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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11681 | 2025-10-07 | Predictive value of dendritic cell-related genes for prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma 
          2025-Jan-14, Cancer cell international
          
          IF:5.3Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12935-025-03642-z
          PMID:39810206
         | 研究论文 | 本研究通过筛选树突状细胞相关基因构建预后特征模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 创新性地建立了基于深度学习的预测模型DCRGS,结合单细胞RNA测序和机器学习算法筛选树突状细胞相关基因 | NA | 开发预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, 机器学习算法 | Coxboost, 随机生存森林, 深度学习 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 11682 | 2025-10-07 | Differential impact of TIM-3 ligands on NK cell function 
          2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2024-010618
          PMID:39773563
         | 研究论文 | 本研究探讨了四种TIM-3配体对头颈鳞状细胞癌患者自然杀伤细胞功能的差异性影响 | 首次系统比较四种TIM-3配体对NK细胞功能的差异性调控,并确定半乳糖凝集素-9是最具免疫抑制作用的配体 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本来源局限于头颈鳞状细胞癌患者 | 评估TIM-3+ NK细胞在头颈鳞癌中的功能特性,确定不同TIM-3配体的免疫调节作用 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和血液样本中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外杀伤实验,细胞增殖检测,细胞因子分析,数字空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11683 | 2025-10-07 | Chemotherapy-induced cellular senescence promotes stemness of aggressive B-cell non-Hodgkin's lymphoma via CCR7/ARHGAP18/IKBα signaling activation 
          2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2024-009356
          PMID:39773566
         | 研究论文 | 本研究揭示了化疗诱导的细胞衰老通过CCR7/ARHGAP18/IKBα信号通路促进侵袭性B细胞非霍奇金淋巴瘤干性特征的机制 | 首次发现化疗诱导衰老的B-NHL细胞中CCR7高表达记忆B细胞群体,并阐明CCR7/ARHGAP18/IKBα信号轴在促进淋巴瘤干性中的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步的体内实验验证;样本量有限 | 探究化疗诱导的细胞衰老如何促进B细胞非霍奇金淋巴瘤的干性特征和化疗耐药 | 侵袭性B细胞非霍奇金淋巴瘤细胞系(Raji和SU-DHL-2)及患者样本 | 癌症生物学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,流式细胞术,免疫荧光,western blot,免疫共沉淀,细胞增殖检测,衰老相关β-半乳糖苷酶染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据,细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11684 | 2025-10-07 | Disruption of tumor-intrinsic PGAM5 increases anti-PD-1 efficacy through the CCL2 signaling pathway 
          2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2024-009993
          PMID:39773565
         | 研究论文 | 本研究探讨肿瘤内在PGAM5通过调控线粒体动态影响肿瘤微环境中免疫细胞浸润及免疫治疗疗效的机制 | 首次揭示PGAM5通过调控线粒体分裂-融合平衡影响mtDNA应激和CCL2信号通路,进而调节肿瘤相关巨噬细胞极化和抗PD-1疗效的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 探索肿瘤内在PGAM5作为肝细胞癌免疫治疗增敏靶点的潜力 | 肝细胞癌患者样本、小鼠肝癌模型、肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、蛋白质组学、免疫荧光、染色质免疫沉淀、ELISA、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 两个独立队列的肿瘤组织芯片、TCGA-LIHC和GEO数据库、皮下和原位小鼠肝癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11685 | 2025-10-07 | Targeting the NLRP3 inflammasome abrogates cardiotoxicity of immune checkpoint blockers 
          2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2024-010127
          PMID:39773567
         | 研究论文 | 本研究通过抑制NLRP3炎症小体活性,成功减轻了免疫检查点抑制剂引发的心脏毒性并同时增强抗肿瘤免疫 | 首次证明NLRP3抑制剂MCC950能够同时解决免疫检查点抑制剂的心脏毒性和抗肿瘤效果之间的矛盾 | 研究仅在黑色素瘤小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 寻找有效减轻心脏毒性同时保留或增强免疫检查点抑制剂抗肿瘤免疫的方法 | 黑色素瘤荷瘤C57BL/6J雌性小鼠 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 逆转录定量PCR, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 图像数据, 细胞表型数据 | 黑色素瘤荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 11686 | 2025-10-07 | Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types 
          2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2023.03.02.530774
          PMID:39803528
         | 研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合方法,从基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的生物物理模型相结合,通过可解释的稀疏线性回归模型将离子通道基因表达与生物物理模型参数直接关联 | 模型与数据之间存在不匹配的挑战,且方法依赖于多模式Patch-seq数据的质量和可用性 | 建立基因表达与皮层神经元类型生理特性之间的联系 | 多种皮层细胞类型 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学, Patch-seq, 模拟推理 | Hodgkin-Huxley模型, 稀疏线性回归模型 | 多模式电生理和基因表达数据 | 多种皮层细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 11687 | 2025-10-07 | Neuropilin-1 is a novel host factor modulating the entry of hepatitis B virus 
          2025-Jan, Journal of hepatology
          
          IF:26.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jhep.2024.06.032
          PMID:38960374
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现神经纤毛蛋白-1(NRP1)是调控乙型肝炎病毒进入肝细胞的新型宿主因子 | 首次发现NRP1通过与HBV大表面蛋白preS1结构域和NTCP受体形成复合物来调控HBV进入过程 | NA | 探究除NTCP外其他调控HBV感染的宿主因子 | 儿童乙肝肝活检样本、原代人肝细胞、HepG2-NTCP细胞、人肝嵌合小鼠 | NA | 乙型肝炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 儿童乙肝患者肝活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11688 | 2025-10-07 | Combination of spatial transcriptomics analysis and retrospective study reveals liver infection of SARS-COV-2 is associated with clinical outcomes of COVID-19 
          2025-Jan, EBioMedicine
          
          IF:9.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105517
          PMID:39709771
         | 研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析和回顾性研究揭示了SARS-CoV-2肝脏感染与COVID-19临床结局的关联 | 首次结合空间转录组学技术和临床回顾性研究证实SARS-CoV-2可直接感染肝脏细胞,并发现血清白蛋白浓度变化与死亡风险相关 | 样本量有限(仅6例患者肝组织),回顾性研究设计存在固有偏倚 | 探究SARS-CoV-2肝脏感染的机制及其对COVID-19临床结局的影响 | COVID-19患者肝组织、住院患者临床数据、叙利亚仓鼠模型 | 空间转录组学 | COVID-19 | 免疫组织化学染色,空间转录组测序,TCR CDR3序列分析,回顾性研究 | NA | 组织切片图像,基因表达数据,临床检验数据 | 6例患者肝组织样本,650例住院患者临床数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium CytAssist Spatial Gene Assay | 
| 11689 | 2025-10-07 | Visium spatial transcriptomics and proteomics identifies novel hepatic cell populations and transcriptomic signatures of alcohol-associated hepatitis 
          2025-Jan, Alcohol, clinical & experimental research
          
         
          DOI:10.1111/acer.15494
          PMID:39592394
         | 研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术识别酒精相关性肝炎中的新型肝细胞群体及其分子特征 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学技术系统揭示AH中细胞群体的空间分布特征和分子改变,发现PCNA+肝细胞的胆管细胞样特征及疾病相关肝细胞标志物 | 样本量较小(仅2例AH患者和2例对照),需要更大规模研究验证发现 | 识别酒精相关性肝炎中的肝细胞群体及其转录组和蛋白质组改变 | 人类酒精相关性肝炎患者和正常对照的肝组织 | 空间转录组学 | 酒精相关性肝炎 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 4例(2例AH患者,2例非ALD对照) | 10x Genomics | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组和蛋白质组分析平台,使用福尔马林固定石蜡包埋肝组织 | 
| 11690 | 2025-10-07 | Analysis of the effect of ALA-PDT on macrophages in footpad model of mice infected with Fonsecaea monophora based on single-cell sequencing 
          2025, Open medicine (Warsaw, Poland)
          
         
          DOI:10.1515/med-2024-1132
          PMID:39822988
         | 研究论文 | 本研究基于单细胞测序技术分析ALA-PDT治疗对单色芬氏菌感染小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响 | 首次结合单细胞测序技术与小鼠足垫感染模型,系统研究ALA-PDT对真菌感染中巨噬细胞免疫调控机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证;样本量有限 | 探究ALA-PDT治疗对着色芽生菌病免疫反应的影响机制 | 单色芬氏菌感染的小鼠足垫模型中的巨噬细胞 | 单细胞测序 | 真菌感染性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠足垫感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11691 | 2025-10-07 | Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions 
          2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.07.03.601990
          PMID:39005270
         | 研究论文 | 通过构建人鼠嵌合脑模型研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用机制 | 开发了同时移植人类诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞的新型共移植模型,首次在体内观察到人类小胶质细胞修剪人类神经元突触并吞噬神经元的现象 | 使用小鼠作为宿主环境可能无法完全模拟人类大脑的复杂微环境 | 研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用及其在神经系统疾病中的作用 | 人鼠嵌合脑模型中的人类神经细胞(神经元、小胶质细胞、大胶质细胞) | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建技术,细胞间通讯分析 | 人鼠嵌合脑模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11692 | 2025-10-07 | Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging 
          2024-Dec-16, Cell reports methods
          
          IF:4.3Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
          PMID:39662473
         | 研究论文 | 比较单细胞RNA测序算法与单分子RNA成像在转录噪声量化方面的差异 | 首次系统比较多种scRNA-seq算法与smFISH在量化转录噪声变化方面的性能差异 | 所有scRNA-seq算法均系统性低估噪声变化,且仅测试了代表性基因面板 | 评估基因组范围内转录噪声的最佳量化方法 | 人类和小鼠数据集中的基因表达噪声 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, smFISH | NA | NA | 
| 11693 | 2025-10-07 | Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes 
          2024-Dec, Virologica Sinica
          
          IF:4.3Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003
          PMID:39426602
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示生殖器疱疹患者免疫细胞多样性和系统性免疫反应特征 | 首次在单细胞水平系统分析生殖器疱疹患者外周血免疫细胞的转录组特征,发现特定免疫细胞亚群的激活状态和关键信号通路变化 | 样本量相对有限,主要关注外周血免疫细胞而未直接研究局部感染部位的免疫反应 | 探究HSV-2感染和复发过程中免疫系统的应答机制 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 健康个体和复发性生殖器疱疹患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11694 | 2025-10-07 | Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis 
          2024-Dec, Experimental hematology
          
          IF:2.5Q3
          
         
          DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
          PMID:39393608
         | 综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用,重点关注可变剪接机制及其在血液系统疾病中的意义 | 整合了最新单细胞测序技术与造血研究,系统阐述剪接因子突变在血液恶性肿瘤中的作用机制 | 作为综述文章,未提供原始实验数据和新发现 | 探讨可变剪接在造血过程和血液疾病中的作用机制 | 造血干细胞、祖细胞、成熟血细胞及其转录组 | 自然语言处理 | 血液系统疾病 | 多色流式细胞分选、bulk测序、单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11695 | 2025-10-07 | Low-intensity focused ultrasound stimulation promotes stroke recovery via astrocytic HMGB1 and CAMK2N1 in mice 
          2024-Nov-05, Stroke and vascular neurology
          
          IF:4.4Q1
          
         
          DOI:10.1136/svn-2023-002614
          PMID:38191183
         | 研究论文 | 本研究探讨低强度聚焦超声刺激通过星形胶质细胞中的HMGB1和CAMK2N1促进小鼠脑卒中恢复的机制 | 首次揭示LIFUS通过调控星形胶质细胞特定亚群中HMGB1上调和CAMK2N1下调来促进血管生成和突触形成 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及性别差异分析 | 探究低强度聚焦超声在缺血性脑卒中中的神经修复机制 | 成年雄性小鼠的缺血性脑卒中模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | iTRAQ蛋白质组学分析,scRNA-seq,激光散斑成像,电肌电图,纤维光度记录,荧光原位杂交,Western blot | NA | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据,影像数据,电生理数据 | 成年雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA | 
| 11696 | 2025-10-07 | Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice 
          2024-Oct, Virologica Sinica
          
          IF:4.3Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006
          PMID:39153545
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人巨细胞病毒感染人源化小鼠后外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次在人源化小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术研究HCMV感染后的免疫细胞反应 | 研究基于人源化小鼠模型,与真实人体感染环境存在差异 | 揭示HCMV感染过程中病毒与宿主的相互作用机制 | 人源化小鼠模型中的外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞测序分析 | 人巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 11697 | 2025-10-07 | G-protein signaling of oxytocin receptor as a potential target for cabazitaxel-resistant prostate cancer 
          2024-Jan, PNAS nexus
          
          IF:2.2Q1
          
         
          DOI:10.1093/pnasnexus/pgae002
          PMID:38250514
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞,发现催产素受体信号通路可作为治疗靶点 | 首次在卡巴他赛耐药前列腺癌中发现催产素受体信号通路上调,并验证氯哌斯汀通过抑制该通路具有抗肿瘤活性 | 样本量有限,需要更大规模的临床研究验证 | 探索卡巴他赛耐药前列腺癌的耐药机制并寻找治疗靶点 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞和肿瘤组织 | 单细胞测序 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间基因表达分析, 质谱磷酸化蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 11698 | 2025-10-07 | Altered Sox9 and FGF signaling gene expression in Aga2 OI mice negatively affects linear growth 
          2023-11-08, JCI insight
          
          IF:6.3Q1
          
         
          DOI:10.1172/jci.insight.171984
          PMID:37796615
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Aga2 OI小鼠生长板组织,揭示I型胶原突变对软骨生长板的影响机制 | 首次在OI小鼠模型中通过单细胞RNA测序发现生长板软骨细胞中Sox9和FGF信号通路表达异常 | 研究仅限于Aga2+/-小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究成骨不全症对线性生长的负面影响机制 | Aga2+/-小鼠的胫骨和股骨生长板组织 | 单细胞转录组学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Aga2+/-小鼠生长板组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 11699 | 2025-10-07 | Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens 
          2023-11-08, JCI insight
          
          IF:6.3Q1
          
         
          DOI:10.1172/jci.insight.172449
          PMID:37751306
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现胰腺导管腺癌中的浆细胞能够分泌针对自身抗原的抗体 | 首次系统性地鉴定了胰腺癌中浆细胞产生的自身抗体所针对的三种特异性自身抗原(F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1) | 样本量较小(仅7例PDAC样本),且抗体反应性的功能意义尚未完全阐明 | 探索胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原特征 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和血浆样本 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白测序,重组抗体技术 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据,免疫组织化学数据 | 7例原发PDAC样本,41个重组抗体代表235个浆细胞和12个B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 11700 | 2025-10-07 | Islet-autoreactive CD4+ T cells are linked with response to alefacept in type 1 diabetes 
          2023-11-08, JCI insight
          
          IF:6.3Q1
          
         
          DOI:10.1172/jci.insight.167881
          PMID:37751304
         | 研究论文 | 本研究通过分析胰岛自身反应性CD4+ T细胞特征,探索其对阿法赛特治疗1型糖尿病疗效的预测价值 | 首次发现具有特定转录特征(簇3)的记忆表型IAR CD4+ T细胞基线频率与阿法赛特治疗反应呈负相关 | 样本量有限,需在更大队列中验证生物标志物的预测效能 | 寻找能预测1型糖尿病治疗反应的生物标志物 | 新发1型糖尿病患者的胰岛抗原反应性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | T1DAL临床试验参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |