单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11621 - 11640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11621 | 2025-10-07 |
Identification and validation of five ferroptosis-related molecular signatures in keloids based on multiple transcriptome data analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1490745
PMID:39834787
|
研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析鉴定并验证了与瘢痕疙瘩相关的五个铁死亡相关分子标志物 | 首次系统性地识别了瘢痕疙瘩中与铁死亡相关的关键基因，并通过单细胞测序等多重分析验证了这些基因在纤维化过程中的作用 | 样本量相对有限（24个瘢痕疙瘩和17个正常皮肤样本），需要更大规模的研究验证 | 探索铁死亡在瘢痕疙瘩形成机制中的作用，并识别相关关键基因 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | 转录组测序, qRT-PCR, Western blot, 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 24个瘢痕疙瘩样本和17个正常皮肤样本（转录组数据），外加5个瘢痕疙瘩和5个正常皮肤活检（实验验证） | NCBI | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | GEO数据库 | NCBI GEO数据库中的GSE145725、GSE7890、GSE44270和GSE181316数据集 |
| 11622 | 2025-10-07 |
Epigenetic Induction of Smooth Muscle Cell Phenotypic Alterations in Aortic Aneurysms and Dissections
2023-09-19, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的表观遗传调控机制 | 首次发现IRF3通过STING-TBK1信号通路调控平滑肌细胞表型转变的表观遗传机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 小鼠主动脉平滑肌细胞和人类升主动脉瘤组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 小鼠模型和人类主动脉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 11623 | 2025-10-07 |
Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2452701
PMID:39829399
|
研究论文 | 本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因构建儿童急性淋巴细胞白血病的预后模型 | 首次将中性粒细胞胞外诱捕网相关基因与儿童急性淋巴细胞白血病预后关联，并通过多组学分析和体外实验验证 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 转录组测序, 单细胞转录组测序, RT-qPCR, 多组学分析 | LASSO回归, Cox回归, 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自TARGET-ALL-P2、TARGET-ALL-P3队列和GSE26713、GSE130116数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 11624 | 2025-10-07 |
Identification of circadian rhythm-related biomarkers and development of diagnostic models for Crohn's disease using machine learning algorithms
2025-Jan-21, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453922
PMID:39836385
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别克罗恩病的昼夜节律相关生物标志物并开发诊断模型 | 首次将昼夜节律相关基因与克罗恩病诊断相结合，并利用单细胞测序技术验证基因表达特征 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发克罗恩病的诊断模型并预测生物疗法疗效 | 克罗恩病患者和对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析 | 机器学习算法, 回归技术 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11625 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Small-Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Cervix
2025-Jan, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70183
PMID:39831355
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞起源和演化过程 | 首次在单细胞分辨率下提供宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞组成、HPV感染特征和基因表达谱的全面见解 | 仅基于两名患者的样本数据，样本量较小 | 探究宫颈小细胞神经内分泌癌的细胞异质性、起源和肿瘤发生轨迹 | 宫颈小细胞神经内分泌癌患者肿瘤组织和邻近正常宫颈组织 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,全外显子测序 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 2名患者 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子测序 | NA | NA |
| 11626 | 2025-10-07 |
The transcription factor TCF21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.14.607910
PMID:39211232
|
研究论文 | 本研究探讨转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的调控作用 | 首次揭示TCF21缺失导致肾脏基质细胞亚群特异性耗竭并诱导血管内皮标志物Emcn异常表达的新型细胞群体 | 研究仅聚焦于胚胎期14.5天的时间点，未涵盖肾脏发育全过程 | 解析TCF21在肾脏发育过程中调控Foxd1+基质祖细胞分化的分子机制 | 小鼠胚胎肾脏中的Foxd1+基质祖细胞 | 发育生物学 | 先天性肾脏异常 | 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 32,461个GFP+细胞来自E14.5胚胎肾脏 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11627 | 2025-10-07 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-Nov, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
|
研究论文 | 通过综合基因组学分析研究人类多能干细胞在体外培养过程中获得'培养适应性表型'的分子机制 | 首次在等基因hESC模型中系统分析培养诱导异常的表观遗传机制，揭示20q11.21拷贝数增加和表观遗传变化共同驱动培养适应性表型 | 研究基于特定hESC模型，结果可能不适用于所有人类多能干细胞系 | 探索人类多能干细胞在体外培养过程中遗传和表观遗传变化的分子机制 | 人类胚胎干细胞(hESCs)和人类多能干细胞(hPSCs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 单细胞ATAC-seq, 基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 11628 | 2025-10-07 |
Continuous cell type diversification throughout the embryonic and postnatal mouse visual cortex development
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616246
PMID:39829740
|
研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育过程中的全面单细胞转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 提供了胚胎期和出生后发育阶段最详细的小鼠视觉皮层细胞类型动态分子图谱，揭示了细胞类型在不同发育阶段的连续多样化过程 | 研究仅限于小鼠视觉皮层，结果可能无法直接推广到其他脑区或其他物种 | 揭示视觉皮层发育过程中细胞类型多样化的分子机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，单核多组学测序 | 发育轨迹重建 | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | 568,674个高质量单细胞转录组和194,545个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 单核Multiome测序技术，提供转录组和染色质可及性联合分析 |
| 11629 | 2025-01-22 |
An Integrative Approach to Precision Pre-implantation Genetic Diagnosis by Investigating Single-cell Sequencing, Polygenic Risk Assessment, Artificial Intelligence-guided Embryo Selection and Genome Editing in Embryos with COL4A1 c.1537G>A Mutation
2024 Oct-Dec, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/jhrs.jhrs_145_24
PMID:39831092
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11630 | 2025-10-07 |
Adhesion G Protein-Coupled Receptor Gpr126 (Adgrg6) Expression Profiling in Diseased Mouse, Rat, and Human Kidneys
2024-05-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100874
PMID:38786096
|
研究论文 | 本研究系统分析了黏附G蛋白偶联受体Gpr126在小鼠、大鼠和人类肾脏疾病中的表达谱 | 首次在多种肾脏疾病模型中详细表征Gpr126的表达变化，并发现其在肾小管和肾小球损伤中的差异表达模式 | 研究主要关注表达谱分析，功能机制研究相对有限 | 探索Gpr126在肾脏疾病中的表达变化及其潜在治疗价值 | 小鼠、大鼠和人类肾脏组织样本 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | RT-PCR, RNAscope定量分析, 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织样本 | 多种肾脏疾病患者样本（狼疮性肾炎、IgA肾病、FSGS、高血压、糖尿病、急性肾损伤、慢性肾脏病） | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列分析 | NA | NA |
| 11631 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Unveils Dynamic Immune Cell Responses during Haemonchus contortus Infection
2024-05-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100842
PMID:38786064
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示山羊在捻转血矛线虫感染期间外周血单个核细胞的动态免疫细胞反应 | 首次在单细胞水平上系统解析捻转血矛线虫感染期间宿主外周血单个核细胞的转录组特征和细胞通讯网络 | 样本量较小（仅4只山羊），需要更大规模研究验证 | 探究山羊对捻转血矛线虫感染的免疫应答机制 | 波尔山羊的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序，qPCR，粪便虫卵计数 | NA | 单细胞转录组数据 | 4只波尔山羊（2只感染组，2只对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11632 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cardiac Fibroblast-Specific Transcriptomic Changes in Dilated Cardiomyopathy
2024-04-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090752
PMID:38727290
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示扩张型心肌病中心脏成纤维细胞特异性转录组变化 | 采用更新的生物信息学流程结合无监督聚类和参考标签转移，更全面注释单细胞数据集，发现心脏成纤维细胞特异性基因表达改变 | 未明确说明样本数量和技术重复情况，功能验证部分基因功能评估尚未完成 | 检测扩张型心肌病中细胞特异性转录组改变 | 人类扩张型心肌病心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11633 | 2025-10-07 |
Differentiation route determines the functional outputs of adult megakaryopoiesis
2024-03-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.02.006
PMID:38447571
|
研究论文 | 本研究通过命运示踪系统比较了巨核细胞生成的两种分化途径的功能差异 | 首次开发命运示踪系统区分巨核细胞的直接和逐步分化途径，并揭示它们产生功能不同的巨核细胞亚群 | NA | 探究巨核细胞生成的两种分化途径的功能重要性 | 成年小鼠的巨核细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 命运示踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11634 | 2025-10-07 |
An atlas of cells in the human tonsil
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.01.006
PMID:38301653
|
研究论文 | 构建了包含超过55.6万个细胞的人类扁桃体细胞图谱，整合了五种数据模态 | 首次整合单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组、免疫组库测序和空间转录组学五种数据模态构建人类扁桃体细胞图谱 | NA | 建立人类扁桃体细胞图谱并解析其免疫功能 | 人类扁桃体细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序, 单细胞蛋白质组测序, 免疫组库测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 超过556,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11635 | 2025-10-07 |
An exhausted-like microglial population accumulates in aged and APOE4 genotype Alzheimer's brains
2024-01-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.001
PMID:38159571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现阿尔茨海默病大脑中积累了一种类似耗竭状态的炎症性小胶质细胞群 | 首次鉴定出在衰老和APOE4基因型阿尔茨海默病大脑中积累的终末炎症性小胶质细胞(TIM)群体 | 研究主要基于AD模型小鼠，人类样本验证有限 | 探究年龄和APOE4基因变异如何改变神经免疫功能 | 携带三种常见人类APOE等位基因的AD模型小鼠和人类AD患者脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | AD模型小鼠和人类AD患者脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 11636 | 2025-10-07 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1
PMID:38077031
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和成像技术揭示了COVID-19后遗症中免疫细胞与上皮祖细胞相互作用的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类患者中进一步验证 | 阐明呼吸道COVID-19后遗症的病理生理机制 | PASC患者和小鼠模型中的肺组织 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学, 成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据, 图像数据 | 三个独立的PASC患者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11637 | 2025-10-07 |
Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.012
PMID:34508661
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术鉴定人类皮肤中两种稳态和两种激活状态的朗格汉斯细胞亚群 | 首次发现人类朗格汉斯细胞存在功能迥异的LC1和LC2亚群，并揭示其不同的发育调控机制 | NA | 探究人类朗格汉斯细胞的异质性及其发育调控机制 | 人类皮肤表皮中的朗格汉斯细胞和CD34造血干细胞来源的朗格汉斯细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11638 | 2025-10-07 |
HapCNV: A Comprehensive Framework for CNV Detection in Low-input DNA Sequencing Data
2025-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629494
PMID:39763944
|
研究论文 | 开发了一个用于单倍体低输入DNA测序数据中CNV检测的综合统计框架HapCNV | 构建了新型基因组位置特异性伪参考，通过初步细胞聚类方法选择无偏参考，有效保留常见CNV | NA | 开发针对单倍体低输入测序数据的CNV检测方法 | 单倍体和二倍体生物的低细胞和单细胞DNA测序数据 | 生物信息学 | 寄生虫病 | 低输入DNA测序，单细胞DNA测序 | 统计框架，聚类方法 | DNA测序数据 | NA | NA | DNA测序 | NA | NA |
| 11639 | 2025-10-07 |
Eosinophils Enhance Granuloma-Mediated Control of Persistent Salmonella Infection
2025-Jan-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5610725/v1
PMID:39801515
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现嗜酸性粒细胞在控制鼠伤寒沙门氏菌持续性感染中发挥宿主保护作用 | 首次揭示嗜酸性粒细胞通过CCL11依赖性机制被招募到肉芽肿中并增强其活化，从而限制沙门氏菌在关键持续部位的感染 | 研究仅使用小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究嗜酸性粒细胞在持续性沙门氏菌感染控制中的作用机制 | 鼠伤寒沙门氏菌感染的小鼠模型 | 感染免疫学 | 细菌感染 | 空间转录组学，实验操作 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11640 | 2025-10-07 |
TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400023
PMID:38828688
|
研究论文 | 本研究揭示TRIM24通过与Ras突变协同作用，通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs驱动胶质瘤进展的分子机制 | 首次发现TRIM24与Ras突变协同驱动胶质瘤进展的新机制，阐明PHAX/U3 snoRNA/DNA-PKcs信号轴在表观遗传重编程中的作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质瘤进展的表观遗传调控机制 | 胶质瘤细胞、人类神经干细胞、临床Ep-GBM标本 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床Ep-GBM标本及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |