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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11641 - 11660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11641 | 2025-10-07 |
Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues
2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069
PMID:38670317
|
研究论文 | 本研究利用GTEx数据集分析49种人体组织中基因表达变异的模式和原因 | 对17,282个样本进行大规模表达变异分析，识别出522个变异转录本簇并系统分类其生物学和技术原因 | 仅评估了最可变的前2%转录本，部分变异簇(14%)未能明确归因 | 探究人体组织基因表达中非期望变异的模式和原因 | 49种人体组织的17,282个基因表达样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17,282个样本来自49种人体组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11642 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Heterogeneity and Transcriptional Dynamics in Porcine Circulating CD8+ T Cells
2024-04-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080692
PMID:38667307
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示猪循环CD8+ T细胞的异质性和转录动态 | 首次系统表征猪外周血CD8+ T细胞的异质性，定义四种亚型并揭示其分化轨迹和转录组差异 | NA | 解析猪免疫系统中CD8+ T细胞亚型的异质性和功能特征 | 猪外周血循环细胞中的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11643 | 2025-10-07 |
Single-Cell DNA Sequencing Reveals an Evolutionary Pattern of CHIP in Transplant Eligible Multiple Myeloma Patients
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080657
PMID:38667272
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研究论文 | 通过单细胞DNA测序揭示适合移植的多发性骨髓瘤患者中CHIP的进化模式 | 首次使用单细胞DNA测序技术研究多发性骨髓瘤患者自体干细胞移植前后CHIP的克隆进化动态 | 样本量较小（仅12例患者），仅检测了20个白血病相关基因 | 研究多发性骨髓瘤患者中克隆造血现象的进化模式及其与治疗反应的关系 | 多发性骨髓瘤患者的循环CD34+细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞DNA测序，高通量扩增子测序 | NA | 单细胞DNA测序数据 | 12例多发性骨髓瘤患者，其中4例有纵向样本 | Mission Bio | 单细胞DNA测序 | Tapestri | MissionBio Tapestri平台，包含20个白血病相关基因的靶向panel |
| 11644 | 2025-10-07 |
Potential Roles of Specific Subclasses of Premotor Interneurons in Spinal Cord Function Recovery after Traumatic Spinal Cord Injury in Adults
2024-04-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13080652
PMID:38667267
|
综述 | 回顾了成年创伤性脊髓损伤后运动前中间神经元在形成新脊髓内回路中的作用研究 | 强调单细胞RNA测序揭示成年脊髓中间神经元表达谱重叠的新发现，挑战传统基于胚胎发育转录因子的分类方法 | 明确指出现有研究很少澄清参与功能恢复的具体细胞身份，研究人员在分类这些群体时面临困难 | 探讨特定运动前中间神经元亚类在成年创伤性脊髓损伤后功能恢复中的潜在作用 | 脊髓运动前中间神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,转录组学实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11645 | 2025-10-07 |
Brooklyn plots to identify co-expression dysregulation in single cell sequencing
2024-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad112
PMID:38213836
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研究论文 | 开发了一种名为'布鲁克林图'的软件工具，用于检测单细胞RNA测序数据中染色体相邻基因共表达的全局变化 | 首次提出使用布鲁克林图检测单细胞测序数据中基因组相关相邻基因共表达的非随机性变化 | 方法主要针对单细胞数据集，在批量数据集中可能无法观察到相同的转录爆发模式 | 识别人类疾病中开放染色质区域改变导致的基因共表达失调 | 扩张型心肌病心肌细胞及其他细胞类型的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | 统计分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11646 | 2025-10-07 |
Expansion spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01911-1
PMID:37349575
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研究论文 | 本研究提出了一种扩展空间转录组学方法，通过组织透明化和膨胀处理提高基因表达检测的空间分辨率 | 通过组织透明化和膨胀处理结合改进的捕获协议，突破了传统空间转录组技术中阵列密度对分辨率的限制 | 仅在小鼠脑样本中进行了验证，尚未在其他组织类型或物种中测试 | 开发高分辨率空间转录组学技术以更精确解析组织中的基因表达模式 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，polyA转录组捕获 | NA | 基因表达数据，空间位置信息 | 小鼠脑样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11647 | 2025-10-07 |
Generation and Functional Analysis of Defective Viral Genomes during SARS-CoV-2 Infection
2023-06-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00250-23
PMID:37074178
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研究论文 | 本研究阐明了SARS-CoV-2感染过程中缺陷病毒基因组的生成机制及其与宿主抗病毒免疫反应的关系 | 首次发现SARS-CoV-2缺陷病毒基因组与持续性病毒感染相关，并识别了四个基因组重组热点区域 | 缺陷病毒基因组生成的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2缺陷病毒基因组的生成机制和免疫功能 | SARS-CoV-2病毒和COVID-19患者样本 | 病毒学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 二代测序 | NA | 转录组测序数据 | COVID-19患者感染样本和尸检肺组织 | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11648 | 2025-10-07 |
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281898
PMID:36827401
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研究论文 | 开发了一种从SARS-CoV-2感染细胞制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法 | 首次建立甲醇-丙酮灭活方法，使单细胞RNA测序分析可在BSL2实验室安全进行 | 方法仅在非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞中验证，需进一步测试其他细胞类型 | 开发安全研究SARS-CoV-2的高通量分子检测方法 | SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织培养感染剂量测定 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11649 | 2025-10-07 |
Isolation of myeloid cells from mouse brain tumors for single-cell RNA-seq analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100957
PMID:34825218
|
研究论文 | 开发从小鼠脑肿瘤中分离髓系细胞用于单细胞RNA测序分析的实验方案 | 无需细胞分选即可快速分离小鼠小脑肿瘤中的髓系细胞，最大限度减少细胞损伤 | 未提及样本量限制或技术局限性 | 建立优化的单细胞RNA测序样本制备流程 | 小鼠脑肿瘤中的髓系细胞 | 单细胞测序 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11650 | 2025-10-07 |
Multi-omic evaluation of metabolic alterations in multiple sclerosis identifies shifts in aromatic amino acid metabolism
2021-10-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100424
PMID:34755135
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法评估多发性硬化症中的代谢改变，重点分析了芳香族氨基酸代谢的变化 | 首次在多发性硬化症患者中发现芳香族氨基酸代谢的显著异常，并揭示了这些代谢变化与疾病残疾程度的相关性 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探究多发性硬化症的代谢组学特征及其与疾病病理生理的关系 | 多发性硬化症患者和健康对照者的血液样本 | 代谢组学 | 多发性硬化症 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据，单细胞RNA测序数据 | 多发性硬化症患者637个样本，健康对照317个样本 | NA | 单细胞RNA-seq，代谢组学分析 | NA | NA |
| 11651 | 2025-10-07 |
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-021-00269-2
PMID:34001262
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法 | 首次在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序，而非传统的单核RNA测序 | 763个细胞中仅有171个达到质量控制标准，样本利用率较低 | 探索在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序的可行性 | 小鼠快肌趾短屈肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式分选, RNA原位杂交(RISH) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 763个小鼠趾短屈肌肌纤维(171个通过质量控制) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11652 | 2025-10-07 |
Consistent RNA sequencing contamination in GTEx and other data sets
2020-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15821-9
PMID:32321923
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研究论文 | 本研究通过分析GTEx和其他RNA测序数据集，揭示了测序污染的存在及其对分析结果的影响 | 首次系统性地识别和验证了GTEx数据集中广泛存在的RNA测序交叉污染现象 | 研究主要基于现有数据集的分析，缺乏实验验证污染的具体机制 | 探究下一代测序中读段污染的影响因素和程度 | GTEx数据集中的48种组织样本及其他研究的RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | GTEx数据集中的48种组织类型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11653 | 2025-10-07 |
Transcriptional characterisation of human lung cells identifies novel mesenchymal lineage markers
2020-01, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00746-2019
PMID:31619469
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胎儿肺组织，鉴定出新型间充质谱系标志物 | 首次在人类胎儿肺中识别出分子特征不同的间充质祖细胞群，并发现气道和血管平滑肌细胞在发育早期就具有独特的空间特异性标志物 | 研究仅针对胎儿肺组织，缺乏对成熟肺组织的分析 | 深入理解人类肺间充质细胞的多样性和谱系特化机制 | 人类胎儿肺组织细胞 | 单细胞基因组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，原位杂交 | Seurat分析流程（典型相关分析、聚类分析、t-SNE可视化） | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 人类胎儿肺组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11654 | 2025-10-07 |
Macrophages preserve endothelial cell specialization in the adrenal gland to modulate aldosterone secretion and blood pressure
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114395
PMID:38941187
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞通过VEGF-A信号维持肾上腺内皮细胞特化，调控醛固酮分泌和血压的机制 | 首次发现巨噬细胞通过VEGF-A信号维持肾上腺球状带PLVAP窗孔内皮细胞，提出“haptosecretagogue”信号新概念 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究巨噬细胞在肾上腺内皮细胞特化和醛固酮分泌调控中的作用 | 肾上腺巨噬细胞、内皮细胞、醛固酮分泌机制 | 分子生物学 | 原发性醛固酮增多症 | 单细胞转录组测序、功能表型分析、基因特异性敲除 | NA | 基因表达数据、生理指标数据 | 基因工程小鼠模型、人类醛固酮产生腺瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11655 | 2025-10-07 |
Insulin and leptin oscillations license food-entrained browning and metabolic flexibility
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114390
PMID:38900636
|
研究论文 | 本研究揭示了定时喂养通过诱导胰岛素和瘦素的双相振荡促进皮下白色脂肪组织褐变和代谢灵活性的机制 | 首次发现胰岛素和瘦素的双相振荡是定时喂养诱导脂肪褐变的关键许可信号，并阐明其通过ILC2细胞招募和神经支配依赖的机制 | 研究主要基于动物模型，人类临床相关性尚需验证；具体信号通路细节仍需进一步阐明 | 探索定时喂养促进脂肪组织褐变和能量消耗的整合机制 | 小鼠皮下白色脂肪组织(sWAT)、先天淋巴样2型细胞(ILC2)、胰岛素和瘦素信号通路 | 代谢生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、神经切除手术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、代谢参数 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11656 | 2025-10-07 |
The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage†
2025-Jan-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae136
PMID:39303127
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现复发性流产患者母胎界面中dNK1/2和EVT1细胞亚群的缺失 | 首次鉴定出同时表达dNK1和dNK2生物标志物的新NK细胞亚群dNK1/2，并发现其在复发性流产组织中缺失 | NA | 研究复发性流产患者母胎界面的细胞特征异常 | 复发性流产患者和健康捐赠者的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 复发性流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发性流产患者和健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11657 | 2025-10-07 |
PerturbDB for unraveling gene functions and regulatory networks
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae777
PMID:39265120
|
研究论文 | 开发了PerturbDB平台，用于整合和分析Perturb-Seq数据集以揭示基因功能和调控网络 | 首个用户友好的Perturb-Seq数据整合平台，通过基因聚类和化学扰动整合识别潜在抑制剂 | 平台依赖现有公开数据集，未提及对新数据类型的扩展支持 | 构建基因功能研究和调控网络解析的平台工具 | 基因功能、调控网络、癌症相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | Perturb-Seq, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | Mixscape算法 | 单细胞转录组数据 | 4,518,521个单细胞转录组，涉及10,194个基因在19种细胞系中的敲低实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11658 | 2025-10-07 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
|
研究论文 | 介绍了一个名为MAPbrain的灵长类大脑多组学图谱平台 | 开发了首个整合转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据的灵长类大脑多组学图谱 | 未明确说明数据整合和分析方法的具体技术限制 | 理解基因如何影响大脑发育及神经系统疾病机制 | 灵长类大脑发育过程 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个亚区，涵盖胚胎和成年阶段，包含人类和非人灵长类的164个时间点 | NA | 多组学整合分析 | MAPbrain | 在线交互式多组学分析平台，支持用户数据上传和整合分析 |
| 11659 | 2025-10-07 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
|
研究论文 | 介绍scTWAS Atlas知识库，这是一个整合单细胞转录组全关联研究数据的综合性数据库 | 开发首个整合文献整理和数据分析的scTWAS综合知识库，提供交互式知识图谱和多组学水平调控网络 | 当前版本仅涵盖34个性状、30种细胞类型和9种细胞条件，覆盖范围有待扩展 | 构建单细胞转录组全关联研究的综合知识库，解决细胞类型异质性解释难题 | 基因-性状关联、细胞类型特异性调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究(scTWAS)、单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析 | NA | 基因表达数据、关联分析数据、多组学数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状、30种细胞类型、9种细胞条件和16,470个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11660 | 2025-10-07 |
CancerSCEM 2.0: an updated data resource of single-cell expression map across various human cancers
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae954
PMID:39460627
|
研究论文 | 介绍单细胞表达图谱数据库CancerSCEM 2.0的更新内容与功能增强 | 新增拷贝数变异评估、转录因子富集、伪时间轨迹构建、生物特征评分等功能，并首次引入单细胞水平癌症代谢图谱 | 未提及具体的技术验证或数据质量评估细节 | 构建和优化人类癌症单细胞表达图谱数据库 | 127个研究项目中的1466个单细胞RNA测序数据集，涵盖74种癌症类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1466个数据集，涵盖肿瘤、匹配正常组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |