单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 11661 - 11680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11661 | 2024-08-05 |
Distinct populations of antigen-specific tissue-resident CD8+ T cells in human cervix mucosa
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149950
PMID:34156975
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研究论文 | 研究了人类宫颈黏膜中抗原特异性组织驻留CD8+ T细胞的不同群体 | 首次通过单细胞RNA测序定义了人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的表型和TCR克隆型 | 缺乏广泛关于人类FRT中T细胞受体库的全面知识 | 研究人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的特征及其与特定病毒抗原的关系 | 主要研究人类宫颈黏膜中的CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 性传播感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HSV-2血清阳性个体中的Cervical CD8+ TRM克隆型，具体数量未提供 |
| 11662 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
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研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征，可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 |
| 11663 | 2024-08-05 |
Profiling B cell immunodominance after SARS-CoV-2 infection reveals antibody evolution to non-neutralizing viral targets
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.001
PMID:34022127
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研究论文 | 这篇文章解析了SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变，揭示了抗体对非中和病毒靶点的进化 | 首次通过单细胞测序分析COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性B细胞，并揭示了抗体对非中和内源性抗原的适应性 | 研究样本仅限于38名COVID-19患者，可能限制了结果的普适性 | 了解SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变及其对二次暴露时抗体的重要性 | 研究对象为38名COVID-19患者的记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 38名COVID-19患者 |
| 11664 | 2024-08-05 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
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研究论文 | 本研究显示，MHC类II的泛素化通过March-I调节树突状细胞的功能和生存 | 揭示了MHC类II的泛素化在树突状细胞功能中的重要性，并发现其缺失会影响到T细胞的激活能力 | 研究主要集中在小鼠模型中，未探讨人类树突状细胞的类似机制 | 探索MHC类II泛素化对树突状细胞及其激活CD4 T细胞能力的影响 | MHC类II泛素化缺失的小鼠树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠树突状细胞 |
| 11665 | 2024-08-05 |
Glycolytic metabolism of pathogenic T cells enables early detection of GVHD by 13C-MRI
2021-01-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020005770
PMID:32785680
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研究论文 | 本研究探讨了糖酵解代谢在早期检测移植物抗宿主病(GVHD)中的应用 | 提出了一种利用磁共振成像技术检测活化CD4+ T细胞糖酵解代谢，以实现GVHD的非侵入性早期检测的方法 | 该研究的IV型数据尚不完善，缺乏足够临床研究验证所述结果的有效性 | 旨在通过代谢成像技术，提供一种非侵入性方式早期检测GVHD | 主要研究活化的CD4+ T细胞与糖酵解过程在GVHD发病机制中的作用 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 超极化13C-丙酮酸磁共振成像 | 动物模型 | 代谢成像数据和转录组数据 | 在小鼠模型中进行，临床样本数据来源于接受AHSCT的患者 |
| 11666 | 2024-08-05 |
The NF-κB regulator Bcl-3 restricts terminal differentiation and promotes memory cell formation of CD8+ T cells during viral infection
2021-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009249
PMID:33508001
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研究论文 | 本研究记录了Bcl-3在CD8+ T细胞分化中的细胞自主作用 | 首次明确了Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中对记忆细胞和终末效应细胞平衡的自主决定作用 | 尚未清晰定义Bcl-3在各免疫细胞类型中的直接作用 | 探讨Bcl-3在病毒感染中CD8+ T细胞的分化角色 | Bcl-3缺失的CD8+ T细胞在病毒感染过程中的分化 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | 使用了Bcl3-/-小鼠的CD8+ T细胞进行分析 |
| 11667 | 2024-08-05 |
Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report
2020-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0733-7
PMID:31959990
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案例报告 | 该文章通过单细胞转录组分析指导靶向治疗药物诱导的超敏反应综合症的案例 | 提出通过单细胞RNA测序识别JAK-STAT信号通路作为潜在靶点，实现个性化治疗 | 临床应用的限制和对复杂人类病理生理理解的不充分 | 探讨药物诱导的超敏反应综合症的治疗策略 | 一名难治性药物诱导的超敏反应综合症患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和皮肤样本 | 一名患者的样本 |
| 11668 | 2024-08-05 |
Clonal kinetics and single-cell transcriptional profiling of CAR-T cells in patients undergoing CD19 CAR-T immunotherapy
2020-01-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13880-1
PMID:31924795
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研究论文 | 本文探讨了在接受CD19 CAR-T免疫治疗的患者中，CAR-T细胞的克隆动力学和转录组特征 | 本研究揭示了CAR-T细胞在输注后如何受到转录程序的调控，特别关注了细胞的克隆多样性及其对抗肿瘤反应的影响 | 尽管发现了克隆动力学的不同模式，但整合位点并未被确认作为克隆动力学的主要驱动因素 | 研究CAR-T细胞在输注后行为的转录程序及其克隆动力学 | 研究重点是CD8 CAR-T细胞，包括输注产品和患者的血液样本 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | TCRB测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 研究涉及的样本包括输注产品和接受治疗患者的血液样本 |
| 11669 | 2024-08-05 |
Single-Cell Applications of Next-Generation Sequencing
2019-10-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a026898
PMID:30617056
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研究论文 | 本文提供了单细胞测序的概述，并探讨了其在基础和临床研究中的应用 | 介绍了下一代测序技术在单细胞生物学中的新前沿 | 未提及具体的技术限制 | 提供单细胞测序的高级概述 | 单细胞及其在组织、微生物生态系统和癌症中的功能共存 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序 | NA | RNA和DNA | 数百到数百万个细胞 |
| 11670 | 2024-08-05 |
A component overlapping attribute clustering (COAC) algorithm for single-cell RNA sequencing data analysis and potential pathobiological implications
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006772
PMID:30779739
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研究论文 | 本研究开发了COAC算法用于分析单细胞RNA测序数据及其潜在的病理生物学意义 | 提出了一个新的COAC算法，能够从大规模单细胞RNA测序数据中执行局部基因共表达网络分析 | 尽管COAC算法显示出高准确率，但仍然依赖于数据的质量和完整性，限制了其在其他类型数据中的应用 | 研究旨在通过分析单细胞RNA测序数据识别功能基因集合及其调控网络与人类疾病之间的联系 | 研究对象为来自黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 来自多名黑色素瘤患者的单细胞RNA测序资料 |
| 11671 | 2024-08-05 |
Assessing parameter efficient methods for pre-trained language model in annotating scRNA-seq data
2024-Aug, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.05.007
PMID:38759908
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研究论文 | 本文探讨了在注释单细胞RNA测序数据中的参数高效方法 | 引入参数高效微调(PEFT)的新方法，以减少计算成本，同时优化少量参数 | 微调预训练语言模型仍然需要大量计算资源，可能对一些研究者而言不够实用 | 研究如何高效地注释单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 探索三种参数高效微调方法在scRNA-seq细胞类型注释中的能力 | 自然语言处理 | 肿瘤 | scBERT | NA | 数据集 | 多个数据集的基准研究 |
| 11672 | 2024-08-05 |
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma immune prognostic signature through a naive B cell gene set
2024-Jul-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216981
PMID:38795761
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中的Naive B细胞免疫预后标志。 | 提出了一种基于Naive B细胞基因集的12个基因预后标志，能够精准映射PDAC中的免疫相互作用。 | 尚未完全理解肿瘤浸润免疫细胞与肿瘤微环境的详细分子相互作用。 | 研究Naive B细胞在胰腺导管腺癌中的免疫预后意义。 | 分析与PDAC相关的Naive B细胞基因及其在预后中的作用。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CIBERSORT，单细胞RNA测序，WGCNA | Lasso，plsRcox | 转录组数据 | 包含多个外部队列以及多种风险分层的患者组 |
| 11673 | 2024-08-04 |
Functional genomics of the human epididymis: Further characterization of efferent ducts and model systems by single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13477
PMID:37301539
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术阐明了人类附睾的细胞特征。 | 该研究首次详细描述了人类附睾的不同细胞类型及其在体外培养模型中的适应性。 | 研究受限于组织样本的稀缺，且主要依赖于单细胞RNA测序的生物信息学分析。 | 阐明人类附睾的细胞类型及其功能。 | 人类附睾的不同解剖区域的细胞及其在二维和三维培养模型中的特征。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 不同解剖区域的人类附睾组织 |
| 11674 | 2024-08-04 |
Developing a dormancy-associated ECM signature in TNBC that is linked to immunosuppressive tumor microenvironment and selective sensitivity to MAPK inhibitors
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32106
PMID:38868025
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研究论文 | 本研究揭示了与休眠相关的ECM特征在三阴性乳腺癌中如何与免疫抑制肿瘤微环境及对MAPK抑制剂的选择性敏感性相关 | 首次描述了休眠癌细胞的ECM特征及其与免疫抑制微环境的相互作用 | 研究中缺乏临床样本验证和长期随访数据 | 探讨三阴性乳腺癌中休眠癌细胞与ECM的相互作用及其在治疗中的潜在应用 | 主要研究MDA-MB-231细胞系中的休眠癌细胞及其相关的ECM特征 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 主要使用MDA-MB-231细胞系进行研究 |
| 11675 | 2024-08-04 |
Multi-omics analysis uncovered systemic lupus erythematosus and COVID-19 crosstalk
2024-Jun-11, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00851-6
PMID:38862942
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19对系统性红斑狼疮(SLE)的影响及两种疾病之间的相互作用机制 | 发现了14个在COVID-19和SLE之间共享的中心基因，并确认了IFN-I/II介导的JAK-STAT信号通路在这些基因调控中的作用 | 本研究基于已有数据集，可能未完全覆盖所有相关的基因或信号通路 | 阐明COVID-19对SLE的影响及其潜在机制 | 研究COVID-19与系统性红斑狼疮之间的相互影响及其共享的基因特征 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 使用了多个RNA-seq数据集和全基因组关联研究数据集 |
| 11676 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing depicts tumor architecture and empowers clinical decision in metastatic conjunctival melanoma
2024-Jun-11, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00683-y
PMID:38862482
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研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序描绘了转移性结膜黑色素瘤的肿瘤结构，并为临床决策提供支持 | 本研究首次将单细胞RNA测序分析转化为针对癌症的临床试验，提供了一个新概念，将单细胞RNA测序数据与癌症治疗相结合 | 样本量可能有限，仅包括7个结膜黑色素瘤样本，研究结果的普遍性需要进一步验证 | 揭示结膜黑色素瘤在肿瘤发生和进展过程中的肿瘤微环境的景观和异质性 | 正常结膜样本（n=3）和结膜黑色素瘤（n=7）中的47017个细胞 | 数字病理学 | 结膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组 | 共获得47017个细胞，包含3个正常结膜样本和7个结膜黑色素瘤样本 |
| 11677 | 2024-08-04 |
DOT: a flexible multi-objective optimization framework for transferring features across single-cell and spatial omics
2024-Jun-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48868-z
PMID:38862466
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研究论文 | 本文提出了DOT，一个灵活的多目标优化框架，旨在在单细胞转录组学和空间组学之间转移细胞特征 | DOT框架通过利用超出数据模式中的共同基因，进行空间特征的转移，并推断组织部位细胞群体的绝对和相对丰度，展示了其创新性 | 对细胞类型信息的空间特征转移可能受限于所使用的技术和数据的特点 | 研究单细胞转录组学与空间分辨率数据的结合 | 涉及细胞特征的转移和定位问题 | 数字病理学 | NA | 基于Frank-Wolfe算法的优化技术 | NA | 单细胞转录组数据和空间数据 | NA |
| 11678 | 2024-08-04 |
Spatially resolved multiomics on the neuronal effects induced by spaceflight in mice
2024-Jun-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48916-8
PMID:38862479
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研究论文 | 本研究探讨了航天飞行对小鼠大脑的神经影响，采用单细胞多组学与空间转录组学相结合的方法 | 首次将单细胞多组学与空间转录组学结合，深入解析航天飞行对小鼠脑部的影响 | 研究对象仅限于雌性小鼠，尚未纳入不同性别或品种的样本 | 旨在揭示航天飞行对中枢神经系统的影响 | 以雌性小鼠为研究对象，通过比较地面对照组和航天飞行暴露组 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 数据集 | 小鼠样本数量未具体说明 |
| 11679 | 2024-08-05 |
Metric multidimensional scaling for large single-cell datasets using neural networks
2024-Jun-11, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-024-00265-3
PMID:38863064
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研究论文 | 该文章提出了一种基于神经网络的度量多维尺度方法，用于处理大规模单细胞数据集 | 本研究提出的神经网络方法比之前的先进方法快几个数量级，并能处理多达数百万个细胞的数据集 | 当前方法尚未在其它类型的数据集上进行验证 | 研究目的是解决传统方法在处理大规模单细胞RNA测序实验中面临的效率问题 | 研究对象为单细胞RNA测序实验中的大规模数据集 | 数字病理学 | NA | 神经网络 | NA | 单细胞数据 | 多达数百万个细胞 |
| 11680 | 2024-08-05 |
TMPRSS2 is a tumor suppressor and its downregulation promotes antitumor immunity and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2024-Jun-11, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02870-7
PMID:38862975
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研究论文 | 本研究探讨了TMPRSS2在肺腺癌中的作用及其与抗肿瘤免疫和免疫疗效的关系 | TMPRSS2被确认为肿瘤抑制因子，其下调与肺腺癌的免疫表现和预后相关联 | 研究主要集中于单一类型的肺癌，可能不适用于其他癌症类型 | 探讨TMPRSS2在肺腺癌中的生物学功能及其与免疫特征的关系 | 分析肺腺癌中TMPRSS2的表达及其影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、生物信息学分析、蛋白组学 | NA | RNA测序数据、蛋白组学数据 | 使用了五个转录组学数据集、一个单细胞RNA测序数据集和一个蛋白组学数据集 |