据 | 训练数据集的准确率为94.33%，测试数据集的准确率为94.08%至94.26%不等 |
| 11687 | 2024-08-04 |
Immune mechanisms shape the clonal landscape during early progression of prostate cancer
2023-06-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.010
PMID:37148881
|
研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在前列腺癌早期进展中调节肿瘤克隆景观的作用 | 研究展示了肿瘤中的多克隆景观与微环境的关系，并揭示了免疫编辑在克隆生存中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探讨免疫微环境如何影响肿瘤内异质性和克隆景观 | 主要研究了前列腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和克隆动态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型 | NA | NA | 使用了基因工程小鼠模型进行研究 |
| 11688 | 2024-08-05 |
Targeting BMP2 for therapeutic strategies against hepatocellular carcinoma
2024-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101970
PMID:38797016
|
研究论文 | 本研究探讨了BMP2在肝细胞癌（HCC）生长和转移中的作用 | 文章创新性地结合了单细胞RNA测序和整体RNA测序来分析BMP2在HCC中的关键作用 | NA | 研究BMP2在肝细胞癌进展中的作用，评估其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌细胞系Huh-7及其相关的HCC模型 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11689 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing to classify and characterize tumor subgroups in bulk RNA-sequencing data
2024-Jul, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04710-6
PMID:38811523
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为CLIPPR的算法，用于从大规模转录组数据中分类和特征化肿瘤亚组 | 通过结合单细胞模型、RNA推断的拷贝数变异信号和初始大规模模型，CLIPPR算法展示了其在肿瘤分类方面的优势 | 虽然CLIPPR算法在整体准确性方面表现优越，但在某些情况下仍可能面临分类准确性有限的问题 | 提升癌症亚组的分类准确性，以便实现个性化治疗 | 研究针对脑膜瘤的分类，并包括多达789个样本的肿瘤数据 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | CLIPPR元模型 | 转录组数据 | 77个样本和约10,000个单细胞，以及789个肿瘤样本和711个TCGA胶质瘤样本 |
| 11690 | 2024-08-05 |
Single-cell technologies in psoriasis
2024-Jul, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110242
PMID:38750947
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在牛皮癣研究中的应用 | 介绍了单细胞技术在了解牛皮癣发病机制中的新进展 | 未提及具体的实验结果或数据 | 探讨牛皮癣的发病机制 | 牛皮癣相关的免疫细胞及其与皮肤实质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞转录组、蛋白组和代谢组 | NA | NA | NA |
| 11691 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq reveals dark- and light-induced differentially expressed gene atlases of seedling leaves in Arachis hypogaea L
2024-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14306
PMID:38391124
|
研究论文 | 本文探讨了花生种子叶在暗光条件下的不同基因表达图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统性研究花生在光照条件下的基因表达变化 | 研究可能未覆盖所有潜在的基因调控机制 | 探明花生种子叶在不同光照条件下的基因表达及其调控机制 | 主要研究对象为一周大的花生幼苗叶片的单细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 13409和11296个单细胞 |
| 11692 | 2024-08-05 |
Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway
2024-Jul, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31376
PMID:38450771
|
研究论文 | 该文章探讨了在近端气道中的适应性免疫应答的相似性网络分析 | 首次通过单细胞RNA测序和相似性网络分析，揭示了iSGS患者气道中的T细胞克隆及其抗原靶标 | 样本量有限，研究仅针对特定患者群体，可能不具备普遍性 | 研究近端气道黏膜中T细胞受体的解剖分布和抗原靶标 | 自主性亚声门狭窄患者的匹配疤痕和未受影响的黏膜 | 数字病理学 | 气道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 32名自主性亚声门狭窄患者和10名健康对照 |
| 11693 | 2024-08-07 |
Correction to: Leveraging single-cell sequencing to classify and characterize tumor subgroups in bulk RNA-sequencing data
2024-Jul, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04731-1
PMID:38834749
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11694 | 2024-08-05 |
Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer
2024-Jun-17, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02039-2
PMID:38880903
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了一种新的癌基因集群，TRAP1低表达/CAMSAP3低表达在早期子宫内膜癌中表现出更具攻击性的行为和较差的预后。 | 首次发现TRAP1和CAMSAP3在特定细胞集群中显著下调，并构建了结合TRAP1、CAMSAP3和TP53的新的预测模型。 | 本研究的样本量相对较小，仅包含24名早期子宫内膜癌患者，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究早期子宫内膜癌的临床异质性，识别高质量预后标志物及其在肿瘤攻击性行为中的潜在作用。 | 研究对象为早期子宫内膜癌患者及其癌和旁癌组织的样本。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 蛋白质组学和单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 生物样本 | 24名早期子宫内膜癌患者 |
| 11695 | 2024-08-04 |
Cystatin F attenuates neuroinflammation and demyelination following murine coronavirus infection of the central nervous system
2024-Jun-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03153-0
PMID:38879499
|
研究论文 | Cystatin F在小鼠冠状病毒感染后的神经炎症和脱髓鞘化过程中的作用 | 首次详细探讨了Cystatin F在病毒感染后神经疾病严重性中的影响 | 主要使用小鼠模型，结果可能无法直接推广到人类 | 研究Cystatin F在小鼠冠状病毒引起的神经疾病中的作用 | Cystatin F缺失的小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 电子显微镜 | NA | 细胞, RNA | Cst7-/-小鼠和控制小鼠的细胞样本 |
| 11696 | 2024-08-04 |
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.577927
PMID:38352492
|
研究论文 | 本研究旨在表征参与形成粒腺瘤的趋化因子。 | 使用空间转录组学技术动态研究趋化因子表达在粒腺瘤形成过程中的变化。 | 研究中对其他免疫细胞的角色探索不足。 | 探索趋化因子在免疫细胞形成粒腺瘤中的作用。 | 小鼠感染模型和其免疫反应中的单核细胞来源巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 小鼠感染模型 |
| 11697 | 2024-08-05 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
|
研究论文 | 本文研究KLF4在平滑肌细胞来源的祖细胞中的作用，探讨其对心脏炎症和纤维化的影响 | 首次发现源自成熟血管平滑肌细胞的AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的作用，并揭示了KLF4在调控这些细胞向致纤维化表型转变过程中的关键角色 | 目前尚不清楚KLF4如何具体调节AdvSca1-SM表型的分子机制 | 探讨KLF4在心脏炎症和纤维化相关过程中对平滑肌细胞来源祖细胞的作用 | 研究对象为来自主动脉、颈动脉和股动脉的AdvSca1-SM细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 11698 | 2024-08-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
|
研究论文 | 介绍了一种名为scSNViz的R基础工具集，用于可视化和分析细胞特异性表达的单核苷酸变异。 | 提供了3D可视化功能，兼容多个流行的scRNA-seq处理工具，并能够进行统计指标的估计和图形表示。 | NA | 旨在理解单细胞水平的遗传变异，以获取细胞异质性和基因表达调控的见解。 | 着重分析细胞特异性表达的单核苷酸变异（sceSNVs）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11699 | 2024-08-04 |
Single-cell lineage capture across genomic modalities with CellTag-multi reveals fate-specific gene regulatory changes
2024-Jun, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01931-4
PMID:37749269
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的方法CellTag-multi，用于在不同的单细胞基因组测序中进行细胞谱系追踪 | 提出了CellTag-multi方法，可以直接捕获作为多腺苷酸化转录本表达的遗传随机条形码，适用于多种单细胞测定 | NA | 研究细胞谱系追踪与转录组分析相结合的方法 | 小鼠造血过程中的前体细胞谱系及其重编程过程中的基因调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测定 | NA | 转录本 | 小鼠造血过程中的前体细胞 |
| 11700 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of tumour infiltrating T cells efficiently identifies tumour-specific T cell receptors based on the T cell activation score
2024-May-10, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03710-9
PMID:38727812
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序建立了一种有效的方法来分离肿瘤反应性T细胞受体 | 创新性地结合多个激活和效应分子的表达水平来提高肿瘤特异性TCR的分离效率 | 研究仅包含两名肺腺癌患者，样本量较小 | 旨在识别肿瘤特异性T细胞受体以改善癌症治疗 | 研究对象为肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 2名肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |