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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11641 | 2025-10-07 |
ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling
2024-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48285-2
PMID:38816354
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研究论文 | 本研究揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路维持间充质干细胞静息状态的新机制 | 首次发现ARID1B通过直接结合Bcl11b第三内含子抑制其表达,从而调控非经典Activin信号通路维持MSC静息状态 | 研究主要基于小鼠切牙模型,在人类系统中的验证尚需进一步研究 | 探究ARID1B在间充质干细胞静息维持中的调控功能和分子机制 | 小鼠GLI1+间充质干细胞谱系 | 干细胞生物学 | Coffin-Siris综合征 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
11642 | 2025-10-07 |
Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma
2024-05-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad257
PMID:38237157
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在胶质母细胞瘤中对髓系细胞吞噬功能的调控作用 | 首次发现TREM2在胶质瘤中与吞噬功能标志物正相关而非免疫抑制通路,并揭示其通过Syk信号通路介导吞噬作用 | 使用小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病,研究样本量未明确说明 | 探究TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用机制 | 人类胶质瘤样本和两种不同的小鼠胶质瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内吞噬追踪方法,体外实验 | 小鼠胶质瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11643 | 2024-08-13 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar
2025-Feb, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022
PMID:39128494
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11644 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Jan-14, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
11645 | 2025-10-07 |
The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis
2024-01-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020895
PMID:37879046
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研究论文 | 本研究通过多种成像技术和单细胞RNA测序分析证实骨髓是血小板生成的主要场所 | 首次系统比较骨髓、脾脏和肺部巨核细胞的相对丰度及血小板生成能力,结合多种先进成像技术和单细胞测序数据分析 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于已发表的单细胞测序数据库,需要进一步实验验证 | 确定在稳态条件下血小板生成的主要器官及其相对贡献 | 成年小鼠的骨髓、脾脏和肺部巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 双光子活体成像, 光片显微镜, 定量组织成像 | NA | 图像, 测序数据, 流式数据 | 成年小鼠骨髓、脾脏和肺部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11646 | 2025-10-07 |
Targeting MXD1 sensitises pancreatic cancer to trametinib
2025-Jan-16, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333408
PMID:39819860
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌对trametinib耐药的分子机制,并发现MXD1可作为克服耐药性的潜在治疗靶点 | 首次发现trametinib治疗通过诱导MXD1表达激活转座元件转录和病毒模拟反应,导致耐药性产生 | NA | 阐明PDAC对trametinib耐药的机制并识别相关可成药靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源异种移植模型和原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
11647 | 2025-10-07 |
Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis
2025-Jan, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00582-1
PMID:39715784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,构建了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱 | 首次结合多研究单细胞RNA测序与12例不同阶段人类标本的空间转录组数据,揭示微血管系统在动脉粥样硬化中的新作用机制 | 样本量相对有限(12例人类标本),需要更大规模研究验证发现 | 揭示人类动脉粥样硬化中细胞类型特异性表达变化和空间受限的细胞间通讯 | 人类动脉粥样硬化斑块标本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 12例不同阶段人类动脉粥样硬化标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11648 | 2025-10-07 |
Identifying cell-type-specific spatially variable genes with ctSVG
2024-Dec-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5655066/v1
PMID:39764138
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研究论文 | 开发了一种名为ctSVG的计算方法,用于在单细胞分辨率下识别细胞类型特异性的空间可变基因 | 首次提出专门针对单细胞分辨率空间转录组数据的细胞类型特异性空间可变基因识别方法,相比传统方法能发现更多不重叠的新基因 | 目前主要针对Visium HD空间转录组技术,在其他平台上的适用性有待验证 | 解决传统空间可变基因识别方法未能充分利用空间位置信息的问题 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | ctSVG计算方法 | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组单细胞分辨率技术 |
11649 | 2025-10-07 |
Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis
2024-Oct, Rheumatology and therapy
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s40744-024-00699-6
PMID:39073510
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研究论文 | 本研究探讨IL-6/JAK/STAT3信号通路在幼年皮肌炎中的异常激活机制及其与肌肉损伤的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示JDM患者骨骼肌细胞、巨噬细胞和血管内皮细胞中JAK/STAT3通路的异常激活,并发现IL-6通过调节钙通道基因SLN和诱导ROS产生参与肌肉损伤 | 样本量有限(72例患者,仅2例进行scRNA-seq分析),亚组分析中TIF1γ阳性患者未显示IL-6显著升高 | 阐明IL-6激活JAK/STAT3通路在幼年皮肌炎发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者(新诊断72例,治疗缓解期同一队列)及健康对照 | 免疫学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RT-PCR, ROS检测 | NA | 血清样本, 肌肉活检组织, 细胞实验数据 | 72例JDM患者(含亚组分析),2例JDM患者肌肉活检scRNA-seq,体外骨骼肌细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11650 | 2025-10-07 |
The architecture of silk-secreting organs during the final larval stage of silkworms revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114460
PMID:38996068
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研究论文 | 通过单核和空间转录组学揭示家蚕末龄幼虫丝腺器官的细胞和空间组织结构 | 首次结合单核和空间转录组学系统绘制家蚕末龄幼虫丝腺的细胞组成和空间结构图谱 | NA | 阐明丝腺器官的细胞空间组织和高效丝蛋白合成机制 | 家蚕末龄幼虫的丝腺器官 | 空间转录组学 | NA | 单核转录组学, 空间转录组学, 转基因技术 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
11651 | 2025-10-07 |
The mechano-chemical circuit in fibroblasts and dendritic cells drives basal cell proliferation in psoriasis
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114513
PMID:39003736
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研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞通过机械-化学信号通路驱动成纤维细胞增强真皮硬度,从而促进银屑病基底细胞过度增殖的新机制 | 首次发现树突状细胞分泌的LGALS9可通过CD44受体作用于真皮成纤维细胞,建立机械-化学信号通路调控银屑病基底细胞增殖 | NA | 阐明银屑病发病机制中真皮成纤维细胞的作用及机械-化学信号通路 | 树突状细胞、真皮成纤维细胞、表皮基底细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、硬度测量 | NA | 基因表达数据、空间定位数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11652 | 2025-10-07 |
Identification and characterization of TM4SF1+ tumor self-seeded cells
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114512
PMID:39003738
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研究论文 | 本研究通过光转换标记技术识别并表征了TM4SF1+肿瘤自播种细胞,揭示了其在肿瘤生长和转移中的关键作用 | 首次建立准确追踪肿瘤自播种细胞的动物模型,发现TM4SF1作为TSCs特异性标志物,并证实其在癌症早期即可检测 | TSCs的追踪和分离技术仍存在挑战,需要进一步验证其临床应用的可行性 | 研究肿瘤自播种细胞的特性及其在癌症进展中的功能 | 循环肿瘤细胞和肿瘤自播种细胞 | 癌症生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,光转换标记技术 | 动物模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11653 | 2025-10-07 |
An atlas of GPCRs in dopamine neurons: Identification of the free fatty acid receptor 4 as a regulator of food and water intake
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114509
PMID:39003735
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研究论文 | 本研究通过构建多巴胺神经元中GPCR的图谱,发现游离脂肪酸受体4(FFAR4)是调节食物和水分摄入的关键因子 | 首次系统绘制了多巴胺神经元中GPCR的表达图谱,并鉴定出FFAR4作为连接高能量摄入与多巴胺奖赏通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要在其他物种中验证;部分受体的功能验证尚未完全完成 | 绘制中脑多巴胺神经元中G蛋白偶联受体的表达图谱,并探索其在代谢调节中的作用 | Dat-eGFP转基因小鼠的中脑多巴胺神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | qPCR阵列分析、单细胞RNA测序数据挖掘、离体钙成像、体内功能实验 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、行为学数据 | Dat-eGFP小鼠的多巴胺神经元,分析了377个GPCR的表达 | NA | 单细胞RNA-seq、qPCR | NA | NA |
11654 | 2025-10-07 |
Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues
2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069
PMID:38670317
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研究论文 | 本研究利用GTEx数据集分析49种人体组织中基因表达变异的模式和原因 | 对17,282个样本进行大规模表达变异分析,识别出522个变异转录本簇并系统分类其生物学和技术原因 | 仅评估了最可变的前2%转录本,部分变异簇(14%)未能明确归因 | 探究人体组织基因表达中非期望变异的模式和原因 | 49种人体组织的17,282个基因表达样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17,282个样本来自49种人体组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
11655 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Heterogeneity and Transcriptional Dynamics in Porcine Circulating CD8+ T Cells
2024-04-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080692
PMID:38667307
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示猪循环CD8+ T细胞的异质性和转录动态 | 首次系统表征猪外周血CD8+ T细胞的异质性,定义四种亚型并揭示其分化轨迹和转录组差异 | NA | 解析猪免疫系统中CD8+ T细胞亚型的异质性和功能特征 | 猪外周血循环细胞中的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11656 | 2025-10-07 |
Single-Cell DNA Sequencing Reveals an Evolutionary Pattern of CHIP in Transplant Eligible Multiple Myeloma Patients
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080657
PMID:38667272
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研究论文 | 通过单细胞DNA测序揭示适合移植的多发性骨髓瘤患者中CHIP的进化模式 | 首次使用单细胞DNA测序技术研究多发性骨髓瘤患者自体干细胞移植前后CHIP的克隆进化动态 | 样本量较小(仅12例患者),仅检测了20个白血病相关基因 | 研究多发性骨髓瘤患者中克隆造血现象的进化模式及其与治疗反应的关系 | 多发性骨髓瘤患者的循环CD34+细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞DNA测序,高通量扩增子测序 | NA | 单细胞DNA测序数据 | 12例多发性骨髓瘤患者,其中4例有纵向样本 | Mission Bio | 单细胞DNA测序 | Tapestri | MissionBio Tapestri平台,包含20个白血病相关基因的靶向panel |
11657 | 2025-10-07 |
Potential Roles of Specific Subclasses of Premotor Interneurons in Spinal Cord Function Recovery after Traumatic Spinal Cord Injury in Adults
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080652
PMID:38667267
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综述 | 回顾了成年创伤性脊髓损伤后运动前中间神经元在形成新脊髓内回路中的作用研究 | 强调单细胞RNA测序揭示成年脊髓中间神经元表达谱重叠的新发现,挑战传统基于胚胎发育转录因子的分类方法 | 明确指出现有研究很少澄清参与功能恢复的具体细胞身份,研究人员在分类这些群体时面临困难 | 探讨特定运动前中间神经元亚类在成年创伤性脊髓损伤后功能恢复中的潜在作用 | 脊髓运动前中间神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,转录组学实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11658 | 2025-10-07 |
Brooklyn plots to identify co-expression dysregulation in single cell sequencing
2024-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad112
PMID:38213836
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研究论文 | 开发了一种名为'布鲁克林图'的软件工具,用于检测单细胞RNA测序数据中染色体相邻基因共表达的全局变化 | 首次提出使用布鲁克林图检测单细胞测序数据中基因组相关相邻基因共表达的非随机性变化 | 方法主要针对单细胞数据集,在批量数据集中可能无法观察到相同的转录爆发模式 | 识别人类疾病中开放染色质区域改变导致的基因共表达失调 | 扩张型心肌病心肌细胞及其他细胞类型的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | 统计分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11659 | 2025-10-07 |
Expansion spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01911-1
PMID:37349575
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研究论文 | 本研究提出了一种扩展空间转录组学方法,通过组织透明化和膨胀处理提高基因表达检测的空间分辨率 | 通过组织透明化和膨胀处理结合改进的捕获协议,突破了传统空间转录组技术中阵列密度对分辨率的限制 | 仅在小鼠脑样本中进行了验证,尚未在其他组织类型或物种中测试 | 开发高分辨率空间转录组学技术以更精确解析组织中的基因表达模式 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,polyA转录组捕获 | NA | 基因表达数据,空间位置信息 | 小鼠脑样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
11660 | 2025-10-07 |
Generation and Functional Analysis of Defective Viral Genomes during SARS-CoV-2 Infection
2023-06-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00250-23
PMID:37074178
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研究论文 | 本研究阐明了SARS-CoV-2感染过程中缺陷病毒基因组的生成机制及其与宿主抗病毒免疫反应的关系 | 首次发现SARS-CoV-2缺陷病毒基因组与持续性病毒感染相关,并识别了四个基因组重组热点区域 | 缺陷病毒基因组生成的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2缺陷病毒基因组的生成机制和免疫功能 | SARS-CoV-2病毒和COVID-19患者样本 | 病毒学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 二代测序 | NA | 转录组测序数据 | COVID-19患者感染样本和尸检肺组织 | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |